Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29781 LG8 30427172 30427807 PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor 1B
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 30427261 missense_variant p.Val183Leu
T/C 30427302 missense_variant p.Lys169Arg
A/T 30427447 missense_variant p.Ser121Thr
G/C 30427633 missense_variant p.Pro59Ala
C/G 30427643 missense_variant p.Lys55Asn
G/A 30427793 synonymous_variant p.Phe5Phe

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29781.1
MSSPFFQSPYWDMIMLQEPSEILFQSLSSNDVLDPLHDSLSFDMVDFSTAPAEGKHKEPKKLVVESEVKNRERSYIGVRKRPWGKFAAEIRDTTRSGRRVWLGTFETAEAAALAYDQAAFSMRGHNAVLNFPVKRVKESLQEIQYTCFNGSSPALALKARHCKQKHLSKAKYCKGKEKSKPSVVVLEDLGVDYLEQLLSISDQSANPTYFN*


CDS Sequence:
>Vu_29781.1
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Promoter Sequence:
>Vu_29781::LG8:30427807-30429807(-)
GTAAATAATTTTTTCTCTCCACATAACAACAGGATACAACATGACAATAACATATTTGATTAAGAAAAAAGATTAAAGATATCTTGTTTTTTATATAGTTAATAACTCAAAATAATATATTAATATTCTTTGAACCAATAAATTCCCTTTTTCTTATTTTAAAAATATTTAAATTCATTTTGTACTAATTTATTAAAATAGACGAGTTTCATCATAATTAATAAAACATTCAATAATATTTCATCATATTATGTAATATATATTTATTTATCTAAATATCATGGTTAGACTTCTAACTACAATATCGTCAAAACTTTATTTATTATAAATTTTATTATTCTACGAGGATAATTTAGGTTATATTTATCTATTTGTTAGCCATAAGAAAATAAAGTAATGAATAATAAAATCAAGGAATATAAATAAATAATTAGAATCAGTGTATTATAAAAAATAAAAATAAATAATTAGGACAAGAGCGTAATTAAAAATAAATATAAATAATAAAACAAATAATACTCATACTAAATAAGTGAAGATACATATAAATGAATGGATAAATATAAATAAATAAGTTTAACTTAAAAAAATAAAATAAAATTAGAAACACAATATAATATATAAATATAAATAAATAAATAAAATAAGATTGATAACACTTCACCTAAATTATTATTACAATTATAAAATAAATAGGATGATAGATATCTTCTTTTCTTATTTCATTAATTATAGAATATGATGGTTTCCTCTTTTATATATATGCATAGACGGTAATTGCAAGCATATGAGTATATTTTATTTACGCTCTTATCTCTTCATATAAGATAAGTCCATTGTTTCTGTTCCTAATAGTAATATCATTATTTTTAATTAATTAATTTTTTATTTATCTTTTTGGTATTATTATGAGTATATTTTTATTTACGCTCTTATCTCTTCGTATAAGATAAGTCCATTGTTTCTGTTCCTAATAGTAATATCATTATTTTTTTAATTAATTAATTTTTTATTTATATTTATAATAAATATTACAGTATTTATATAAAATATAATAATAAAATATTTATATAATTGTAATGCATTATTTATGAAAAACATTACAGTATGAATTTTTAGATTTTACAAGACGTTGTTGATGGAACTTGAGGCGGCTATCCCCTCCGTATCTTAAAATGTTTTCTTTTGTTTGTTCTATTGATGTTCTTACAAGAATAAAAATTTAGCATGGAACTAACTAAAACCATTTAAGAAGATAAAAAAAAAGACGAGTATGTTAATTTTGTTATAACTAAAACCATTTAAGAAGATAAAAAAAAGACGAGTATGTTAATTTTGTTATAATTTCTACGAGGCATCTCATTGGAGATGCTAAAGTTAAAATTTTTCTTAAATTTTGAAGTTGATAACTTTAAGTCTAACTTAATTCTATAAAATCAATTTATAAAATAAAATATTAGATTAGACATTAATTAGTAGTTTAATAATAATCTTTAATAGATGAAATAATATATCAATATAAATGAATAAACTTTAATATGACTATGATAGTGAATTTTAAATCTAATTCAATTGATATAAAATATGAGACTTTTCAACATAAGTAACACTCAAATCTATCATAATGATAGTTAAAAACAAATAGAAAGGATTAATAAAAGATTAACCCAAGTACGAATAAATTAATGGGAAATGGGAAGATGATGAAGCTACGAAAAAACAGTTGCCTAATAAGACTTACTTTTTTTTTGGAAAACCCAGATTGGAACATGTAGGAGGAATCATTAAACGATAAACAAAACAAGATGGACATATTAAGTTAAATATTTAAAAGATATATTTAATACTTTAACATCACGTCACATACCTGTAGATAAATGATAAAGCCCCTGAATTAAACAAATCAAAATAATATTTGGTCCGAGGCAAATAAATTGCAGTCAGGAGGAGAAGGAACATGAAGAAACAGACAAGAGTTAGTTGTCTACAAGCCTAGTACT


Gene Sequence:
>Vu_29781(-)
ATGTCTTCCCCTTTCTTCCAGAGCCCATATTGGGACATGATCATGCTACAGGAGCCTTCAGAAATTTTGTTCCAATCGTTGTCATCCAATGATGTTCTTGACCCTCTACACGATTCTCTTTCCTTCGACATGGTTGACTTCTCTACAGCACCAGCAGAAGGAAAGCACAAGGAGCCAAAGAAATTGGTGGTGGAGTCTGAAGTGAAGAATAGGGAGAGGTCATACATAGGTGTGAGGAAAAGGCCTTGGGGAAAATTTGCTGCAGAAATCAGAGACACCACAAGGAGTGGCAGACGGGTTTGGCTTGGAACCTTTGAGACTGCAGAAGCTGCTGCGTTAGCTTACGACCAAGCTGCATTTTCCATGAGAGGCCATAATGCTGTACTCAATTTTCCTGTCAAAAGAGTTAAAGAGTCTTTGCAAGAGATCCAATATACCTGCTTCAATGGCTCTTCTCCTGCACTTGCACTCAAGGCCAGGCACTGCAAGCAAAAACACTTATCCAAAGCAAAATATTGTAAAGGGAAAGAGAAATCAAAACCAAGTGTAGTGGTGTTGGAAGATTTGGGAGTTGACTATCTAGAGCAACTTCTAAGCATATCAGATCAAAGTGCAAACCCTACCTACTTCAACTAA