Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30299 LG8 35668170 35670906 PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g45780
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 35668370 missense_variant p.Lys67Asn
C/G 35668565 missense_variant p.Ile132Met
G/A 35668630 intron_variant
T/G 35668656 intron_variant
C/T 35668664 intron_variant
G/A 35668674 intron_variant
T/C 35668741 intron_variant
T/A 35668820 intron_variant
G/T 35668867 intron_variant
G/T 35668903 intron_variant
A/G 35668965 intron_variant
A/T 35669307 missense_variant p.Thr223Ser
A/G 35669780 missense_variant p.Gln343Arg
G/A 35670340 downstream_gene_variant
T/C 35670344 downstream_gene_variant
T/C 35670360 downstream_gene_variant
C/T 35670372 downstream_gene_variant
G/C 35670404 downstream_gene_variant
C/A 35670406 downstream_gene_variant
T/G 35670411 downstream_gene_variant
A/T 35670450 stop_gained p.Lys526*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30299.1
MAFSVLLLLFSLAFLLSNPTWVCGNGELRALMDLKASLDPESLYLPSWTVNGDPCGGYFEGVACNEKGQVANISLQGKGLSGKLSPAIAGLKHLTGLYLHYNSLYGDIPREIANLTELVDLYLNVNNLSGEIPREIATMENLQVLQLCYNHLTGSIPTQLGALKKLSVVALQSNQLTGAIPASLGDLGMLARLDLSSNNLFGSIPTSLAEAPSLRVLDVHNNTLSGNVPPALKRLEDGFLYKYNLGLCGVGFSSLKACNASDHVIPSRPEPYGAATRDIPETANVKLPCNGTQCLNSSKSNKSISITVVIFVVIIAMSAIGILTFTLYRRRKQKLGGSFHISDNRQGTEEAMGVCRKNGSLVSLEYSTGWDPLAESRNFNGYSQDMFQSLRFNLEEVESATQYFSELNLLGKNSFSATYRGVLRDGSVVAVKSISKTSCKSDEAEFMKGLNMLTSLRNDNVVRLRGFCCSRGRGECFLIYDFVSNGNLSRFLDVKEGDGEVLEWSTRVSIVKGVAKGMAYLHAYRANKPVLVHQNISADRVLIDQRYNPLLADSGLYKLLTNDIVFSALKGSAAKGYLAPEYATTGRLAQTSDVYAFGVLLFQILSGKQEITTSSIRLAAECSNFQEFMDPNLHGRYFEYEAAKLAKIALLCSHESPFERPSMEAIVQELGNCSSCL*


CDS Sequence:
>Vu_30299.1
ATGGCGTTTTCAGTACTGCTACTGTTGTTCTCTCTTGCGTTTTTGCTCTCAAACCCAACATGGGTGTGTGGGAATGGAGAGCTAAGAGCACTGATGGATTTGAAAGCCAGTTTGGATCCAGAGAGCCTTTATCTACCGTCTTGGACTGTCAATGGTGACCCATGTGGTGGATATTTTGAAGGAGTGGCATGCAATGAGAAGGGTCAGGTGGCAAATATTTCTCTGCAGGGTAAGGGTCTCTCAGGGAAGCTTTCACCAGCCATTGCAGGGCTCAAGCACCTGACTGGACTCTACTTACATTATAACTCTCTGTATGGAGACATACCTAGAGAGATTGCAAACTTGACTGAGCTTGTTGATTTGTATTTGAATGTAAACAATCTGTCTGGGGAAATCCCACGCGAGATAGCCACCATGGAGAACTTGCAAGTTTTGCAGCTTTGCTATAATCACTTGACTGGAAGCATTCCTACACAGCTAGGTGCTTTGAAAAAGCTGAGTGTTGTTGCATTGCAGTCAAACCAGTTAACTGGTGCTATCCCTGCTAGTCTAGGTGATTTGGGCATGCTGGCGAGGTTAGATTTGAGCTCTAATAATCTTTTTGGTTCCATTCCCACTAGTCTTGCTGAAGCTCCTTCACTGAGAGTTTTGGATGTTCACAACAACACACTTTCTGGGAATGTACCTCCTGCTCTTAAGAGACTAGAGGATGGGTTTCTGTATAAGTACAATCTGGGGTTATGTGGAGTTGGGTTTTCATCCTTGAAAGCTTGCAACGCTTCGGATCATGTCATTCCAAGCAGACCAGAGCCTTATGGAGCAGCCACTAGAGATATCCCCGAAACTGCAAATGTGAAGTTACCATGCAATGGTACTCAGTGCCTTAATTCATCAAAATCAAATAAATCCATATCAATTACTGTTGTCATATTTGTGGTAATAATTGCAATGTCTGCAATTGGTATTTTGACATTCACACTGTATCGTCGGAGAAAGCAAAAGCTTGGAGGTTCTTTTCATATCAGTGACAACCGTCAAGGTACTGAGGAGGCCATGGGTGTGTGTAGGAAAAACGGATCTTTGGTCAGCCTTGAGTACTCTACAGGATGGGACCCTTTGGCTGAGAGTAGAAATTTCAATGGGTATAGTCAAGATATGTTCCAGAGTTTGAGGTTCAATTTGGAAGAAGTGGAGTCTGCTACTCAGTATTTCTCAGAGTTGAATCTGTTGGGCAAGAATAGCTTCAGTGCAACATATAGAGGAGTTTTGAGAGATGGATCCGTTGTTGCTGTGAAGAGCATAAGTAAAACTAGTTGCAAGTCGGATGAAGCTGAGTTTATGAAGGGACTGAACATGTTGACCTCATTGAGGAATGATAATGTAGTTAGGTTGAGAGGATTCTGTTGTTCAAGGGGACGAGGTGAATGCTTTCTGATTTATGATTTTGTTTCCAATGGAAACCTTTCACGCTTCCTTGATGTTAAGGAAGGAGATGGTGAAGTCCTTGAATGGTCAACTAGAGTTTCTATTGTGAAAGGGGTTGCAAAAGGTATGGCATATTTACATGCATACAGAGCAAACAAACCAGTTTTGGTTCACCAAAACATCTCAGCTGACAGAGTCCTGATTGATCAGCGGTACAATCCATTGTTGGCAGATTCTGGCCTGTACAAGCTTCTTACTAATGATATTGTGTTCTCTGCACTGAAGGGTAGTGCAGCAAAGGGTTACCTGGCTCCTGAATATGCCACTACTGGGCGCCTTGCTCAGACAAGTGATGTCTATGCTTTTGGGGTGCTGCTTTTCCAGATCCTTTCTGGGAAGCAAGAAATCACTACCAGCTCAATAAGGCTTGCTGCAGAGTGCTCCAACTTCCAAGAATTTATGGACCCAAATCTTCATGGAAGATACTTTGAATATGAAGCAGCTAAACTGGCTAAAATAGCTTTGCTTTGCTCCCATGAGTCTCCTTTCGAGAGGCCATCCATGGAAGCCATTGTTCAAGAACTGGGAAACTGCAGTAGCTGCCTCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_30299::LG8:35666170-35668170(+)
GCCAATTCTGATTGCTGGTAATGGTGGAGAAATCGGTTCTAGAGAAAAAAGAATAGATTTCGTACCTATATTAAGATACATCAACAAGATTTCTTTTTAGCTAAAGTGAATAGATATATATGTTTCTAACAATATTTTAATTTAGTTTATTTTATTTTATACGTAAAAGCTACTCACTTACACCAAAAGATTTCTTTTAAAATAATAAGCAATATATATACCTATAATAATAATAAATAATAGTAACAATATAATATGTTAATTTTAATTATAAGAACAAAATAAATAATCTTATATTTTAATCTATTAAAACATCTTTTTCCTTTTTTTTTTCAAAACTCACAATTTTCTTATTTTTTCCCTTAGTGTAAACAACTCAATTTTCACTTATCTTTTATTCCAAATCCACTTCCAAAACCAATCACAATTCATATCTTTAAAAAAAAAAATAACTGAAATTTTACAACGAAATTCATCCATTATTTTCTTCATCTTTAAATAGAAGACAACTTATCACTTTGATATGTTAAACTATGTAAGGAATTTGAATTTTGAAAAGCATTTCATTCACCAACTCCACGCGCTAGGCGCGTGCCACACTCATTCCCAAACGTGGCAGACGTGGCGCTGTACCAACGGTGGGACCTGTAAAGCAGACAAATTAATTTCGCAGTCCATAGTACATTTTCTACTCAAAAAGAAAAATTCGAAAAAGAAGGAATTTATTAAAAAACTTAAACGGTTTGAATTTTCAAACTCCAAGATGCAGATGTAATAATTCTAAAACACATATACTTTTTTAAATTAAATTATATTATTATGTATTTCCGTCTAAGTATATTTAGGCTTTTATTATATTAAATATATCATTTAAAAAAATAATTTTGTAAGAATGATATTACAAAAATGATAAAATAATACAATTTTATTAGAACAGTGTTGAAATAACTTGTGATAGTTATTTTTAAAAAGAAAAATTATTTAATTATCTAGAAATAAAAAGCTATTTGATTATTTATTTTAATAAATAAATAAATAAATAATTTTTTTATCTATGAAAATAGAATTAAGTAATGAAAAGATGACAGCAAAAAGAATTACTAAAAACGACATAGATTAGTATATTTCTCTTGTACTGTGGTTTTGTATCAATATTATATCATCCTACCTGTGATGCTATTTGCTACATAGAATTTAATTATGGAAAAAAATCTCAATAACAAATGGAAGCAAAGGAAAGAGAATCTCCCAATATTTTAATTCAAAGCTTGTTTGTTTCTAAAGTTTGAAATTAGAAAAACAACAGGCTATATACTATAACATTGCTAAACATATATAATTACCACCGTTGTTACTAACAATAATAACATAAATCAGGTGGTGATTAAGGATAAATGAATTTTTAAGTGTGAAATTTCTTGAATAATGGGTATTTAAAGCTGTAAAAACAATTAGAGTAATAAAAATGTTTTTTTTTTCTAGAAGAAAAATGCACATAAAAGCCATAAGATCACAACCCCACAAAAAAAGAAAACTTTACCCCTTTTTCTTCCATGCTTTGATGATCTACTTCCCTTTTTATTTTCCACTTTTGGATTCACTATACCATGTTGACAAGGAAATGTAATTATGTAGATAACGTCAATCATTTAAACATTATTTGGACAAGATTAAAGTGTTATTTAACAAAAACTTACGTAATGATATGAAGAAAAGTGTTCTATAATGACGCGTGGGAGAGTACTCCTTGAAAAAGTGGTTAGTTTTGAGTTTTTGCAACATTCCACGAACACCACTTTTACTGTCTTTGATTTATGACTTGACTTGAATCCGTTCACCACTTCACTTGTCCTCTATGCGCTTTTTCCACTCTCTTTGCTCTTTGCTCTTTGCTCTTTGCTTTACACACGGAAACATAAGCCTTGCATAGGGTCGCATTCAAAAACCAAAAGTTCAGAGCTTGTTTATTTGTACGCCTTTTTTTCGTTAGGAACTGAAAA


Gene Sequence:
>Vu_30299(+)
ATGGCGTTTTCAGTACTGCTACTGTTGTTCTCTCTTGCGTTTTTGCTCTCAAACCCAACATGGGTGTGTGGGAATGGAGAGCTAAGAGCACTGATGGATTTGAAAGCCAGTTTGGATCCAGAGAGCCTTTATCTACCGTCTTGGACTGTCAATGGTGACCCATGTGGTGGATATTTTGAAGGAGTGGCATGCAATGAGAAGGGTCAGGTGGCAAATATTTCTCTGCAGGGTAAGGGTCTCTCAGGGAAGCTTTCACCAGCCATTGCAGGGCTCAAGCACCTGACTGGACTCTACTTACATTATAACTCTCTGTATGGAGACATACCTAGAGAGATTGCAAACTTGACTGAGCTTGTTGATTTGTATTTGAATGTAAACAATCTGTCTGGGGAAATCCCACGCGAGATAGCCACCATGGAGAACTTGCAAGGTTTGTGGTTGTGATCTGTTGAACAAGATCGAAACCTTTATTATTCTGTTTTAGTTTTGTTTTTCAATTTTTCCGTGTTTAAAGCTTGTCTTTTTTTGTTTTGTTTTCTGTTTGGAGAAGATGGGCTTTGGCTGAAAGACTTGAGCTTGGTTTCGATTATTTTTTGTACTATACCATTTGTTTTGCTTTATTCCCTCAAATGGTGTGCACGGAACTCTCTTACACTTGTTCCAAAATGGTTTTTCCTTTTCTTTAATAGTGTTGAACGTTGGCTTTTTGAATCCTGTATATTTTGACAAACTTGTAAGCTGAAAAAAGAGTTTTATTTCTGTTGATTGTTTACTCTCTTCATTTAGCATTTGTTCAAAAACTAAATTTGCTACCTGTTCTTCCTATGGGTATCTTCAGTTTTGTGTTGGTTGTTCAAACTGTTCAGTGTGCTTATTTGTCCCTTTCACTTTTTTTACAGTTTTGCAGCTTTGCTATAATCACTTGACTGGAAGCATTCCTACACAGCTAGGTGCTTTGAAAAAGCTGAGTGTTGTTGCATTGCAGTCAAACCAGTTAACTGGTGCTATCCCTGCTAGTCTAGGTGATTTGGGCATGCTGGCGAGGTTAGATTTGAGCTCTAATAATCTTTTTGGTTCCATTCCCACTAGTCTTGCTGAAGCTCCTTCACTGAGAGTTTTGGATGTTCACAACAACACACTTTCTGGGAATGTACCTCCTGGTAATAACGATGTTACTGTACATGGTTAATCTTGTCAGTTTTTTCCATTTCTTCATTAGTTTGTTTTTCTTATCTAAAATATGTTTATTTTCCTTTTCTTGATTCGATGAAGCTCTTAAGAGACTAGAGGATGGGTTTCTGTATAAGTACAATCTGGGGTTATGTGGAGTTGGGTTTTCATCCTTGAAAGCTTGCAACGCTTCGGATCATGTCATTCCAAGCAGACCAGAGCCTTATGGAGCAGCCACTAGAGATATCCCCGAAACTGCAAATGTGAAGTTACCATGCAATGGTACTCAGTGCCTTAATTCATCAAAATCAAATAAATCCATATCAATTACTGTTGTCATATTTGTGGTAATAATTGCAATGTCTGCAATTGGTATTTTGACATTCACACTGTATCGTCGGAGAAAGCAAAAGCTTGGAGGTTCTTTTCATATCAGTGACAACCGTCAAGGTACTGAGGAGGCCATGGGTGTGTGTAGGAAAAACGGATCTTTGGTCAGCCTTGAGTACTCTACAGGATGGGACCCTTTGGCTGAGAGTAGAAATTTCAATGGGTATAGTCAAGATATGTTCCAGAGTTTGAGGTTCAATTTGGAAGAAGTGGAGTCTGCTACTCAGTATTTCTCAGAGTTGAATCTGTTGGGCAAGAATAGCTTCAGTGCAACATATAGAGGAGTTTTGAGAGATGGATCCGTTGTTGCTGTGAAGAGCATAAGTAAAACTAGTTGCAAGTCGGATGAAGCTGAGTTTATGAAGGGACTGAACATGTTGACCTCATTGAGGAATGATAATGTAGTTAGGTTGAGAGGATTCTGTTGTTCAAGGGGACGAGGTGAATGCTTTCTGATTTATGATTTTGTTTCCAATGGAAACCTTTCACGCTTCCTTGATGTTAAGGAAGGAGATGGTGAAGTCCTTGAATGGTCAACTAGAGTTTCTATTGTGAAAGGGGTTGCAAAAGGTTAACTCTCTATCTATCAATCACCCTTTATTAATTAATTGCATTCCTATAATGTAATTATAAGTACTTTCTCATTATGCTTTCTATTTGAGGTCTAAACTGAAGCCTTTTTTGTTGATCAGGTATGGCATATTTACATGCATACAGAGCAAACAAACCAGTTTTGGTTCACCAAAACATCTCAGCTGACAGAGTCCTGATTGATCAGCGGTACAATCCATTGTTGGCAGATTCTGGCCTGTACAAGCTTCTTACTAATGATATTGTGTTCTCTGCACTGAAGGGTAGTGCAGCAAAGGGTTACCTGGCTCCTGAATATGCCACTACTGGGCGCCTTGCTCAGACAAGTGATGTCTATGCTTTTGGGGTGCTGCTTTTCCAGATCCTTTCTGGGAAGCAAGAAATCACTACCAGCTCAATAAGGCTTGCTGCAGAGTGCTCCAACTTCCAAGAATTTATGGACCCAAATCTTCATGGAAGATACTTTGAATATGAAGCAGCTAAACTGGCTAAAATAGCTTTGCTTTGCTCCCATGAGTCTCCTTTCGAGAGGCCATCCATGGAAGCCATTGTTCAAGAACTGGGAAACTGCAGTAGCTGCCTCTGA