Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30130 LG8 33991573 33997098 PREDICTED: probable serine/threonine-protein kinase At1g54610
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 33991600 3_prime_UTR_variant
G/T 33991614 3_prime_UTR_variant
G/A,* 33991649 3_prime_UTR_variant
A/T 33991669 3_prime_UTR_variant
A/G 33991758 3_prime_UTR_variant
A/T 33991831 3_prime_UTR_variant
G/T 33991922 3_prime_UTR_variant
C/T 33991942 missense_variant p.Ala580Thr
C/G 33991973 synonymous_variant p.Leu569Leu
T/A 33992246 missense_variant p.Leu478Phe
A/T 33992374 intron_variant
G/C 33992481 missense_variant p.Pro459Ala
A/G 33992524 synonymous_variant p.Val444Val
A/T 33992542 synonymous_variant p.Ala438Ala
T/A 33992625 intron_variant
T/A 33992657 intron_variant
A/C 33992660 intron_variant
G/A 33992704 intron_variant
A/C 33992744 intron_variant
A/G 33992746 intron_variant
T/A 33992981 missense_variant p.Arg434Trp
T/A 33993124 intron_variant
T/C 33993209 intron_variant
C/T 33993447 intron_variant
A/G 33994154 intron_variant
G/A 33994222 intron_variant
A/G 33994740 intron_variant
C/G 33994746 intron_variant
G/A 33995198 splice_region_variant&intron_variant
C/T 33995346 missense_variant p.Asp203Asn
C/T 33995505 missense_variant p.Val150Ile
A/T 33995626 intron_variant
T/A 33996011 missense_variant p.Lys51Met
T/A 33996065 missense_variant p.Glu33Val
A/T 33996137 missense_variant p.Val9Glu
T/A 33996316 splice_region_variant&intron_variant
G/T 33996397 5_prime_UTR_variant
G/T 33996403 5_prime_UTR_variant
A/G 33996611 downstream_gene_variant
G/C 33996698 downstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30130.2
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>Vu_30130.1
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CDS Sequence:
>Vu_30130.2
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>Vu_30130.1
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Promoter Sequence:
>Vu_30130::LG8:33997098-33999098(-)
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Gene Sequence:
>Vu_30130(-)
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