Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30335 LG8 36089198 36091521 PREDICTED: myb-related protein Myb4-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 36089624 downstream_gene_variant
G/T 36089803 stop_gained p.Glu75*
T/A 36089905 downstream_gene_variant
T/A 36090329 downstream_gene_variant
A/G 36090330 downstream_gene_variant
G/A 36090436 downstream_gene_variant
G/A 36090437 downstream_gene_variant
C/T 36091427 3_prime_UTR_variant
T/C 36091431 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30335.1
MVRAPCCEKMGLKKGPWAPEEDQILTSYIQKHGHGNWRALPKQAGLLRCGKSCRLRWINYLKPDIKRGNFTSEEEETIIKLHEMLGNRWSAIAAKLPGRTDNEIKNVWHTNLKKRLLNSNSRRVTKPKIKRSDSNSSIITESEAANFNFREMDSTSACTTSSDFSSVTVGESKNIKCEDIESLETMPVIDESFWSEPAIDEAPSMSSQSMTISNQMPFQYPFTNYEETFPQSHAYDSNFDDGMDFWYDIFTRTADSTELPEF*


CDS Sequence:
>Vu_30335.1
ATGGTCCGAGCTCCTTGTTGTGAAAAGATGGGATTGAAGAAGGGTCCTTGGGCTCCCGAGGAAGATCAAATCCTCACTTCTTACATCCAAAAACATGGCCATGGCAATTGGCGTGCCCTCCCAAAACAAGCAGGCCTGTTAAGATGTGGAAAAAGTTGCAGACTGCGATGGATTAACTATTTGAAGCCTGATATCAAGAGAGGGAATTTCACATCTGAAGAAGAAGAAACTATCATTAAGCTGCATGAGATGCTGGGTAACAGGTGGTCGGCAATTGCAGCAAAATTGCCCGGAAGAACTGACAACGAAATAAAAAATGTGTGGCACACCAATTTGAAGAAGAGGTTGCTGAATTCAAATTCCAGAAGAGTCACAAAGCCAAAAATCAAACGTTCTGATTCCAATTCCAGCATCATAACTGAATCAGAAGCTGCCAATTTTAATTTCAGAGAAATGGATTCAACATCTGCATGCACCACTTCTAGTGATTTTTCATCGGTCACAGTTGGTGAAAGCAAAAATATCAAGTGTGAAGACATAGAGTCTCTAGAGACAATGCCCGTGATTGACGAGAGTTTTTGGTCAGAACCTGCAATTGATGAAGCACCCTCCATGTCATCACAATCCATGACAATCTCAAATCAGATGCCATTTCAATACCCTTTTACTAACTATGAGGAAACTTTCCCGCAGAGTCATGCTTATGATTCAAACTTTGATGACGGCATGGATTTCTGGTATGACATATTCACCAGGACTGCCGATTCCACAGAATTGCCAGAGTTCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_30335::LG8:36087198-36089198(+)
GAATAACTTTTCAATGACTATATTGTTTAAAAAAAGCAAGGGAACAAGGTTCTTTTAGATGGAATAGGTAGCGGGCGATCGATCACCATGTTTATGTATGTATGCTGTGACCAGTTCTCCTTTAATAATGATAACTTGGACAAACACATTGATGCCTTCAAACACATACGATATGTTCAAACAGTTAACTAATCTTATCATAGTTTTGTCTAAGGTTCCTACCCACTTCCTAATAACAATAAGCTTGAAATTGGGCTTAAATTTATATATTTTTACCAATAATTAAATAAAGGTTTAATTGCTTCCTTTGTCCCCAGTTTGGTTGAGTTGTGTCAAATTCATCCTCATTTTTAAAAAAGTTTCATTTTCGTCCTCACGTGGTGTAAAAGTGTCAATTGAATCCAAACATTGAAAAAATGTGTGTCAATGTAGTCATCTCCGTTAAATACACACTAACGGTGTTAAGTGACTGATTATTTGGCACTAGAGAATTAAAACGTGGCAAAAGAAAGGTTTACGTGGATGCCCAATAAACGTAATCTTCCAACGAAGTTCCAAAGCAGTTTCTTCGTGAAACATCTCAAACAGCCAGTGCCAGCAAAACCTCGTTCATTTCAAGTGCAAACCCCTTTCCAGATTCTTCCAGCCACGGCGTTTTTCTTTTGCAAGAATCTGGAAAGGGGTTTTCAAAAAAGCTATTCTTGCCCAATTAAATTTATTTTTTTAATTTCTTTTACGTTTCAGAATCTAAACCCTTCCATTTCTCTCCCTCCCCATCTCTCACGCGGTTTCTCCCCTTCCCATCTCCACACCAATAATTTGCTTCTCAATCTCTCATCCAGTCAGCAACGACGACCTCTGGCGGTTCACCGGCAGCGATGCGTTGATGGAATAGTGCTAACCAACTTTCGTTTTCCAGCGTTGAAGGAATGGCTTTTGAAGTTGCGATTTTGTGATTGGGGTTTCTGATTTGGATAATTTCGTGTGTTCTTTTTGGGGTTAGGGTTTCGAATTGGGGATTTGGGAATCTAAAAATAAATTTTCAAGTGCAAACCCCTTTCCAGATTCTTCCAGCCACGGCGTTTTTCTTTTCAGGTCCGGCTATGATCCTTTCAAGTGCATCAGATATCTCATCTTTACTGATTTCCTTGAGGTCACGCCTGGCTGCAAGAATAGCTGCTTCATTCATCAAATTCTGCAAACCCCTTTCCAGATCCCCTTTCAACCTCTCTACAACAATCCCCCAATTAAGATCGTGCTGAGCACGATAGTCTTAGTGAAACTAATGCCGGAAATCGAACAGGCGGCGGCGGAGAGCACCGTTTTGTTTGAAAAATACGAGGTGGGAAGGCTCCTAGGATGCGGCGCGTTCGCGAAGGTGTACCACGCCCGTAACACCAGCACGGGGCAAAGCGTGGCAGTGAAAGCGGAAGATTACGTTTATTGGGCATCCACGTAAACCTCTCTTTTTGCCACATTTTAATTCTCTAGTGCCAAATAATCAGCCACTTAACACCGTTAGTGTGTATTTAACGGAGATGACTACATTGACACACATTTTTTCAATGTTTGGATTCAATTGACACTTTTACACCACGTGAGGACGAAAATGAAACTTTTTTAAAAATGAGGATGAATTTGACACAATTCAACCAAACTGGGGACAAAGGAAGCAATTAAACCTTAAATAAAACATTAATAAAATTACGAAGTGAATAAAAATTAAATGAAAACATGTTGTTACGAATATTTCAATGTAATGTGATTAACTAATAAATAGTTTAGTGGATAGAGAAAACAACGTGGCATTCTATACAATATTAGCATATAGAAATAAATCAATGCAATTTGGTTGGCAAATGACAATGAATGTGTGCGAAATTTGTCGTTATACTCTTTCACCACTCCCAAGTCTCACTAGTATATGCATGTAACATTTATTTTTCTTTTCTCTTTGTGTATGCGTGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGAAAGAAAGAAAGG


Gene Sequence:
>Vu_30335(+)
GAAACCTCTTTCGCGGAAACTGCTAAATGGTTTGAATATGGAAATTTGTTTTTCCTATTGTTGGACCATTCTGGTCATGGCGTGCGGAGTATCCAAGGATAAATAGCCAGCGAGAGTCTTTGGAAACGAAGTTGAAGGAGAGAGAAAAGAACTAGTTTGCTAGTGAGACTAGCACATACTATAGTACTACTCTACTACTCCATCAATTTCTTCATCTTCCCTTTTATATTATTGCCATCAAAACAATACCACAAACATGGTCCGAGCTCCTTGTTGTGAAAAGATGGGATTGAAGAAGGGTCCTTGGGCTCCCGAGGAAGATCAAATCCTCACTTCTTACATCCAAAAACATGGCCATGGCAATTGGCGTGCCCTCCCAAAACAAGCAGGTAAACATTATTCACCATACTTTTTTAACACTTTCTGCTTCATGCTTTACAAACCTTAATGAATGAATATATATATATATATATCTTTCCAGTTTTTTCTTCTAATTCCTATGACCATTTTGCTCAGGCCTGTTAAGATGTGGAAAAAGTTGCAGACTGCGATGGATTAACTATTTGAAGCCTGATATCAAGAGAGGGAATTTCACATCTGAAGAAGAAGAAACTATCATTAAGCTGCATGAGATGCTGGGTAACAGGTATTCATTGATCATTTCCTATCTTGGACCCATACATGACATTAATCATGCTAATTTAACTTCCCAGCAAAAAGCATATCATGACAAAAACATCATGCACATGTCTGCCATCCAATTCCTAGTTTACACGTCACGCTGCTCAATCATTTTGATCTTTTTAATTTGCTCAAATCATGATATGTGCGGTTTTTCCAAAGTTTCTCCCATGGATAAACAAGGTTGATCAAGTGGTGGGGGCCGGAGGCAATTATTGTCAACTTGGGTGAAAATTAAAATGTAATAAAGGCTGTGTTAATTAATTAGTATTTATTTCATAATGGGGAGTCGAGTATTGTGTGAGAAAATCGAGGTATACGATCCCACCTTTGACGGTGCAAGTGATCACAGAAAGAGTGTTATGATAGATATGCAATTATATATAAGTAATTAATTGCGTAAACCCAGATGTTAAAAGAAAGAGAGTATTGAAATACAAAACTATAGTCTATTAAACATCGAAACCAAAAGTGAAAAAAACAAAAAGTGGGGCTGCCATGGAAAGAATCTCTGATTAGATCTGCCACGCACGAAACAAATTGCCGTGGCAGTTTATGGCACATGCAATTATGACATGTGTTAGACGTAAATACCAATATGAGCATGAGATTCATTGTCCGTGTACTATAGAATTAGGACAACATCAATGTTTGTTGTTTACCGATTCACTAGAAAAAACAAAGTGAACGCGAATCTCGTGCAATAATTTCTCGAATATAATATTAACCGTGTTGATCCTTATTTTCAGGTGGTCGGCAATTGCAGCAAAATTGCCCGGAAGAACTGACAACGAAATAAAAAATGTGTGGCACACCAATTTGAAGAAGAGGTTGCTGAATTCAAATTCCAGAAGAGTCACAAAGCCAAAAATCAAACGTTCTGATTCCAATTCCAGCATCATAACTGAATCAGAAGCTGCCAATTTTAATTTCAGAGAAATGGATTCAACATCTGCATGCACCACTTCTAGTGATTTTTCATCGGTCACAGTTGGTGAAAGCAAAAATATCAAGTGTGAAGACATAGAGTCTCTAGAGACAATGCCCGTGATTGACGAGAGTTTTTGGTCAGAACCTGCAATTGATGAAGCACCCTCCATGTCATCACAATCCATGACAATCTCAAATCAGATGCCATTTCAATACCCTTTTACTAACTATGAGGAAACTTTCCCGCAGAGTCATGCTTATGATTCAAACTTTGATGACGGCATGGATTTCTGGTATGACATATTCACCAGGACTGCCGATTCCACAGAATTGCCAGAGTTCTGAAATTTTCAAATGTCACGTTCGAAGAGGGTATTATTAAATTTACCGGATAATACTTTCAAATGAAAGGGTAACTTCAATTTGACCGTTGCAACAAAAGGGTACCATAATTTCGGCTGTGGGGACGCCATTATCGCCAGCTGCAAGATCTTGGAGTCATCCATTGACAAAGAAACCAGCCAGAGTAATGGGAAAGGCTAATGTTCTGTAATGTATGTACACATGTAATCTACTTGTCAAACACTGACTCTACTTTTTTTAGTGGAAAACACCAATCTTCTAACATTTTTGTATTTTACGAATTAGTGTTTAATCAGGCTAGAGCTTTTTGATTGTAATATCAATAAATGATGTCCTAAACGTTATTATTC