Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30588 LG8 38707723 38710152 PREDICTED: myb family transcription factor EFM-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 38707738 3_prime_UTR_variant
T/A 38707741 3_prime_UTR_variant
T/A 38708183 stop_gained p.Lys339*
T/A 38708199 synonymous_variant p.Pro333Pro
G/C 38708234 missense_variant p.Pro322Ala
G/A 38708236 missense_variant p.Ala321Val
C/T 38708628 intron_variant
T/A 38709050 missense_variant p.Glu176Asp
T/A 38709055 stop_gained p.Lys175*
A/C 38710047 5_prime_UTR_premature_start_codon_gain_variant
G/A 38710050 5_prime_UTR_variant
G/T 38710148 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30588.1
MYFFTEKMQRLKMGFPDYIQALEEERRKIQVFCKELPLSFELVTQAIEACRQQLSGTTSEYNLNGQSECSERTTSSEGPVLEEFIPIKKRASSSPCCDEDDEDYEQHSLRQTVLNENNNNSDKRKSDWLRSVQLWNPDPPAEEDATKKVPGMELKRSGSGGGAFQPFHREERATKETETLYKAPSSTRVPAASSSAGELTPEKNQNEGQRKQRRCWSQDLHKRFLHALQQLGGADSATPKQIRELMNVDGLTNDEVKSHLQKYRLHTRRPSPLVHNNSSPQAAPFVLVGNIFVQSPEYAAVATSTASREVTTVTVPAGVYAPVATHPKPVSQPSADSIKKPQFKKFKHSEHSNSDERGHHSEGAVHSNSPTSSSSTHTSASPGY*


CDS Sequence:
>Vu_30588.1
ATGTATTTCTTCACTGAGAAAATGCAGCGTTTGAAGATGGGGTTTCCTGACTACATCCAGGCATTGGAAGAAGAACGCCGTAAGATTCAGGTCTTCTGCAAAGAGCTTCCTCTTTCCTTCGAGCTAGTTACTCAAGCAATTGAAGCTTGCAGACAACAGTTGTCTGGCACCACTAGCGAGTATAATTTGAATGGTCAATCGGAGTGTTCGGAGCGGACAACATCATCGGAGGGACCAGTCTTGGAGGAGTTCATTCCGATCAAGAAAAGGGCATCATCATCCCCCTGTTGCGATGAAGATGACGAAGACTATGAACAGCATTCTCTCAGGCAAACGGTTTTAAATGAGAATAATAATAACAGTGATAAGAGGAAATCCGACTGGCTCAGATCTGTTCAGCTGTGGAATCCAGATCCCCCAGCTGAGGAGGATGCGACTAAGAAAGTTCCTGGGATGGAATTGAAGAGAAGTGGGAGTGGTGGTGGTGCTTTCCAGCCATTCCACAGGGAAGAAAGAGCTACAAAGGAAACTGAAACATTGTATAAAGCACCCTCTTCAACTCGGGTACCTGCTGCGAGTTCTAGCGCCGGAGAACTCACCCCAGAAAAAAATCAGAATGAGGGACAGAGAAAGCAGCGCAGATGCTGGTCTCAGGACTTACACAAGCGCTTCTTGCATGCCCTTCAGCAGCTTGGGGGTGCAGATTCTGCCACACCAAAACAAATCCGAGAGCTAATGAATGTTGATGGACTCACAAATGATGAAGTGAAAAGCCATTTACAGAAATACCGTTTGCACACCAGAAGGCCAAGTCCCTTGGTTCACAACAATTCCAGTCCACAAGCAGCGCCTTTTGTCCTTGTAGGGAACATTTTTGTTCAGTCACCAGAATATGCTGCTGTAGCTACCTCAACAGCATCAAGAGAAGTGACCACAGTTACAGTACCTGCTGGAGTTTATGCACCAGTGGCCACACATCCTAAGCCTGTTTCACAACCATCAGCCGATTCAATTAAGAAGCCACAGTTTAAGAAATTTAAGCATTCTGAACATTCAAATTCAGATGAAAGGGGTCATCACAGTGAAGGAGCCGTTCATTCAAATTCCCCTACCTCATCCTCCTCTACACACACCTCTGCTTCCCCTGGTTATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_30588::LG8:38710152-38712152(-)
AAAAAAAATTTAAGTTAAACACATTTTAATTTATCTTAATAAAGATTGTTTTACTATTGTCATTGTTAAAATTATGTTTTTATTTATTTATTTAGGTAGATTTAAATTATCTTACGATTGAAATTTGTTAATACGAATTATAATGAGGCTACTTTACTTTTTTTTTTTCATTTTTATTAATTTTATTGAATATTGAATGTGGATTTACGAACAGATGACAATATTTTAATATGACTTTGAAAATGTTTATGGTTGGGAATGAAACTCTTTATCTTTTATGAGTTATGAGTATAAGTAAGATAAAGTGAATATTTTTTTAAAAATATATTAATTATATTTATAGAATCAATATAAACCATGAACCAATTGAAATTATACTATATAATTACATTAAAATAATAATATAATAATAACTATAATATACATTTTTTAAAATTAGTTATAATATGTAAATATTATTTTAAATACATCTAAATTTAAACTGATCTGAATAAAAAAACTTAATGGATATTATTCGATGATGTAGTATGTTTATTAGATCGGTAATATATATACTTTAAAATTACTATAACTATTAATTTTTGAAGTCAATTATTGGACATGTAGATATGGATTAAAGAGATAATTGAATATTTAATTGCATATATTTGTTGTGATGGATAGAAGGAAAAGAAATAAGAAAAAGTAAATCAATGTAATATGAATAGATGAAAAATAAAATGAAAATGAAGGAGTTTAGTTGGAAAAAGAGAAAAAGAAGAAGGAAAGACAGAGAGATAAGATGTGTGGATTTCATGTGGGAAGGAAACATGTGTTAAAAGATAATCTGGATTATAGGTGGTACGTGGCAAGTTTAAGATAATAGGAAGTGAGTTAGAGGAAAAAGATAAAGAAAATCATGTGAAATGATTGAGATGATTCTTAAATATTTTATGAAAGTCACACGCAGGAAAAGTCAGGAACAGCTGGTACTAGTGGTGCGCGAGATAGAGATAGAGATAGAATGAATGAGATGTTATAGAAGAAACTGTATAATACAACACAACACTCAACACAACAATTTAAGGATTGAATAATCATAACTAAGGTTGTCCATTCAACTGCCTCAAAGGCCAATTTCAATCTCTTCTCTTTCCAACCTTTTTTCATTTTTTTCTTTCAATCTCCATTTCTTTTCACATCTCTTCTATTGCAATTCCACAAATTACATCTTTCATTTTTAAATATTAATAAACATCTAATTTAATTATTGGCATCAACTAATTTTTCTTCTAAAATGCCATATTTAGGATGTTCAATTTATGTATTTAATAATTACGAACGGAAAGTATAATTTTATATTATTGATTATATATTTTTAAACAATTATTACAAAATTTAACTAGTTTGTTGTGTATAATGATTTATGATTGGATGTTTAGATAATAAAAACCTAATATCATTTGACACAAACTTTATAAGATAATCCATCTAATATTAAAATATAAAGGTTAGCAGAAAAAAATAAAGGATAGAAGAGAGAGTTGTTGATCTTATCCTTAAACCACAACAGTGATTGGTGAAGAGACAGAGACAAAAGATTTGAAAAAGCAACAGAGCAAACGCCCATGAAATACCTCTCTCTCTTAATAGAAATTGCCAACATAAATAGTATTTATTGATTTTAGTTGTTTGAGAGTTAAATTTTAAGTAATTGAAAATATATTTTTTTGAAAATGTTTATTTAACCATTTTATTTTACTTAAAATGAATTCAGGAATTCTTGTATAGTTTATGAATTAAAAACAAAACGATTAAGTTGAACTTAAGAGTTATAAAATTAACTACAATATTTTGGTTTTATTTTAGAAAATTTATATATTTATTTTATTTTATTTTATACCCAGCAGTTTTATTTTCTCGATCTTTTTTCAAAACTAGAAACAATTTATCCCCTACCCAGAGGAGAGCAAAACAAATGAAAAAACAATATAAAAAGCATCAAAGATTCTGTATGCGAC


Gene Sequence:
>Vu_30588(-)
GCCCCGACCGCGATATTTTCCCGAGCTGTTGGTTTCAATTCAATGTCTCGTTTTCTCGACCCATCTCTCTCTCTTCCTCTTTTGTTGGGAATTTTCTTTTTTCTTTTTAGTTTTTCCAATTGTTTTCCTTGCTTGGTTTACAAGTCTATTTTATTATTCCAAAATTTGATTCCAAGATCCCATATTCTTCAATGAGAAGCTCTCTCCTCGCTCCTTTCTGCTTCCATAAAACGCCATTTCCTTGTATATCTCTTTTCCCTCTTCTTTCTGTTTTTCTACTTTACTCCACCACGTTGGCTTCCATAAATGTATTTCTTCACTGAGAAAATGCAGCGTTTGAAGATGGGGTTTCCTGACTACATCCAGGCATTGGAAGAAGAACGCCGTAAGATTCAGGTCTTCTGCAAAGAGCTTCCTCTTTCCTTCGAGCTAGTTACTCAAGGTAACCCAACAAACAAACAAACAAACCATATCCTTTTGTTGCTTTCTAGAAGATCATAAAGTTTCCTCCTTTATTTTCTGGGTTTGTTTACTGAAAGGTTTTTGTTTTCTTGGTTTTGTTGTTTTTGTTATGTTTGCAGCAATTGAAGCTTGCAGACAACAGTTGTCTGGCACCACTAGCGAGTATAATTTGAATGGTCAATCGGAGTGTTCGGAGCGGACAACATCATCGGAGGGACCAGTCTTGGAGGAGTTCATTCCGATCAAGAAAAGGGCATCATCATCCCCCTGTTGCGATGAAGATGACGAAGACTATGAACAGCATTCTCTCAGGCAAACGGTTTTAAATGAGAATAATAATAACAGTGATAAGAGGAAATCCGACTGGCTCAGATCTGTTCAGCTGTGGAATCCAGATCCCCCAGCTGAGGAGGTAAAAAGACCAAAGCTTAATTGTGAATTTTCCATTGTTTGAATAAGTTTTGTGCTTTGTGTAGACGATGTTTGTTAATTGACTATTTTTCCTTTTTGTGTGTATGCAATTTCCTTGGCAAATTGTTCAGGATGCGACTAAGAAAGTTCCTGGGATGGAATTGAAGAGAAGTGGGAGTGGTGGTGGTGCTTTCCAGCCATTCCACAGGGAAGAAAGAGCTACAAAGGAAACTGAAACATTGTATAAAGCACCCTCTTCAACTCGGGTACCTGCTGCGAGTTCTAGCGCCGGAGAACTCACCCCAGAAAAAAATCAGAATGAGGGACAGAGAAAGCAGCGCAGATGCTGGTCTCAGGACTTACACAAGCGCTTCTTGCATGCCCTTCAGCAGCTTGGGGGTGCAGATTGTGAGTATCTTAATCAGTTTTGATTGTTTTGTCATGTGCTTGGGATGTCACTATAATTGCCTATTTTCGTGGTTTCTGCAGCTGCCACACCAAAACAAATCCGAGAGCTAATGAATGTTGATGGACTCACAAATGATGAAGTGAAAAGCCATTTACAGGTATGTTAGGTATATATATGCTGTTTGTATCCAAATTCACAAAGATTGGTTAACAAAATTAACTTAAGCTGGTAGAATCACAATCGGGGTCTTTGCTATTGTAATTTCCATTGTCTAGTCTAGTCTCCCCGGTGTGGAATCGTTAACTGTTTGTTCTTGTTTCCTTAACCCTCCCCTCCAGTTTTAAGGGGGTCCAAACTAATTAAGTTTTTTTGTTTCAGAAGGTATAGTAAATATTCTTGAGATCCAGCCGTTCCATATTCTGAATCATAGTCTAAATTTTTCTGTGTTTTGGACAGAAATACCGTTTGCACACCAGAAGGCCAAGTCCCTTGGTTCACAACAATTCCAGTCCACAAGCAGCGCCTTTTGTCCTTGTAGGGAACATTTTTGTTCAGTCACCAGAATATGCTGCTGTAGCTACCTCAACAGCATCAAGAGAAGTGACCACAGTTACAGTACCTGCTGGAGTTTATGCACCAGTGGCCACACATCCTAAGCCTGTTTCACAACCATCAGCCGATTCAATTAAGAAGCCACAGTTTAAGAAATTTAAGCATTCTGAACATTCAAATTCAGATGAAAGGGGTCATCACAGTGAAGGAGCCGTTCATTCAAATTCCCCTACCTCATCCTCCTCTACACACACCTCTGCTTCCCCTGGTTATTAAGTTTAAAATGTTGCACAAGTTTTGTTACCAAATTGCTGTAGAAAGTCCTTTGATATTTCCTTCTGACGTTTTTTTTGTACTAAAATTATCTTTACTCCTGTTATATGGGATTTAAATCAGAGGTAAAATACACAGTGACAGTTTTGATGTTAAATAAGTCCACCCCACCCTCATAGCTGGCTACCATGTTATCTCCTTGCACAGAAGGTGAACTGAAATTTCAAATTTTAAATTTGGAAGCATGATCAATGTTTCAATTGGTACTTCTTGAGATTGTGACTAATTAAAAGTTACTAGTCTGACTTAGTCATACTCCTTCC