Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30165 LG8 34354456 34360955 PREDICTED: light-inducible protein CPRF2-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 34354640 missense_variant p.Ser7Leu
C/T 34354655 missense_variant p.Ser12Phe
C/A 34354665 missense_variant p.Phe15Leu
C/T 34354673 missense_variant p.Ser18Leu
C/T 34354685 missense_variant p.Pro22Leu
A/C 34354700 missense_variant p.Asp27Ala
G/A 34354702 missense_variant p.Glu28Lys
T/C 34354710 synonymous_variant p.Ser30Ser
A/T 34354711 stop_gained p.Lys31*
C/T 34354719 synonymous_variant p.Ser33Ser
T/C 34354722 synonymous_variant p.Arg34Arg
A/C 34354767 synonymous_variant p.Ser49Ser
T/A 34355133 intron_variant
T/G 34355176 intron_variant
T/A 34355299 intron_variant
C/A 34355368 intron_variant
C/G 34355384 intron_variant
C/A 34355425 intron_variant
A/T 34355442 intron_variant
A/T 34355491 intron_variant
T/A 34355535 intron_variant
T/C 34355567 intron_variant
A/G 34355627 intron_variant
A/G 34355652 intron_variant
A/T 34355700 intron_variant
G/C 34355709 intron_variant
A/T 34355841 intron_variant
T/A 34355850 intron_variant
T/A 34355851 intron_variant
G/A 34355916 intron_variant
T/A 34356156 intron_variant
T/C 34356159 intron_variant
T/C 34356168 intron_variant
A/T 34356172 intron_variant
T/A 34356266 intron_variant
T/C 34356277 intron_variant
A/C 34356369 intron_variant
T/C 34356725 intron_variant
T/A 34356743 synonymous_variant p.Ser127Ser
A/C 34357025 intron_variant
G/A,* 34357371 intron_variant
G/A 34357463 intron_variant
C/A 34357529 intron_variant
C/A 34357534 intron_variant
A/T 34357535 intron_variant
G/C 34357641 intron_variant
A/G 34357674 intron_variant
T/*,A 34357717 intron_variant
G/A 34357720 intron_variant
A/G 34357742 intron_variant
G/A 34357770 intron_variant
T/C 34357825 intron_variant
T/A 34357828 intron_variant
A/G 34357944 intron_variant
A/G,* 34358004 intron_variant
A/G 34358033 intron_variant
G/T 34358066 intron_variant
G/T 34358223 intron_variant
G/T 34358309 intron_variant
A/G 34358675 intron_variant
T/G 34358713 intron_variant
T/G 34358717 intron_variant
A/G 34358727 intron_variant
T/G 34358813 intron_variant
T/C 34358990 intron_variant
C/T 34359108 intron_variant
C/A 34359120 intron_variant
G/T 34359149 intron_variant
G/C 34359238 intron_variant
T/C 34359257 intron_variant
A/T 34359784 intron_variant
A/T 34359970 intron_variant
C/T 34360561 missense_variant p.Pro366Leu
G/T 34360577 synonymous_variant p.Gly371Gly
C/A 34360617 missense_variant p.Pro385Thr
A/T 34360622 synonymous_variant p.Ala386Ala
T/G 34360655 synonymous_variant p.Thr397Thr
G/A 34360673 synonymous_variant p.Val403Val
C/T 34360686 missense_variant p.His408Tyr
G/A 34360900 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30165.1
MDRVFSSVDEISDHFWPSPPIPVSAADEASKMSRSASEWAFQRFIQEASAPSPPSPSSATRATSAAATDVVFVEIDDHPKPAPAPPQNAAVLPNAPVPVPLDSDEYQAFLKSKLNLACAAVAMTRASLAKSQEPAPFSDGGSQPIDPSQVGSQTTSKGSIPSGNDPSKLQDKDTKVPVGMPSIPSTQKKPVVAVRPSTSGSSRELSDDDDAEGETSMNDMDPADAKRVRRMLSNRESARRSRRRKQAHLTDLETQVSQLRGENSTLLKRLTDVSQKYSESAVDNRVLKADVETLRAKVKMAEETVKRITGLNPMVHAMSDMSSLGMTLFDGRSPSDTSADAAVPVQDDHHHFYQPTSNNPIPSHDPIVNDGLAGMSSIENVQQNPAAVAGGNKMGQTSSLQRVASLEHLQKRIRGGVDSCGPPSNGEQ*


CDS Sequence:
>Vu_30165.1
ATGGATAGGGTGTTCTCCTCAGTCGACGAAATCTCCGATCACTTCTGGCCATCGCCGCCGATCCCCGTCTCCGCCGCCGATGAGGCCTCTAAGATGAGCCGTAGCGCCTCCGAGTGGGCCTTCCAACGCTTCATCCAGGAAGCTTCAGCACCCTCTCCCCCCTCTCCTTCCTCCGCCACCAGGGCTACTTCTGCGGCCGCCACTGACGTTGTCTTTGTCGAGATCGACGATCATCCCAAACCTGCCCCTGCTCCTCCCCAGAACGCCGCCGTTTTGCCCAATGCCCCTGTTCCCGTACCCCTTGACTCCGATGAGTACCAGGCCTTCCTCAAGAGCAAGCTCAACCTTGCATGCGCTGCTGTTGCCATGACTAGGGCATCTTTGGCTAAATCTCAAGAGCCAGCCCCTTTTTCTGATGGTGGATCACAGCCTATCGATCCTTCTCAAGTTGGATCTCAGACTACATCTAAAGGATCTATTCCTTCTGGAAATGATCCATCTAAGTTACAAGATAAAGATACGAAAGTACCAGTTGGGATGCCTTCCATACCTTCCACGCAAAAGAAACCTGTTGTTGCAGTTAGACCATCAACAAGTGGATCATCAAGAGAACTGTCAGATGATGATGATGCTGAGGGAGAGACATCTATGAACGACATGGACCCAGCTGATGCAAAAAGAGTAAGGAGGATGCTATCCAATAGGGAGTCTGCCCGGCGCTCTAGAAGAAGAAAGCAGGCTCATTTAACTGACCTAGAAACACAGGTTTCTCAATTAAGAGGTGAAAATTCTACCTTGTTGAAGCGCCTTACTGATGTAAGTCAGAAATACAGTGAATCTGCTGTTGACAACAGAGTTTTAAAAGCTGATGTGGAAACATTAAGAGCAAAGGTGAAGATGGCTGAAGAGACCGTCAAAAGAATTACCGGGTTGAACCCAATGGTTCATGCCATGTCTGACATGTCATCATTGGGCATGACGTTATTTGATGGAAGAAGCCCTTCAGACACTTCAGCAGATGCAGCTGTTCCTGTGCAAGATGATCATCATCACTTCTATCAACCCACATCTAATAATCCTATTCCCAGTCATGATCCGATAGTCAACGATGGGTTGGCGGGCATGTCTTCAATTGAAAATGTGCAGCAGAACCCTGCAGCAGTGGCAGGTGGGAACAAGATGGGTCAAACTTCTTCCCTGCAGCGGGTGGCTAGCTTGGAACATCTTCAGAAGCGGATTCGTGGTGGTGTGGATTCCTGTGGACCTCCCTCTAATGGGGAGCAGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_30165::LG8:34352456-34354456(+)
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Gene Sequence:
>Vu_30165(+)
AGAAAAAAAATTGAAAAAGAAAAGAAAGAGAAAGATTGAATGTCTTCCCCCAGTGGTGTACGATTTTGACCTATATGCCCCGGTGCTCTCGATTTGTATAGCCGCGGCCTCCTCCCATCGCATCACATCACACACAATCAAACCCAAGGAGACGTAAGATACGATATGGATAGGGTGTTCTCCTCAGTCGACGAAATCTCCGATCACTTCTGGCCATCGCCGCCGATCCCCGTCTCCGCCGCCGATGAGGCCTCTAAGATGAGCCGTAGCGCCTCCGAGTGGGCCTTCCAACGCTTCATCCAGGAAGCTTCAGCACCCTCTCCCCCCTCTCCTTCCTCCGCCACCAGGGCTACTTCTGCGGCCGCCACTGACGTTGTCTTTGTCGAGATCGACGATCATCCCAAACCTGCCCCTGCTCCTCCCCAGAACGCCGCCGTTTTGCCCAATGCCCCTGTTCCCGTACCCCTTGACTCCGATGAGTACCAGGCCTTCCTCAAGAGCAAGCTCAACCTTGCATGCGCTGCTGTTGCCATGACTAGGGTAATCCTTTTCTTCTTCACCTTTCTTCATCGTTCAATGTCTGCTCCGTTTCGCATGTGCGAATCAAACGATTCCATTGGTTCTGATTTGGATCTGTCTTGCGTTTTAACTTTTTTTCGTCTTTCAGTCAATTATCTTGCATGCATTTTTTTGTTTATTTATTTGCACACTGGGGTCTGCTTATATATTTAGGAGCAAACGGCGATCATCTCGTGTTTTAAAATTAAATAGAGAAACGTCGAATCACACCACACTTCAGAGTTGTTCTTAAAGTGAATTTGCCATTTCAATTCTGAATGCAAATATCTGAATATGATACGTAACATATTCAGGTGCAACTATTCTGTTACTAGGGAGTCCCCCAATTTGATTCATTTCAGCAGTTTGCCTTCTCTCATAAGTGGTCCTTTAAGTAGAACAAATCACTTACTAGTGTATAAAATATTAAAAATCCATTAAATTCGACTTTGCGATTAAACTGGTGATTCAATATTTAAGTATTACTTAAAGGGATTTTGATAATGTAAACCCATTTGTAGTTTAGACGGAGTGCATTGCCAAATTATAACTATTATTAATCCCGAAATACTTCTTGGCGTAGCTTCATAACACACTCCTTCTAATGAAACATACTTCTCCTTATAAACCAAGTTGGAAGATACTAGCAATTGCTCGTAGGATTTGCTAAAATAGACCCACTTATTAGTTAGGATGACGTAAGAAAATTATAACTACGATCAATTTTAAAGAACATCTGGATGCATCTTGTTAACATACTCCTTCTAAAAGACAAGTGGGTTTATGTCAGTAAATCTCTTCCATAATTTTAATTTTAGTTATCCTAGACTTACTATTTACTTTTCTAGTTTGTATAATTTCTTATCACTGAGACGAATCAACAATTCATTGTGTGGGTGTGGGCGGGCGCGCTTGTGTATATTTTTACCTTTTCACCATTTCTTGTGAAAAAAAATTAAAACCTCATTTGAGCTTAAATTTTCAATTAAAAGAAATTGAAAGAATACTTGTGAACTTTTCCTATATGATTATTCCACTACTTTATTAATCACTCATCAATTCAATGCTCTTGCTCTATTTAGCCATGTAATTGCTTCATTTCCATTCTTCTAAAATAAGGATTGCACAAACTCATATATAACTAATACTTTTTGTCTTATATGACTTTTACTTAAGTTGTTTTATCTATTTCTAGCTTAAATTGTTTGCATTGAACACCGTGTATTGTCTATATGAGATTTGTTCCACTTCCTTCCCTCGTATTCATCTTGCTTTAGTTGCTTTCTGGAAGCAGTTTTGAAGTATTTTTCTCTAAATCTTACGATTACAAATTATGACTTACATATGAAATAATCAATCAGAAATTCAGAATCCAAATCTTGATTGGATAGCCTTGGTTTATAACATTAAGAACTATTTAGGAGACAGAATAATAGTTTGAATACGAAATTAGAGGTTTATTACCTGTTTATGCAATTCAGAGTAATACAGATATATTACCTGTTTCTGTACTTCCTGGGGTACACACCAGTATTAACTAGCCCTTCGAAATTCAGTTCAAAAGCATGTGTTTTCAACAAATAGCTATACAAAATTAGGAGGAAGTATCCAAATAGAAGGTCTCCAATGCATTCCATGAAGGACTTTCTATTTGTATCTATTCTCATCTTTCCCCACTGAGAATTGAACCAGTATCTAATTTTTTTCTCTATTCTCCGCAATAGGCATCTTTGGCTAAATCTCAAGAGCCAGCCCCTTTTTCTGATGGTGGATCACAGCCTATCGATCCTTCTCAAGTTGGATCTCAGACTACATCTAAAGGTTTGAATTGGTAAATATTTATGCATACATGTATTAAAAGGGTTAAATGACAATACATGGTCAGTGAAGTAGAGTTTGTGGAATGCTGAATATGTAATGAATAAGTATCTAGTTGCAGTTGCACGAGTGGGTTAATTGCATAATCTGTATTTACCATTTTATTTTGATCAGAACACTATTGCCTTCTTTCATTGACCTGTTTAGTAATTTTTTGAGCAGCTTTACAGGTTCAATTTTATCTCTCTTTGTATGGATAACACCTATTGAATTATGTCAAACATATATGTCTATGTAGGATCTATTCCTTCTGGAAATGATCCATCTAAGTTACAAGATAAAGATACGAAAGTACCAGTTGGGATGCCTTCCATACCTTCCACGCAAAAGAAACCTGTTGTTGCAGTTAGACCATCAACAAGTGGATCATCAAGAGAACTGTCAGATGATGATGATGCTGAGGGAGAGACATCTATGAACGACATGGACCCAGCTGATGCAAAAAGAGTAAGGAGGTAACGATATTCTAAAAATTGCATGTTTTTATTGTATAAAATGCTGGTACTTCTTTTATACGCAGGAATTAAATGTAATATCATGTGATTGTGCTCACAGAACGCTCATTAGTGTTGCATGATTTGCAATACAGTAAGTGCGATTCCATATGATTCAAGCATCTGGTGATACAATCAGTGAGCAAATCATTTTCATACTTGAATCACATCATGATTCATACCTGAATCGCAGTAATTGCGATCTGGAGAAGTGTAACACTTGTCATACGTAAGTTCTGTTAGGCCTCAGAAGGAGTTGTTACATTCAACTACTTTTCTGAGGCTGTCACCCCTGGTATGAGCGGCATTTTCTGCTGCTAAAATAAAAAAATAAGAAGGAAAAAACAGCAGCCAGAACGCTGGGTGGACAAATCATGTGCTGCAGTTCTAACTTCTGTGTTGCATATGCCGTGCGTGGATTCCCAATTACTGGTTGTTATCTTTTTATCTTAAAGTCTAGGCTTATTTACTTATTTAGTTCCGCTTTTGTTTTTTCAAAATTTTGTTACCCAATTGTTGAAAGCCTCAATTTGGTCTCAGTTTTTTACAAAATAGGTCACTGTTTGCCATTCTGTTAATCTGATGGAAACAGTGTTTAAGCAATGCGAACATGATGTTATTATTGTTGATGTGTCCGTTAAGGATTAAATGAGCTCTCAAAAAACTGTTGGTATTCATGGGATTCGGTGGAGGTGCTCTTCTTCATTTGGCTTAGGGTTGCCGGGGTATTTGGTTTATGAGGGCATCTCTTTTGCAGCGTCATAAGTTTAAAATGTGTGTCTTATAAGATCTTCGTATTAGAGTATGCTGTCATGATATAAAATTTAAGACTGGTGAGTATAAAAATAAAAAAAATATTCTTCTGCCTTAAAAATTATTGAAATGCAGGTTTTATGAAAACCCTTGTATCGGAAATTTTGAAAGTGATGTGACAGTGAGATTCATAAAAGTAAATTAAGACTTCCTTCATTGACTTTTGCAATGGAGATGACTTGAGAAGAATGTTCCTTTCCTCTTTAGGGTAATTGGTTGCTTATCTCTTTCTTAGTCTCTTTTTCTATCTTTTACGTCCGTTTCTCTTTCTTAATTCACAAAACCCTTTTTCTGCTCTCTATGCTATTCCGGCATGTTTGATTTATTATTTCCCAATTCAAAGATTTTTGTGCTCATTGATATTGTGTGATTTTTATTTTGGGGTTTCCTTTTTTAGGGTGAATTACGGGTGTTGAGAATTTTATGGGATTTTGAATCTGTGTTTGATTGAGTTCATTGGTGGATTGATTGATTTTAGTGTTTTGGATAGATTTTGTGGTTTTCAATGATGGGTTTTTTGTGGATTTTACTTGAATTGAGTTCATTTATGTGTTGTTTGGAGCACATGGCTGTCGAAATGTAATGGGAACTGTGCCGCTTACTTCCCAATTGTTTATTGTGAACTTTAACCCATGTTTTAAGGTCACCTCCATTGTTAGAGTCATTACAAGGTTTTAATTTACTTTTTGTAGGAAAAATGATTTTATGTTCTTATGACCCAGGGTCTTCTTTAAGACCTACAGTCTCAAATTTTGTTATATTAGCTTTCAGCAATAGAGATGTTCTTAATTTAAAGTTGCAATGGGCTTTCTTGCACATGCAGACCACGGGCTTTTAAAAATTTCCGATTTCAATATTTAAATATTAAATTAACTTATTTTAACTGCAATATCCACCTTAAAGAGATCACAATGTATTCTTCCGTCAGGCATATAGATGGTGTTAATGAAGGGAAAAAATTAGCGAATTTCATTAAGGTGGACCAAATTGAAACTTTTAATAACTATAGGACGAAATTGAAAAAATGAATAAATTGTGTGACACAATAAGTTATTAAATCCAAAATAATCTATTATAAAGCCGTAGTAAAATACTTGCTCCATTCTGATTTGTAAGCAAAACAAGGAACACTTTTTTGTTATAACTATAATTTGAATTCTGATTCAACTACCTTGGTTCAGAGTGGTTAGGTGTTTTGTTTACTCATAGGATTTGCCAGCTCCTGCCTTGTAAACTAAGTGATTGGCGGCATGCCAG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