Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30246 LG8 35106536 35110447 hypothetical protein LR48
 Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09159 Environmental adaptation   C 04626 Plant-pathogen interaction [PATH:ko04626]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 35106839 missense_variant p.Ser331Leu
A/G 35107209 upstream_gene_variant
G/T 35107237 upstream_gene_variant
G/A 35107687 synonymous_variant p.Arg127Arg
G/T 35107793 missense_variant p.Thr92Lys
A/G 35107935 upstream_gene_variant
A/T 35108821 upstream_gene_variant
A/T 35108829 upstream_gene_variant
G/C 35109008 intron_variant
A/T,* 35109011 intron_variant
G/C 35109014 intron_variant
T/A 35109293 intron_variant
T/A 35109303 intron_variant
A/G 35109382 intron_variant
T/C 35109388 intron_variant
A/T 35109419 intron_variant
T/C 35109442 intron_variant
T/G 35109551 intron_variant
A/T 35109573 intron_variant
A/T,* 35109670 intron_variant
G/T 35109722 intron_variant
C/A 35109782 intron_variant
A/T 35109790 intron_variant
C/G 35109895 intron_variant
A/G 35109991 intron_variant
G/C 35110119 intron_variant
G/T 35110288 missense_variant p.Pro54Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30246.1
MSSFVENNSHQHDHTNQISEPNFHGLSFKPNCSQQKRVIDFDLNEPEIDAMASPPLMDNNLVPISQVSADNVPVATEGCQTLATTSDLLPPTQVIEQVHSSNSNHDITVKFPFDLNAEFDEEDSISRTEEARHKVVETIPTIPSTHSELTPQDVPPTDMDNEDRASVVEGGTATSETRKRKKSTEGEYVKVHARSFRGKTLTVNVESRRRTIVDDGYRWRKYGQKTIKGNLFPRAYYKCTSSGCSVRKHVERDSRNRKNVITTYEGKHNHEQPSPKNPNEKHYAEEDDEDEEDDTEEVATAASNDLWNFRLSESMNFLNTPQPAQHRLHTLELFRNDTNPGFAYAGSVWPFGSFNMNITSSSYTTQMHYSSFLNSTNTMPYRFYGLDLNRFAAPQTEFPMPPPFNIPSSSQVFSIGSSSVFPLRGAIYRRW*


CDS Sequence:
>Vu_30246.1
ATGTCGTCTTTCGTGGAAAACAATAGCCACCAACACGATCACACCAACCAAATCTCAGAACCCAACTTTCATGGTTTATCTTTCAAACCCAATTGCAGTCAGCAGAAAAGGGTTATCGATTTCGATTTAAATGAACCCGAAATCGATGCAATGGCTTCTCCTCCTCTTATGGACAACAATTTGGTTCCAATCTCTCAGGTTTCTGCTGATAATGTCCCTGTGGCAACGGAAGGTTGCCAAACTCTTGCTACAACATCGGATTTGTTACCTCCTACACAAGTTATTGAACAAGTGCATTCATCCAATTCCAATCATGACATAACAGTGAAGTTTCCATTTGATCTTAATGCTGAATTTGATGAGGAGGATTCAATTTCTCGCACTGAGGAAGCACGTCACAAAGTTGTTGAAACCATTCCAACTATACCTTCTACTCATTCGGAGCTCACACCACAAGATGTTCCTCCTACAGACATGGACAATGAAGATAGAGCAAGTGTTGTCGAAGGAGGAACAGCTACCTCTGAAACCAGGAAAAGAAAGAAATCTACAGAGGGAGAATATGTGAAAGTGCATGCGAGGTCATTTCGTGGGAAAACATTGACTGTAAATGTTGAAAGCCGAAGAAGGACCATCGTGGATGATGGCTACCGTTGGCGAAAATATGGCCAAAAAACTATAAAGGGAAATTTGTTCCCTCGGGCCTACTACAAATGCACAAGTTCTGGGTGTTCTGTAAGGAAGCACGTGGAACGAGATTCGCGAAACAGAAAGAACGTAATCACTACTTACGAGGGGAAACACAATCATGAACAACCATCCCCTAAGAACCCTAATGAGAAACATTATGCAGAAGAAGACGATGAAGATGAAGAAGATGACACAGAAGAAGTTGCTACTGCTGCATCCAATGATCTATGGAATTTTAGATTATCTGAGAGTATGAATTTTCTCAACACTCCACAGCCTGCACAACATCGACTTCACACTCTCGAGCTCTTTCGTAATGACACAAACCCTGGATTTGCCTACGCTGGGTCTGTTTGGCCTTTTGGAAGTTTCAACATGAATATTACGTCTTCTTCTTACACCACTCAAATGCATTATTCTTCTTTCTTGAACAGTACCAACACCATGCCTTACCGTTTCTATGGACTTGATCTCAACCGTTTTGCTGCGCCCCAAACTGAGTTTCCAATGCCACCACCCTTTAACATTCCTTCTTCTTCTCAAGTTTTTTCTATTGGCTCCAGTTCAGTCTTTCCTTTGAGGGGTGCAATATATCGCAGATGGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_30246::LG8:35110447-35112447(-)
TCTATAATGTTATTTCAATAGATTTTAGGTCAGAATTTTGACGTCGTCAAAAATAAAAGTGAGATTTTGAAGATGCATCACTCCTTTGACCCTTCTCATTTTCTTTAAATCTTGATTAGAATAATCTTGCATAGTTTAAAAATCGAAATTAAAAACAATTTAAATATATATTCCTCTCTCAATGGACTTAACAATATCAATTAAGTATTTTTACCATATTACACATGTAATATTATTATTGACCACATTACCATAATATTTTGAAAAAAAAAAGAGTAATAAAATTCGAAACTTTAATGAGTATTTTTTCTTAACAAAATTCAAATTCTAAACTTCATTGGAAATTTTTTACATCAATTTCACTTAAGCTGGCATAAAATTTTGTTCTCATGCATTATTTAATGTATTTTATAATATTAATGAATATTTAATCGTCACCCACATAACCATTATTTAATTAATTTAGATTGGATTGTTTTTTTTTTAACAAAATTTTCCTTTAACACATGAGAGTCTGTTTGGTAAGAATAAAACATCTAACTCTTGAATAAGCTTTATGGGACATGATTCTTACATATTCTTAGTCTTACTCCTATTTTTACTGAGCATGTAAAGAGATTAGCTCTACTTAATCATAAATCTTCATTAATAGTGCTATAGGATTAATTTAATTTTTTGCAAATAATTAATTTAAACTTTAATGATTTTTTACATACTTGTCTTATATATGAATGTTATTTAATACTAAGACATTCATATTATGTTCCTTTCATATTATTCTGAAATAGAGTTTTAAGTGTGAAATAAGAATTATAAAAGAAGGAAAGTTTCAAATTTAGTTAACACTTTGAGACAGACTATAAGCCATAATTCCTGTAATAATTTGGAGTTTATTTATCTGGAAATATTGAATGGAGAAGATAAAGTAGACTTGGAGTATTAGGTGCAGTATATTGAAATTGATTACTCTGATGTTTTTATTTGTGTAAATATGATACATATTATAATTTTTTTTTGTTAAAATCTGAAAAAAATAAAATAAAGATAATGATGATGATCATCTACTTACAATAATTTATTTTATTATAAAGATATTTTTTTTATATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAGACACACACGTGTACTTATGTTTAGTTTAAGTTGTGAACTTACATATAGTGATATAAAGTTTTTTTTTTATTACTATTATTATTATATATTTGTACATTTTGTTTGGAATTTAGAATTTAAAGTTAAAGGTTTAATTTTTTTTATATACATGTTTAGACTATGTTTTGTAGTTCACATAATTTAAACCTAAGGTTATGTTTGTGATAAATGTGAAAATTAGATTATTTTAACAATTAATTTATATATATATCAATTAATGTAATAATTTATTATAATATTAATCAAATTTTATTTAAAAAAGTTTACTAAAAGTGTTTAAGATAATTATTTTGGATGCAGAATTTTTTTACCTAAGACTGTACAAATGAATAGTTAAAAGAAGAAAAAAAAAACTAATGAAAATAAATTATTTTTTAATTATTTTACTAAATATAAGCTAAAGTCCAAACATCTAGTTTGTTTTATGAATACTTGTTAATATAATCACAATCAAAATTTACAAAAAAAAAGTATTTTTTTTCCAAAGAAACAAAGTTTTGATATTTTCTTTTTTATATGCATTGACTTTTAAACTCCGTTGTTTTTTTCTTTTTTCATTTAACCTTTGACATGATGTAACAGCTTAGTTATGTATTTAGTCTAAGTACTTTCCTTTCATGATCACAGCTTGTGGTAGCTATACACAGTTTCAATTAGTAAGAAGTGTTTTATTTCCTTAATTTGCATCTAAATTGTCCATATATTGGTTGCATAAGTTGTGTAAAAACACAGCAAAAACTTCAATGGTTTAAGATCCATTCTTCTATCAGCCAAATCCTAGTTTTCGATTTTCACAAA


Gene Sequence:
>Vu_30246(-)
ATGTCGTCTTTCGTGGAAAACAATAGCCACCAACACGATCACACCAACCAAATCTCAGAACCCAACTTTCATGGTTTATCTTTCAAACCCAATTGCAGTCAGCAGAAAAGGGTTATCGATTTCGATTTAAATGAACCCGAAATCGATGCAATGGCTTCTCCTCCTCTTATGGACAACAATTTGGTTCCAATCTCTCAGGTATTGTATATCTATGTGTGTTTTGATTCAAAAAATTCTTTTTTTTCTTCCTCATTTCATAATAAAAATGTTTTCTTTATGCTGTATGTTACTAGTAAGTTTCAATAATTGATCCATACACTGTGTTTTTCACAGAACTATTTTTTGTAAGAAATTAATTTGGGGGAAAATTGATTTTGAAATGAAATAATTTATGTTTCGGTATATATTATTTTAAAAGTAATTTCACTGTTCTGAATTTTTTCTCTCAATCTGATATGATGATTTAGTCTTCTAAAGATATTTAAATGTAACTGCGTTAATGATTAATCTCATACAAACCATACCTAATTAATAGATAAATAGACAGAGATAGATACTCAAAATTAAAATAACATTTGAACTTGAATTCGAATTATAAAAACAAAGAGGTAAATTTTTGTTTAAATTAATTAGTTTTTTTTTATTGCCAAAGAATTTTAATGAAAGGAAGAATTTAGGATGCCCAAACCAATATACAATATACACTAATATTCTGTATTTCATTCCCATTAATTTGAAGATTTAACACAATATCGTAAAGATACACAAAACAATATTTACCATACTTCCTTAGCAGAAGATAACTACTATTAGCACAAACATCATCAGATTTGCCTATAAATTGTAATATGCTATATGCCTTTCCATTTCTCTATCATAATAGATAAGATCAAATTATAGAAATTAATTAGTATTTTAACAAAATTTTATATTTTTTATGAAGATTTCACGTTAACTGGATAGATAAGATCAAATTATAGAAATATAGAACAATATATAAGAGCAAACTTTTTATTGAACTAGTTTAGTATATTTGAGTTAGATCATAATTTCAATAGTAGGTATTACAATAAAGTTCAAATCTCAACTAATCTTATTCAACCAATTTAGTGAAACTGAGTTAAATTTAAATTTTTCTATTTTAATAATTTATTAAAGTCATTCAAAGTTTATTATAGTCAATATTTGATCAAATTCATCTCAATTATCAGACTCAAACGAGAGGGTGTGTCAGATATTAATTTCATAAGATTAAATTATATAAGTAGTGAAATTAAATCGACCATATTACTAAGTGATTAGGTCAAAAAAATTTGAAAAAAGAAGAAGTAATCTTTGTCTTGTAGGCTTATAAATGTAATCATTTAAACATAATTATGACATTGGATACCATCATGCGTGCAAACTCATTTGTGTGGGATGTTTCAATTTAACATTATCTTAAATTTAATTTATAGATGTACAGTAGCACTAAATATTCATAGACATTTGTTATTCACAACAAAGGTTGTATTTTGTATAAAATATCTGTAATTTTAAACCCAACAAAGAAGATTAGTTTATGAAAATATTACAATTATAATTTTATTTCTCATAAAAATACTAATTATTTCTTGTCTTTATATTTAATATAATGATGTCACTGTAGTTATTCTTTACAGATTTTCAGTCTTACTAGGAATCTAAAACTACGCTCCATTTTTGTAAATGCTATACACACACACTTTTAAGGAATCGCATAACTAGCCATGATATTTTTAGAAAAGTTTACATATATTTTAAATACATGTAATATATATACTCAATTTTCTACTTTATTCATTCTAAACATGTTTGATAAGTTGTGTGATGACATGCCATTTTATATTATTTTTAATTTGATAAATATAAACACTATATTTGTCCTTTTTATTTTGAATTTTAATTTTTATGTTTTGCATCACCTATAGGTATCAAAGAGTATACAACGTCTTATACTGCATTCATCTATCTGTATTTCATTCTTTGCAAAGAGTTATGAAGTTTGGGTCTCATAATTGTGTGTCCATATATTTAACATATAATGGAAATCGATAAACACATACTATTGTAGTGTTCAATTCAAAAGATATATTTTTCTGTTTTTGAAATAATTTTGAGATGATTTTAATACTAGGTTAATAAAAATATAATTGTATTCTAAATTTATTGAATAAATTTTTATTATAATTATAAAAACTAAGGAATAAATCTTAAATATTATTTTATTTTTAATATTAGATAGATGAATTAGATTTATTTTTGTAATACATTTAACTTATATTATATTTAACCAAACTAGTTTATAGGCAATTTTGAATATATAAATTTTAATTGTTAATTTAAATAATCTCATAATGTTCTAATATGCAAAATGGTGTCAGTGTCCAACATTTCTGAAACTTAACGTGTCAGAAATGTTCATGTCCATATCGTATCAAATGTCCTGATGAGTAACCATGATAGATACATTAGTGCATAGATTAGGAGTAATTAGTAACTAATCTGTTTTGTAATTCACCGAAAGTATACACGAATTTGTCATATATGAAATGTTCAGGTTTCTGCTGATAATGTCCCTGTGGCAACGGAAGGTTGCCAAACTCTTGCTACAACATCGGATTTGTTACCTCCTACACAAGTTATTGAACAAGTGCATTCATCCAATTCCAATCATGACATAACAGTGAAGTTTCCATTTGATCTTAATGCTGAATTTGATGAGGAGGATTCAATTTCTCGCACTGAGGAAGCACGTCACAAAGTTGTTGAAACCATTCCAACTATACCTTCTACTCATTCGGAGCTCACACCACAAGATGTTCCTCCTACAGACATGGACAATGAAGATAGAGCAAGTGTTGTCGAAGGAGGAACAGCTACCTCTGAAACCAGGTTTTTCTCTATCAAAAGTATCATTGGCATCACACTGATATCAACTATTTATGTATTGGTATATTGTATGATATGCAGGAAAAGAAAGAAATCTACAGAGGGAGAATATGTGAAAGTGCATGCGAGGTCATTTCGTGGGAAAACATTGACTGTAAATGTTGAAAGCCGAAGAAGGACCATCGTGGATGATGGCTACCGTTGGCGAAAATATGGCCAAAAAACTATAAAGGGAAATTTGTTCCCTCGGTATGTGTTCGTTCTTTACATGGAATTTCTCGCTTCTACACCTAAATGCATCTATTCTTCGCATTATGGAAAACTGTTTTGCCCTAGTTCATATTCATTCGTGCAATTTTGCCAATATGCATTAACTTGAAGATAAACTTTTCCTGGGAAATTTCTAGGGCCTACTACAAATGCACAAGTTCTGGGTGTTCTGTAAGGAAGCACGTGGAACGAGATTCGCGAAACAGAAAGAACGTAATCACTACTTACGAGGGGAAACACAATCATGAACAACCATCCCCTAAGAACCCTAATGAGAAACATTATGCAGAAGAAGACGATGAAGATGAAGAAGATGACACAGAAGAAGTTGCTACTGCTGCATCCAATGATCTATGGAATTTTAGATTATCTGAGAGTATGAATTTTCTCAACACTCCACAGCCTGCACAACATCGACTTCACACTCTCGAGCTCTTTCGTAATGACACAAACCCTGGATTTGCCTACGCTGGGTCTGTTTGGCCTTTTGGAAGTTTCAACATGAATATTACGTCTTCTTCTTACACCACTCAAATGCATTATTCTTCTTTCTTGAACAGTACCAACACCATGCCTTACCGTTTCTATGGACTTGATCTCAACCGTTTTGCTGCGCCCCAAACTGAGTTTCCAATGCCACCACCCTTTAACATTCCTTCTTCTTCTCAAGTTTTTTCTATTGGCTCCAGTTCAGTCTTTCCTTTGAGGGGTGCAATATATCGCAGATGGTAA