Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30481 LG8 37612370 37615246 probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g35710
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 37612483 synonymous_variant p.Cys38Cys
T/A 37612569 missense_variant p.Leu67His
C/T 37612570 synonymous_variant p.Leu67Leu
C/A 37612722 missense_variant p.Pro118Gln
C/T 37612725 missense_variant p.Ser119Leu
A/G 37612743 missense_variant p.Asp125Gly
G/A 37612913 missense_variant p.Val182Met
A/T 37612967 missense_variant p.Arg200Trp
C/A 37612973 missense_variant p.Pro202Thr
C/T 37613077 synonymous_variant p.Phe236Phe
C/T 37613281 synonymous_variant p.Thr304Thr
A/C 37613520 upstream_gene_variant
T/G 37613870 missense_variant p.Cys402Gly
G/A 37613909 missense_variant p.Glu415Lys
A/T 37613939 missense_variant p.Thr425Ser
A/T 37613960 missense_variant p.Asn432Tyr
G/A 37613972 missense_variant p.Gly436Ser
A/T 37613987 missense_variant p.Asn441Tyr
A/C 37613988 missense_variant p.Asn441Thr
A/T 37613990 missense_variant p.Ile442Phe
T/A 37613992 synonymous_variant p.Ile442Ile
A/T 37614002 missense_variant p.Met446Leu
G/A 37614004 missense_variant p.Met446Ile
C/A 37614008 missense_variant p.Gln448Lys
T/G 37614028 synonymous_variant p.Leu454Leu
A/G 37614050 missense_variant p.Ser462Gly
A/C 37614055 synonymous_variant p.Ile463Ile
T/A 37614058 synonymous_variant p.Pro464Pro
T/A 37614072 stop_gained p.Leu469*
G/T 37614080 missense_variant p.Asp472Tyr
A/T 37614118 synonymous_variant p.Ser484Ser
A/G 37614141 missense_variant p.Glu492Gly
C/T 37614146 missense_variant p.His494Tyr
A/T 37614150 missense_variant p.Lys495Met
G/A 37614236 missense_variant p.Val524Ile
A/G 37614258 missense_variant p.Asn531Ser
C/T 37614302 synonymous_variant p.Leu546Leu
T/C 37614606 missense_variant p.Leu647Ser
G/A 37614982 synonymous_variant p.Lys772Lys
G/T 37615027 missense_variant p.Glu787Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30481.1
MAAIEPNSAAKDNSFECIEMERKALLKFKESLSDPFHCLSSWVGSDCCKWVGVRCNKHAGNVIRLNLRGTEICSKATNESATHTKWPLSGELNASLLDLKHLNYLDLSHNDFENVQVPSFLGSLDKLWYLNLSRSSFAGKVPSQLGNLSNLQYLSLSTPSSSLWSSDLSWLSGLTSLQYLDVSGVNLSRASSSWLQSINRVPSLSFLRLSDCKLSALPQTLPFLNLTSLLVLDLSFNSVDSLIPGWLSNISTLIELELDGAGLKGPITEVSWGNFRKLHSLDLSSNLEIVGDVEGLVEALTICTNSSIEKLDLSFNKLTGNLPTSLGYLKNLRTIMLKGNKLSGSIPSSIGNLSYLTFLGLSHNMMNGTIAPNIGQLTELITTMDLSYNQLKGSLPKSLHFCDFAYVSLGFNALEGSIPVWSGVTFLYLSNNFLSGSIPSNIGQGMSQLEGLDLSGNFITGSIPSSMSLLSDLTLLDLSNNSLSGKIPLYGEGHKLSLYTIDLSGNNLSGGIPAWMCTTPSLRVVQLSNNNLSGEISSVLPNCPHLYTIDLGDNAFFGSITKWLGNNRTWINELRLQGNALTGNIPESLCQLPYLHLLDLSHNNLSGHIPPCLGNMTGFKAPSDYYIGRDNSVVYYEHMDLYVKGRLIEYTSQMHVINLIDLSCNHLSGEIPHSLTELSYLVSLNLSWNQLTGGISTNIGALHQLESLDLSNNNLSGPIPPNMASLTFLGHLNLSYNNLSGEIPTTNQFHTLIDPSIYEGNPHLCGTPLSVKCSEHVDESTTANDTEEDQDSSHNKLWLYLSIGLGYIVGFWAVCGSLVLKKSWRHAYFQFVDSMKDWILLVTIVNWIRIKRKLNLEKD*


CDS Sequence:
>Vu_30481.1
ATGGCAGCTATAGAGCCAAATTCTGCTGCTAAGGATAATAGTTTTGAGTGCATTGAGATGGAAAGAAAAGCCCTTCTTAAGTTTAAAGAAAGTCTAAGTGATCCTTTTCATTGTCTATCTTCATGGGTTGGCAGTGATTGCTGCAAATGGGTGGGTGTAAGATGCAACAAACATGCAGGGAATGTGATAAGGCTAAACCTCAGAGGCACAGAAATCTGTTCCAAGGCTACAAATGAGTCAGCCACACACACCAAATGGCCTTTGAGTGGTGAGTTGAATGCTTCTCTGCTTGACTTGAAACATTTGAACTATTTGGACTTAAGTCACAATGATTTTGAGAATGTTCAAGTCCCATCATTTTTAGGTTCACTTGATAAGTTGTGGTATCTCAATTTATCCCGTTCATCCTTTGCTGGAAAGGTTCCTTCTCAGCTAGGAAACTTGTCTAATTTGCAGTATCTTTCTTTGTCAACGCCTTCCTCTTCATTGTGGTCTTCTGATTTGAGTTGGTTGTCTGGTCTTACATCTCTCCAATATCTAGATGTGAGTGGTGTGAATCTCAGTAGAGCATCAAGTTCATGGCTCCAATCTATCAATAGGGTTCCATCTCTTTCATTTTTGAGGTTATCTGATTGTAAACTTTCTGCTTTACCTCAAACTCTTCCATTTTTAAACCTTACATCACTTTTAGTTCTTGATCTTTCTTTCAATTCGGTTGATTCCTTGATACCAGGATGGCTGTCCAATATCAGTACCTTGATAGAACTTGAATTAGACGGTGCAGGACTTAAAGGTCCCATCACTGAGGTTTCATGGGGAAATTTTCGCAAGTTACATAGTTTAGACTTGTCATCAAACCTTGAGATTGTTGGTGATGTTGAAGGACTTGTGGAGGCTTTAACAATATGTACCAACAGTAGCATAGAGAAACTAGATTTGTCCTTCAATAAACTTACAGGGAATTTACCAACCTCATTGGGTTACCTTAAAAATTTGAGAACCATTATGTTAAAGGGTAACAAATTGTCTGGTTCAATTCCTTCATCCATTGGAAATTTGTCATATTTGACATTTCTTGGCCTTTCTCACAACATGATGAATGGGACTATTGCACCTAACATAGGTCAGCTCACTGAACTGATCACTACTATGGACCTCTCCTACAACCAATTGAAGGGAAGCCTTCCAAAGTCCTTACACTTTTGTGATTTTGCATATGTTAGTTTGGGGTTTAATGCCTTGGAAGGGTCAATTCCAGTTTGGTCTGGTGTGACTTTTCTTTATCTAAGCAACAACTTTCTCTCTGGCTCAATTCCTTCAAATATTGGCCAAGGCATGTCACAGTTGGAAGGTTTGGATCTTTCAGGGAACTTTATAACTGGCAGCATACCTTCATCCATGAGTTTGCTAAGTGATTTGACTTTACTTGATCTTTCAAACAACAGTTTATCAGGGAAAATACCTTTATATGGAGAGGGACACAAGCTAAGCCTTTATACCATTGATCTATCAGGCAACAATCTATCAGGAGGAATCCCTGCTTGGATGTGCACAACACCTTCACTTAGGGTAGTTCAACTAAGCAACAATAATCTTTCTGGGGAGATTTCATCTGTGTTGCCAAATTGCCCCCATCTGTACACAATAGATCTTGGAGATAATGCATTTTTTGGATCCATAACAAAGTGGCTCGGGAATAACAGAACTTGGATAAATGAGCTAAGACTACAAGGCAATGCACTCACTGGAAACATCCCTGAAAGTTTGTGCCAGCTACCATACCTTCATCTTCTTGATCTTTCACACAATAACTTATCAGGCCATATCCCTCCATGCTTAGGCAACATGACAGGTTTCAAAGCACCGAGTGATTATTATATTGGCCGAGATAATTCTGTAGTGTACTATGAGCACATGGATTTGTATGTGAAAGGAAGATTAATCGAATACACATCACAGATGCATGTTATAAATCTTATTGATCTTTCCTGCAACCATCTATCTGGGGAGATCCCACACTCACTGACAGAACTCTCATACTTAGTTTCCTTGAACCTGTCTTGGAACCAATTAACTGGAGGCATTTCAACAAACATTGGAGCGCTACATCAATTGGAAAGCCTTGACCTTTCCAACAACAATCTCTCAGGTCCAATACCTCCAAATATGGCTTCCTTGACTTTCTTGGGACATTTGAACTTGTCCTATAACAACTTGTCTGGTGAAATACCAACAACAAATCAGTTCCATACTTTGATAGATCCCTCCATCTATGAGGGCAATCCACACCTTTGTGGGACACCTCTGTCTGTTAAGTGCTCAGAGCATGTTGATGAAAGCACCACAGCTAATGACACAGAGGAAGATCAAGACAGTTCCCATAATAAACTATGGTTATATTTGAGCATAGGACTTGGCTACATCGTCGGTTTTTGGGCTGTTTGTGGCAGCTTAGTATTGAAGAAATCTTGGAGACATGCCTATTTTCAGTTTGTTGATTCCATGAAGGATTGGATTTTGCTTGTTACAATTGTGAATTGGATTAGAATTAAAAGAAAACTGAACCTAGAAAAAGATTGA


Promoter Sequence:
>Vu_30481::LG8:37610370-37612370(+)
AGATTAAATTTGTGTTATATATTTTGTGTGGTCCCTATTTCATTAATGAGTTTATATATAGGTAAAAAGAGAAAATTAAAGTTTAGGACTAAAATATAAGATAAAACTGATAAGTTGTCTTAGGGGAAAGAAATATATGATATTGTGAAATTAGAGATAACGAAATATTAATTCGTTGAAGAAAAATACAACGAGGCTTTAGGAACAGATGTAACTGAAATTGCCTAAAAGCATCAATATCACAACACATTAATTTTCATGTTTAATAGGTTTCAGTGCTACCTACTTGAAGTACGAGTTTCAGCAACACCGGTTGGATAGCAGAAACAAAATAATTAAGTTAAACCTAATCAGCACGGTGATCAGCTAAACTTGATCAAGAATTTTAATTCTTTCTTCTTCAACAATGGCATCAACCAAGACGAAGGAGGAGGAGAACCGAAGGTTGAGAAATCAATCCAAATATGCGGAAGACCTCTGTGATAGATTGGTTCATGCAGAATAAGAAGCCGAAGAAGCTGATAAATCAATCTTTCCATTAAATCACTCCCGAGTTACAGAAGGGAAAGAAGCGGGAAAGACGAAAATACTTACGTTGTAAAAATACGTTAGAACTCGTGAATCAATTCCGTCTGTAATGAATTTGAATTCAACTGAGTTAAAAGAGATTCAAAATTTTCGACGTACTAAGAATTTGATTCACTGAACTAACACACAAATCTACCTAATTTTGCTTTTTTATGTTAGATTTTGGATTGCATTTGAAATTTATTATGATTTTGAATTATAGTATATTTTTTTGAATTGATTCTAAAATTTAACATCATTTTAAACTAAAATTTATTTAAATCTAAATTAAAAAAAATTGTTATTTTTATAAAATTAAAAAAAAAACTTATAATTAAGTTAGTCTAACTTGTTTAACTCATAAATATGTGATAAATTAAATTGGTTTCAAATTTTTTTAATTTATTAATAAATAAATTAAATTAGATTTACTCAGTAGAAAACTAAACCGGATTGAATGACAATTTTGATAACATTAGTATCACAGTGGTGTAATGAAACTTAGGTAAACTAGTCATTTGGACAAAGAAGTTAAAATGATGAAAAAACCATTATTTGAGACAAGTGTCAACCAATGAGATTGGGTCAGTAAGGTAAATTACTTAGTGAGGAATTTTCTTAGATGTAGATTGATTACATTCAACAAAATTTGATTCCAGAACTTCGTTTAATTTACTCAAATTTCCATTTCTTTCCACAACGTATGATGAAAACAAACAAAAGTTCAAAATTTTAATCTGTTCATGCCTCTTTAGGAAATGTTAAAAAGTGAATTCTTCAAGATATTGCTGTGTAACATTGACCTGTTCTCAAAGGAATAAAATTTTAAAGTAGTTTTCCGAATCAAATTAACTTTCTCCTGAGTGAACAAAACACGGATTGCTGTACTTTAGTAGTCACGAGACGACATCATGTTTTCTTGTCACAGTGCAAGTAGTTTCTTCTAACTTTCCATTCCACTCCACTAACATAATTTATCAAATACACGCCTATATGCCTACACGCCTACCCTTAAATAGATAAAGCAAAATTTTCTATTAATGCTAATTTTCAGAGACGTAACTCTCACTCTAAAAAAAATAGTTAAGTCAATTATAAAGAGACTAATTAATTGTACAAAATTGTTTGCACTTGGAATTCTACCACCGTCTACAGAACAAAAAAATTAGTATCAATGTTAGTAATACCTGGCAGATAGACTAAGAGCAAATTAATAGTTTGATAAACAATCAGTACATGTTAAGTGGAAATTTCGTACTGTTAGTAAGTGTATGAGAAATGAAAATGTAATTAGAGGGTTGAATTCAACACACTTATGGCTATAAAAAGGTGCTCAAGATAACACAGTTTTATATTCAATGTCATGGAGAAAAATCAAGCCATGTTTCCAGTTTCTATCATTCTTTTTTCACTCTTGCTTCAATCACTTGTTA


Gene Sequence:
>Vu_30481(+)
ATGGCAGCTATAGAGCCAAATTCTGCTGCTAAGGATAATAGTTTTGAGTGCATTGAGATGGAAAGAAAAGCCCTTCTTAAGTTTAAAGAAAGTCTAAGTGATCCTTTTCATTGTCTATCTTCATGGGTTGGCAGTGATTGCTGCAAATGGGTGGGTGTAAGATGCAACAAACATGCAGGGAATGTGATAAGGCTAAACCTCAGAGGCACAGAAATCTGTTCCAAGGCTACAAATGAGTCAGCCACACACACCAAATGGCCTTTGAGTGGTGAGTTGAATGCTTCTCTGCTTGACTTGAAACATTTGAACTATTTGGACTTAAGTCACAATGATTTTGAGAATGTTCAAGTCCCATCATTTTTAGGTTCACTTGATAAGTTGTGGTATCTCAATTTATCCCGTTCATCCTTTGCTGGAAAGGTTCCTTCTCAGCTAGGAAACTTGTCTAATTTGCAGTATCTTTCTTTGTCAACGCCTTCCTCTTCATTGTGGTCTTCTGATTTGAGTTGGTTGTCTGGTCTTACATCTCTCCAATATCTAGATGTGAGTGGTGTGAATCTCAGTAGAGCATCAAGTTCATGGCTCCAATCTATCAATAGGGTTCCATCTCTTTCATTTTTGAGGTTATCTGATTGTAAACTTTCTGCTTTACCTCAAACTCTTCCATTTTTAAACCTTACATCACTTTTAGTTCTTGATCTTTCTTTCAATTCGGTTGATTCCTTGATACCAGGATGGCTGTCCAATATCAGTACCTTGATAGAACTTGAATTAGACGGTGCAGGACTTAAAGGTCCCATCACTGAGGTTTCATGGGGAAATTTTCGCAAGTTACATAGTTTAGACTTGTCATCAAACCTTGAGATTGTTGGTGATGTTGAAGGACTTGTGGAGGCTTTAACAATATGTACCAACAGTAGCATAGAGAAACTAGATTTGTCCTTCAATAAACTTACAGGGAATTTACCAACCTCATTGGGTTACCTTAAAAATTTGAGAACCATTATGTTAAAGGGTAACAAATTGTCTGGTTCAATTCCTTCATCCATTGGAAATTTGTCATATTTGACATTTCTTGGCCTTTCTCACAACATGATGAATGGGACTATTGCACCTAACATAGGTCAGCTCACTGAACTGGTGACACTGAACCTTGATGGGAATTTTTGGGAAGGCTTTCTAACTGAAAACCATTTCCATAACCTCACAAAGTTGTCCACATTTTCTGTGTCCTCCAAAAGGGGGTCTTTAACTTTCAACATCCCACAAAACTGGGCTCCATCTTTTAATGTAGTGTATCTGAAAATTCATGACTGTCAATTAGGCCCTGAGTTTCCTGCATGGCTCAAAACTCAAAGCAACCTAATGACCATTGTTCTCAAAAGCACTGGAATATCAGATAGAGTGCCAAATTGGTTTTGGGATTTCTCACCACAGATCACTACTATGGACCTCTCCTACAACCAATTGAAGGGAAGCCTTCCAAAGTCCTTACACTTTTGTGATTTTGCATATGTTAGTTTGGGGTTTAATGCCTTGGAAGGGTCAATTCCAGTTTGGTCTGGTGTGACTTTTCTTTATCTAAGCAACAACTTTCTCTCTGGCTCAATTCCTTCAAATATTGGCCAAGGCATGTCACAGTTGGAAGGTTTGGATCTTTCAGGGAACTTTATAACTGGCAGCATACCTTCATCCATGAGTTTGCTAAGTGATTTGACTTTACTTGATCTTTCAAACAACAGTTTATCAGGGAAAATACCTTTATATGGAGAGGGACACAAGCTAAGCCTTTATACCATTGATCTATCAGGCAACAATCTATCAGGAGGAATCCCTGCTTGGATGTGCACAACACCTTCACTTAGGGTAGTTCAACTAAGCAACAATAATCTTTCTGGGGAGATTTCATCTGTGTTGCCAAATTGCCCCCATCTGTACACAATAGATCTTGGAGATAATGCATTTTTTGGATCCATAACAAAGTGGCTCGGGAATAACAGAACTTGGATAAATGAGCTAAGACTACAAGGCAATGCACTCACTGGAAACATCCCTGAAAGTTTGTGCCAGCTACCATACCTTCATCTTCTTGATCTTTCACACAATAACTTATCAGGCCATATCCCTCCATGCTTAGGCAACATGACAGGTTTCAAAGCACCGAGTGATTATTATATTGGCCGAGATAATTCTGTAGTGTACTATGAGCACATGGATTTGTATGTGAAAGGAAGATTAATCGAATACACATCACAGATGCATGTTATAAATCTTATTGATCTTTCCTGCAACCATCTATCTGGGGAGATCCCACACTCACTGACAGAACTCTCATACTTAGTTTCCTTGAACCTGTCTTGGAACCAATTAACTGGAGGCATTTCAACAAACATTGGAGCGCTACATCAATTGGAAAGCCTTGACCTTTCCAACAACAATCTCTCAGGTCCAATACCTCCAAATATGGCTTCCTTGACTTTCTTGGGACATTTGAACTTGTCCTATAACAACTTGTCTGGTGAAATACCAACAACAAATCAGTTCCATACTTTGATAGATCCCTCCATCTATGAGGGCAATCCACACCTTTGTGGGACACCTCTGTCTGTTAAGTGCTCAGAGCATGTTGATGAAAGCACCACAGCTAATGACACAGAGGAAGATCAAGACAGTTCCCATAATAAACTATGGTTATATTTGAGCATAGGACTTGGCTACATCGTCGGTTTTTGGGCTGTTTGTGGCAGCTTAGTATTGAAGAAATCTTGGAGACATGCCTATTTTCAGTTTGTTGATTCCATGAAGGATTGGATTTTGCTTGTTACAATTGTGAATTGGATTAGAATTAAAAGAAAACTGAACCTAGAAAAAGATTGA