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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29956 LG8 32396825 32400736 hypothetical protein LR48
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 32396986 synonymous_variant p.Asp54Asp
A/T 32397615 missense_variant p.Lys228Met
C/T 32397908 splice_region_variant&intron_variant
A/T 32397909 splice_acceptor_variant&intron_variant
T/A 32398018 missense_variant p.Leu294Met
C/T 32398153 downstream_gene_variant
T/C 32398318 downstream_gene_variant
C/T 32398593 downstream_gene_variant
C/T 32398595 downstream_gene_variant
A/T 32398749 downstream_gene_variant
A/C 32398900 downstream_gene_variant
G/T 32398935 downstream_gene_variant
G/A 32398941 downstream_gene_variant
T/C 32398942 downstream_gene_variant
A/C 32398948 downstream_gene_variant
C/A 32398954 downstream_gene_variant
C/G 32399050 downstream_gene_variant
T/C 32399094 downstream_gene_variant
G/A 32399284 downstream_gene_variant
T/C 32399299 downstream_gene_variant
C/A 32399812 downstream_gene_variant
T/C 32399840 upstream_gene_variant
G/A,* 32400027 synonymous_variant p.Leu338Leu
A/T 32400159 missense_variant p.Arg382Ser
T/C 32400362 upstream_gene_variant
T/A 32400526 missense_variant p.Ser414Thr
C/G 32400620 upstream_gene_variant
G/C 32400706 missense_variant p.Cys443Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29956.1
MGADLKEELSVKTPVFDLKVWELIGIAVGLFIIIILCVLSFCLTSRKKSRKARDRVPVSHIPAVSKEITEVRVEQVPANGFVPREGILLTIHDKSSDKESDKVMLHLGVGKKKHGDSGSHSDSFHYLEKDGGGSQSGEEISSGSVGMYMPSSSYPLTAPSPLSGLPEFSHLGWGHWFTLRDLELATNRFSKENVIGEGGYGVVYRGQLINGTPVAVKKILNNIGQAEKEFRVEVEAIGHVRHKNLVRLLGYCMEGTHRMLVYEYVSNGNLEQWLHGAMRHHGYLTWEARIKILLGTAKGDPIDYGRPAQEFVMTNSDEGILTDIYDELQCPQVNMVDWLKMMVGNRRSEEVVDPNIEVKPSTRALKRALLTALRCVDPDSEKRPKMGQVVRMLESEEYPLAREDRRHRRSHGVNSEIESHKDSSDTDGSDIQGSRSESGRFLDLPTRDGYGRG*


CDS Sequence:
>Vu_29956.1
ATGGGTGCTGATCTTAAAGAAGAATTGTCCGTGAAAACTCCTGTTTTTGATCTTAAGGTTTGGGAACTGATTGGAATTGCGGTTGGACTGTTTATCATTATCATCCTCTGTGTGCTCTCATTCTGCCTTACTTCAAGGAAGAAGTCTAGAAAAGCCAGGGATAGGGTTCCTGTTAGTCATATACCTGCTGTCTCAAAGGAAATCACAGAAGTGCGAGTTGAGCAAGTGCCGGCGAATGGATTTGTTCCACGTGAAGGAATACTTCTGACAATTCATGATAAATCCAGTGACAAAGAATCAGACAAAGTTATGCTCCATTTAGGTGTTGGGAAGAAGAAGCATGGAGATAGTGGTAGTCACTCGGATTCGTTTCATTACTTGGAGAAAGATGGTGGAGGGTCACAATCAGGGGAGGAGATTAGCTCTGGCTCGGTTGGAATGTACATGCCATCTTCTTCATACCCTTTAACAGCTCCTTCACCTCTCTCTGGTCTTCCGGAATTCTCTCACTTGGGTTGGGGTCACTGGTTTACTCTGAGGGATCTCGAGCTTGCTACAAACCGTTTTTCAAAAGAAAATGTAATTGGTGAGGGTGGGTATGGAGTTGTTTACCGGGGACAGTTGATCAATGGGACTCCAGTGGCAGTTAAAAAGATACTCAATAACATTGGTCAAGCTGAGAAAGAATTTAGAGTGGAAGTTGAAGCTATTGGCCATGTCCGGCATAAAAATTTGGTTCGACTTTTGGGGTACTGCATGGAGGGGACTCACAGGATGTTAGTCTATGAATACGTCAGTAATGGAAACTTAGAGCAATGGCTTCACGGAGCTATGCGACATCATGGATATCTTACCTGGGAAGCACGTATCAAGATTCTCCTTGGCACAGCTAAGGGAGATCCAATTGACTATGGTCGCCCAGCACAGGAATTTGTTATGACAAATTCTGATGAAGGAATTTTGACTGACATTTACGATGAACTACAATGCCCTCAGGTTAACATGGTTGATTGGCTGAAGATGATGGTTGGAAACAGACGATCAGAAGAAGTGGTGGACCCAAACATTGAGGTGAAGCCATCTACCAGGGCTTTGAAACGGGCGCTCTTAACTGCTTTGAGATGTGTAGATCCAGATTCAGAGAAAAGACCCAAGATGGGTCAAGTTGTGCGTATGCTTGAGTCAGAGGAGTACCCTTTAGCTAGAGAGGACCGTAGGCATCGAAGAAGTCATGGAGTTAACTCAGAAATTGAATCCCATAAGGATAGTTCTGACACAGATGGGAGTGACATTCAAGGTTCTAGATCAGAAAGTGGAAGATTCTTGGATTTGCCTACCCGAGATGGGTATGGCAGAGGCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_29956::LG8:32394825-32396825(+)
ATAATAAAAATTTCAAAGTATCTATAACTTAAAGACAATGCAATTGGTTGGTTTCTTTTACCTGAGATGAACTTGCTCTAAAGAATTTCAAATCTTTTTCAACTCACAGGATGTCCTATCTATATTTAGGAACAATACAACACGATTAGGATACATCATTATAATCATTGATCAACGAATATTCATATAGATAACTAAAAACACACATACAAGTGAAAAAAGACTCACATGCAATAAATAAATAAAAAACTAAAACTCAACTAACACACGAACCAAGAAACTAATTGGTCCAAATTAAAAAAACTCATTACAATGATCAATTTTATTATTTCGATTTTTCAATTAGACAAATAAAAAATAAAAATCTTTAAAAAATTATTATGTTAAAATCTTTTAATATTAAAATAATCAAATCGTTATTTTTAATTGTTATATTAACTTTATACATTAAAATATCTATCTATTTTTATGATTTATAAATATTTGTTTTGATGTGCATTTTTTTATTCAAATAAAATTTTGTTAATTTAATGTTTGGTAATCATAACACTAAAAGAATATTTTATTAAATGTTTTACAACTTTAAATAATAAAAACAAATAAAATAAAAAATGTTAAGATAAACATCTGATTATAGATAGTTTATGAATACTGTTGCTATTATATTATTATTATTATCAAGATTATCCTGACAGTTTATCTGAATAGTATAGTACGGAAAATAATAACTGAAGAATATATAATCACAGCAGGAAGGAGTCTTCAATTTAATTTCATGGTGGTTATCTTTCTTCTTTTGTGGACTGAATCCTTGTTAACTTTCACTAGAAAAAACATTGATTATTATCATTATTTATTTAATTTAATTTAAAATACCATAAATAATCATTATTAGGCCAGTTTAATTAAAATTTCCATAAATATCGTTCAAAACACATGGTTTTGATATTAATAATGGTAATAATAATAATTTAATACTATAACATGATTTTATCCAATATTTATTTAGACAATAAATTTAGTGAAAAAAAAAGACATAACAATGTCTGGATAATTGTTTACGGTAATTTATGAGAGAGGATCGTTTACGCAGCATAGTTGGAAATGAAGGAGAGTAAATAAAGAGGTAACCATGGAGTCAAATGGAAGTATAAGAACAGAATAAGAATGGAAAATGTAAAGGATGAGGGTGAATTCAATTTTTGATACTATTAGTCAGTAATGTTTATGTTCGTAACCATGCGATGCCATGAGAATATCTAATCCATCGCAAGAGGACTGACTCACTTCAGAGATATATCACAATCACAATTGCATTGCATGCTTCTGTTCTCTTCTGTACTCTTTCTTTTACTGCACTGGAAATTTTGAATTGGATGTATCTGTATGCGTATCCCTTCTAACGCATCTATTCCCTCTCACTCATAACTCCACCCTTTCTTCTTATCACTCCTACCCACTACTCCCATTCTCAACACTGCTTAGATTTTCCCTCACATTTTCCCAACCCACTAAGGCTTTTCAATTTTCATCACTTTTTCACTACTGGGTTGTCAGGATTCCATCCTTTTGGACTTCTATTTGGTCAAAGATCTGGCCTTTTTCTGTTTGGTGTTCCTTTTTTGGGATGTGGTGATCTGGGGTTTGTGGTGCTTGTCCTTGTGAATCTCGCTCCGCAATCCACGACGATTGGTAATGCTTTGAAGTCCGTGTCTTTGCTTTTAGGGTTCCTTTCTTTGTTTTTCTTGTTGTCTGTGAATGCTTGTTGTTCTGAAATGCTTGTGCTTTTGTATTATCAACCAATCAAGGCTGTTTATGGTGCGGTGAATATTCTATTTGCTTTTTGCGTCGTAGTCTAGTGGTAACAGATACCTGCTCATATTCCTCATACATAATGCATCGACAATTTGAATATTGATGTCATTTTTGGGTTATAATGCAGCTTACCTCTCTTTTTTTTTATTACATGTATATTGCAGAGCTCAGGGGGTTCTAAGAGA


Gene Sequence:
>Vu_29956(+)
ATGGGTGCTGATCTTAAAGAAGAATTGTCCGTGAAAACTCCTGTTTTTGATCTTAAGGTTTGGGAACTGATTGGAATTGCGGTTGGACTGTTTATCATTATCATCCTCTGTGTGCTCTCATTCTGCCTTACTTCAAGGAAGAAGTCTAGAAAAGCCAGGGATAGGGTTCCTGTTAGTCATATACCTGCTGTCTCAAAGGAAATCACAGAAGTGCGAGTTGAGCAAGTGCCGGCGAATGGATTTGTTCCACGTGAAGGAATACTTCTGACAATTCATGATAAATCCAGTGACAAAGAATCAGACAAAGTTATGCTCCATTTAGGTGTTGGGAAGAAGAAGCATGGAGATAGTGGTAGTCACTCGGATTCGTTTCATTACTTGGAGAAAGATGGTGGAGGGTCACAATCAGGGGAGGAGATTAGCTCTGGCTCGGTTGGAATGTACATGCCATCTTCTTCATACCCTTTAACAGCTCCTTCACCTCTCTCTGGTCTTCCGGAATTCTCTCACTTGGGTTGGGGTCACTGGTTTACTCTGAGGGATCTCGAGCTTGCTACAAACCGTTTTTCAAAAGAAAATGTAATTGGTGAGGGTGGGTATGGAGTTGTTTACCGGGGACAGTTGATCAATGGGACTCCAGTGGCAGTTAAAAAGATACTCAATAACATGTGAGTTCCCGCACAATGTCTAAGGCATTGAATTTATTCGAACTTTTGTTTTTAGTTCTCATACTTCTACCAAACTTTGACTACTTTCTCTTCCCTCTGTTCTGTAGTGGTCAAGCTGAGAAAGAATTTAGAGTGGAAGTTGAAGCTATTGGCCATGTCCGGCATAAAAATTTGGTTCGACTTTTGGGGTACTGCATGGAGGGGACTCACAGGTACCCAACTTGTCAATTATATTGCAGTCTCAACAGGCATAGTCTCAATAAATTTCTTAGAGGAATTGAATTATAACTGCCAGAATCATAAAATTATGAAAATTCCTTTGAGTTGCATATTCTTCAGGTTGATCTCAAGTTCAACACACAACAATTTAAGTATGTTATCTTAATTATATTTTCTCCCGTATGGTGGAGTATTTCAGGATGTTAGTCTATGAATACGTCAGTAATGGAAACTTAGAGCAATGGCTTCACGGAGCTATGCGACATCATGGATATCTTACCTGGGAAGCACGTATCAAGATTCTCCTTGGCACAGCTAAGGGGTGAGTTGCTGTGTGTATGCTTCTTCAGGCTTCTGTAGTCCTCATAAAGTTCTTCAGGTTATCACTTGGTCCTAATTTAGAGCAACATATTTGTTTCAGGCTTGCATATTTGCATGAAGCGATTGAGCCAAAGGTGGTGCACCGAGATATCAAGTCAAGCAACATATTAATTGATGATGACTTTAATGCCAAGGTTTCTGATTTTGGCCTGGCTAAGTTACTGGGTTCTGGGAAGAGTCATGTTGCAACACGAGTTATGGGAACCTTTGGGTCTGTTACTTATCTGCTCTTCACTATTTCCTTTTTCCACTCTCAATATTGTTGACAAACTTTGATAAGTTGGATCCTTATATTTATTCTTTCTTTTTTGCTCCGTACAACTGACAGATATGTGGCCCCTGAATATGCAAATACTGGTCTTCTAAATGAAAAAAGTGATGTGTATAGCTTTGGTGTTGTGCTATTGGAAGCAATTACTGGAAGAGATCCAATTGACTATGGTCGCCCAGCACAGGAAGTGAGTAAATCCATCTTGAAGAATTTTCTTGATAAAACTTCACTCAATTCACCAAATAATCGTAAAGCATTACCTTTTGAGTTTGACTTGTTCATCCCAAAAAAGTAATCTGTGTTTTTGTCTTGGCATTAGTTGGATTGCAGCTCATATTTCGATATTTTCTGGCCTATGATCTGAACATATGTTTTTAGACATGTAACATTACTTTATCTTACTGAATAATGTTAGCAACATACTCCTCTACTCGTTTTTTAACTCTTGTTTTATCATTCAGCAAATTTTTATGTGCACCTCACCCTATAACAGAGCGTCAGTATGTTGCTAGGCATTTCTCCTACCATATTGTAGCAAACTTCAGGATAAAATTATTTTGATTCCTAAATGGGTCTAGTTAGACACATTTCTGTTTTGATGCTCTGATGCATAGCTAATTTATGAAATATCTTTATAATTGTTCTTTCCAATACTACAAGAAAATCAATTCATGAGTCATTACGGTCAAAAATTCAGTTACCAACTGAAAACATCTAGAGAAGTTGATATTGACTTTGGAAGCTATAATCAATGAAAAATTTAAACATTTTCCAGAACGCGAGCAATTTGATCTATTGCAACTATGGGTCCTTTGGTCCTCTCTACCAAACTTATTACCCTGCCCTTTTTAAGTCATATCCCTGGCCTTAAAATGCTCTAAACATCATACACCATTGGCTAAATATTAGGATATAAAGTTGGAGTGCCTGATCACTACCTCCACTTTAGCTGTGCTACATATGAATTCCAGCTGGGTGCATGTAATCATTATTTGTGGATTCTATTGATAAACATCATAATTTTGGGGGAAGTAAGTAGGTCCCCAGAATTTCAAAATTCTAGAGCGGTCTATATTTTCGGTAAATTCAAAAACCTTTTCAAGACAGTCCTTAAGTCTAGTTTATTGTTAGATCACCGTGTATAGATCCAACGGAAAAAGGTTTTAAAACAATGTCTTCATTCCTTTTTTATCACTTGAACTTGCCTTGGACCTGACTGATGCAGTATTGATGAATCAATTCTATATTTCTTACATTTATAACGTGAATGCAATGATAGTTGCTGCTGTTGTATCGTATACGACTATGATGCCAAATTTAGATGGCTTGTTTATTTAAGGCTTCCGTACGGGAAATAGGGATTTGAAGTTAGCAGGGTTTTAATTAAGGGTTGTAATTCTGATAAAAATATGAGGAGTTGCAACATTATCAGCTAGGGATTTACCTTCCCAGTTTATTGTTTGTTAGTTATTACCTTATTCTCAGTGATTAGTTTCAACATCTTGTGCTTGATTTTTAACAACAACAAAATTCAGATGTTCTTTGTGTTCTTCTCAGTTGCTTATTTTCTACATCAGTTTGTTATGACAAATTCTGATGAAGGAATTTTGACTGACATTTACGATGAACTACAATGCCCTCAGGTTAACATGGTTGATTGGCTGAAGATGATGGTTGGAAACAGACGATCAGAAGAAGTGGTGGACCCAAACATTGAGGTGAAGCCATCTACCAGGGCTTTGAAACGGGCGCTCTTAACTGCTTTGAGATGTGTAGATCCAGATTCAGAGAAAAGACCCAAGATGGGTCAAGTTGTGCGTATGCTTGAGTCAGAGGAGTACCCTTTAGCTAGAGAGGTTTGTTATGCTGTCACCATTTTTCTAAAAGTGTTTTTTTTTCTTTAATTGTTAATACTGCCATGATACTCAAAAACCTTTTTGGCCTCTGACTAATCTTGGGTCAAGCTGATTGGACCTACTTCAGGCAGGATGTGGATCATTCGGCATCAACCTTTCAGTTTTCATACTAGATCATAAATGGATTCATATATCCCATACTTAAGGGACAATTAGTTTTTACTGAAATAATTTAGACTGACATTTGATTTATTTCATTTGCTGGATACTCAGGACCGTAGGCATCGAAGAAGTCATGGAGTTAACTCAGAAATTGAATCCCATAAGGATAGTTCTGACACAGATGGGAGTGACATTCAAGGTTCTAGATCAGAAAGTGGAAGGTAACTGCAGGCATGAGCTAAGAGAATGAGATTCTTTTTTAGGATCAGTGGTGTGTATAAAGTGAGTGATTTATTTTATTTGTCTGGTTAGATTCTTGGATTTGCCTACCCGAGATGGGTATGGCAGAGGCTGA

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