Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30515 LG8 37913051 37916304 protein PHR1-LIKE 2 isoform X4
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 37913461 upstream_gene_variant
C/G 37913501 upstream_gene_variant
C/A 37913554 upstream_gene_variant
T/C 37913564 upstream_gene_variant
T/C 37913725 upstream_gene_variant
A/C 37913921 upstream_gene_variant
G/A 37914140 upstream_gene_variant
A/G 37914229 upstream_gene_variant
A/G 37914309 intron_variant
A/T 37914321 intron_variant
T/A 37914339 intron_variant
C/T 37914444 intron_variant
T/A 37914527 intron_variant
A/T 37914530 intron_variant
A/T 37914531 intron_variant
G/A 37914645 intron_variant
A/G 37914650 intron_variant
A/G 37914676 intron_variant
A/G 37914679 intron_variant
T/A 37914685 intron_variant
T/C,* 37914808 intron_variant
T/A 37914821 intron_variant
G/A 37914827 intron_variant
T/C 37914828 intron_variant
C/A 37914875 intron_variant
C/T 37914909 intron_variant
A/C 37914993 intron_variant
A/T 37914998 intron_variant
G/A 37915169 downstream_gene_variant
T/C 37915363 downstream_gene_variant
T/A 37915435 downstream_gene_variant
G/T 37915537 missense_variant p.Glu156Asp
T/C 37916183 3_prime_UTR_variant
A/C 37916232 3_prime_UTR_variant
C/T 37916237 3_prime_UTR_variant
T/A 37916264 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30515.1
MFSRLIHPHEGGVGQEDMQGASNHAHLGDPCLVLTSDPKPRLRWTADLHERFVDAVTQLGGASKATPKAIMRTMNVKGLTLYHLKSHLQKYRLGKQSGKDSDEGCKDGSYLQESPGTDNSSPKLPTSDANEGHEVKEALRAQMEVQSKLHLLVEAEKHLQIRQDAERRYMGMLERACKMLADQFIGDIIMDTDGQKFQGLESKTPRSSLVDHVGFFPPVCSEVGGMHVSEVPPILQPQGADCSTESCLTSLESLGGLTLEGSPGGSKKRMLSLDSMVAPLIWSEANTRTQGIHLAQVNPPGITRYGM*


CDS Sequence:
>Vu_30515.1
ATGTTTTCTAGGTTGATACATCCCCATGAAGGGGGTGTTGGGCAGGAAGACATGCAGGGTGCTTCCAATCACGCTCACCTCGGAGACCCTTGTCTTGTTCTCACCTCTGATCCCAAACCTCGTCTTCGGTGGACCGCTGACCTTCACGAACGCTTTGTTGACGCTGTCACTCAACTTGGGGGTGCCAGTAAAGCCACTCCTAAAGCGATCATGAGAACCATGAATGTCAAGGGTTTGACGCTCTATCATTTAAAAAGTCATCTTCAGAAGTACAGGCTTGGTAAGCAATCAGGAAAAGATTCTGATGAGGGTTGCAAAGATGGTTCGTATCTTCAAGAAAGCCCCGGTACTGACAACTCATCTCCAAAGTTACCAACTTCGGATGCAAACGAGGGTCATGAAGTGAAGGAGGCATTAAGAGCACAAATGGAAGTGCAAAGTAAACTACACTTACTAGTGGAGGCTGAGAAGCACTTGCAAATTCGCCAGGATGCAGAGCGGAGGTACATGGGCATGCTCGAGCGAGCATGTAAGATGTTAGCCGATCAATTTATTGGGGACATAATTATGGACACAGATGGCCAAAAATTTCAAGGGCTGGAAAGTAAAACACCCAGAAGTTCCCTAGTTGATCACGTTGGGTTTTTCCCCCCAGTATGTTCTGAGGTAGGTGGAATGCATGTTTCAGAAGTACCACCTATTCTCCAGCCTCAAGGGGCTGACTGTTCCACTGAAAGTTGTCTGACATCACTTGAGAGTTTAGGAGGGTTGACGCTCGAAGGATCTCCCGGCGGATCGAAGAAGAGGATGCTGAGCTTGGATTCAATGGTAGCACCTTTGATCTGGAGTGAAGCCAACACCAGAACTCAAGGAATCCATTTAGCTCAAGTCAATCCTCCAGGAATAACTAGGTATGGTATGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_30515::LG8:37911051-37913051(+)
GGTAAGATTTTTGCATTATTTTTTCTATTGAATTGAGGGGGCTATTGGTTAAACAGTGAAAGAAATTTAAATTCAACAATTCGCAATATAAACACATTTTAACAAAAAAAAAACCGTATTTTGAATATTTTTTGGATGATCTGAAAAGTGTAATTGAAATGGTAAAAGTCCAGAAAGAGGAGCTTTCAAATATTCAAAGATTGTAATAATGAGATGAAAAATTTGATGGTATTGTATGTAAGGAAGCAAAAGTAGTGTTTACTTAAAAGAAGATAGATGAATGTATTGTTTGGGTTGAAAAAAGAAGATAAAATGAGAAGGGGTGGTACCTACTTGACCAAGCAAATCTTTGATGAACATGTTTGACAATGAGATACAAATTTTAAAGCATTAACTTGTGGATATAAAAGACCATCAAAGTAGAAAATATGAGATTAACATGGTGACAGCCTGTTTTTCCTTTAAAAATATTTAAACCAAATTTCATGGTGTTAAGCACATGCAAGTGTATGTTCCATGATGCAAACTATGGACAAAAAACCTTTGTCTTAAGTCATAGTCTAACGTTACGTAGTTCCAACAATTCAACACCTTAATCTTCAACATGAACACAATTCACAACCAGTTGTATAGCAACAACACCCTCTAAGTTCATGCAATTTCTTCCACCTACGCTTTCTCTTCTGAAAGATCAAAATTAACCCCCTCTGTAAACAACTGGGGAAGTGGACGTAATTCACTTTTCAAGAGTTTAACAAAAGTTTACCAAGACATGATTCATCCCGTTATTGATTTGCATGAAGAACGTAGAAGTAAAATATCATCTAGTATAAAAATTTGTCTAGAAATAATAAAAAAAAAACAGAGATAAAAACGTTATAATTTTGTTGGGTACAAACAAAGTCCCACATCAGATAAAATATGAAATACACATGAGTTTATATACAACATAAGATACATTCCTTAATAATAGATTTTTGGAGTGGTACCAAAAACAAATATGTGGTATAAAAATTAAGAGAATCCTTTAGCAAATATTTAAGATATAAAAAATCTTGAAAATTAAAAAAATAAAAACAAATTATTTATAATTAAAAAATTATAAATATTTTTAATTATCTAAATTATTGTATACTTATGTTTCAGTCATTAACTTTACACCCCCTTTAATTTCAATTTTCGTGGAACATTATGAGAATTGCAATTACTCTTTCTTAAATTATTCTTTTATAAAATCAAGCTTTAGTCCTCTGTCACCTACAGAAGGAAAAGTTGAAAAGGATCATGTATTAGTCATTGTTAAGATAAAAAGCTGTATCACTAATTTGTATATAGTGTGTGCCTGAGAAAAGAAAGATGTTCAGTGTTTTCACGTAGTGGATAGGACCACAATTGGATCCAATGGACTCCTGGTATAGCCCACAGACCTAGTAATGGACAATGTGTCTTGGACTAAACTCTGTAATCATCAGCCCATACCACAATCACTATCATCAAAGCATAATGCTCATGCCTGCCGAAAAGGAAAAATACCTCTTTTTTGAAAAATATATTTCACCAAAACTAACGTGGAACTCAAACTCGGTGTTCTGAATAATAATAAGTATTAAAATTGGAATGATTGAAGATTTTAGAGATAAGTAATTGATGAGATTGAATCGGAGGAAGAAGAGTTTGACGTAACTGATTGGAATTCCCATGGACGCCCTAAAAGATGAACCCTAAAAAAATGGGTATGGAAAAATGATGGGAGGGAAGCAGAGAGCGGCAAGTGCAAATGAACAGTACTGAATTTATTAATTTAATTTGTTATTTTGTTTAAAAGAAGAAAGGTAAAGCAGGAGAAAGTGACAAAATCCCAGTAAAGCGTGACAGTGCCAGCTCCATTTGGCCTCTCAACCCAAAGTCTTGTGCTTTTCACATACCCATTTCCCCATTCGCCCCACTCCTCCTTTCTGCTTCCCCTTTCACCAAATGGGTCATCTCCATCTTCCATAACA


Gene Sequence:
>Vu_30515(+)
ATAACAACAAACCCACGTTTTCTCCTTTTCTCTCTCTTCTTCCTTTCGTGGGGTTTAACGTTTCACTCTACAACAACAGCAACAAGGAGAAGAAGAACAGGATTAGGATGTTTTCTAGGTTGATACATCCCCATGAAGGGGGTGTTGGGCAGGAAGACATGCAGGGTGCTTCCAATCACGCTCACCTCGGAGACCCTTGTCTTGTTCTCACCTCTGATCCCAAACCTCGTCTTCGGTGGACCGCTGACCTTCACGAACGCTTTGTTGACGCTGTCACTCAACTTGGGGGTGCCAGTAGTGAGTAATTTTTTCCCTTTCATATTTCATTCATGCTAATATGTCTGCTACTGTGTTTTTTTGGCGTGCTGTGGTGAAATTTGTTATTAATTTGTGTACTGTTGGCCTGGTACTGTTAGGAAATTGTTTATAGATGTTGGGATTCGTGCAGAGCTTTTATTTGTTGTTCATGGAGGCCAGTGTTAGGTAGCAGGGAAAGGAGGGGCCTTTCTTATCTGAGTTGTAGTGGTATATGTTGGAATTGCAGGTTTGGTTGCATTATATATGGGCTTATTCTCCTAATTATTAGTGTAGCATATTGTTGTGGCGTGAAAGAAAACTTTGCTGGAATTAGTGATTGTGTGTCTTGTACTGTGGCTTAATTATGCACTAGATATTGCTATCCCTCGAAAAAAAATGAAAAAATAAACAAAAATAATGTAACTGCCCAACATTAACCATCAGAGCAAACCTTAATATTTTGCTTATTTCCTAACAAGTTGAATATTGAATAATGTGATAAACTAGACAATATAATGTGTGTTTGGAAGCAGATATCACGTCAAAGGACCAAAGCAACAACTGGTAGGATCTATTGAGATGTGGCAAACCACATCAAATAGGCCTCGTAATGTGTTACCAAACACGCTAGTTGCATATAGAAGGACCTAAAATGATTACAATGTGGAATACTAGGTTTTAGTCACTAGAGTATAAAGCTTATTATAAGGCTCTTTTTGGTTGTGTCTTCAATTTCATTGCAGCCTGTTGATTTTCGTCACTGTAGTAGTTTGTTGCCTTCTATTTCTGTATGTTTTTCAGTAGGCATCCTTCCCACAAACTCATGCTGCGTGTTTTTTGTAATGCAATACAATTCTCAATAAAAATGGACTTTATCTAGGACCCAAAAATCATTAGCTAGCTTTTACTAGCACAATGCCACTATCCAGGAATGAGGGGAGGACAAAGCCTTCAGTAATTGATACATTAACCTAGGTTCTGATGTTGAAGATATGTTCTTCAAGTCAAGTGCACATTACTTTAGATTTTTTCTAAATATCATGGAGATTTAATCGTCTTCTTGTTTTTCTTGATTCATATTTACTTTTTTCTCAATCTGTAGTGGGGTTATTTATGACTTGTGAATATATTCTAGGAAATTCTGCTATATACATGAGTGATATCATCACTGCTATATTATTAAAATTATTATTTACAGAAGCCACTCCTAAAGCGATCATGAGAACCATGAATGTCAAGGGTTTGACGCTCTATCATTTAAAAAGTCATCTTCAGGTTCGTTTTGCTACAGTTGATTGCATAATAATTGGTGAAATTGAAACTTTATGATAATGTTCTGTTTTATACTATTGTTCATTGCATTGCAGAAGTACAGGCTTGGTAAGCAATCAGGAAAAGATTCTGATGAGGGTTGCAAAGATGGTAGGTTTATCTATCTTTATTTTTGAAAGTATGCCACATTTTTTTTTTCACTTTGATGTATCAATGTCTGTTTCAATGGATGGGTCACATTTTATCTTTGTTGCCCTGATCAAATAAAGGTTGATTCTGGAATTTACGTCTGTATAAAACAGGGTCAAAATCGTACACCAACAATAATGTTTATATTATAAGCTTTTGTATTGGTCTAAACTTGGTCTCATTTATTGAAAAACCCATGCAAGGGATGTCAGGTTCGTATCTTCAAGAAAGCCCCGGTACTGACAACTCATCTCCAAAGTTACCAACTTCGGATGCAAACGAGTAAGAATTCCATGGTATCTTGAAAAACAATTTATTCGTGTCCAGATGTATGAATGGTTGTTGATAAACAAATTGAGAGTTGAAATGTCACGTGTAGGGGTCATGAAGTGAAGGAGGCATTAAGAGCACAAATGGAAGTGCAAAGTAAACTACACTTACTAGTGGAGGTAAATTTCCTTCTCACAATGTAAGGTGCTTTATAGTTTTGGCACATTATTTGAGACTATATTGATTGGTGTTGGAGTTAGACTCGGTGCATGGTTCCAGGATGATGAGTTGATTGCTTGCTTTTATATTCATCTCCCTTATTTATGTGGACAGATATGAACTAAATAAATAATAACTGAAAATGTTTAATTCAGTGTTGTATTAAAAAAATAGTTGGTATATCTTATAAATGTACCCTAACACTTACTATTTTTAAGAACTATGGTATTGCAGGCTGAGAAGCACTTGCAAATTCGCCAGGATGCAGAGCGGAGGTACATGGGCATGCTCGAGCGAGCATGTAAGATGTTAGCCGATCAATTTATTGGGGACATAATTATGGACACAGATGGCCAAAAATTTCAAGGGCTGGAAAGTAAAACACCCAGAAGTTCCCTAGTTGATCACGTTGGGTTTTTCCCCCCAGTATGTTCTGAGGTAGGTGGAATGCATGTTTCAGAAGTACCACCTATTCTCCAGCCTCAAGGGGCTGACTGTTCCACTGAAAGTTGTCTGACATCACTTGAGAGTTTAGGAGGGTTGACGCTCGAAGGATCTCCCGGCGGATCGAAGAAGAGGATGCTGAGCTTGGATTCAATGGTAGCACCTTTGATCTGGAGTGAAGCCAACACCAGAACTCAAGGAATCCATTTAGCTCAAGTCAATCCTCCAGGAATAACTAGGTATGGTATGTAGAGTAGGGTTGGGAAGGTTAGTTCCTCATGAAGAGAGTTGAGGAAGTGCTTTGTTCCAAGCTTTTAGGATTAAGTAATGAATTAGATTCTTATCTGTTCTTGTCCATCAAGTTGGTGATAATCAACTTGCTCACATGTCATTGTGTAAATGGAAAATACCATGTGCCTTAACTTAGACCATCGCTAAAGGTTGGCGCTGACCATGTACGTTTCTCACTTCTTCCTTAGTGGCCTTCGTTATGTACGAAGAGTTACAGGATTTCATTGCCTTTAACTTTTTATTTTTCTAATTATTAACCATTACGAATTCTT