Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29961 LG8 32422792 32425896 hypothetical protein PHAVU_007G204000g
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09191 Unclassified: metabolism   C 99980 Enzymes with EC numbers
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 32423300 upstream_gene_variant
G/A 32423567 upstream_gene_variant
G/T 32423609 upstream_gene_variant
A/C 32423661 upstream_gene_variant
A/T 32423707 upstream_gene_variant
T/A 32423799 missense_variant p.Phe89Tyr
T/A 32423817 upstream_gene_variant
C/A 32423887 upstream_gene_variant
C/A 32424002 missense_variant p.Leu122Ile
C/T,* 32424007 synonymous_variant p.Asp123Asp
A/G 32424456 upstream_gene_variant
G/A 32424488 splice_region_variant&intron_variant
T/C 32424676 upstream_gene_variant
A/T 32425231 missense_variant p.His320Leu
C/T 32425491 upstream_gene_variant
C/T 32425587 upstream_gene_variant
G/A 32425639 missense_variant p.Arg362His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29961.1
MTSVGVAPTSGLREASGHGAAGVDRLPEEMNDMKIRDDREMEATVVDGNGTETGHIIVTTIGGRNGQPKQTISYMAERVVGHGSFGVVFQAKCLETGETVAIKKVLQDKRYKNRELQTMRLLDHPNVVSLKHCFFSTTEKDELYLNLVLEYVPETVNRVIKHYNKLNQRMPLIYVKLYTYQIFRALSYIHRCIGVCHRDIKPQNLLVNPHTHQVKLCDFGSAKVLVKGEPNISYICSRYYRAPELIFGATEYTTAIDIWSVGCVLAELLLGQPLFPGESGVDQLVEIIKVLGTPTREEIKCMNPNYTEFKFPQIKAHPWHKIFHKRMPPEAVDLVSRLLQYSPNLRCTALDALTHPFFDELRDPNTRLPNGRFLPPLFNFKSHELKGVPAEILVKLVPEHARKQCPFLGL*


CDS Sequence:
>Vu_29961.1
ATGACATCCGTTGGTGTGGCGCCAACTTCGGGTTTGAGAGAAGCTAGTGGGCATGGAGCAGCAGGTGTTGATAGGTTGCCGGAGGAGATGAACGATATGAAAATTAGGGATGATAGAGAAATGGAAGCCACTGTTGTTGATGGCAATGGAACGGAGACCGGACATATCATCGTGACTACCATTGGGGGTAGAAATGGTCAGCCGAAGCAGACTATAAGCTACATGGCAGAACGTGTTGTAGGTCATGGATCGTTTGGTGTTGTCTTCCAGGCTAAGTGCTTGGAAACTGGTGAAACCGTGGCTATCAAAAAGGTTCTTCAAGACAAGAGGTACAAGAATCGGGAGCTGCAAACAATGCGCCTTCTTGACCACCCAAATGTTGTCTCTTTGAAGCACTGTTTCTTTTCAACAACTGAAAAGGATGAACTCTACCTTAATTTGGTACTTGAGTATGTTCCTGAAACAGTTAATCGTGTGATCAAACATTACAACAAGTTGAACCAAAGGATGCCTCTGATATATGTGAAACTCTATACATACCAGATCTTTAGGGCATTATCTTATATTCATCGTTGTATTGGAGTTTGCCATCGGGATATCAAGCCTCAAAATCTATTGGTCAATCCACACACACACCAGGTTAAATTATGTGACTTTGGAAGTGCAAAGGTTTTGGTAAAAGGCGAACCAAATATATCATACATATGTTCTAGATATTACAGAGCACCTGAGCTTATATTTGGAGCAACTGAATATACTACAGCCATTGACATCTGGTCTGTTGGATGTGTCTTAGCTGAGCTGCTGCTTGGACAGCCTTTGTTCCCTGGTGAGAGTGGAGTTGATCAGCTTGTTGAGATTATAAAGGTTCTCGGCACTCCAACAAGGGAAGAGATTAAATGCATGAACCCTAACTATACAGAATTTAAATTCCCACAGATTAAAGCACATCCATGGCACAAGATCTTCCACAAGCGCATGCCTCCAGAGGCTGTTGATCTGGTATCAAGACTACTACAATACTCCCCTAACTTGCGGTGCACAGCTTTAGATGCTCTGACGCATCCTTTCTTTGATGAGCTTCGTGATCCAAATACTCGCTTGCCAAATGGCCGATTCCTTCCACCACTATTTAATTTTAAATCTCATGAACTGAAAGGAGTCCCAGCTGAGATTTTGGTGAAATTGGTTCCAGAACATGCGAGGAAGCAATGCCCGTTTCTTGGCTTGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_29961::LG8:32420792-32422792(+)
ACAAAAGATTTTCTGAAAAAAAATTTACAAGCATAGAAATTTAATAATAGTCCTATTTATATATTATTATGGTGATATTTTTTCAATTTTACTGATATTTTAGTAATTTTTATTTATATAATATGATAATGAGATATGTTTGAGTTTACTGTTATTCATAACTTCTCTATGCTTAGAAAATTATTGTAAGAGATGAAAACAAAATAAAAACATTACACTACTATTATGATTAGCAATTGAAATTAGTAATAAAACAACAATATTCTATCTTTCTTCTTTTGAATTTTTAAATAAATTTATTCAAACATGTAAAACAGTTAATAAAACAGTTACTATTTATTCAAAAGTATTTTTCTTTTAAAAGAACAACAAAAATACTTATAAATTTATTGCCTTAATTTAATATTTTGAAAAGCATCAGTTAATAATAAGGAAATAAATTACAAATTTATTATTTTATGATTTTTATTAATTTTGAGAGATTAATTATTTTAGAGAATAATCCAACTCTTAATATTAATTTAACTTACCATTTAATTTTAGAGATTAAATTAATTTGTGGTAAACACTATTTGATTGCTTTATTAATTTCATTAACCCATTCTACTTATAATGATTCTTTTGAAAATTAAAAACTAAATAAACTATAAATCTTTATTTAGTTAAAACTCTCACACTATTTTATTATGAAAGGAACCCACATCTTTATTTATTTATTGCATTGATCTTATTCAATGCTGATAGTGTTTAAAACATCAAAATACATGTCAATAAAAAATAAACAAAATTAATTAGACTTTATCTAATCACTTTAATTATTAACTAAATTTATGAAGACTTAAAAGTTACATAAAAAAATATGAAGAATGTATAACTGTAAATTTTGTCCACATAAATATTCTAAGACAAATTATTGAGCTCACTGATTTATTTGACATGCTAATTTGAGAACAAAATAATAATATAAATTATTAAAGTGTCTATTCATTTGTTTGTAATTTTTCACGTGTCGTTGTAAATATTATAAATATATATGATTTTTGGAACTATAAAAAAACGAGAGCACTAAAGAAGGCGCCTAAAACACACATGCCGCGGTGGCCAATTAATAGTTGTTACCATTTCAATACAGTGAGTTTGAACTTTGAAGTTTGAACGGTCAAAAGTGATGGGAAAACTAGGTTACATTTTTCTATATTTTATTTACTCCAAAATACACAATTATTTAATTATTTAATTAATTATTTAATTAATAATAAATAAATAAATAGTTAGAATGGGTTGGTTTTCTTCTTTGACTGTCACCAGCGCATTATAGCACACCACACAAAAAAGCAGAGAACAACTGTTACTCACACAAATCCAAACACGCCATGGGTATGCCTCTCATGGATCTAACCCTCTCTTCCTTCTAACCGCCCTTTTCGCCTCCTTCTTTTCCATTCCAAACTCTAGATTCCTTATCTCTCTATTTTCTCCTCTTCATTTTCTTCCTCTTCCGTCGAACTTTTCTTTTCTCCGACGTCGCTGCTTTTCTTTCTGCTTTTCCTGTGTTTTGAACGCTCTGCGTTTGTTAATTTTGTTTTGTGTGTTCGGATCGTGTTATTTCACCTTCAGTTGCGGGGATCTTCGGTTTAGGTTTGTTTAGGGATTTTTTTTTTGTTGCCTGTTTCTGTTTCTGTTGGAGTTTTCGGATGGATTTGTGGCGTTCTGTGAGATTGATGGAGTTTTATGTTGCTTTAATGTTTTCCTTTTTCACATAATGGATATTTATTTATGGACAAAAGGGATTTGCGTTTTTTGTTTCTTTAATTCGTTTTCGAACGGTGCTACTTTCCTATTTGGTTCAGTTTTTATTATGTCTGTTGATTCCAGTTTTAATGCTTAAATTAAAAAAAAAAAGTTGTCCATTTTTTTTAATTATGGTGTGATTGTTCATTCTGGCAGGTGTATGAGTGGTTTTTGAGCAGAAGTTAACGGAGAAAGGGATTCAGTGAAGA


Gene Sequence:
>Vu_29961(+)
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