Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30162 LG8 34326342 34328598 hypothetical protein
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09191 Unclassified: metabolism   C 99980 Enzymes with EC numbers
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 34326366 missense_variant p.Ser320Thr
T/G 34326403 missense_variant p.Met308Leu
T/G 34326443 downstream_gene_variant
G/T 34326474 downstream_gene_variant
C/T 34326869 downstream_gene_variant
A/T 34327116 missense_variant p.Cys218Ser
C/A 34327248 missense_variant p.Gly174Cys
G/T 34327251 missense_variant p.Gln173Lys
T/G 34327258 missense_variant p.Lys170Asn
T/C 34327698 downstream_gene_variant
T/C 34328198 splice_region_variant&intron_variant
T/A 34328574 stop_gained p.Lys9*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30162.1
MGSVASSKKNNECSERLSEAQDVPQLKSSKQKKIDLVKHEKFARFESESTKIDTETKALGRKYKPQAYSFVADFRNLGRRSDSNYMRLRCFDLYKLHSWAGGLTEFADGRNQESTSEAVNAYYSAALMGLAYGDTQLIATGSTLAALEIHSAQMLWHLGEGHKLYEEDYTKENKVVSVVWANEIVDYSVERVQACIHVLPLSPITEALLSDVGYVKELVPRENSPEQDANKTLNSHSASLITYSDCEEEDLIPMNNIVNKPQEMRQLTPSAYNCFIKEEINRLKAESPDMAHKEAFSTAAKIAKEMIKRNARHINLWILTPKWTLLMLR*


CDS Sequence:
>Vu_30162.1
ATGGGTTCCGTGGCCTCCTCTAAGAAAAACAACGAATGCAGTGAGAGATTAAGTGAGGCTCAAGACGTGCCCCAGCTGAAAAGTTCTAAACAGAAGAAAATTGATTTGGTGAAGCATGAAAAGTTTGCCAGATTTGAAAGTGAATCAACTAAGATTGATACTGAAACAAAGGCTTTGGGAAGGAAGTACAAGCCTCAAGCCTATTCATTTGTGGCAGATTTCAGGAACTTGGGAAGAAGATCAGACTCTAATTACATGCGTTTGAGGTGCTTTGATCTGTATAAACTGCACTCTTGGGCAGGAGGGTTAACTGAATTTGCAGATGGAAGAAATCAGGAGAGTACTAGTGAAGCTGTGAATGCATATTATTCTGCAGCATTGATGGGTCTAGCATATGGTGACACTCAACTTATTGCCACTGGATCAACACTTGCAGCATTGGAAATTCATTCAGCTCAAATGTTGTGGCATTTGGGAGAGGGACATAAACTGTACGAGGAAGATTATACAAAAGAGAACAAGGTGGTAAGTGTTGTGTGGGCTAACGAGATAGTGGACTACTCAGTGGAGAGAGTGCAGGCTTGTATTCATGTTTTACCACTGTCTCCTATTACCGAGGCCTTGTTGTCAGATGTTGGTTATGTGAAGGAACTTGTACCAAGAGAAAATAGTCCAGAACAAGATGCTAACAAGACTTTGAACAGCCACAGTGCATCCCTGATTACCTATTCTGATTGTGAGGAAGAGGATCTCATTCCAATGAATAATATTGTGAATAAACCTCAAGAGATGAGACAGCTAACGCCATCAGCTTATAACTGCTTCATCAAAGAAGAGATTAACAGGCTAAAGGCTGAGAGCCCTGACATGGCTCACAAAGAAGCTTTTAGTACAGCTGCAAAAATTGCAAAGGAGATGATCAAGAGAAATGCCAGACATATCAACTTGTGGATCTTGACTCCCAAGTGGACCCTCCTAATGTTGAGGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_30162::LG8:34328598-34330598(-)
AAATATTTTAAACTCATTTATATTGGACATTAGGACTTTTTGAAGTTCACATCAAACGTGTAAAAAATTGATGTAAAAGTCGATTTTTTCTTCCTAGAATTTGGGCGCATGTTTCTCTTTCTTTTCTCGTATTCTTATTCGGTTGCGGCACAACTGGGGTTTGTGGTGCTTTTGGTGGACATCTTTGTAATCTGAATTCATTCTTGTATCCGGTTTATGATGGTGAACATTTATCCCTAATTCCATTTAGAATATTTGTAAGTCAAATGTTGAAGTAGATACTTTATATCTCAACTTTATTAATATTGTATAATACTGTAATGTTTTTACTAAATTTGCTTCATCTTCTAATTATTCTTTAATTTCAATCATGAAAAAGAGTCTATAACGTTATTATGTTCATGTTACAAGTAATAAATTTTAACCTTAACAATATACGGTAATATTTTTGTAAATATTTTATTTAAATTGATATCAGTGGTAAATATTAATATTTAATTTAACATAATTTAACAATTATAAAAAAAACTCACTTTAAGATTTGAATATTTATTTATATTAAAACAAAATAATAAATATATATATATATATAAGTGCATATCTCTCTTAAAAAGAGACAATGTCTATGTCAAAATAACAGAGTTAAAAGATTCTATTTGTTGTTCAGAATATCCATCCACTCTTATGATATGTTTACTTTGGATTTGAGGAAAAAAGAGTGACTAGATTTGATATTTAAAAATAAAATTTATAAAAGTTAGTGTATATTTTGATCGATATAACACATAAATTTTTTAAAATTATTTTGAAATATTAAAATTAAAAAAATTAAAAAATTAAAACAAAATATTATTTAGAAGTATCATTATTATTTATAGAAGACACTAATATTTTTGAACTAATACTTTTATTTTTCAGTTGAACATTGGAAATGATTAAACAAGGATAATTTTGTAAAATGTTATTTCTTCCCTCGCAAATTTCCTCCCATATAAGTTCGATGAGATATTGAACTTATCCCGCAAATCAATCTTTTATTCAATCTGAAATCCTTACAAGTGAACACAATAAATTCCTGAAAATCCATCTTTTAACATCTCTTTGAACAGTAAATGGTGTGAAACGAAGACAGCATTAAAGCTTCGATAATCTTGGGAGAATTCCCGTCAATGGTATATTTGTTCCTCTACTCCACAATATACATTGTACTTGTCAGTTATAATTGTGTGCCTCCACCCACGTGAGTATAAGCTACCAGAAGACGAAACAGATATTGTATGCCGCCAACCACAAGCAACCATGACCATGTTGTAGTAAAGCTACCAATTTTATTATGATTCAGATTTAAAGCAAGATCGAAGTGCATTGCCTCCAATCCTTCAATGGCTTCCACCGTCTTAAATGATATTGTTAAATTTATTTCAATGGTTAAACAATGACTTCTACAAACAAATTCCTTATAATTCTTTTGCTCTAATTAAAAGATAACTTACCTTTAAGAACTTTAAGAAATCAACAGTAATTGAATTCAACATGCTATAACTGAAAAAAAAAAATTCTCTTACATTTGAGACATGGGATAATTTTTATTCTCATCCGCACATCTTCTTTTCTCCTTCAGAGAATCTTCTATTCGCGTAAGTCATCTTCTTCTCCTCATGGATTTACCTTTTCACAAGTGTTTTTCTATATCTGTAAGTTGATTTTCTCCCAAGTCATTTTCAATTTTGTTTTTCATTTGAAGTTTCAAATTCTGATAAACCCTAATTTCAATTACTTTCTGATGTGTTTTTTTTATTCGTAAGTTGATTTTCTGCATTCCATTCTTCAATCTCAAGTTCCTCACATAGGTAATTTTTTAAATTTGCGCAAAGAGAAAGGGTAAGATAAAGTAATTGATTTGTTTTTTTATAGGTAATTTTGTTTTATCTGCTCAATTCTTAAATCAATGATAGTTTTCTTTTCCATCTAGTTATCGCGGTTCCAGACGGATTAAAGGC


Gene Sequence:
>Vu_30162(-)
ATGGGTTCCGTGGCCTCCTCTAAGAAAAACAACGAATGCAGTGAGAGATTAAGTGAGGCTCAAGTAAGTTTCACTGCCTCTATTTTGCCAAATTTGTCTTTTATTGTGATTCTTACAGAGTCAATTTTCTTGGAGTTTGGTTTATTGAGTGTGGAGTGATTGACTTTTAATTTAAATATATTCTATATCTGAAATTCTTTCTAAAATTTTCACTCTGCATGAACTGAGTGACATTTGAAGAAATGCAACTTAAATTTTATTGCACAATGCATGAATAAAACCACTTCACTTGAAGAAAATATCCTTTCTAGATCAGTTTTGCTTCTGAAATTTTGCAAACTCTTGTCTGGTGCACTTGTACATTGCCAATTTTGGTTGTTTATAGTACATACGTGTAACTATGCAGGACGTGCCCCAGCTGAAAAGTTCTAAACAGAAGAAAATTGATTTGGTGAAGCATGAAAAGTTTGCCAGATTTGAAAGTGAATCAACTAAGATTGATACTGAAACAAAGGGTATACTAGTTTTATTTTACACTTGGATAAGAATGTGTTTTTTTTTATCTTGTTTTAATGTATTGACTGTTGTGCTATCTGTTAAAACATTTGTTAATAATTGTAACATTTGGAAATCTTCCAAAGCACCCTGATGAAAACTGTAGTCTTAATGGTGGTACCCTATTAGTAACCTTTCTGAGATTACTTCTGGCGAGTTTTCTGGCATAATTAGGATAAGAGTGTTGCCTGATTCTGACCCTAAGTAAGAGGTAATCCTCAATACGTTCAGCTCTTGTTATCCTGTCTCTGGGGATGCAGCATTCACAAATCCGTTCTGTGTAAAGTATAAATAGGAAAAGAAAGGGTGGGAGGAGTTGTTAATGGCTAGCTCACCCTCTTCACCAAAGATTCAGGAGCAGATTTTGTGTTTGGTGTTTCTATGATCATCATTACAATTGGGGTACTTCCTTTATGGAATTGCGGTGCTTGCAAAGATTGATCCAGCTTTGGGAAGGAAGTACAAGCCTCAAGCCTATTCATTTGTGGCAGATTTCAGGAACTTGGGAAGAAGATCAGACTCTAATTACATGCGTTTGAGGTGCTTTGATCTGTATAAACTGCACTCTTGGGCAGGAGGGTTAACTGAATTTGCAGATGGAAGAAATCAGGAGAGTACTAGTGAAGCTGTGAATGCATATTATTCTGCAGCATTGATGGGTCTAGCATATGGTGACACTCAACTTATTGCCACTGGATCAACACTTGCAGCATTGGAAATTCATTCAGCTCAAATGTTGTGGCATTTGGGAGAGGGACATAAACTGTACGAGGAAGATTATACAAAAGAGAACAAGGTGGTAAGTGTTGTGTGGGCTAACGAGATAGTGGACTACTCAGTGGAGAGAGTGCAGGCTTGTATTCATGTTTTACCACTGTCTCCTATTACCGAGGCCTTGTTGTCAGATGTTGGTTATGTGAAGGAACTTGTAGTGAATCCAATGACCCACATACTCATCTTTAATTATTTGCTTTGGATTTTTCTTCTTTTCTGAAACAGCATTTGTACTGTTTTAACTCTTCTACAGCCAAGAGAAAATAGTCCAGAACAAGATGCTAACAAGACTTTGAACAGCCACAGTGCATCCCTGATTACCTATTCTGATTGTGAGGAAGAGGATCTCATTCCAATGAATAATATTGTGAATAAACGTACGTAAGATAGTCAATAATAAGATGAGTTATATTGAGTTTAAAGCAAGGTTTTTGTGCACTCATACTTCACTGTAAATTGTTTTTTTTTATCCATGGATTGTATGCAGCTCAAGAGATGAGACAGCTAACGCCATCAGCTTATAACTGCTTCATCAAGTAATGATTCAATGAACAAAGTTGTATAGCACTCATAGTTCAAACTTTGAATTCTAATGAGAGTACTAGTTTAATGCAGAGAAGAGATTAACAGGCTAAAGGCTGAGAGCCCTGACATGGCTCACAAAGAAGCTTTTAGTACAGCTGCAAAAATGTAAGGTCTAATTTCTTAGTTCAACTCGTTTGCAAATTTGGTAGTATTATAAAGTTGGTGAACCATGGATATTGGTTAAAGAACGGTGCTTTTCTTAAGCATTACCTTGAAAATATTTGTCATTTTCACTGGGCCAATTTTCCCCCAACTCAGTGCAAAGGAGATGATCAAGAGAAATGCCAGACATATCAACTTGTGGATCTTGACTCCCAAGTGGACCCTCCTAATGTTGAGGTAA