Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30297 LG8 35641319 35646092 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   biological_process
Cellular Component   located in   chloroplast, chloroplast, chloroplast
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 35641453 3_prime_UTR_variant
T/A 35641549 missense_variant p.Arg366Ser
A/G 35641654 upstream_gene_variant
C/G 35641750 upstream_gene_variant
C/T 35641754 upstream_gene_variant
A/G 35641761 upstream_gene_variant
T/C 35641793 upstream_gene_variant
A/G 35641936 upstream_gene_variant
A/T 35642024 upstream_gene_variant
C/T 35642084 upstream_gene_variant
G/C 35642143 upstream_gene_variant
C/T 35642194 upstream_gene_variant
G/A 35642230 upstream_gene_variant
G/A 35642333 upstream_gene_variant
T/C 35642403 synonymous_variant p.Gly357Gly
C/T 35642518 upstream_gene_variant
A/G 35642599 upstream_gene_variant
G/T 35642605 upstream_gene_variant
A/G 35643137 upstream_gene_variant
G/A 35643171 upstream_gene_variant
A/G 35643230 upstream_gene_variant
A/G 35643631 downstream_gene_variant
T/C 35644114 downstream_gene_variant
A/C 35644378 downstream_gene_variant
T/A 35644465 downstream_gene_variant
C/T 35644552 downstream_gene_variant
T/A 35644562 downstream_gene_variant
C/T 35644670 downstream_gene_variant
A/G 35644691 downstream_gene_variant
C/T 35644725 splice_region_variant&intron_variant
C/T 35644799 synonymous_variant p.Gly181Gly
G/A 35644804 missense_variant&splice_region_variant p.Pro180Ser
G/T 35644865 downstream_gene_variant
T/A 35644875 downstream_gene_variant
C/T 35644972 downstream_gene_variant
A/T,C 35644983 downstream_gene_variant
G/A 35644991 downstream_gene_variant
G/A 35645069 downstream_gene_variant
G/A 35645086 downstream_gene_variant
C/A 35645142 downstream_gene_variant
T/A 35645149 downstream_gene_variant
C/G 35645155 downstream_gene_variant
G/T 35645267 downstream_gene_variant
C/A 35645507 missense_variant p.Gly131Cys
C/T 35645510 missense_variant p.Glu130Lys
A/C 35645511 missense_variant p.Ile129Met
C/T 35645697 missense_variant p.Arg99His
T/A 35645863 missense_variant p.Gln71Leu
A/G 35645865 synonymous_variant p.Asp70Asp
T/A 35645973 missense_variant p.Lys34Asn
T/A 35646065 missense_variant p.Thr4Ser
G/T 35646087 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30297.1
MVVTSWCSSSWLPLSLRLPWNLKAARMPLSLKLKCEAFSEYSCCLVHNDQADLQALLQILPSDLHQSLLDQPNRSQLLEVVLDLGRFPEARYLGEHGRRCLRNTEVTVKELEYAEQAVGEFGKDNRAGIEGTLHRVSAIRSRNGHIVGLTCRVGRAITGQIDMVYDLLQYGKSILFVGRPGVGKTTVMREIARVLSEELHKRVVVVDTSNEIGGDGNIPHAAIGGARRMQVREPSMQHRVMIEAVENHMPEVIIVDEIGTEAEAHACRSIAERGIILIGTAHGQKLENIIKNPTLSDLIGGIEIVTLGDAEAKARNCLKTVLERKAPPTFDFLIEMRDRHYWLTHQTDKSVDMLLRGKSPQVEVRRKDEKCKVVIEKSKAYDKCL*


CDS Sequence:
>Vu_30297.1
ATGGTAGTTACGAGTTGGTGTTCATCTTCGTGGCTGCCTCTGTCACTACGGCTGCCATGGAATTTGAAGGCAGCAAGAATGCCACTGTCACTGAAATTGAAATGTGAAGCGTTTTCTGAATACTCTTGTTGTCTTGTTCACAACGACCAAGCCGATTTGCAAGCTCTCTTACAGATCCTTCCATCTGATTTGCATCAAAGTCTCCTTGATCAACCTAATCGTTCTCAACTTCTGGAGGTTGTATTGGATTTGGGTCGTTTTCCAGAAGCACGCTATTTAGGAGAGCATGGACGCCGCTGTTTAAGGAACACAGAGGTAACTGTGAAGGAGTTGGAATATGCTGAACAAGCTGTTGGAGAGTTTGGCAAGGACAATAGAGCTGGAATTGAGGGTACTTTGCACAGAGTATCTGCAATTAGGAGTAGGAATGGTCACATAGTTGGCTTGACTTGTCGTGTGGGAAGAGCAATCACTGGCCAGATTGACATGGTTTATGACCTACTTCAATACGGGAAGAGCATTTTGTTTGTTGGAAGGCCTGGGGTTGGCAAAACTACTGTTATGCGTGAAATTGCTCGGGTGCTGTCTGAAGAGCTTCACAAAAGAGTGGTGGTTGTTGATACCAGCAATGAAATTGGGGGTGATGGCAATATCCCACATGCAGCAATCGGTGGAGCACGAAGAATGCAGGTGCGGGAGCCATCAATGCAACACAGAGTGATGATTGAGGCAGTGGAAAATCACATGCCTGAGGTGATTATAGTTGATGAGATTGGCACCGAAGCTGAAGCTCACGCTTGCCGATCAATTGCCGAGCGTGGGATCATTCTTATTGGGACTGCTCACGGACAGAAGCTTGAGAATATCATCAAGAATCCTACCCTTTCTGATCTGATTGGCGGAATAGAAATTGTTACTCTGGGAGATGCAGAAGCCAAGGCAAGAAATTGTCTGAAGACAGTTCTTGAGAGGAAAGCACCTCCAACATTTGATTTCTTAATTGAGATGAGAGATAGACACTACTGGCTCACACATCAGACTGACAAAAGTGTAGATATGTTGCTTCGGGGAAAAAGTCCACAGGTTGAGGTAAGAAGAAAAGATGAAAAGTGTAAGGTCGTGATAGAAAAATCTAAGGCATACGATAAATGCCTATGA


Promoter Sequence:
>Vu_30297::LG8:35646092-35648092(-)
TACTTGGATTTGTGTGAATATGTATGATAGCAACTTAGTTTTATTATTCGGATGATGGAGTCTGGATTAATGTAGTATTGATTAATATTAATAAGGCAACATGCGTCACCAATGCTATCCGCTTGTCGACTTTTGGTTTGAAGCTAAATTCTTTCTTTGTTTACAGAGGGATATGTGCTTCTTTGAGCATGATGGATTTATTTATTTTCCTTTGTGGGATAGTTTTAATTTTTTCCTGTGTTGCAGGTTTTGTTGTTCTTGGTTAGTATCTCATCCAGGTATAAATTTTGTTCTATATTCACGTAAAACAGAATCTTGTATCCATTTTAATAGAATAATAATTCTTAGGAGTTATTTGATGTGTGCGAAGACTAAACTTTGAAAAGGCATATTAGTTGTGAAAATGTTGGATCTTTCCTATCTAGCGTCTAATTGTTTAAAACGGAATTGTTTGTTATTCAAACTTGCCCATCTAAATTTTACCCATCTAATATGTTGGCAGGAAAACACAGGACTCCTTGATATGTGGAGCTTCGGCGCATCGTGAATTATGGAAGAAGGAAGAAGAAGAGGATTATTAGAAGAATAATTATAGTTTTTTAAAGTATCTGTTCTGTAAAAGATGTTTATTATAACTCTCTTGATGACTCTTTCTAAGGTTCTTTAGTAATAAATAGTACTCGAAACTTGTTTAATAGTATTTATAAGTGATTAGGTGCAGATCTTGCTGCACCATCCAGGTATATTGTTGTTCTTTGCTTTTTCTCTCTTAATAGTATAATTATGATATGTGTTGAATGGATTTTCTCCTCTCTTTCTCTTGTTTTTGGTTTTATTTGTCAACAAAACTTCTACCAGGTGTTTACAATCTAGAATAATATTCTTCTCAATTACACATATGTAGAACTTATTTAACTCAAAATTTATATGAAAACTTACTGATAAAATTAGAGAAAAGATGAGAGAGATTCTGGATTTATCTTTCTCTACTAACAAAATACTAATTATCAATATTTATGAATAAAAAATAATTTAATATAACTATTACAATAAAACAAGCGTTCACTCTCTAGTAAAAGTGAAACAAAAAAACCTTTTAGTTATGAGTAACTCTTTATTCAATAAATATGTAAAGACACCCTACATCCTAATTAGGTTAGGAATTGTAGGAAGGAAGAAAAGAAATATACTATTCAGTTATTATCATGCTTTCAAATCTATAAATTTAGTGAAAACAAATAATTTTTTAATATAAAATGAAAATATCAGTATAAGTTATCATTCTAATTAAGTTGAGACTCTAATAAAATAAGATACTATCATTTAACAGGAATCTTCTGTACTCATTTCCTATTTTGATTTTAATACCAAAAGTTTTATAAAGAGTCAATTTTCTCATCTTGAATAATATGTAAACTCTAATCAGACACACTAGATATTTTTATGTAATATATTTTATATTGTTTTTTAAAATTGTGAATAAACATGTCATAGCTAATGTATGTATATATATATATTTCGAAATTAAAATTTAATTATGTATAAATTAAAATAAAACTTAAAAATATATAAAAAAATTATTGTACAAATTAGCTCATAAACGAACTAATTTTGTTTTAAAAAAAGTAATTTCTTTTTATTTTTTTTGTCTTTATTAAAGATGTGAATGAATAAATTGACATAACTTACTAGTGTTAACCTGTTGAATCTTGTTACCAAAATAACAATATTTTGTTTTAAAATATATGAAAAAGAAAACTTGAAAATATATGAAAAATTATTGTACAAATTAGCTCATAAATAAACTAATTTTGTTTTAAAAAAAGTAATTTTTTTATTTTTTCTTTATTAAAAATGTGAATGAATAAATTGACAAAACTTACTAGTGTTAACCTGTTCAATCTTGTTACCAAAATAACAATATTTTCTGTGAACTAAATTTTAATTGAACAGCATTAAAGAAATAAACTATTTAATAATAATAGAAAGGAGAAAAGGGT


Gene Sequence:
>Vu_30297(-)
GATAACGCAGGAAAGGAAATGGTAGTTACGAGTTGGTGTTCATCTTCGTGGCTGCCTCTGTCACTACGGCTGCCATGGAATTTGAAGGCAGCAAGAATGCCACTGTCACTGAAATTGAAATGTGAAGCGTTTTCTGAATACTCTTGTTGTCTTGTTCACAACGACCAAGCCGATTTGCAAGCTCTCTTACAGATCCTTCCATCTGATTTGCATCAAAGTCTCCTTGATCAACCTAATCGTTCTCAACTTCTGGAGGTCACTTTTCAATGTCAACGCTATTTATTTAATCCTTAATTCACTGCACTTCTTTCTAATCTAAAGTTCCTTTATTCAGTAGGTTGTATTGGATTTGGGTCGTTTTCCAGAAGCACGCTATTTAGGAGAGCATGGACGCCGCTGTTTAAGGAACACAGAGGTAATGCGTACCTTGCGCTCTTCATTCGGTGGTATTGTTTATGTCTATGTAATGTGATATCCAGAAATGTATTGAGTTATATGTTTTATAGCTAGGTAACTGTGAAGGAGTTGGAATATGCTGAACAAGCTGTTGGAGAGTTTGGCAAGGACAATAGAGCTGGAATTGAGGGTACTTTGCACAGAGTATCTGCAATTAGGAGTAGGAATGGTCACATAGTTGGCTTGACTTGTCGTGTGGGAAGAGCAATCACTGGCCAGATTGACATGGTTTATGACCTACTTCAATACGGGAAGAGCATTTTGTTTGTTGGAAGGTATAACACAGAATTCCCCTTTAATCATTGATATTTTAAGATTGATACAAGTTGAAGTGCTGAGGGAATCCTTGAAATAAAATTAGTTTGATTCCTCATTTTACTTTTGTTAAAAGAATACTTGTAAGAGAAAAAACAAGAAGGTAAAATGAATTAAATTTCTCCTACAAGTTAAAATCACACACTTTAGTACTTTAGAAAATAAAGTTTATATTCTGTGGATGTTCAAGTGAATAAGTTGATTTTACCTTTTTTGTTTTCTTATCCTGTAAGTACTTAAAGAGAGATTTTTCCAGAACATGTGTCATTTGGTTATTTTTCTAAATTTAAAATATTTTATGGATTCTGTGTTTGTCATTGTCAATTGTAACATAGGGCTTAAGTTGTTTGCTTTGGAAGACTTTTGAAATTTATGTTAAGATCTGTCTAATAAGTGATAAAATTTACTTTACCATGGTCTATTGACTCACCAGTCCAATAATGTAGAAGAAAGTTGCTCTGTTTCTCTATGAAAATTTGATGATTTTTTTCCATTCTTTTTCTTGGATTCTCTCAGGCCTGGGGTTGGCAAAACTACTGTTATGCGTGAAATTGCTCGGGTGCTGTCTGAAGAGCTTCACAAAAGAGTGGTATGCTGATTTTTCAGCATCTCACAGCATTTTCCTCTTCCTTAAAGTACTTTTTTATACTGGCTCAGGATAGAATAACTTCTTGCAAGATGAGTAGACGATTATTGATACCTAATGTGAATCCACTTGGCATGAATTCAATTTATGGATCTTTCTAGGATGGAGATGGAAACAAAGAAAGGATGTGGAGCTACAGCCTAGTTTAGGAAAAATTCCTTGATAAGTTATAGGCAGTTCTGTCAAGAACCCAATAGAAACAGTTCTATCAAAAGGGATAATCCAATTTTTAAATAATTCAAGCTTGCTTTGCACATGTACATGTACATAATAGGCTAAGTGAGGCCTGTCAACAGTTGCAGCTCTTAGGAAGCTAAAAGGACTCCACCCGCATGCAATTACCATGTATGTTAATTGTCTGTTACATTAATTTCTATAATTAAATAAGCACTAAGGAGATGACCCACTAGTAATTGTAGAGCACAAGGGCTGTCAAAAGTTGCAACACCTAGAAAATTAACAGGATTTCACTGGTTTGAAAAGCATGCTCGCCCTCTTCAAGAGACAACCATGGCTAGCGGCTCAAGCCTTATTCTTCCTTAAAGTACTTGTTTTAGATAGACTCATGATAGAATAACTTCTTGCAAAATGAATAGGTGGTTGTTGATACCAGCAATGAAATTGGGGGTGATGGCAATATCCCACATGCAGCAATCGGTGGAGCACGAAGAATGCAGGTGCGGGAGCCATCAATGCAACACAGAGTGATGATTGAGGCAGTGGAAAATCACATGCCTGAGGTGATTATAGTTGATGAGATTGGCACCGAAGCTGAAGCTCACGCTTGCCGATCAATTGCCGAGCGTGGGATCATTCTTATTGGGACTGCTCACGGACAGAAGCTTGAGAATATCATCAAGAATCCTACCCTTTCTGATCTGGTTTGTTTTAACTTTTATATACTTGTGCAATAACATCCAATAGTTTGTTGCTTTTGCTCCGTTTTTAAGCAAGTTTTGAACTCTATGTGGCCTTATTTTTACTTAATTTAAGACAATAACTGTCTCTTTTTACTTCATGTTTTGAATAAGTAATGAATGCTGTTTAGATGAGGCCTGAAACTGAATCCCATTTTAAGTTGTAACCTTATTTTCATCTGAATTTTAGTTTTCACATAACTTGAATATCACCCATCTAAGCACTCTAATATTCAAGATTCACCTCCATTTGCTTGATCAGATTGGCGGAATAGAAATTGTTACTCTGGGAGATGCAGAAGCCAAGGCAAGAAATTGTCTGAAGACAGTTCTTGAGAGGAAAGCACCTCCAACATTTGATTTCTTAATTGAGATGAGAGATAGACACTACTGGCTCACACATCAGGTATGTTGATTGAGCATTTATTACTGAAATATCAATAACCTTATCCCACTTGGTGAAGTTGTCTATATGCAACACCATTGGACTTACTCAAAAACTAATTTCAGCAATGCCTTTTTAAGCTCTCTCTACCCTTTCTCATAGGGCTAAAATTCATGAGATCTACTCTCATCACCGGTGCCTGCTCGCCTTCTTTACACTCGTCCAAACTACCTAAATCGATTTTTTATGATTTTTTCTTCGATATTTGACAACCAAGATCTCATACAATATTTTTATATTCCATCCTTGTTCCATGCATTCATTATCATTTCTGCTATTCCCACTTTTTTCCGTTTACTTTTATAGAAATTATTGTTGTTATTCATTTAACTTATTTTCAGAATAGCATCAGTGATTTTGTCCAGCCCTTTGAATAAAATGTACACAACACAATGAATGTACTAAAATTCATGAAAGAAAACGTATTGTTAAAATGGACTGTCATCAATACTATGTCCTTGGTTTAAAGCTGAACGTCAATTTCAATCCCCTACCTTAAATACGTTTTTTGACTCTCAAATTTAAGTCAAGTTTGTTTTTTGTCCTTTCAATAAAGAATTGAGGTTTTTGTCCCCTATAGTTTGAAAAAAAAAAACTTGTTTTAATGCCCCGAAGCCTTGTATATTAAACGTTGTCAAAATGGATATTTTGAAAGGAAAACAAACATATGGTTGGGTATTTGATGATAATTATGCAAAATCGAATTATCTTGTGTTGTTTTTATTGATAATTTCTTTTTGTTAACGTCAAATTACTTCAGCAGAATTATATGGGCCAATTGAAAGGCCAGGTAGGGTAGTTTCTGTTAATCATTGAGGGCATTGATAGGCTAAACTTTCATTTCGTTTCAATTATATCTTTTTTTTTTCCTTTTGCAGACTGACAAAAGTGTAGATATGTTGCTTCGGGGAAAAAGTCCACAGGTTGAGGTAAATTCTTTACCGCTGTACTTTTTCAGTTTATTTGATTGAAAGATTTTTCTATTATTATTTGTTTCTGCCTATACTTCATAATACTTATCATTTATATTTGTTGGAGTTGGACATTGCCTGATCTATTACTGTAAAATTTTACTGATGAAAGCGACTGTTAGCTTTTTGGTTGATGCCTGCCAGAGGAGAAAACCTTAAATCTAATGTTAAGTTTTTCCTCTGTTTTCTGAAACTACATCTTAAAGAGCAAACGGCATGATCAGGCTTCTGAGATTGTAGATAAACTCAACATAAGTAGCCATGGTCATAGAAATATAGGTTCACTCCTCGCATCTGGCCTTGTTCTTTCCTCTTTGGTTTTTTTCCTAGTCTTCCTTCCTGACACCTGATTACAATCATATAAGTGTGAGCCACAATGCATGTCCATCCATATGTTCCAGAAGCCTAAATCTGCAATAACTTCACGGGTTTTTAAACTTGTGTCTTCGAATTAACGGAAGTTCATCACGCTTTCTAGATAAATATATAGGGATATTTTGGATATTATGAATGCCATCTTTAACTTCACTATAGGTTACAAATGTTTGGACTTTGGAGTAGCATTCTAAATATGAAGATTTTTACTCAGAAGGTAATTTTGGAGCATGTTTGTGTTGTCATATGGATGTTAATTCGCTTTTAAAATTGGTTCATAGGCTCTGATGCATATGCACTTGATAAGTTGATATGTCTGACCAACATATAAACGATTCTCTTATATATCTTTGATACCATTTTTCCAGGATATTTTATAGTATGACCATCTCTCTAACTTTTTTTTGCAGGTAAGAAGAAAAGATGAAAAGTGTAAGGTCGTGATAGAAAAATCTAAGGCATACGATAAATGCCTATGATATAATTCAATTAGAAACAGTTTAGTTTATGACTTGTAAATTGTTTAAAAACCAATTTAGATTTAAAGCTATAAACCAGGATTATGTAAATTATGTATTTATTTCATTGAGATATATGTATATATTTTCACTCTGAAGTTATATCCAACACTTTATGTTCCGTGTTGTGT