Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30485 LG8 37635764 37639155 PREDICTED: wall-associated receptor kinase 3-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 37635765 missense_variant&splice_region_variant p.Met619Ile
T/C 37635835 missense_variant p.Lys596Arg
T/A 37635836 stop_gained p.Lys596*
A/G 37635848 missense_variant p.Trp592Arg
T/A 37635860 stop_gained p.Lys588*
C/T 37635876 synonymous_variant p.Arg582Arg
C/T 37635877 missense_variant p.Arg582Gln
C/G 37635919 missense_variant p.Ser568Thr
T/G 37636352 upstream_gene_variant
T/C 37636355 upstream_gene_variant
A/G 37636472 upstream_gene_variant
A/G 37636505 upstream_gene_variant
G/T 37636540 missense_variant p.Pro520His
A/C,G 37636811 stop_lost p.Ter430Glyext*?
C/T,* 37636904 missense_variant p.Gly399Arg
T/C,* 37636915 missense_variant p.His395Arg
A/G 37636937 missense_variant p.Ser388Pro
C/T 37636949 missense_variant p.Glu384Lys
G/A 37636968 synonymous_variant p.Gly377Gly
G/A 37637025 upstream_gene_variant
A/G 37637087 upstream_gene_variant
T/C 37637146 synonymous_variant p.Arg357Arg
T/A 37637190 missense_variant p.Arg343Trp
G/C 37637245 missense_variant p.Asn324Lys
A/G 37637306 missense_variant p.Phe304Ser
A/C 37637311 missense_variant p.Asp302Glu
T/A 37637312 missense_variant p.Asp302Val
A/T 37637757 intron_variant
C/A 37637781 intron_variant
T/C 37637870 intron_variant
A/T 37637872 intron_variant
T/A 37637948 intron_variant
T/A 37638072 intron_variant
A/T 37638104 intron_variant
C/A 37638219 intron_variant
A/G 37638279 intron_variant
A/T 37638372 missense_variant p.Tyr262Asn
G/A 37638713 missense_variant p.Thr148Ile
G/A 37638921 missense_variant p.Leu79Phe
A/G 37638927 synonymous_variant p.Leu77Leu
G/A 37638963 missense_variant p.Pro65Ser
T/A 37638977 missense_variant p.Asn60Ile
A/T 37638981 missense_variant p.Cys59Ser
C/G 37639108 missense_variant p.Met16Ile

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30485.1
MAMNKILKLIQLILLMAVASKAVSQPSPDCPKSCGNLSIPYPFGTREGCYMNDTFLVTCNHDNSPTSIPLLGTNNILVLNISLEDGEVIVSSPVVRDCYGTKSKNSNDQNGLNLTHFSISPSRNKFTAVGCGTVGVFIGYDSSRKHVTTRGCVSMCDTLGEIRNGSCDGIGCCQIGVPDGVYGFAMKSWSISNNSTVRDGDFNPCNYAFTVAEGYYKFETTNLKSLENPRLPLVLDWAVGNQTCEEAQQHPSSYACKDKNSYCLDSTNGIGYRCKCNHGGNPYLYDGCHESLDKPKMKSNSEITLFGSDKDECALNSNPCIHKKTCKNAPGEGLKCSCPKGHEGDGLRNGQGCRPKRDKNTGNLILIIGLSLSLSLLAVVVGCLNIYPQFRERKLMKIRENYFKKNGGMLLQRQIDLVNGSTERATIFTAEELKKATDNYDDDRIIGKGGHGTVYKGILSNGSVVAIKKAMVSNQTEIGQFINEVVVLSQINHRNVVKLLGCCLETEFPLLVYEFITNGTLCEHLHFEEVANLAKRCLRLHGEERPSMKEVAMELEGIRIIEKHSLGGAKDVASQEETESFLGPRSHLSIDHGDGTSSSTISRFYDLHNQILEPLEDGR*


CDS Sequence:
>Vu_30485.1
ATGGCTATGAACAAAATCCTAAAGCTCATCCAACTTATTCTTCTGATGGCAGTAGCTTCAAAAGCAGTGTCTCAACCCTCTCCAGATTGCCCCAAAAGCTGTGGCAATCTAAGCATACCTTACCCTTTTGGGACACGCGAGGGCTGTTATATGAACGACACTTTCCTCGTCACTTGCAACCATGATAACTCCCCCACGTCCATTCCTCTATTGGGAACAAACAACATATTGGTGCTCAACATATCACTAGAAGATGGGGAAGTTATAGTTTCAAGTCCCGTAGTCCGTGATTGCTATGGCACCAAAAGCAAAAACTCAAACGACCAAAATGGTCTCAATTTGACCCACTTTTCAATCTCACCAAGCAGGAACAAATTCACAGCAGTTGGTTGTGGCACGGTTGGAGTATTCATCGGTTACGATAGCAGCAGAAAACATGTTACAACAAGAGGGTGTGTATCCATGTGCGACACGCTTGGTGAAATCAGAAACGGATCATGCGATGGCATTGGTTGTTGCCAAATCGGTGTTCCCGATGGAGTGTATGGTTTTGCAATGAAAAGTTGGAGTATAAGCAACAACTCCACCGTACGTGACGGTGACTTCAATCCTTGTAACTATGCGTTTACGGTTGCGGAAGGCTATTACAAGTTCGAGACAACAAATCTTAAGAGCCTCGAGAATCCGAGGTTGCCCTTGGTGCTTGATTGGGCTGTGGGAAATCAAACGTGCGAAGAGGCGCAACAACATCCTAGTAGCTATGCGTGCAAGGATAAGAACAGTTATTGCCTCGATTCAACGAATGGGATTGGTTATCGTTGCAAATGCAATCATGGTGGAAACCCTTACCTCTACGATGGTTGCCATGAAAGCCTAGATAAACCAAAAATGAAATCGAATAGTGAGATCACTTTGTTTGGGTCAGATAAGGATGAATGCGCTTTGAACAGCAATCCATGCATCCACAAGAAAACCTGCAAAAACGCCCCTGGAGAAGGTTTGAAGTGCTCATGTCCAAAGGGCCACGAAGGAGATGGATTGAGAAATGGCCAAGGCTGCAGACCCAAAAGAGACAAAAACACAGGGAATCTTATTCTTATAATTGGATTGAGTTTGAGCTTAAGTCTATTGGCAGTGGTTGTGGGATGCCTGAACATATACCCTCAATTCCGTGAAAGAAAGCTCATGAAAATCAGGGAGAACTATTTTAAGAAAAATGGTGGCATGTTATTGCAAAGGCAGATTGATCTGGTCAATGGCTCAACCGAAAGAGCCACAATTTTCACTGCTGAGGAGCTCAAGAAAGCCACCGACAACTACGATGATGATAGAATCATAGGCAAAGGAGGACATGGAACGGTGTACAAAGGTATATTATCAAATGGCAGTGTTGTTGCCATCAAGAAGGCCATGGTTTCCAACCAAACCGAGATTGGCCAATTCATCAACGAAGTGGTCGTGCTTTCCCAAATCAACCATAGGAATGTCGTCAAACTACTAGGTTGCTGTCTGGAGACTGAGTTTCCTTTGCTTGTTTATGAGTTCATCACCAACGGTACCCTTTGTGAGCATCTACATTTTGAAGAAGTTGCTAATCTAGCCAAAAGGTGTCTTAGGTTGCATGGAGAAGAAAGACCAAGCATGAAAGAAGTTGCTATGGAGTTGGAGGGAATAAGGATCATTGAAAAACATTCACTGGGAGGAGCAAAAGATGTTGCATCTCAGGAAGAGACAGAGAGCTTTCTCGGACCACGTTCTCATTTAAGTATTGATCATGGTGATGGTACAAGTAGCAGTACAATTTCTAGGTTCTATGATTTGCATAACCAGATTTTGGAACCACTTGAAGATGGACGATGA


Promoter Sequence:
>Vu_30485::LG8:37639155-37641155(-)
TAGTAACATTAATCAGGGAAAAATGTTTTTAAGAAAGAAAAAGATTGACTTTATAAAATTAAAGTTAGTTTGCAAAAAAGAGTGAGAAAGACTACGATATTGCAGGAAAAACAGAGGAGAGAGAAGAAATGAGATTTCATAGCCACGTCAGCACGAGTTAACTTCCATATGTCAATTTAAGGGAAGGGACTGTGATTCATACATTTTTTTACAACTTCGGAATCCAATGTATGTACTTTTAAAACCGTGATTCATACATTTTTTTACAACTTTGGGACCCAATGTATGTACTTTTAAAACCTGGTATCAAAACTGGAAAAAAAAATCATAGGGACCAAGTAAGCAATTAAGTCTTTATAATATTATAGTCTTGAATAGATAAATTTATAATATTTTTCTCTATTGAAACATTTTTCTATCCTCGTCTACAATATAATAAAAAAAATTAACTAATAAAATTGAAACACAAAATAATAAATAATTAAATTAAATTAGGTGAATTGGTGAGTCAATCCGACTCATCACGGGTTCAACCCGGATGAGCGGGATTGAAAACTAACCCGCATAAAAAAATTACATTTTTTAAAACTCAACTCGACTTAAATCCGTAGTGGGTCGGGTTGACTCGTGAGTTACAACCCATTAACACTATAAAATTTAATGAATTTCCTTTATTCAATCTTAGAAGAAACACACACAAACATACATAAGTAATCATTTAAAAAAATAATTTAATTGTTTTAGTAAATTTTAGTTCGATCAATGTTATCTTCATATTTTAGTCTAATAAATTTATTTTAACAGAAAAGGAAAAAAAAGTAAATTTATGTTAAATTGATAATTTGTTTTTTTTTAAAGATTATTATTATTTGAGTTCATATGTATAAGTCAATTTATTTTGAATTTTTAATAAATATTGTTTACTTACGCCTCTTATTAGATATGAAATCATAACTTAAGATATTAAAGATCATACACCGATAAGAGATAATAAGATAAATTTATACTATAGAAATATGGGTGTAAATTTTTTTAAATTGGTTTTCTAATATTAGAGTTAGGTTTAAAATTTATTTTCTATATAGAATAAAAATCATTCAAATATTTTAGTGAGACGTGTTCTTTGATGGATCTAAAATATTTAATTTTACACTCAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGACGTAAAAAAGTGTATTAGAAATTACATGAATAATAAGACAAATTAAAATATATTTTTTAAAATGAAATCCTATTTTAATCCTAAAAAATGACTAACATATACCGCTTAATTATACTAAAATAAGTAAAAATAAAGTTCATATTATTACTATTAAGCTCAAACGAGCAATTAACTCCAAGAAAAATGATTCATAGACCTTAAAAAGGTCATTGACACTTAATATATACTTGGAAAAATAATAAAAATCATAGATTTATAGGTCATTGATGTAATAAAAAAAAGAGATAAAAAGAAAAATCATATACAGAATATGTGTAGATAAAATTAAGGTATACATATACCATTTCTCTGGCTCTAATTAAAAAGTTATAGTTGTAGAATCATTTATGAGGGTTGACCAGTCACAACTTTCATTTAACCCAACTTAAACCAAAAGCTATACCAGGGTTTGCATATTGTATGTCATACTTAACCACACCACAGCACACTACACCATACACACAACACTCTCAGAAAGCAAGGGAAGCCAACTTACTTCATCACCTACTTCTCCTCGCATTCGTTTGTGGTACACCATCGTATTTCATTCTTACCTACCTTAAAACAAAACTTGGTTGCTTTGCTGCTTCAAACAAAACATTAACTGAATATTCCACACTCCAAAAAGCCTCAGTTTCAATCTTGTTACTCCAAAACTCTTGTCTTTTTTTTCAACCTTCTTGAGATTTTGTAGGTAATATCCAGACTCATATAAGCTCTACAAGGGATCTTTGGTGAAGCC


Gene Sequence:
>Vu_30485(-)
ATGGCTATGAACAAAATCCTAAAGCTCATCCAACTTATTCTTCTGATGGCAGTAGCTTCAAAAGCAGTGTCTCAACCCTCTCCAGATTGCCCCAAAAGCTGTGGCAATCTAAGCATACCTTACCCTTTTGGGACACGCGAGGGCTGTTATATGAACGACACTTTCCTCGTCACTTGCAACCATGATAACTCCCCCACGTCCATTCCTCTATTGGGAACAAACAACATATTGGTGCTCAACATATCACTAGAAGATGGGGAAGTTATAGTTTCAAGTCCCGTAGTCCGTGATTGCTATGGCACCAAAAGCAAAAACTCAAACGACCAAAATGGTCTCAATTTGACCCACTTTTCAATCTCACCAAGCAGGAACAAATTCACAGCAGTTGGTTGTGGCACGGTTGGAGTATTCATCGGTTACGATAGCAGCAGAAAACATGTTACAACAAGAGGGTGTGTATCCATGTGCGACACGCTTGGTGAAATCAGAAACGGATCATGCGATGGCATTGGTTGTTGCCAAATCGGTGTTCCCGATGGAGTGTATGGTTTTGCAATGAAAAGTTGGAGTATAAGCAACAACTCCACCGTACGTGACGGTGACTTCAATCCTTGTAACTATGCGTTTACGGTTGCGGAAGGCTATTACAAGTTCGAGACAACAAATCTTAAGAGCCTCGAGAATCCGAGGTTGCCCTTGGTGCTTGATTGGGCTGTGGGAAATCAAACGTGCGAAGAGGCGCAACAACATCCTAGTAGCTATGCGTGCAAGGATAAGAACAGTTATTGCCTCGATTCAACGAATGGGATTGGTTATCGTTGCAAATGCAATCATGGTGGAAACCCTTACCTCTACGATGGTTGCCATGGTAATTTCTAATTTTTGGATTAGTATTTTACTTTCTAATATCTCATTTTTAGTAGATTAATTCGTTTAGTTATCCTTAAGTAACTGGATTCTTCTATGAAAAGTATATTTATGTCAAAAGAATTTAACTTTTTTATATACTAGTGATTCTTTTTATACTATTAATTAAAGGTGGTGGGTTAATTTTGCGAAAGGAAGTGAATTTAAGTAGGCAAAAATGCATGTGTTTTATTTAAAATTAAGGGCAATTTTTTTTAGAATAAATACTTTGTTTAATAAGTTGACCTTAGTTGACTAGGTTACCTCGTAAATTCATGTTGGGTTAGTTAACGTGTAAGCTATATCAACTTGCTTGAGAGTCACTTGCCAGTTTGAATGCATGAACAAGACTAAATTGTCATCAATCAATCAATCACTGATGCATTTAATATTTGTCTGATATGTGTATGGCCTGATGAACTAATTGGATCTTAAATTTGATCACAATCAAAAAGGCTTATGGTGGTTGGATGGAAAGGGAAAAAAATGGACTGGAAAAGATAAGACTATGAAGGAAAAGATAAGACTATGACCCATCTCTTGCTAGTATACGTAACTTGAGAGATTGAAAGCTGAATAGATATATTTTTTTTGAAGTCCATGTTTTAACGAATTTTATTAATTTAAACATATTGATAATGTATTATTTCCATTTTTATATAATTTTTAAACTAATAGATAAAATAAAAATACGATGGCATTCTTGTACTTAAAGACGAAAATAAAAGAAACGTTTCTAGATTTTCCTTTACTCGTTCTATTCCATGTACAAGTCTTTATCATAACTTAGTAAAGAAAACACGTTTTTTATCTTGATGCTTCATTTTGGCGAATGATTAGTCCTATTTTAACGTTGCTCTGTGATCTTCTTTGCATTCCTTGCTATATATATGATATAGAAAGCCTAGATAAACCAAAAATGAAATCGAATAGTGAGATCACTTTGTTTGGGTCAGATAAGGATGAATGCGCTTTGAACAGCAATCCATGCATCCACAAGAAAACCTGCAAAAACGCCCCTGGAGAAGGTTTGAAGTGCTCATGTCCAAAGGGCCACGAAGGAGATGGATTGAGAAATGGCCAAGGCTGCAGACCCAAAAGAGACAAAAACACAGGGAATCTTATTCTTATAATTGGATTGAGTAAGTAAAAAACATGTACATTCGTTCACACACAATGTTTCTTACTCTCTAGTTTATATTGTTGGAAGTCAAATTACGTAGCCGAAAACAAAGGATGTAATGTAACTGTTGTTCACAGGTTTGAGCTTAAGTCTATTGGCAGTGGTTGTGGGATGCCTGAACATATACCCTCAATTCCGTGAAAGAAAGCTCATGAAAATCAGGGAGAACTATTTTAAGAAAAATGGTGGCATGTTATTGCAAAGGCAGATTGATCTGGTCAATGGCTCAACCGAAAGAGCCACAATTTTCACTGCTGAGGAGCTCAAGAAAGCCACCGACAACTACGATGATGATAGAATCATAGGCAAAGGAGGACATGGAACGGTGTACAAAGGTATATTATCAAATGGCAGTGTTGTTGCCATCAAGAAGGCCATGGTTTCCAACCAAACCGAGATTGGCCAATTCATCAACGAAGTGGTCGTGCTTTCCCAAATCAACCATAGGAATGTCGTCAAACTACTAGGTTGCTGTCTGGAGACTGAGTTTCCTTTGCTTGTTTATGAGTTCATCACCAACGGTACCCTTTGTGAGCATCTACATTTTGAAGGTGAGGCATGTGGTGATAAACACAAACTTTCATGGACAACACGTTTGAGAATTGCAGCAGAGACAGCAGAATCTCTTGCATACTTGCATTCTTCTGTTTCCACACCCATCATACATAGAGATGTTAAAACAGCAAATATTCTTCTAGATGACAACCTCACAGCAAAAGTTTCTGACTTTGGTGCTTCAAAGCTTGTTCCTCTTGATCAAACTCAGTTAACAACGTTGGTGCAAGGAACCATGGGTTACCTTGATCCTGAGTACTTCCAAACAAGCCAACTAACCGAGAAGAGTGATGTTTACAGCTTTGGTGTTGTTCTTGCAGAACTATTGACAAGTAAGAAGGCACTTTCGTTCCTTAGGCCTCAGAGTCATAGGAATTTGTCCATGTATTTTGTTTCTGCAATGAATGAGGGTCGGTTGGATCAAATATTGGACAAGGAAATCGTGAGTGATGCAAGTGTTGAGTATGTGATAGAAGTTGCTAATCTAGCCAAAAGGTGTCTTAGGTTGCATGGAGAAGAAAGACCAAGCATGAAAGAAGTTGCTATGGAGTTGGAGGGAATAAGGATCATTGAAAAACATTCACTGGGAGGAGCAAAAGATGTTGCATCTCAGGAAGAGACAGAGAGCTTTCTCGGACCACGTTCTCATTTAAGTATTGATCATGGTGATGGTACAAGTAGCAGTACAATTTCTAGGTTCTATGATTTGCATAACCAGATTTTGGAACCACTTGAAGATGGACGATGA