Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29780 LG8 30397166 30397804 hypothetical protein PHAVU_007G193700g
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 30397211 synonymous_variant p.Leu198Leu
G/A 30397351 missense_variant p.Leu152Phe
G/A 30397359 missense_variant p.Ser149Phe
T/A 30397602 missense_variant p.Lys68Met
G/C 30397612 missense_variant p.Leu65Val
T/C 30397650 missense_variant p.Glu52Gly
A/G 30397709 synonymous_variant p.Asp32Asp
C/T 30397802 start_lost p.Met1?

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29780.1
MTSPFIQNQDWDMSQEPSEILFNSLPRNAVLDPIHDSLSFDMVDFSTAPPQENHNQLMLKTEEELKKKERSYKGVRKRPWGKYAAEIRDTTRNGTRVWLGTFESAEAAALAYDQAAFSMRGHNAVLNFPVKRVKESLQEIQYTCFSGSSPALALKERHCILRKVSSQAKKCKGKHPSEDPTPSLLVLEDLGVEYLEHLLSISDQSESPSFFD*


CDS Sequence:
>Vu_29780.1
ATGACTTCTCCTTTCATCCAGAACCAAGACTGGGACATGTCGCAGGAGCCCTCAGAAATTTTGTTCAATTCATTGCCAAGAAATGCTGTTCTTGATCCTATTCACGATTCACTTTCCTTCGATATGGTTGATTTCTCCACTGCACCACCACAAGAAAATCACAACCAGTTGATGCTCAAGACAGAAGAAGAACTGAAGAAGAAGGAGAGGTCGTACAAAGGTGTGAGGAAGAGACCATGGGGAAAATATGCAGCAGAGATAAGAGACACAACAAGGAATGGAACAAGGGTTTGGCTTGGAACCTTTGAGAGTGCAGAAGCTGCTGCTTTGGCTTATGACCAAGCTGCATTCTCCATGAGAGGCCACAATGCTGTGCTCAATTTTCCAGTCAAAAGGGTCAAAGAATCTTTGCAAGAGATCCAATACACCTGCTTCTCTGGTTCTTCTCCTGCTCTTGCACTCAAGGAGAGGCACTGCATCCTAAGAAAAGTGTCATCTCAAGCTAAAAAGTGTAAAGGGAAACACCCATCAGAGGATCCAACACCATCTTTGCTCGTGTTAGAGGATCTGGGAGTTGAATATTTAGAGCATCTATTAAGCATATCAGATCAAAGTGAAAGCCCTAGCTTCTTCGACTAA


Promoter Sequence:
>Vu_29780::LG8:30397804-30399804(-)
TTTATCAGGAAATATTTTAAAACATGCAAGAAAAATACAAAAAGTTTTAGAGTTTAATACGCGTTTTCTTTATAATTTTTAAGTTATTATTTTTATAAAATTTAATAAAGTTATGAAGCCAAAAAATTTATAATTAACATAATTTATACTACAAATAGGAAGCCACAAAAAGTTGTCTGGTCCATTTCATTTTGAATTCTTTTATTTCTAATTTGCCAAAAAAAAAAGGGTTGAAATTAAGAGGATATCTGATCTACCTTGTCGGGAGAATAAATTGACAAGCAAAAATATTGTTCTTTCAATTCTTAGATTTCAACCAGCTCCTATCTTATTTAAAATTAAAAATATAAAATAAAATTATTCAACACATCAGAAAATATGACTTCGGATTTTATGTTATATTTTTCATATTGTTCTTTGTTATATTTTTAAAATACACTAATGTTAATATTTTAGAATATATTAATTTGTTTAATATATCTAAATTATTATATTTTAAAGATACAACAACAACAAAACATTAAAATTTAAAAGAAAAAAAATCCAAATTTGTAAAACAAACTATACACCACCCGGAAAAGATGCTATATATATTTTAAATCTTTATATTATCTTAATTATAATAAAAAAAGTACCAAATAAATGTGTTTGTTAAAAATATAACATGCATTTAATATTTATTAGATAAAAATATCACTAATGGTTGGAATTTCTATTAGTATATATAGATTTTTAGCACATTCATTTTCTAATAGAAAAATATTATTTTCTCTCTTCACTCTTTATTCCTTTACACCATATATATGTCTATAGAATACAATTATTTGTCTACCAATTATTTTTCATCACTGATTTTGGTCAAGTCGCTGAGTATTAGGTATGATGACAATTTTTTGGCATATATATGCGTCTTTTCTTAATGCATTATAAATATTTTATATTATTTTTTTGTCTTTATATCTTCAAACACCAAAATGAAGGATTAATAAATTCTTCACACCAATGACATATTTCTTTTAAAAAATGTTAAAATCATGAAATTATTGTGCCCTTTACTCCGAGACATCATTTAAACTTTAAGCTAGAAGATGTCTTTTAGCATATTCAAAGAAAATATAATATTTCCTCCTTTTACTTTGCAAATCAAACAAGGTGATGACACTTCTTTTACCAACCCTTCAAATTCAACTGATTTTTTTTAATAGTACACAATGTAAACCAAAACAATTTTTGGACAGAATGTATATTGTTTCATCTTATGAATTAAACAAAATTTAACCATTATCTTTGGTAAAATTAGTCAAAAGATAAGTGAAAAAGTTGAATTTAAAGTTGAAATTTAGGCTAAAAGTATTTTATAAAACTAGTTAAAAGCTGTAAAATGATGAATAAAAACATGAATAGTTATTAAATCAAACCTTAACATTAAATAATTATAAATTTATATTTTTTAATCTATATTTGAATATTTAATATAAATTAAATTTCAAATAATATTTGTATAACAATTAATTACTCGTTATAATTTAATATAGTTACCGTTCTCAATAAAAAATAATTATTTTATTAAAAATAAAATAAATTATTATATAATAAAAAAAATAATAACATAACTACAACATTAAATTAATAATTGAAAATAAAGTAACAGTAAAACTATAATCTGAAAATCATGATGATAAACAAGATTTACAAGTTTTCTATTATTATTTTAAAAATAGAAATATAAATTTTATATTATTTGATAAGATGAATAACTTAATAAATTAAGTTAAAACAATAAAAATAAACTTCATCTAACGCAAATAAAAAATGAAATAACTTGATTAATATTTTATCTTACAATTACATCAGATAAAACACTACTTAATAATCTATAGCTGGACCTCAACATTAGATAACAGAAATTAATATTTGAATAATAATGTATGACCTGGGTTGAGGGGAATAAATTAAACCCAGAAAAGGGAGATTGGAATCACAGAAAACAATTGGCTACT


Gene Sequence:
>Vu_29780(-)
ATGACTTCTCCTTTCATCCAGAACCAAGACTGGGACATGTCGCAGGAGCCCTCAGAAATTTTGTTCAATTCATTGCCAAGAAATGCTGTTCTTGATCCTATTCACGATTCACTTTCCTTCGATATGGTTGATTTCTCCACTGCACCACCACAAGAAAATCACAACCAGTTGATGCTCAAGACAGAAGAAGAACTGAAGAAGAAGGAGAGGTCGTACAAAGGTGTGAGGAAGAGACCATGGGGAAAATATGCAGCAGAGATAAGAGACACAACAAGGAATGGAACAAGGGTTTGGCTTGGAACCTTTGAGAGTGCAGAAGCTGCTGCTTTGGCTTATGACCAAGCTGCATTCTCCATGAGAGGCCACAATGCTGTGCTCAATTTTCCAGTCAAAAGGGTCAAAGAATCTTTGCAAGAGATCCAATACACCTGCTTCTCTGGTTCTTCTCCTGCTCTTGCACTCAAGGAGAGGCACTGCATCCTAAGAAAAGTGTCATCTCAAGCTAAAAAGTGTAAAGGGAAACACCCATCAGAGGATCCAACACCATCTTTGCTCGTGTTAGAGGATCTGGGAGTTGAATATTTAGAGCATCTATTAAGCATATCAGATCAAAGTGAAAGCCCTAGCTTCTTCGACTAA