Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29905 LG8 31842796 31845370 PREDICTED: probable WRKY transcription factor 47 isoform X1
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 31843228 synonymous_variant p.Phe308Phe
A/C 31843254 missense_variant p.Ser300Ala
T/C 31843327 synonymous_variant p.Lys275Lys
C/T 31843393 upstream_gene_variant
C/T 31843495 missense_variant p.Val243Ile
C/G 31843649 missense_variant p.Arg218Thr
G/C 31843760 upstream_gene_variant
G/A 31843997 upstream_gene_variant
T/C 31844038 upstream_gene_variant
T/C 31844054 upstream_gene_variant
A/T 31844116 upstream_gene_variant
T/A 31844471 upstream_gene_variant
A/G 31844690 upstream_gene_variant
A/G 31844753 missense_variant p.Phe135Ser
A/G 31844761 synonymous_variant p.His132His
T/C 31844871 upstream_gene_variant
G/A 31844904 upstream_gene_variant
G/T 31844957 missense_variant p.Ser100Tyr
G/A 31844998 synonymous_variant p.Asp86Asp
T/C 31845033 missense_variant&splice_region_variant p.Thr75Ala
A/G 31845050 upstream_gene_variant
C/G 31845160 missense_variant p.Glu71Gln
C/T 31845298 missense_variant p.Asp25Asn
G/A 31845341 synonymous_variant p.His10His

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29905.1
MENHRQMQQHRRQITLLGSTNLDLDSTTVNTVKELDFFSTSPSNHTHTDNLHHLPSNIPKDNGPQPLFTDEFVNTTLNLMCPSQSDELSRSAAIDQNLKSPLNTLQKEFLRLQEENYRLRTMLDQVTQNYHHLQFFIAMQKQKPYQKVEKKEMMSGHHLMDPQSCPKLDAKVVASVSNDKSSQEAHPDRVEDVIEQSSSKSPKFEESKPGEPPLRRTRVSVRARSEAPVICDGCQWRKYGQKVSKGNPCPRAYYRCTMALGCPVRKQVQRCTEDKSVLITTYEGNHNHPLPPSATVMANSTSAAATMFLSSSGSTTSNEALNNSVGVFSSMYLSASAPFPTITLDMTNNNPMQLHRDTSSFPLHATTFPQLPGHPIIFPHKLQHSLGQKQPSFMTDIMTAAVASNPNFTVALAAAISSIIGAPRSNDANNIYSNNGGNVLALGTSMLPGST*


CDS Sequence:
>Vu_29905.1
ATGGAAAACCACCGCCAAATGCAACAGCACCGTCGTCAAATCACCTTACTTGGATCCACCAATCTCGATCTGGATTCTACAACCGTCAACACCGTCAAAGAACTCGATTTTTTCTCAACTTCACCGTCCAACCACACTCATACCGATAACCTCCATCATCTCCCTTCAAACATTCCTAAAGACAACGGACCACAACCTCTTTTCACTGATGAGTTCGTAAATACCACTCTGAATTTAATGTGTCCGAGTCAGAGTGACGAACTGTCAAGATCAGCAGCAATTGATCAAAATCTTAAATCTCCGCTGAATACGCTCCAAAAGGAGTTTCTAAGACTGCAAGAAGAGAACTACAGGTTGAGAACGATGTTGGACCAAGTCACCCAAAACTACCACCATCTTCAATTTTTCATTGCTATGCAGAAGCAAAAGCCGTATCAGAAGGTGGAGAAAAAGGAGATGATGTCTGGTCATCATTTAATGGACCCACAATCATGCCCCAAATTGGACGCTAAAGTTGTTGCATCAGTCTCCAATGATAAATCTAGTCAAGAGGCTCATCCTGATCGTGTAGAAGATGTTATTGAACAATCATCATCCAAGAGTCCCAAGTTTGAAGAATCCAAGCCCGGTGAGCCTCCTTTAAGAAGAACCAGAGTTTCCGTGCGTGCAAGATCAGAAGCTCCAGTGATTTGCGATGGATGTCAATGGAGGAAATATGGGCAAAAAGTATCCAAGGGTAATCCATGTCCTCGTGCCTACTATCGTTGCACCATGGCACTAGGATGTCCGGTTCGAAAACAGGTGCAAAGATGTACAGAGGACAAAAGTGTGTTGATAACAACTTACGAAGGCAATCATAACCACCCTCTTCCACCTTCAGCCACGGTGATGGCGAATTCTACCTCAGCAGCTGCAACTATGTTTTTATCTTCTTCAGGTTCAACAACAAGTAACGAAGCACTAAACAACAGTGTAGGAGTATTCTCTTCCATGTACCTCTCAGCCTCTGCACCATTTCCCACTATCACCCTTGACATGACCAACAACAACCCTATGCAACTGCACCGGGACACCTCCTCTTTTCCATTGCATGCAACTACTTTTCCTCAGCTACCAGGCCACCCTATCATCTTCCCTCACAAATTGCAACATTCATTAGGGCAAAAACAACCTTCGTTTATGACAGATATCATGACTGCAGCTGTTGCTTCCAATCCAAATTTCACTGTAGCGTTAGCAGCAGCTATCTCGTCAATTATTGGAGCTCCTAGAAGCAATGATGCAAATAATATCTACAGTAACAATGGTGGAAATGTTCTTGCTCTTGGGACATCTATGTTGCCTGGATCCACTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_29905::LG8:31845370-31847370(-)
TAATGAATAAGGCGAAAAGTCAGGATCCATCTTTTATGCTAATTTCAATATTTTGTTTGGTAGTGTTCGTGTAAGTTGGTCAGTTGTGGCCTAGAAACATTACGTTTTAGAAAAACGCTGCGTTCAACCATGTACATAATGACAAATGAGAAATTTGAGTGTTTGTATATATGCATATATATACAAACAGATTCAATTTGATATTTGTCTTTCTATATTTATCTTCTAAAAAATCTTAAAGACAAAACTCAGAAAATAATTTTTAATATGAGAAAATTTTAGTTTATTTTATTTTATTTAGTGATAGTTTTAATCATATTATAATTTTAATCGATATTTATTATTTACTTATATAATTCTATTTTAATAAAACTGGGTGAGAAAATTAGTTTTGGTTTTTCAGTTATTGGGTAGTGGTAAGGATGGCATGAACCTAGAGTGACGCGGGGCTGACGTGGAGGGCTGATCCAATACGAAGAGGGGCCCACCTCTTGCAGTTCCTAACGACCTTCAGATAGAGCCGTGCCGTCAAACGTCTCCGAAATGAACAGAGAAAAATCAAACAAAACGAGATACTTTTTTCTATTTTAACCATTACTCTCTTTTTTTAAAAATAATAACAGCTTTTGTTTTTAACAATATGTCATTTATAATTGAGAGTAATTAATATAAAACTATTTTCACTAGACGGGAACTTACCAATATTTGAACAGTTACAGATTTATTTTATTGAATACGTCTTACTCGCGTATTTTAATTAATGGAGAAAGGAATAAATAATGTTTTGAAAAATCACTAATTACTTTAGAATCAGAGTATTTAATATATTTAACGAATAAAAAATGTAATGAATTGTGCTGTAACTAATAAAAGCATAAATAACAGAAAACATTAAACGGGATGCTATTCATATGTTTCTGATTAGTTGTTTGATCAATGAATCTTTCAAACACCATATTCTGATTTCGGCTTTTTAATAATCTTAATTTAAAGCATAGATTGAATTTTCAATCGTTTGTTAAAAAAAATAATAGTGGTTTAGCTATATAATATATATGGCAAATATAAAATTAAATATACGCTTTATTATATATTTATTATTAACATTTGCCCTGCTTTATTTTTTAAAATATCAATTCTTATCGTAGAGGTATTAAATCCATTATATTGAAAGTTTTTTAAATTTAGAAGAATCATTCTTATGTAAGTGAATTAGATATTTTTTAGATCATCAAATTATGTATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAATCTTTATGAGGATACCAATGTACTTTTGAGATTCATTAACAGGTGATAATGCTTCTTCAAAAAAAAAAACCAATGTTTTGAAGGGACCCGTTAATTTACTAAATGGGGCTTTATATAAATAATTAGGAAATGGCTGTTCTAAAAATACAGTGAAAAGGAAAAAAGTTATTAAACAATCTAGAATTATCGAGAGTATTTAATATTCTTACCAAACTTTATAGACATTTTGTTATATAGTGTATGTAATCTAAACTTTTAATTTAACAAAACAACATTAATATGTAGTAATACGTCAAAACAATAATTTTCTTACTATCACTCTCAGAATCTATATATTGTCAGTCATTGAAATCCTTATTTTAGTTAGTAAAACATAATTTAATAAAAATCAAACACTAAGATTATCATAATTGAAAATATCGTATTTCTTTTTTCACCTTACGCTCTCCGCACTTTTGTCTTTAACTGAAAAAAAAAATGAAAAATAATGTTTTTTAATTTCATTTTCGTTTTTTCCTAACATATACAGTAATATTATTTGAGCATATAAAAAGAGATTCTCGGTCTTAACTTGAAAGGATGAAAAAGAGAAATAGAGTGTGCAGTAGCAGTGGCACACATCTAAACCCTTGGCGTTGAAAGTGCTCCTTCTGTTTCTAACTCTCTCCCCAGTAAGAGTGATA


Gene Sequence:
>Vu_29905(-)
ATGGAAAACCACCGCCAAATGCAACAGCACCGTCGTCAAATCACCTTACTTGGATCCACCAATCTCGATCTGGATTCTACAACCGTCAACACCGTCAAAGAACTCGATTTTTTCTCAACTTCACCGTCCAACCACACTCATACCGATAACCTCCATCATCTCCCTTCAAACATTCCTAAAGACAACGGACCACAACCTCTTTTCACTGATGAGTTCGTAAATGTAAGTTTTCACATCAACCGAAAATCACGTAAATGTAATTTTCCATTTATGCTTGCTCTTTAATTAGATTCTGAAAACCCAATATTCCTTATTCTTTGTGTTGTGCAATATCCAGACCACTCTGAATTTAATGTGTCCGAGTCAGAGTGACGAACTGTCAAGATCAGCAGCAATTGATCAAAATCTTAAATCTCCGGTTTGCATCACAAGATCTTTACATATGCTCTTCAAAATTAAATAGATGCCAGAATCTATGTTTTGAGATTCAATTTTGTTTATCTCTCTTTGCTTCCAGCTGAATACGCTCCAAAAGGAGTTTCTAAGACTGCAAGAAGAGAACTACAGGTTGAGAACGATGTTGGACCAAGTCACCCAAAACTACCACCATCTTCAATTTTTCATTGCTATGCAGAAGCAAAAGCCGTATCAGGTAGCTAGGTTTTATGTGTAATTAGCAGTCATATATATGTGTGTGTGTTTAGTTTTACTAGGTTATACGTTTTGTGCAGATAAGATCGATCTTATGTTTACAACATTAAATGAATAGCTTCAGTCTAACTAAGATTTATGGTTTGTACTCTCTTTATTAGTTCAGTCATTTTAAATTCTTTCATATTCTTTCCGACCGTCTGAGTGTTACCAATTTCAATGGGACATTGATCTAAAAGAGCTAAGAAAGGTCGTCATGATTTCCATCCTTAAAGTCGTCGAATCCATATATGTGGTTACTTCGGGCTTTCCACGAACTCCTAGGTCGTTAGTCAGAAGAGATAAAGAGTAAGAAAAAGACTTAAATGTAGAAAAAAAAACTAGGTGAACTTTTTTTTACATATGAATTGTAAGGAGTAGTATCTAAAAAAGAACTACACTTATGAAATGTGGAAATATGTCATTCTATCTCATGAACATGCCAGATTTTATTTTATTTAATAAAATAATTAAAAAATCATTATTTTAAAGTACGTATAGTGCTCATTTTTAAAATAATATAACTTATTGTGTCAGTTAGTTTAATTTTACTAAGGGTAGTATTATTTTGTATGTAACCAGTATGTATAAACTATCAATTACTAATTCGTAAACCTAATAATGCTACATTTTGCTAATTATATCAAAATTTACATTCAAACATCTAGATGCATAGAGTTAAACCAAAAAGCACTGAACTTATTTAGTATACGGAACAGAAGGTGGAGAAAAAGGAGATGATGTCTGGTCATCATTTAATGGACCCACAATCATGCCCCAAATTGGACGCTAAAGTTGTTGCATCAGTCTCCAATGATAAATCTAGTCAAGAGGTACTGATTTTCTTAATTTTTCTAGAAAGTCATAGGTACATTATTAACTAATAAAAAAAGGTGCATCATCATTTGACTAAAATAATGCTGGAAAGCAGGCTCATCCTGATCGTGTAGAAGATGTTATTGAACAATCATCATCCAAGAGTCCCAAGTTTGAAGAATCCAAGCCCGGTGAGCCTCCTTTAAGAAGAACCAGAGTTTCCGTGCGTGCAAGATCAGAAGCTCCAGTGGTAATTAATAATTAAATTTAAATACCCTACTTACCAGCTGCATTTATTTTATGTATATTTAATGAAATGTGAGCGTTCAGATTTGCGATGGATGTCAATGGAGGAAATATGGGCAAAAAGTATCCAAGGGTAATCCATGTCCTCGTGCCTACTATCGTTGCACCATGGCACTAGGATGTCCGGTTCGAAAACAGGTAAATAATTCTCATTTTTGCTTCTGAGCATGATGTTGTTACATTATGTTGAGCCAACTACGTTGTACAGGTGCAAAGATGTACAGAGGACAAAAGTGTGTTGATAACAACTTACGAAGGCAATCATAACCACCCTCTTCCACCTTCAGCCACGGTGATGGCGAATTCTACCTCAGCAGCTGCAACTATGTTTTTATCTTCTTCAGGTTCAACAACAAGTAACGAAGCACTAAACAACAGTGTAGGAGTATTCTCTTCCATGTACCTCTCAGCCTCTGCACCATTTCCCACTATCACCCTTGACATGACCAACAACAACCCTATGCAACTGCACCGGGACACCTCCTCTTTTCCATTGCATGCAACTACTTTTCCTCAGCTACCAGGCCACCCTATCATCTTCCCTCACAAATTGCAACATTCATTAGGGCAAAAACAACCTTCGTTTATGACAGATATCATGACTGCAGCTGTTGCTTCCAATCCAAATTTCACTGTAGCGTTAGCAGCAGCTATCTCGTCAATTATTGGAGCTCCTAGAAGCAATGATGCAAATAATATCTACAGTAACAATGGTGGAAATGTTCTTGCTCTTGGGACATCTATGTTGCCTGGATCCACTTAA