Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30245 LG8 35100357 35103898 "PREDICTED: probable WRKY transcription factor 71, partial "
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09159 Environmental adaptation   C 04626 Plant-pathogen interaction [PATH:ko04626]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 35100756 missense_variant p.Asn257Ser
T/C 35100775 missense_variant p.Met251Val
C/A,* 35100820 stop_gained p.Glu236*
C/A 35100821 missense_variant p.Arg235Ser
G/A 35100828 missense_variant p.Pro233Leu
C/T 35100941 downstream_gene_variant
T/A 35101021 downstream_gene_variant
T/G 35101178 missense_variant p.Met170Leu
T/A 35101196 missense_variant p.Arg164Trp
A/G 35101222 missense_variant p.Leu155Ser
G/C 35101330 synonymous_variant p.Ser146Ser
G/A 35101378 synonymous_variant p.Asn130Asn
G/C 35101445 missense_variant p.Thr108Arg
A/C 35101450 missense_variant p.Ser106Arg
A/T 35101616 missense_variant&splice_region_variant p.Val51Asp
T/A 35101903 downstream_gene_variant
A/T,* 35101920 downstream_gene_variant
G/T 35101942 downstream_gene_variant
C/T 35102029 downstream_gene_variant
A/T 35102165 downstream_gene_variant
T/C 35102252 downstream_gene_variant
C/G 35102286 downstream_gene_variant
T/A 35102294 downstream_gene_variant
T/C 35102328 downstream_gene_variant
A/T 35102387 downstream_gene_variant
T/A 35102432 downstream_gene_variant
T/C 35102458 downstream_gene_variant
A/T 35102508 downstream_gene_variant
C/G 35102614 downstream_gene_variant
A/G 35102843 downstream_gene_variant
A/G 35102867 downstream_gene_variant
C/A 35102930 downstream_gene_variant
C/T 35103117 downstream_gene_variant
G/A 35103312 downstream_gene_variant
C/G 35103399 downstream_gene_variant
A/G 35103481 downstream_gene_variant
T/G 35103546 downstream_gene_variant
G/T 35103555 downstream_gene_variant
A/T 35103653 downstream_gene_variant
T/A 35103898 initiator_codon_variant p.Met1?

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30245.1
MSTSIENKHHQINETTAINSAERGFHKERRDLDFDLNEPMININLVPNSQVCNDNCDVLGPPKKAVEQVHSSNSNDVKMVEFPFDLNAKIDEEDQISCSKEVGGWSETIQPLPSSYLEEVDEEHVLPTDNGNEDRSSVVGGASNTSQNRKRKRSIEECEKGRGKGFRRENVEVKIKRQNQNTVDDGYHWRKYGQKPIKGNLFPRAYYKCTTVGCSVKKHVERDSRNQKNLISTYEGRHNHEQPNPSKQYIHDEEDEQLAAVAAANALLTFGSPGTSNFFNTPNPPVHTLQLLPDHTNPEFFNMFIRSNPFGSFNYNMNIGSSYTPPMHYSSFLNNVITMPYGLNLARYVPPPFNIPFSFEGFSQDWMNANGSSSVFRCRETSARDRSRH*


CDS Sequence:
>Vu_30245.1
ATGTCCACTTCCATTGAAAACAAGCACCATCAAATCAATGAAACCACAGCTATCAATTCTGCAGAAAGGGGCTTTCATAAGGAGAGAAGGGATTTGGATTTTGATTTGAATGAACCTATGATTAATATCAATTTGGTTCCAAATTCTCAGGTTTGTAATGATAATTGTGATGTGCTTGGTCCTCCTAAGAAAGCTGTTGAACAAGTGCATTCGTCGAATTCGAATGATGTGAAAATGGTGGAGTTTCCCTTTGATCTTAATGCAAAAATTGATGAAGAGGATCAAATTTCTTGCTCCAAGGAAGTTGGTGGCTGGAGTGAAACAATTCAACCTTTACCTTCCTCTTATTTGGAGGAAGTTGATGAAGAGCATGTTCTTCCAACAGACAACGGTAACGAGGACAGATCCAGTGTTGTCGGGGGAGCATCAAACACTTCCCAGAACAGGAAGAGAAAGAGATCGATTGAGGAATGTGAGAAAGGGAGAGGGAAGGGTTTTCGTAGAGAAAATGTGGAAGTGAAGATTAAGAGACAAAACCAGAATACAGTAGATGATGGCTATCACTGGAGAAAGTATGGTCAGAAGCCTATTAAGGGAAATTTATTCCCTAGGGCCTACTACAAATGCACAACTGTTGGATGTTCAGTAAAGAAGCACGTGGAGCGTGATTCGCGTAACCAAAAAAACTTGATTAGTACCTATGAGGGAAGACACAATCACGAACAACCAAACCCTAGCAAACAATATATACATGATGAAGAAGATGAACAACTTGCTGCTGTTGCTGCAGCCAATGCCCTATTGACTTTTGGATCACCCGGAACTAGCAACTTTTTCAATACCCCAAACCCTCCAGTTCACACTCTTCAACTACTTCCTGATCACACAAATCCTGAATTTTTCAATATGTTCATCAGATCCAACCCTTTTGGAAGTTTCAACTATAACATGAATATTGGGTCTTCCTACACTCCCCCAATGCATTACTCTTCTTTCTTGAATAATGTCATTACCATGCCTTATGGACTTAACCTTGCTCGTTATGTTCCACCTCCATTTAACATACCTTTTTCTTTTGAAGGTTTTTCTCAGGATTGGATGAATGCTAATGGGTCCAGTTCAGTGTTTCGTTGCAGAGAAACAAGTGCAAGAGATCGTAGCCGGCACTAG


Promoter Sequence:
>Vu_30245::LG8:35103898-35105898(-)
TTTGAAACTTTACTTAGACTATATTAACTCAATCTGCGTTATAATACAATTAATGAATCAAAATCAAACATGAGATTTTGTTTGATAAGATTAACTTAATTACACTTTTTTTCCTCTAGTATGATAAGTCGATTATTTGTTTCTCATAATTTTGATTGTTCATTTTATTCGTGCATTAGAAAAATGAACACTTTTTTTTATAGTTTTAATTTTGGTTAACGTATTTAAAGAATTTACATTTATATTTATGGCATTTACTTAGCATTCAATTTTTAACCTATACGATCATATTAAATTTTCATAAGTATCTCGAGATATTTATTATTTAGTTTTTACAAGTTAAGTAATTTAATACAAAATATTTAATTATTTAATAAATAACATTAAACAATTTAATATTAAATAATTTATTAAATACATTAAAAATAAAGTATAATAATATAAATTCACTATCCAACTAGAAATAAATTAGCTAATTGGATTGTGGCATCACCAGAAACGTTAAAAATGGATGGTATGTTAATGGTGAGACTAAAATCATCAAATTTTCAAATTGTGTAAATCAAAATTCAAGAATGTGAACCAAAGTTATTTATTTCATAAATTTTTGGTTCAAAATTGAACCATTATGAAGATTACATTTGTCGCATACGAAACTATAGATAGACAAAAAATTGAATAAAGAAATTTACCATTTTTCAACTAATATTGTTGAACACAGTTAACAAAAATAGTCTTATGTAATAAACTCATAAATGTAAAATGTTTTTAGTACTTTAAAGGAAAACTAAATATTACGAGAGTTTCATCCTTTAAATATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATATGTATGTATGATCTCAGGCAGAGAAATGAAAGACTATGTGTAATTATATAGTTTAAACATGAACTGAAATTTTGGATTTTTATAGATAATTTTAGTAGTTTATTGTCTATGTGATAGACTTATTATAAGCATACTATATGTAGGAATGGGTATAGACTTTGTTTTTATTTTCCTCATTCATATGAATCATATGTATAAATGTTTGGAAAATTTGAATCTTGAGCTGCATAAACTCTCATGAATCTGACTTCATAACTTTTTTTTGGTTACAAATTAAATAAATAAGATAGCTCATTAATATGATAGATTAAAATATTTAGTTTAATCTAATTATTTTCGTATATTTTTTTATCAAAATAATAGTTTTAGAAAAGAAGAAGAAGAATTTAAAAATAGAAAATAAATTTAAAATACATTTTTTAAAAAATATTTAAAAATAAATAAACTAAAAAGTTTAATTATAAAAAAGTTGGATGTACTAATTTTGAATTGTTAAGTATTATTAAAAGAATTCATTCAATTTTGAGAAATAATAAATGAATTATTAACTATTCATAAAATTTAATAAATAAACTCGATTCAATTTATTTTTTATATTTTATAATAGTTATATTAAACAAATCTATTGTAAATGAATCAAACATCTTCTGATTAAGCTACTTGATGATCATACAGTCCACTTTGCCCTGGACAATAAAATTGTGTTGCTGTAATACTAATCACATAGTCCATCAGTGATAAAATTTTGTAACAATAATTAATTTTTTGCACGAAAATAAATTTGTATACATCAGATAGTGACATAATTTAATTAAATTAAAATATACAATGAAAAATACTTTCATTTGCTAAATTGATTTGGTAAAATTAAAGATTTTTTTAATTGTGTACTTGTTGTAGACATTGGAACAGCTTAAACACATATGTAAAGTAAAATTTTCCTTTCATGATCCTACTCTGGGGTATGTGTAAAAAAGTAGATAATTATTAGTTTTTTATTTCCTTAATTCATGTTTCAAATTTTTCATATATTCATTATAGCATTTTTATGTGTATAGAATATATTCAAAGCAAAATCTGCTTCATTGGTACCTACCTAGGTTTCAATTTTCACCACACC


Gene Sequence:
>Vu_30245(-)
ATGTCCACTTCCATTGAAAACAAGCACCATCAAATCAATGAAACCACAGCTATCAATTCTGCAGAAAGGGGCTTTCATAAGGAGAGAAGGGATTTGGATTTTGATTTGAATGAACCTATGATTAATATCAATTTGGTTCCAAATTCTCAGGTATATCATCACCTTTCAATCTATTGTTCATTACAAAAAATATGCCCTTTTTAATAGTTCTATCTTTTGTGTATTGATTTTTGTTAAAATGATTTTGGAGTAAAATAATTAGTTTGGAATATTCTAAAAATTAAATTAGTATAATTTGTTTATTTGACACAAAAATTACTTAGAGTTACTTCAGTTTAAATCACAATCAATTATAAATCTACACTTGATTTTTCACTATGCCATCCAACATGTAATTTTTGTCTAAATTATGTTTGCTTTTTGTTAGTAAAAAGAGAAGTACAATAAATTTAAAGGACACTTGAAATAATCTAGCTCTAGAATATCCATTAATTCATTCGAAAATCTTAAATCTATAGTTTTTATAACCAATTTTACGTGCATACAAATGTAGATCTATAATGTTTCATGATAACTTTGTAAATAACTCTTCCATTTCTGTAATATTGTAGCACACAATCATATTGATAACATATATTTAAAACTGGAAAGCATATCTCAATAGTTTTCTTTAGATTCCTTAGCGTGTGTCTTATAATTTGATTTGTCTATTTTCTTACCCAAATTACATTTAAATCACAAGTTCTGATTAGGAGAGTGAAGGTCAAATTATTTCAATTTAGTTAGTAGTATCAGATTCAATTTTTAAATCAGTATAGTTAAAAAAGTAATTTTGTTTTTAATGATTATACACTAATAGAATAAGATTATCTCATTGGAGGAGTATCATTAGTTTATTGTTTGTAAATATATTATAAGACACTTCATCTCTATTTACATAATTCTCTTTAAAAAAATAGCTTGTTCATGTTTTTTATTATAAGGCAATTTTTCTATTATACGTTGCTTCAATTAATTTTTCTTAAAATATTTTTAATTAATTAATCATTTTTAACTAAAAACAATAAATATTTAAAATTAATTATATACAAATTATTTTTCTATTTTCTTTAAGATGGGAAAGGATGAATTGAAACCAATTTTTTAACTGGAATTGTATATTAAAATTTGCGATATTTTCAATAGATATAAAATACATTTTTATTTTTATTTTTATCTTTTTTAAGCTTGTATTTTTCAGAATAACATAAGATATTGACCTTTTAGCTTTAGTCCTTGTGCTAGGTATTGTTTCATTATGTTATGTGAATACTTGTCATTTATAATTTTTTATCACGTTTGTACTACTATTTATTTTAGTTATTTCTTCATATAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTATTTATATTTATAATAGATCATAAAGGTTTTTTAACCCCCATTTTTATGTTAGTTTAAAAAATATTTTATTTTAATCTAACTTTAGCCACGTCAAATACATTTAGTGATTATTATGTAGTGGTAGAGACTACTCCGTAATATTTAGTGTAACAACAAATAAGTATGATAAGAAAAATGACAAATAAATTAAAGTTTAATAATTTGTTAAATGAAATTAAAAAAATAAAGGGGATATAGAGATATGAACTTGAGATATTTATGTGGTGATTAGGTAGGATTTTTAGAATCCCTTATCCAATATTTACTGAAAAATTATCAAGTTGGGTTGAAATTCTTCAATTCTTTATGTTAAATCTATTCAATTCAAATCTAATGGATTGAATTGATCGAGATTAGTTGGATTAAAGTTTTTAAAGGATTTTTTATTGTTCAAATTTATATTTTTTAAGTATCAACTTAATTTAAAAATAACACGATTTTTACAAAAATTCCTCTTTCCACTTTCTCCCCCTTACTTACAGGTTACAGTTACATTCAATATTACATGAGTTACTTTTTAAAGATTAATTAAATAAAAAATATTTTAGTGAGTAAAAAAAAAGATAATATTTCTATCTAACATGCATTTATTATTTTTCTCATAATTCATCCTTATGGAAGCATCCAAATTGACAATTCACATCGGTAAATATTTTCCCACTCTAAAAATTTAATTAAATTCAAATATTTTTTATTTATTTCGTTTTGTCGTATGACTTACAAAATTTATATACTTGTTTCTTCTATTTATAGAGTGAACACTAATATATTTTTTATTAAAATGCCTGTAAAATTGATCATATATAACATGAGTTTATCAGGTTTGTAATGATAATTGTGATGTGCTTGGTCCTCCTAAGAAAGCTGTTGAACAAGTGCATTCGTCGAATTCGAATGATGTGAAAATGGTGGAGTTTCCCTTTGATCTTAATGCAAAAATTGATGAAGAGGATCAAATTTCTTGCTCCAAGGAAGTTGGTGGCTGGAGTGAAACAATTCAACCTTTACCTTCCTCTTATTTGGAGGAAGTTGATGAAGAGCATGTTCTTCCAACAGACAACGGTAACGAGGACAGATCCAGTGTTGTCGGGGGAGCATCAAACACTTCCCAGAACAGGTTTTGCTCTTTCAAACATATGTCAGTTTTATTTTAATTTACCCAAAAAAAATATTGATATTATTTTTTATTATGTTAAAGGAAGAGAAAGAGATCGATTGAGGAATGTGAGAAAGGGAGAGGGAAGGGTTTTCGTAGAGAAAATGTGGAAGTGAAGATTAAGAGACAAAACCAGAATACAGTAGATGATGGCTATCACTGGAGAAAGTATGGTCAGAAGCCTATTAAGGGAAATTTATTCCCTAGGTATTGTGCTCTCTCAAAGCTCAACTATGCATTATTTATTTTCTTCTATTCCTCAACATTAGACCTAAGCTTTCATGCTATAGTATCGTAAACATTAATGCAAATTTTAGTTTTGCCACATCATTCATTAACTCGACAAGTTTCAATGGATGTTTTCTAGGGCCTACTACAAATGCACAACTGTTGGATGTTCAGTAAAGAAGCACGTGGAGCGTGATTCGCGTAACCAAAAAAACTTGATTAGTACCTATGAGGGAAGACACAATCACGAACAACCAAACCCTAGCAAACAATATATACATGATGAAGAAGATGAACAACTTGCTGCTGTTGCTGCAGCCAATGCCCTATTGACTTTTGGATCACCCGGAACTAGCAACTTTTTCAATACCCCAAACCCTCCAGTTCACACTCTTCAACTACTTCCTGATCACACAAATCCTGAATTTTTCAATATGTTCATCAGATCCAACCCTTTTGGAAGTTTCAACTATAACATGAATATTGGGTCTTCCTACACTCCCCCAATGCATTACTCTTCTTTCTTGAATAATGTCATTACCATGCCTTATGGACTTAACCTTGCTCGTTATGTTCCACCTCCATTTAACATACCTTTTTCTTTTGAAGGTTTTTCTCAGGATTGGATGAATGCTAATGGGTCCAGTTCAGTGTTTCGTTGCAGAGAAACAAGTGCAAGAGATCGTAGCCGGCACTAG