Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30243 LG8 35087154 35092383 PREDICTED: zinc finger CCCH domain-containing protein ZFN-like isoform X2
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 35087174 3_prime_UTR_variant
T/C 35087177 3_prime_UTR_variant
T/C 35087407 3_prime_UTR_variant
G/T 35087426 3_prime_UTR_variant
T/C 35087501 3_prime_UTR_variant
C/A 35088003 stop_gained&splice_region_variant p.Gly382*
C/T 35088019 upstream_gene_variant
C/T 35088025 upstream_gene_variant
A/T 35088052 upstream_gene_variant
C/T,* 35088282 upstream_gene_variant
A/T 35088284 upstream_gene_variant
G/C 35088503 upstream_gene_variant
G/A 35088849 missense_variant p.Pro374Leu
T/A 35088980 synonymous_variant p.Ile330Ile
C/T 35088989 synonymous_variant p.Arg327Arg
T/C 35089184 upstream_gene_variant
A/T 35089950 upstream_gene_variant
A/G 35089959 upstream_gene_variant
T/A 35090029 upstream_gene_variant
A/G 35090034 splice_region_variant&intron_variant
A/T 35090718 intron_variant
T/G 35090776 intron_variant
C/A 35090799 intron_variant
C/T 35090800 intron_variant
T/G 35091114 intron_variant
C/T 35091204 intron_variant
T/C 35091313 intron_variant
T/A 35091674 missense_variant p.Arg93Ser
C/T 35091675 missense_variant p.Arg93Lys
T/C 35091710 synonymous_variant p.Glu81Glu
C/T 35091713 synonymous_variant p.Pro80Pro
T/C 35092181 missense_variant p.Arg29Gly
G/A 35092200 synonymous_variant p.Arg22Arg
T/A 35092378 5_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30243.2
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>Vu_30243.1
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CDS Sequence:
>Vu_30243.2
ATGGAGAAGAAGAAGCTCAACGTCATCATCCCTGATGCTCAACCTCATGGAATCATTCCACGCCGCAATTCCCCTATCTCTCAAAGACAAGATTCACTGTGGATGATGAATTTGAGGAGTGGCGAAACAATGGATTCTGGAGCTTATCCGGAACGTCCAGGGGAGCCAGACTGTTCATATTACATCAGAACTGGACTCTGTAGATTTGGTGCAACGTGTCGTTTTAATCATCCTCCTAACAGGAAGCTGGCTATTGCTACTGCAAGGATGATAGGCGAGTTCCCAGAAAGAATAGGACAACCAGAATGTCAGTACTATCTGAAGACAGGAACTTGCAAATTTGGCGCCACATGCAAATTTCATCATCCTAAAGATCAGGCTGGGATTGCTGGAAGAGTTGCCTTAAATACTTTAGGCTATCCGCTCCGACCTAATGACCCTGAATGCACTTATTATTTGAGAACAGGACAATGCAAATTTGGAAACACTTGCAAATTCCACCATCCTCAACCGAGTAATATGATGCTTTCATTACAGGATTCTTCTGTTTACCCTACTGTCCATTCTCCAACTACACCAGGTCAGCAGTCGTATGCAGGAGGAATTACAAATTGGTCAAGGGCATCATACATCCCTAGTCTTCGCTGGCAGGGTCCTTCAAGTTATGCACCCTTAATTCTTCCTCAGGGAGTGGTTTCGGTGCCTGGGTGGAGTGCATATGGTGGTCAAGTGGGATCAATCTCTACTTCAGACAGTCATCAGCAAGTAATGAGAAATGGTCAAACATATGGAACTTCTCGCCAAGGTGAGCTAGCAAACGCAGGATCACATGGAGCATACTCTCAATTCCGTTCTGGCACTGTTCCAGAAGGGTTTTATGCATTGCAGAGGGAAAACATATTTCCTGAGAGACCTGGCCAGCCTGAATGCCAATTCTACATGAAGACAGGAGATTGTAAGTTTGGTGCAGTCTGTCGGTTCCACCACCCAAGCGAAAGGCTAATTCCTGCTCCTGACTGTGTCTTGAGTCCCATGGGCCTTCCTTTACGTCCGGGAGAACCTTTGTGTGTCTTCTATTCACGTTATGGCATATGCAAATTTGGCCCAAGTTGCAAGTTTGACCACCCAATGGGAATTTTCACCTATAATATCTCTTCATCGCCTTCAGCTGATGCCCAGAGCAGGCATCTGCTACGATCTTCATCAGGAACTGCTGCGTTAAATTTATCTTCGGAAGGACTTGGTGAATCGAGCTCAGCAACGCCCAGGCGGCTTTCATTATCAGAGACAAGACAGATACCATCTGGTGATGATGACATTGATGATGATGGATGATGATGTCTCTTGAAAATGGGTCATTTAGCTTTTACAATTTTTTTAAGGGGAGAGATGACTAATCTGTAA

>Vu_30243.1
ATGGAGAAGAAGAAGCTCAACGTCATCATCCCTGATGCTCAACCTCATGGAATCATTCCACGCCGCAATTCCCCTATCTCTCAAAGACAAGGTTTGGTATTTGTAGCCACTGTGTGCATTGATGATGTGGCTTCAGTTTCGCTTACATCATGCTGTTCACGCGTGTATGATGTTGTTTCAGATTCACTGTGGATGATGAATTTGAGGAGTGGCGAAACAATGGATTCTGGAGCTTATCCGGAACGTCCAGGGGAGCCAGACTGTTCATATTACATCAGAACTGGACTCTGTAGATTTGGTGCAACGTGTCGTTTTAATCATCCTCCTAACAGGAAGCTGGCTATTGCTACTGCAAGGATGATAGGCGAGTTCCCAGAAAGAATAGGACAACCAGAATGTCAGTACTATCTGAAGACAGGAACTTGCAAATTTGGCGCCACATGCAAATTTCATCATCCTAAAGATCAGGCTGGGATTGCTGGAAGAGTTGCCTTAAATACTTTAGGCTATCCGCTCCGACCTAATGACCCTGAATGCACTTATTATTTGAGAACAGGACAATGCAAATTTGGAAACACTTGCAAATTCCACCATCCTCAACCGAGTAATATGATGCTTTCATTACAGGATTCTTCTGTTTACCCTACTGTCCATTCTCCAACTACACCAGGTCAGCAGTCGTATGCAGGAGGAATTACAAATTGGTCAAGGGCATCATACATCCCTAGTCTTCGCTGGCAGGGTCCTTCAAGTTATGCACCCTTAATTCTTCCTCAGGGAGTGGTTTCGGTGCCTGGGTGGAGTGCATATGGTGGTCAAGTGGGATCAATCTCTACTTCAGACAGTCATCAGCAAGTAATGAGAAATGGTCAAACATATGGAACTTCTCGCCAAGGTGAGCTAGCAAACGCAGGATCACATGGAGCATACTCTCAATTCCGTTCTGGCACTGTTCCAGAAGGGTTTTATGCATTGCAGAGGGAAAACATATTTCCTGAGAGACCTGGCCAGCCTGAATGCCAATTCTACATGAAGACAGGAGATTGTAAGTTTGGTGCAGTCTGTCGGTTCCACCACCCAAGCGAAAGGCTAATTCCTGCTCCTGACTGTGTCTTGAGTCCCATGGGCCTTCCTTTACGTCCGGGAGAACCTTTGTGTGTCTTCTATTCACGTTATGGCATATGCAAATTTGGCCCAAGTTGCAAGTTTGACCACCCAATGGGAATTTTCACCTATAATATCTCTTCATCGCCTTCAGCTGATGCCCAGAGCAGGCATCTGCTACGATCTTCATCAGGAACTGCTGCGTTAAATTTATCTTCGGAAGGACTTGGTGAATCGAGCTCAGCAACGCCCAGGCGGCTTTCATTATCAGAGACAAGACAGATACCATCTGGTGATGATGACATTGATGATGATGGATGATGATGTCTCTTGAAAATGGGTCATTTAGCTTTTACAATTTTTTTAAGGGGAGAGATGACTAATCTGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_30243::LG8:35092383-35094383(-)
GAAAAATTTTCAAACTAAGCCCCCATAAACAATATTGAGCATTGATTTGAATTTCAAAGATCTAATTTATATTCTATCTTAATTCAAATCTGTAGATCAGATTTTGGATCCAGATTTTTTTTTTCGTGAAAAACCAATTTGGAATTAGGGTTCCTGAAATTTTGAAATAGAGAAATCTCAAAGAAGAAGCAGCAAAGAGGATTTAGGGTCTTGGAATTTTGAAAAATTTCGAGTGAATTGCAAAGGAGAAGCAACAGAAGGATATAGGGTTCTTAAATATTGAATCGAAGATTGGATCAGATTATTTTTTTAACTGAATATAATCTGGATTTAAAATTCGGATTTTTTTATTTTTAAAATCTATATAACTAAATCAGAAATCTGATTTGGAAAAATTATAAAATACAGATAAAAAATAAATAAATTTCATTCAACCGACCAATATAGATCAAAAGTAGATGAGATTGGGCACACTAGATTTTTCCCCCACGTTAGAAGTTGATCGGGAAGTTAACTCTCGTCCCGCAAATAACCGAACATGGCTTACGTTTTAAGTGTTATAAAGAGTATATTTTCCAGATGAAGAGATGTAAGTTTGTTCAAGCTCATATCATCGTACTACAAATATAATATTAATAATCAAAATCTTCAAACTAAGGAAGAAACGCTTCGAACAGTTTTATTAAAATATTAAAAAAGCAATTTATTAAAACATATACATATGTATTATAGATTATACACATTAACTTGTCTATCTAAAATTAAAATTATTTTTCTTAATAGATTTAAATATAAAAATACATTTTTTTCTTATTATTTTTGTATAGCAAACCAAAATAACTTGTTTATTTGACATAAGCCTAGTCAAACTTATAAAATTAAACAATTTAAAATTTAAGTCAAGCGCAATCGACTTAAATTTAATAAGTTGTCCATGAGGTGCAATTTTAAATACAAAACATAAAAAAAAATATATTAAATTTTACAACAGTTTATTAAAAAAAAGTATATTTTTAGTCATCCTCTTTCTCTTGTAAACAAAAAATAACCAACTAATGATTTTGTCCATTGATAATGTCACCTAAATGAAATTCATTACTATTGATTTTGGAAAAGCAAATTAAATTATTTTATTATAAGTTTAAAACAAATATTAAAAAACATTTTTGTATAAATTTCCCCTTAACTTGTGCTTAAATTAATTTTTATCTATAAGAAGTTGAATTTATTTTTCTTCTTTACGTTTTTTTTTATAAAAAGTAATTAAAGATGACGTTACCATTCCGTGTCCCCAACCAAAATGTTATGATTTTTTCTCATAACGTTGTAAAAATTGTCACATTAACCATAATGACATCATTGCAATCACATCATTATTATAAAACTACTTAAAAGTAGAAACAAAACAAGATTAAAACAAATTTTAATATTCTACTTTTATTTTATTTTATATGCTTTTAAAAATTATTAATGTTTTTCTATATTATCAACAGTGCCATACTTTCTTTTTAATCTTTAACTTATTTAAAATCACTTGGCGTTTTGTGAATCGGTATTTTAAGTATCAATCAATGAAAATATTAATTAATTCGTAATAAATTTATAATTGAATTATAATAATATGGACGCAAAGTATTATTATAATAGTCCATGAACTTTTTATTTATAGAAAGAAAGGAGAGGAATAAAAAAGAGTAAAAGCAGGTGATGTCGTTTTGCACAAAAGTTGAAAACCATAGAAAGGCGGAAAGAATGAGAGAGTTTGTGGTTTGAGTTGGCGGCACCAATTAATGCGATAGCGAGAAAAAGAAATGCGTGCGAGGGAGTGAGGAGTGAGTGAGGTCATAGGTTAAGAAGAAAGAGGCTATTTTCTATGTATAATCACATTTTCTTTTTTTAAATTCACACTTTAAAATAAAAATAAATTAAATAAACGAAAATTGTTTATTGGTTTAATTAAAAAAAAGAAATAAAAAGGAAAGGGAAAAGAGATGGCACGT


Gene Sequence:
>Vu_30243(-)
GTGGGAGAAGAGAGAGAAAGAAGAGATGAGAGTTGTGGTGAGGTTTGTGGAGAGGAGAAGTTTCTCTTTTGAGGAATGGGGTGGAGAAGGTGGGAAATGAGAATTGAAAGGCTTATGAATGGAGAAGAAGAAGCTCAACGTCATCATCCCTGATGCTCAACCTCATGGAATCATTCCACGCCGCAATTCCCCTATCTCTCAAAGACAAGGTTTTTTTTTTAATATCTTTTCTCTTTTGTCGTTTCGTTTTTTCAAATTGAATTCGTTGGTTTAAGAAAGTAACATTTCGTGTTCCAATGCTTTGCGTTAGAGTTAGGAGATGTCATGTGTTCAATTCAGATCAATATTTTTTTTTGTGCTGGATTTAAACTGCTGCGAGAATCAAATTCGATTTCTATTGAAGCGGTGTTTGATTTTTGTTTTGTTTTTTTTTTTGTGAACATTTTAAAAATGATTATTGTAGTTATTTATCGTGATAACGGTAGTTGCACCGACAGTTTTTATTATTTTTTGTGATTGTAGGTTTGGTATTTGTAGCCACTGTGTGCATTGATGATGTGGCTTCAGTTTCGCTTACATCATGCTGTTCACGCGTGTATGATGTTGTTTCAGATTCACTGTGGATGATGAATTTGAGGAGTGGCGAAACAATGGATTCTGGAGCTTATCCGGAACGTCCAGGGGAGCCAGACTGTTCATATTACATCAGAACTGGACTCTGTAGATTTGGTGCAACGTGTCGTTTTAATCATCCTCCTAACAGGAAGCTGGTACGAGTTGGAATGCATTTATTTCTACAAATTATGTTGTAATTTTATGATATATGTGTTTAAATTAGATGATGTTTCTTGCTCTCAGACGGATTCATTTTCAATCCTTCCTATTGTCAAAATAAAATATTAAAATCTCTCTAGTTGGTCAAAGCTATGCACACTTGAAACTATCTGCTGTTGTCCTCTAACATCTTGTGTCCATCCCATGTTTTTGGTTAGCTTTTTTACTATGCAAAACACGTGCATTTCTATTCGTTGTACTGGATTATGACAGCATTTTATCACAGAAAGATGCACATAAACACTGGGGAGATGTTACTCTGTTGTATCTTCCTTTCTTGACGCAGCTCTTTTTGGCTTTTCGCATACATGCTCTTTTTTCACATTTAATGGTTTCACTTTACTGGAGCTACATAATGTTGAATCATACTGTGTTGTTGATTATTTTTATTTTTATATCATTTTTATTACATGGTGAATATAATTACTAATACTGATGATCTCCTATCAGGCTATTGCTACTGCAAGGATGATAGGCGAGTTCCCAGAAAGAATAGGACAACCAGAATGTCAGGCACGTATTAGTTTCTCAATGCATGCATAAGGTGTATGTTGCTTATTTGTTTGCGTGGTCTGGGAATCGTCTCCTTTTGGGTGGAGTTTAGCAATTTCTCTAAATCATATCAATCTTTGTGGGGTTAATTGTTGGATTTGGATTGACACTGGATATGGTTCTTGTGACCGTGGAAGGCTAGCCTAAAGCTGTCAGTGAATTTGAAAGTTGTGGAGAATGAAGGTGTAGGGGGAAAGGGAAGAATCATAAACTTGTGTGTTAGTGACTTTGCCTAAATTATGTGGCTATTGTTGTAATCAGATTCAGTTTACTTTGGCTTTTATTTAATTAAAAACCAACTTTTATTTAATTAAAAACCAACATATATTTATATTTATATATGTGTGTATGCATATTTGTATATCAAAAAACCAATTGAACAATTGAAAAGCTAAGGTGGATTAAATAGAAAATCTTGTTCTTGTCATTCCATATATGTCTGTATGTATATTTGTATATCAAAAAACCAATTGAACAATTGAAAAGCTAAGGTGGATTAAACAGAAATTCTTGTTCTTGTCATTCCGAATAACTGATTGTTATATATGTATGGCTTGCACGTATGTGTGCCATTCAGCTCTTAATAGCATGTGCTAATTCTTTATTTAAGCTCTGATATCAACAGGAGCTCTAGTTACTATATTACTTCATGCTAGACTATGCACGCTTATTTTGATCAGATTTTCTTATTGATTTTGTATTTTTGTTCTTTATGAGTAATAGAGATGTTAAGTGTTAACATCAACCTTGATCTTTGGAGCACTAATGTCTATCTTTATTTAATCATTCACCAATCACCATAACGAAGATGTCTTTTTTTTTTTTTTCTGTTTACCAGTACTATCTGAAGACAGGAACTTGCAAATTTGGCGCCACATGCAAATTTCATCATCCTAAAGATCAGGCTGGGATTGCTGGAAGAGTTGCCTTAAATACTTTAGGCTATCCGCTCCGACCTGTTAGTTTTTAATATTTATTCATTTATAATCATGATTACAATAGTAGTTGCTCATGAATTTGTAGCTTATTATTGTATCTTAACTCATTTGGTAACCAGTGAATTGTCAGACCTGCATATTATGGTTATACTTTCAAAAAATTTGTGTACTTGATGCAGATATTTAATATCTGACCTCTGAGCTTTATAGAAATTATACTTGCTTTCTGATTGATATTAGTGTTCATATAACTTACAAAATGTTTTCTTTGTCTCCTGATTCTGCAGAATGACCCTGAATGCACTTATTATTTGAGAACAGGACAATGCAAATTTGGAAACACTTGCAAATTCCACCATCCTCAACCGAGTAATATGATGCTTTCATTACAGGATTCTTCTGTTTACCCTACTGTCCATTCTCCAACTACACCAGGTCAGCAGTCGTATGCAGGAGGAATTACAAATTGGTCAAGGGCATCATACATCCCTAGTCTTCGCTGGCAGGGTCCTTCAAGTTATGCACCCTTAATTCTTCCTCAGGGAGTGGTTTCGGTGCCTGGGTGGAGTGCATATGGTGTAAGCTCACCCATTCTTTCCATAGGAAACAAACAAGAACAACATAGTCTTATTCTGTGTTTTGACTGGTTCTAAGGCATGTCATATGGGTTTATGTTAAATGTACGTAGAAGGTCATTTGTTTCCATCAATATGATCATTGTTCCCCTGTAAAAATGATGCAGAAACTCTGTTGGTGTGAAATTTCACGGTATTTGTCTCTCAACATAATTGGCGATATTCCTTTCACTTCTGTAATAATGCAACATGGTGCATATGTGCATAACCGTTTTGTTAGAACCTGCCCTGGCTGATTCAATGTCTTGATAGAATATTTATTTTTCAGGGTCAAGTGGGATCAATCTCTACTTCAGACAGTCATCAGCAAGTAATGAGAAATGGTCAAACATATGGAACTTCTCGCCAAGGTGAGCTAGCAAACGCAGGATCACATGGAGCATACTCTCAATTCCGTTCTGGCACTGTTCCAGAAGGGTTTTATGCATTGCAGAGGGAAAACATATTTCCTGAGAGACCTGGCCAGCCTGAATGCCAATTCTACATGAAGACAGGAGATTGTAAGTTTGGTGCAGTCTGTCGGTTCCACCACCCAAGCGAAAGGCTAATTCCTGCTCCTGACTGTGTCTTGAGTCCCATGGGCCTTCCTTTACGTCCGGTGAGTTGGGTTCTTGCTATGGAATTCTATCTGCCTAGTTGTTTTTCCTAGGTGTAAATTTTGTTATTTCAGATTTTATTCTTCATTATAATTTTCAGGATTTTGAGTTTGACAACAATTTGATTCAGATTTAGTCTCCATAAATTTCCTTGGTTCATAGGACTTGTTATTTGATTATTTTTGCATTACCTCTTGGATTCGGATCCCTTCCTTTTTTTTCCTTACATGACATGACCTTGTTTGTTAGGAAGTGGCACTCATAATTCTACTACATATAGCTTTATATGCATGGATTGAATCATATTATATAGCAAAATGCTTATCGAATTGCATGTGGCAATACAATAATGTGAACATTGAAAATTGTTGTTTTAAGTTTGAAAATAATTTGAAGCCAAACTAAGTTGGAATGGTTTGAAGCAGTTACATAGACACCACAGAGGATGCTGAGAAGGGTAATTATTTTGAGTAGTTCGAAGTATGTATTTGTTATATTATCTTAATCAAACTATGATGACTGACAGCGTTAGGGTTTCTCCCTTTGGCTCTTGATTTATCATATCATTCACAAAATATGGACATGGTGTATTTGCATATTAACTATTTTTAAGTTGGTGTGAAGTCTGTATAGTATTTTTGTGTATTCTCATATTTTCCTTCATTGGACTGGATAAATGCGTGGAAAGGTTATTTGTTTGTGGTAATTGGAGAAAATGGGATGATCTGCAAATATTTGTGTCATCATTCTCTTCACTAGTTTGGTCTTGTCAGTTTTAATTGAATTAGAGCGAGCTGATACGAGGCAGTGTCCCATTTGTTACAGGGAGAACCTTTGTGTGTCTTCTATTCACGTTATGGCATATGCAAATTTGGCCCAAGTTGCAAGTTTGACCACCCAATGGGAATTTTCACCTATAATATCTCTTCATCGCCTTCAGCTGATGCCCAGAGCAGGCATCTGCTACGATCTTCATCAGGAACTGCTGCGTTAAATTTATCTTCGGAAGGACTTGGTGAATCGAGCTCAGCAACGCCCAGGCGGCTTTCATTATCAGAGACAAGACAGATACCATCTGGTGATGATGACATTGATGATGATGGATGATGATGTCTCTTGAAAATGGGTCATTTAGCTTTTACAATTTTTTTAAGGGGAGAGATGACTAATCTGTAAATTAATTTTCCATTGCTGGAGATGTACAGAGGTCATATATGTTTTTGATTCTGTCAATAAAATTAAATGCAGTTGGCAGAGTCATTTGTTCTGGTTTCATGTTACCGGGCTCATTGGATAAACTTAAGCAAATGTTGTCACCTTAGGTCCAACCCAATGTGAACAATCCTTCTGTTCTGAAGCCATCTTTCTTTCTAATTAACTTTTCACACTATGTAAAAACCTCCTTCTGGAAATCTGTAATGACCAAAGTTTACCTCCTGGATATTTATTGGTTGCAGGATTGAAACTCGTTGCAAAAACCTTACTCCCACTGCAGTTGGGTTTATGCTGTCTACTGTGCATGTATGGAATTCTTTTCAATAGCAAGCAAACAGTATCGCCAGAATCTTTCCATTTTTCATATTCTTGTACATTCTTACCAGAATTTTGCTGATCGAATTAAACTGTGATTTTGTACATCCGATCCGAGTAAATATCAACTGGAGGAATGTAATTT