Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_30089 LG8 33632944 33634741 PREDICTED: transcription factor bHLH94-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 33633204 missense_variant p.Glu65Gln
A/G 33633369 missense_variant p.Thr120Ala
A/G 33633567 intron_variant
T/A,* 33633625 intron_variant
G/C 33633698 synonymous_variant p.Val187Val
G/T 33633750 missense_variant p.Gly205Trp
T/C 33634064 synonymous_variant p.Ser309Ser
T/A 33634463 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_30089.1
MCLPEGERERERAMALEAVVFPQSQDPFGGYGSVKDFYNCTFLAATSPNWGDYEHININIHKEEEQGSISTFLDNSNNQPDNYPYGGDWTSSSSSILPHLNDLQEPTDPSNATHSLDTLTTRPKRRRAKSRKNKEEIENQRMTHIAVERNRRKQMNEYLSVLRSLMPDSYIQRGDQASIIGGAINFVKELEQRLHFLGAQKEGEGKSDAGGATNMPFSEFFAFPQYSTSGGGGGGSDNSATVGEDVGEVKSGIADIEVTMVESHANLKIRSKKRPKQLLKLVSGLHTMRLTILHLNVTTTGEIVLYSLSVKVEDDCKLGSVDDIAEAVYQTLDRIQQEAVLN*


CDS Sequence:
>Vu_30089.1
ATGTGTTTGCCAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCATGGCACTGGAAGCAGTGGTGTTTCCACAATCACAAGACCCATTTGGTGGTTACGGATCAGTGAAGGACTTCTACAACTGCACTTTCTTGGCTGCTACTTCACCTAACTGGGGGGACTATGAACACATCAACATCAACATCCACAAAGAAGAAGAACAAGGTTCCATCTCTACTTTTCTCGATAATAGTAACAACCAACCAGACAATTACCCTTATGGAGGAGATTGGACCAGCTCCTCATCCTCTATCTTACCCCACTTGAATGATCTTCAAGAACCCACAGACCCCAGTAACGCCACTCACAGCTTGGATACCTTAACCACTCGTCCCAAGAGGCGCAGAGCCAAAAGCAGAAAGAACAAGGAAGAAATTGAGAACCAAAGAATGACTCACATTGCTGTCGAGCGCAATAGAAGAAAGCAGATGAATGAGTATCTTTCTGTTCTTCGCTCTCTCATGCCGGACTCTTATATCCAAAGGGGTGATCAAGCTTCTATAATTGGAGGTGCTATTAACTTTGTGAAGGAGCTTGAACAGAGGCTGCATTTTCTTGGTGCTCAGAAAGAAGGAGAGGGGAAATCTGATGCTGGTGGTGCAACGAACATGCCCTTTTCTGAGTTCTTCGCCTTTCCGCAGTATTCAACAAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCTCTGATAATTCTGCAACCGTAGGTGAAGACGTGGGTGAAGTTAAGTCTGGCATTGCTGACATAGAAGTGACAATGGTGGAAAGCCATGCAAATCTCAAAATAAGATCCAAGAAGCGCCCGAAGCAACTCTTGAAGCTGGTCTCTGGTTTGCATACTATGCGCCTCACAATCTTGCACCTAAATGTTACCACCACCGGTGAAATTGTACTCTACTCTCTAAGTGTTAAGGTAGAAGATGATTGCAAGTTGGGATCCGTTGATGATATTGCTGAAGCTGTGTACCAGACGCTGGATAGGATTCAGCAAGAGGCAGTGTTGAATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_30089::LG8:33630944-33632944(+)
TTTGCATTCTCTTTTTAACACTTTTATAATTTAATCATCTTTGAAATAATATGGAAGTAACAATATTTAGTCGTCAAAAGAAAACTGTGTTTTATTTTATCGGTAAATTTTAAAAAATAAAATAGTTTACTTGGTAATTTACATAAATAGAGTATTTAACATTTTTTTTATGTATTTAAGTAATGAGAGTCTTGAAGACTTTTTGTATAAAATTTTGAAAAGATAAAATGTTATAATTCATGACAATAATTTAAATCATGACGACTTTTAATTTGAATTAAAATAGTTAAGAATGATGACGATTTTTGATTTACATTGAATCAAAATAGTCATGACTCATTACAATTTAAATTGTAATGAATTTTCTTTCGAACAATTAAAATCAACATAAATCATGACAACTTTAGTTTAAATTTGAAGTCTTTATGAATTATGACGATTTTACATTTTCAAAACTTTATGAAAAAAATCGTTAAGATTCACGATGATTTATCTTAAATCTATTTTAATTATTATTTTTTAAAATTAAGAGGAAAACTATCCCATTTTTTAAACTTATCTCTTTTATTTCTTAACACATGTCGATTTGTTATTTCTTACTAATTTACTAATTAAAAGTAAAAGAAAGTATAATTTTCAATTTATAGTGAACGAAAGTTTTCATGACTCGTGACGATTTTAGTTGTAATGAATTTTTTTTCGGACAACTGAAATCGTTATGAGTTATAACAACTTTGGTTCAAATTAGAAATCGTTATAAATCTTCACGATTTCCCTCTCTCATAATTTTATAAAGAACATGAAGACTCATTGTCATTTATTCAGTGAAAAAGGTCAATCGTTAGTTTTTAAAAATTATTAGGCAATTTATTTCTTACTTGTTCATTAATTAAAAGTCACAATAAGCATAATTTATGTCTCTGTGTCACTGTAATCCGAAAAGTTTCAACATTTTTTTTATTCGGAAAGCTTCCATATGTAACACTCGTGCTCAATAACATGAATTCCAAATAAAGTGACTAAAGCAAATTCAATTTTGTTTGGAGTTTTTTGTGTGTTGTTATTGAATGATAGACGGAGGTCGTCATACAGAAGAAATGATCAAAACTACCATAACGAATCTTCACATTTTAAGAAATTAGTTTTTCGTTTTTAACCTTAAAATATCTAACACAAACAATAATTTCTTTTGCGATGATTCTGTATGTATTAATTATATATACATTATATTTATAAGAAAAAACACCATTTAAAAGAAATATTTGTTAAACAATTTAATATCATCATTCAACGTTAAATTTTATAATAACAATACTGAACTTTCCATGCAGAAAATTTGTGATTTTTTTTTTCATTTACAAACATAACATAAATATTTCATCTTACATTAATCCAACTTAACACAAAGTGTATAATTTCCGGTTTATTGTGGAATAGTTTAAAAATTTAGTCAGAAACATCCACCAAACAAATAACACCAAAAATAGAGTATAACCGAACTGCAAGTGCAAAAATTGATATAAGGTAAACATAAGAAAAGAAAAACAAACACACGCATAGGTTAAACTTGGCTCAAATCTACGTCCATAAAAGAATTTATTTTAATAGATATTATAACTTAAGGTTTCTCTAAGATAACTCAAATGTTATACAACTTTATATCAAAATGTAATTATTGAATTATCTAAACTATGTTAATCGTCTAGGAATCTCTTAGGATAAGATTATGATATACTTAATGTTCACTGAATTGAATACAAGTATAAAAGTATATTATACAGATCAATAAACTCATTTTAAAAAAACTGTCTTATTTGTTTGATGTATGAGATGAAAAAAGAAAAAAGATGATTGAATATTGTGACAAGTTATTTTGATATTTTGTAGTGTGTGAATAAAAGTTACTGTATTTAACATTGAATTAATTGTATTTCACGTGCAAAGCAGTGAGCATTTTTGGGGGGCTTTATAAGGCAAAAACTGGTTGCAAAGAGGACCCA


Gene Sequence:
>Vu_30089(+)
AACACAAGACTAGCTAGTGGTGTTTTCCTTTCATCGTCTTCCTCTTGAAGGTATTGAGGTTGTTTGTTATGTGTTTGCCAGAGGGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCCATGGCACTGGAAGCAGTGGTGTTTCCACAATCACAAGACCCATTTGGTGGTTACGGATCAGTGAAGGACTTCTACAACTGCACTTTCTTGGCTGCTACTTCACCTAACTGGGGGGACTATGAACACATCAACATCAACATCCACAAAGAAGAAGAACAAGGTTCCATCTCTACTTTTCTCGATAATAGTAACAACCAACCAGACAATTACCCTTATGGAGGAGATTGGACCAGCTCCTCATCCTCTATCTTACCCCACTTGAATGATCTTCAAGAACCCACAGACCCCAGTAACGCCACTCACAGCTTGGATACCTTAACCACTCGTCCCAAGAGGCGCAGAGCCAAAAGCAGAAAGAACAAGGAAGAAATTGAGAACCAAAGAATGACTCACATTGCTGTCGAGCGCAATAGAAGAAAGCAGATGAATGAGTATCTTTCTGTTCTTCGCTCTCTCATGCCGGACTCTTATATCCAAAGGGTACTTCTCTCCTCTTCCTTTTTTTTGTTCTTACCTATTTGTTTCTTTACTTGGTTCCTTCGAAAATAAAAATTTTGTTTGTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTGTTTGGTCTGGTTGGCCATTGAAGGGTGATCAAGCTTCTATAATTGGAGGTGCTATTAACTTTGTGAAGGAGCTTGAACAGAGGCTGCATTTTCTTGGTGCTCAGAAAGAAGGAGAGGGGAAATCTGATGCTGGTGGTGCAACGAACATGCCCTTTTCTGAGTTCTTCGCCTTTCCGCAGTATTCAACAAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGCTCTGATAATTCTGCAACCGTAGGTGAAGACGTGGGTGAAGTTAAGTCTGGCATTGCTGACATAGAAGTGACAATGGTGGAAAGCCATGCAAATCTCAAAATAAGATCCAAGAAGCGCCCGAAGCAACTCTTGAAGCTGGTCTCTGGTTTGCATACTATGCGCCTCACAATCTTGCACCTAAATGTTACCACCACCGGTGAAATTGTACTCTACTCTCTAAGTGTTAAGGTTTGTCTTTATTGGTGCCTTAAACTTGAGATATTTTTAGTTAATTGTTTTCTTCTGGAAAGTGAAAATGTGCTGAGTTTTTTGTTTTGTTTTTTTGCAGGTAGAAGATGATTGCAAGTTGGGATCCGTTGATGATATTGCTGAAGCTGTGTACCAGACGCTGGATAGGATTCAGCAAGAGGCAGTGTTGAATTAAGATGAGACGATGAGCACCAAATTTGGCTTGCTCCACTTGGTTTTTAACCTTACTTCATGGTGGATCATTATCTCTTGCTATTTTTCTCTTTCAAGATGTACCTAATTATTGCAACTTCTATTCACTTCACCCTTTTTTAATCTACTGATGGTGCCCTGATGTGGACTCCTTGGAGGAAGTTTTTTGGTTTATTCCTTCTTGTGTATGTCTTTGTAGCTCACGAACTTACTTTTGATCTCTCTCTTTCTCTTTCTTCTCTTTTTCTCTGAGGTAGGGGTGGAGGAGGCTCTGTGGTATATTGTTCTTGAGACATATTCTAGTGCTTGGTCAATTTTGCCCACTTTGCTTTGAAATTGGTGGGTCTTGTCTACCTCAACTATAAGCCAAAGCCTAATTGTCAAGCTGAAATTGGGAGCATCTCAAAATAAAATTGAATGAAAATGAGAGCCAAAGATTTTTGGCAATTGTCACATAT