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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30592 LG8 38753026 38756911 PREDICTED: putative leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At2g14440
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 38753300 intron_variant
C/T 38753473 intron_variant
G/T 38754264 intron_variant
G/A 38754265 intron_variant
G/T 38754495 intron_variant
T/C 38754640 intron_variant
C/A 38754879 missense_variant p.Trp469Cys
A/T 38754886 missense_variant p.Ile467Asn
A/T 38754956 intron_variant
A/T 38755060 intron_variant
A/T 38755102 intron_variant
C/T 38755605 intron_variant
G/A 38756157 synonymous_variant p.His227His
G/T 38756224 missense_variant p.Pro205His
G/T 38756357 missense_variant p.Arg161Ser
G/C 38756561 missense_variant p.Leu93Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30592.1
MTLLFFISFFFFFFFFTITITTSAPPPPHPPPPYPYGLSYHINCGTSANSTDSFNTTWLSDRFFSAGSSALVSQPLNFPLPSEKTLRFFPPSSYGKKNCYTFPSLPSSSRYLLRTFTVYDNYDAKSRPPSFDVALSSTVLFSWRSPWPESTAAKGAYSDLFASLSNTSSSLDLCFYGFATDAPLISSIELIQVHPSAYDAPDNIILVNYGRISCGAPQHWGAAFSNDTDRFARSWQPDSAFRKIPQDSNDVSFLSTSKSISGADEEPNYFPMKVYQSAVTTEGTLEYELEVDAKMDYTVWLHFAEIDSSVKKVGERVFDVFINGDNVTRVDIYKQVGGFSALTLHYTLKNLSSNAFTLKLVPVVGAPLISGVENYALVPIDPSTLPLQATAMKALKESLRIPDRMGWNGDPCAPTTWDAWEGVTCRMTTDKTALVISEIDLGTQGLKGYISDQISLLSNLVSLNLSSNSLAGEIPAGLGQKSLIQVDLSNNQLTGSIPDGLASSNLKLVLLNGNLLEGQVPEQLYSVGVHGGAIDLSGNKGLCGVPSLPSCPMFWEHGRLSSRGKLAIGLSCLFVLCVVLLLAYIYIRRKRNDYDFALPHELISLAAKRNRYQRQKSLMLLELESQHAKGLPSPFTPL*


CDS Sequence:
>Vu_30592.1
ATGACTTTACTTTTCTTCATCTCTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTCACCATCACTATCACCACCTCTGCACCACCACCACCACACCCTCCTCCGCCATATCCCTACGGTTTATCCTACCACATTAACTGTGGCACTTCTGCCAACTCCACAGACTCCTTCAACACCACATGGCTTTCCGACCGTTTCTTCTCCGCCGGCTCCTCCGCCCTCGTCTCCCAGCCTCTCAACTTCCCCCTCCCCTCCGAGAAAACCCTCCGCTTCTTCCCTCCCTCCTCCTACGGCAAGAAAAACTGCTACACCTTCCCCTCCCTCCCCTCCTCCTCTCGCTACCTTCTCCGCACCTTCACCGTCTACGACAACTACGACGCCAAGTCCCGCCCTCCCTCCTTCGACGTCGCCCTCTCCTCCACCGTCCTCTTCAGCTGGCGCTCCCCCTGGCCCGAGTCCACCGCTGCCAAGGGCGCCTACTCCGACCTCTTCGCCTCCCTCTCCAACACCTCCTCCTCCCTCGATCTCTGCTTCTACGGCTTCGCCACCGATGCCCCCCTCATCTCCTCCATCGAGCTCATCCAGGTGCACCCTTCCGCCTACGACGCACCCGACAACATTATCCTCGTCAACTACGGCCGCATTTCCTGCGGCGCCCCCCAGCATTGGGGAGCCGCCTTCTCCAACGACACCGACCGCTTCGCCCGCTCCTGGCAGCCGGACTCTGCCTTCCGAAAAATCCCCCAAGATTCCAACGACGTCAGCTTCCTCTCCACGTCGAAATCGATCTCCGGCGCGGACGAGGAGCCTAATTACTTCCCCATGAAGGTGTACCAGTCGGCGGTGACCACGGAGGGGACGCTGGAGTACGAATTGGAGGTGGACGCGAAGATGGACTATACCGTGTGGCTTCACTTCGCGGAAATCGATTCCAGCGTGAAAAAAGTAGGGGAGAGGGTCTTCGACGTGTTCATCAACGGCGATAATGTTACCAGGGTTGACATATACAAACAAGTTGGTGGTTTCTCTGCGTTGACTTTGCATTACACCCTCAAGAACTTGAGCTCCAACGCGTTCACACTGAAGCTCGTGCCGGTTGTGGGTGCCCCTCTCATTAGTGGCGTTGAGAATTACGCATTGGTTCCAATCGATCCCTCCACTCTCCCTCTCCAAGCGACTGCGATGAAGGCGTTGAAAGAGTCGCTTCGTATTCCTGATAGAATGGGTTGGAATGGTGATCCCTGCGCCCCTACTACTTGGGATGCTTGGGAGGGTGTTACCTGCCGCATGACTACCGATAAAACTGCTCTCGTCATAAGTGAGATAGATCTTGGCACTCAGGGCTTGAAAGGGTACATAAGCGACCAGATTAGTCTTTTGTCCAACTTGGTAAGCCTGAATTTGAGTTCTAATTCCTTGGCGGGCGAAATACCAGCTGGACTGGGTCAAAAATCTCTTATACAAGTGGATTTATCAAACAATCAGTTAACGGGATCCATACCTGACGGTTTGGCATCTTCGAATTTGAAGCTCGTGCTACTGAATGGTAACCTATTGGAAGGGCAAGTTCCAGAGCAACTTTATTCTGTTGGTGTGCATGGTGGAGCTATTGATCTCTCTGGCAACAAGGGATTGTGCGGTGTACCATCTCTTCCATCATGTCCTATGTTTTGGGAGCATGGCAGATTATCCAGTCGGGGTAAACTTGCAATAGGCTTGTCATGTCTTTTTGTTTTGTGTGTGGTACTGCTGTTGGCATATATCTACATCAGGAGGAAAAGGAACGATTATGATTTTGCTCTTCCTCATGAATTAATTTCATTAGCTGCCAAGAGAAACCGCTATCAGAGGCAGAAATCGTTGATGCTTCTTGAGCTAGAGAGTCAACATGCCAAGGGACTACCTTCACCTTTTACTCCACTATAA


Promoter Sequence:
>Vu_30592::LG8:38756911-38758911(-)
GAATTTAAATTTCTAACGAGATAGTAGTTTACTCGATAAAAGTATCAATGTTATAAATTTTTAATGAATATTGGTTGATGACAAAGTCGACTAAAATTTGTTAGACTTTATTTTCGGTTGATATTAATAAATAATCAATGAAATTGATGTTATATTTAATATATTTACTTCTAGTTGTTTACAAATATTGATCATGTTAGTTTTACAATATTGTTAATTGAAATTATGTTATCGACTTTAAAAATTAATTAATGTTTGTTAAAATATCTATTTAGCCAACTTTTAAAAATTGATATGTAATTTAACCAGTTACAGTTTTATATTTTACAAAATATATGTTTGATAAATGTAAGAGTTATGAAAAAACTAAGAGTATAATTGACTTTTAAAACTGGAGCTTGATTATTTTCACTAATAAAAATCGAATTTATAAGTGAAAAAAAAAAATAGTTAGCTGAGTTTCATAAGTAAAGACTACCATAATTTTAAAACTATTTTTTTTCTTCCTTTAACTTTTTTTAGTGTATTTGACAATTGGAGAATGTTATAGGATTTCTGACATTAAGATTTACAATTTTTACCAATTATTTTCTCTTATTTTTTTATCTTTTAAAAAATTTGTTTGTATGTGTCATTTAAATATTTAAGGTGAATCTCTCTTTTTTGTCAGAATTGTTAAAAGGTGTTCAAACTTTTTATATGAATATTTATGTGTAAATATTGTATTATATGTGTATAAAGGTCTCGGTAGAGTTATTTGTGTTAATAGCTCACAATCTAAGTAGGGGAGTTAGTAAATTATAATAGTATTGAGTTGTATTTAAATTGAAGTTGCAAACCATTGTTTGATAGAAATGAGAATTGATAATTGAATTTGTTTATAATCAGTCAGGTTCCATGTTTTGTAAACGGACATAAAAAGCTAAATAAATGATATTTTGACATTTTTTTCAAATATAAACTAATATTTGGATGATTTGATGATTTTTAACTTGAACATATAAGAAAAGGACTAATAAAAGGACAAAAACATAATTTTGATGCAATTTTTAAAAAAATTACCAAAATGAGTAGTTTCAAAAAATTGGGATGGTAGATAAGTCAGATAAATGTAGCACGACTTCAGTTTAAATGATTTTATAAAGTTAAAGTTTTATTAATGTAATATAGCTTTAGTTCAGAACATTTTTTTTAAACTAAAATTATATATTTTAATATAATTTCCACCAGAATTGAATTAAAGTGATTATACATTGATACGTCTTCAGTTCTAAATGTATTGTATTTTTTTTTATATGATTTCAACTTAAAAATATTTTAAACTAAAATTGTGTCAATTTCTTTCAATATAATTGTATAAAGATAACATAACTTGTATTCTGAATTTTTTCAAATATACCAATTTCGGTAATTTAAAAAAAAAAATACACGAGAAAAAAGTATGCTTTTAAAAGACGTACATAATGAACAGTGATGTCATATAATTTATCTTATTGTAACAGTTTATAAATTTATGCCTTGGATGTTTTAATAACGCCAAAAATACAAAACCCGTGAAAGATGTAACTAATTTCATAACATTTATATGTATTCCGATAAAATGGTCGTATTGTATTTGTATAATGATGTAAGCAAAATATGTTTATTTAAAGGAGTGTGATAAGTTGGAGCATGAGGTTTTTAAATGTGATGAACACTTAAAAATGTAAAAGAGTTAAAAAAAAAATGGTTAAAAAACATTTTTCAAAAAATGTCGTGAGAAAATGAGCATGAGGTGATAGTGTGGAGTGAAGAAGGGAGTTTAGAAAGAGAAATGAAACAACGGTCATTGCATAGTATAGTAAAGCGTTCATACCTACTCTCTCCTTCAATTCAACTATATTCTCCCGCTAATCTCGCCATCTTCCACTCTCTTCTCTCTGGTTTTGTCATAATTATCATCTCCGCATCACAACCCCACGCTATCCTCACTTCCACCTTCATTCACTTTCACACACACC


Gene Sequence:
>Vu_30592(-)
ATGACTTTACTTTTCTTCATCTCTTTCTTTTTCTTTTTCTTTTTCTTCACCATCACTATCACCACCTCTGCACCACCACCACCACACCCTCCTCCGCCATATCCCTACGGTAAGAAACTTAGCTCTTCCTCTCTCCTCTCACATTTCATTCTTCGGTAACACTCTTCAATTCATTCCGCAGGTTTATCCTACCACATTAACTGTGGCACTTCTGCCAACTCCACAGACTCCTTCAACACCACATGGCTTTCCGACCGTTTCTTCTCCGCCGGCTCCTCCGCCCTCGTCTCCCAGCCTCTCAACTTCCCCCTCCCCTCCGAGAAAACCCTCCGCTTCTTCCCTCCCTCCTCCTACGGCAAGAAAAACTGCTACACCTTCCCCTCCCTCCCCTCCTCCTCTCGCTACCTTCTCCGCACCTTCACCGTCTACGACAACTACGACGCCAAGTCCCGCCCTCCCTCCTTCGACGTCGCCCTCTCCTCCACCGTCCTCTTCAGCTGGCGCTCCCCCTGGCCCGAGTCCACCGCTGCCAAGGGCGCCTACTCCGACCTCTTCGCCTCCCTCTCCAACACCTCCTCCTCCCTCGATCTCTGCTTCTACGGCTTCGCCACCGATGCCCCCCTCATCTCCTCCATCGAGCTCATCCAGGTGCACCCTTCCGCCTACGACGCACCCGACAACATTATCCTCGTCAACTACGGCCGCATTTCCTGCGGCGCCCCCCAGCATTGGGGAGCCGCCTTCTCCAACGACACCGACCGCTTCGCCCGCTCCTGGCAGCCGGACTCTGCCTTCCGAAAAATCCCCCAAGATTCCAACGACGTCAGCTTCCTCTCCACGTCGAAATCGATCTCCGGCGCGGACGAGGAGCCTAATTACTTCCCCATGAAGGTGTACCAGTCGGCGGTGACCACGGAGGGGACGCTGGAGTACGAATTGGAGGTGGACGCGAAGATGGACTATACCGTGTGGCTTCACTTCGCGGAAATCGATTCCAGCGTGAAAAAAGTAGGGGAGAGGGTCTTCGACGTGTTCATCAACGGCGATAATGTTACCAGGGTTGACATATACAAACAAGTTGGTGGTTTCTCTGCGTTGACTTTGCATTACACCCTCAAGAACTTGAGCTCCAACGCGTTCACACTGAAGCTCGTGCCGGTTGTGGGTGCCCCTCTCATTAGTGGCGTTGAGAATTACGCATTGGTTCCAATCGATCCCTCCACTCTCCCTCTCCAAGGTCTCACACATTTTGTATAATTTTATTTCATTCATTGTTTCATAATGGCATAATAGAAAGTTACGAATTGTAATGTGTTTGCAGCGACTGCGATGAAGGCGTTGAAAGAGTCGCTTCGTATTCCTGATAGAATGGGTTGGAATGGTGATCCCTGCGCCCCTACTACTTGGGATGCTTGGGAGGGTGTTACCTGCCGCATGACTACCGATAAAACTGCTCTCGTCATAAGTGAGATGTAATGTAACTCTTCTTTCCATCCTTTTTCAATTTATTTACTCTGCCAATTCATGTTGCAATGAAATCTTAATTCCTGTTGCGGTTTCAGAGATCTTGGCACTCAGGGCTTGAAAGGGTACATAAGCGACCAGATTAGTCTTTTGTCCAACTTGGTAAGCCTGTAAGTATCACCGTCTCTACTTTCAACCCATTTTTTTTTCTGATATGTGAAACCGTTTAGATAGACTCATGATGTTCTGCATTCTACCTCATAAATGAATGCTATGGCTACTGCAAGTATTTCGATTTTCCATACCTGGCCTTTCTCTAAGTTTGTTGTTTGTTGTCCTTCATATTGCCATTTTTTTCCATAATTTTTTTAGTGGAGGCTTCTGTCTTGTATCCACATTCATTATTTATAATTAAGTGTTGCTCTCAGTTTCAATGTTGGAAACGATATTTTATGCCTTTGCCATATACGTATTCTGATTCATGCAGCACGTGTTTTGCCAGACAGTGTTGCTCATTTTCATATTGTGGGCAACTTAATTTTACAGGAATTTGAGTTCTAATTCCTTGGCGGGCGAAATACCAGCTGGACTGGGTCAAAAATCTCTTATACAAGTGTAAGAACAGTTATTATCCCAGTTAGCTACTAGTTCTAGCAGACGAGTAATAATGCTACATCTCCTTAAAAATTCTCCTCCTACTTTACTGTAGGGATTTATCAAACAATCAGTTAACGGGATCCATACCTGACGGTTTGGCATCTTCGAATTTGAAGCTCGTGTAAGTATCTACTACATCTGCATCAATTAATGTGATCGTCTCTTTAGGTTCTATAACCTCGTTATTTTCTTTCTTTTTCTGTTTTGTAAGACGTGTAGTCCTTCCTCTAGATTTAGCGCTTATTTTCCCTCAAGTTCAATATCTTTTTCTGTCACAAATGGGGATGCTGCAATGCTTCTGCTTTATAAAAAATATATCATTTTCTAATCTTTTTAATCATGTCAGGCTACTGAATGGTAACCTATTGGAAGGGCAAGTTCCAGAGCAACTTTATTCTGTTGGTGTGCATGGTGGAGCTATTGAGTATGTCATTTTAATTTGCTATCTTTGCTCTATCTGCTTCTGCATAATTTTGTGTTCAGATTGAAATGTTGAATAACTTTGCTTGTGTATATAATAATAATCCTTATTTGCTATCTCTGCTCTATCCTTATTTTGCTTGTGTGTATAATAATCCTTACTAGTTATTTAACTTTCTATGGATGCAAAAAAGAACTACATATTAATCATGTGTGACCGGTTGTATAATCCAACGAGAAATAATCTTTTTTAAATATTCAATGTGATTTTTTTTTATTCAGTCTCTCTGGCAACAAGGGATTGTGCGGTGTACCATCTCTTCCATCATGTCCTATGTTTTGGGAGCATGGCAGATTATCCAGTCGGGGTAAACTTGCAATAGGCTTGTCATGTCTTTTTGTTTTGTGTGTGGTACTGCTGTTGGCATATATCTACATCAGGAGGAAAAGGAACGATTATGATTTTGCTCTTCCTCATGAATTAATTTGTAAGTATGATTTCAATAAGATTCTGTGTTTGTCATGCATCTTTATTTATAATATTCCTTGTGACGTGTATTGGTTTTCTGGGGCTAACGTGACCTTGCTTTATTTGCTTTGTCGGAGTAGTAGTTGCTCTTTTCTATAACTATCGGACTCTTTTATGAATATACTTTATACACATAGGATTTCATTTTCGTGCAGTATTTATATTAGTTTTCTTGTTCTGGCAAACTCTGACTGGGTGAAATTTCTAACTGCTCCTGTCATGATCATGAAAGCATCCTTCATAAATATTATTTTACTTTTGCTGTCATGTGTATTATTCAAGTTTCATCACGTGTTCATTATTTCAAAAGTGGCAAAATGACGTACATTCTATATCGGAATTTAAATCAAGATTTAAGTTAATGTACCGGTCTTCATTAATCATTAGTTTTTTCCTATGAATAACCTCCATTTCCGGTTCAATCCGGGGTTGGATCAAAGATAAATGAAGAAGTCATTTAAATCCAATCTAACCGATTTTTTAGGGGCCTTGGACATGGCATCTGCTGTGATATTTTGTTTTCTTCTATAAAATGGATCCTCTTATTGAATTTCACTTCTAGCAAGTGTTGGGTTCCAGCTGCTTAAATTCCACCAAATGATGAGATATTCGGTTTAAAAGGACTTCTTAGTTTTAAGAGTTCTATTTATCAACTTTGAATATCGAAATCCTGTGCTAATATCGACTGTTACTGTGACTTCTTCTGCAGCATTAGCTGCCAAGAGAAACCGCTATCAGAGGCAGAAATCGTTGATGCTTCTTGAGCTAGAGAGTCAACATGCCAAGGGACTACCTTCACCTTTTACTCCACTATAA

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