Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29773 LG8 30296852 30298332 PREDICTED: myb-related protein Myb4-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 30297441 downstream_gene_variant
C/A 30297502 downstream_gene_variant
T/A 30297504 downstream_gene_variant
T/C 30297515 downstream_gene_variant
T/A 30297763 downstream_gene_variant
T/A 30297766 downstream_gene_variant
G/T 30297915 downstream_gene_variant
T/A 30297955 splice_region_variant&intron_variant
T/C 30298213 synonymous_variant p.Leu40Leu
T/G 30298220 missense_variant p.His38Pro
C/A 30298329 stop_gained p.Gly2*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29773.1
MGRSPCCERLGLNKGFWSPEEDRILIDHINTHGHKNWHALPRQAGLLRCGKSCRLRWINYLRPDIKRGNFTKEEEDMIIQLHENLGNRWSAIAGKLPGRTDNEIKNLWNTHLKKRLSHQDKDTNQNESLVRTQISKQQQQQPVNALPTDHVIGTTDEKKALSSPQWASSDVSTLTTSTTSDSRDHSATAIDHQHRLPVKPESLDDDFWSQVLSPGKSGDTASFPATGAGHRDFQCSLSPLLTSKGVHASSAYDNVNFWYDVYMGEQELRDF*


CDS Sequence:
>Vu_29773.1
ATGGGAAGAAGTCCTTGCTGTGAGAGATTGGGATTGAACAAAGGGTTTTGGAGTCCTGAGGAAGATCGCATTCTCATCGATCATATCAACACACATGGTCACAAAAATTGGCATGCCCTACCCAGACAAGCTGGGCTTTTGAGGTGTGGGAAGAGTTGCAGACTCAGGTGGATAAATTATCTTAGGCCAGATATTAAACGAGGCAATTTTACAAAAGAAGAAGAAGACATGATAATCCAGTTGCATGAAAACCTGGGGAATAGATGGTCAGCCATAGCAGGAAAGTTACCAGGTCGAACAGACAACGAAATAAAGAACCTATGGAACACCCACTTGAAGAAGAGGTTGTCCCACCAAGACAAAGACACGAATCAAAACGAGTCCTTGGTCCGCACACAAATTTCCAAACAACAACAACAACAACCCGTGAATGCTCTTCCCACAGATCATGTCATCGGAACCACAGACGAAAAAAAGGCACTGTCATCTCCACAGTGGGCAAGCAGTGACGTGTCAACCCTCACCACTTCTACCACCAGTGACAGCAGAGACCACAGTGCTACTGCTATTGATCATCAACACCGCTTGCCCGTGAAGCCTGAATCGCTCGATGATGATTTCTGGTCTCAAGTTCTCTCACCTGGTAAGTCCGGCGACACCGCCAGTTTTCCGGCCACCGGCGCGGGTCACCGGGACTTCCAATGTTCACTCTCTCCGTTGTTGACTTCCAAAGGAGTGCATGCGTCAAGTGCGTACGATAATGTCAACTTTTGGTACGATGTGTACATGGGAGAACAAGAATTACGAGATTTCTGA


Promoter Sequence:
>Vu_29773::LG8:30298332-30300332(-)
CATCCTTCTCTACTTGAGACTAGATGATTATTAGAGTATCAGGATAACCTCCAACTACAGGACCCTCAACATCAACATATACACAATTACCACATCAATACAGAATCTCTCCACGAGACTCATACAATGCTCACATTCCTCAACTCACATTATACTATTACGAAATCTCCCCATAATACTCATATCATGTTCGGATGCATAAATTCAAATCCAATATAATAAATTACAATCATCACAATTAAAATTCACAATTTCGTATCTACCACAATAACATAAATTCATTCCAACGAGATATATTGCATAATAATTTAACAGTACATAATCTGTTCAACAAGAATTAAGTTAAAAGTTTATCGAGTAGACTTCCAGGAAAGAGAGGTGCGTCACAATGGACAACTTAAGTACCAAGTCTTTCCTTAGCCAAAGTGTTCCTCAACTAGTTTTAACAAATTTCTTATTTACAGATTCAAAATAACAGCATATAATATTGACACAGAAATTCAAGATAAATAAATAGTAAGCATTAACAGTATTCACACATAATTTCAAGACATGAATAGTAATAAAACAGTACTATATCATAACATAAAAGCTTAGAAAGGTTAGCTCCCCTACCTCTATTCCAGACTTCTCTTGCTCTGAATTTGCTTCCCCGAAAACTCTTCAGAACCTTTACTCTAAAATTTCTTCCTACTCCAAAAACTTCCTAATTTCTTCTCTTCTCCTAATTTCTCTCTACTTCTTGGTGCAAAAACTCCATTCCTCTTATCTCTATTTATAGGTAAAAAATTTTACTATTCATTAATTTTTTAATATTATTTATTATTTTAATATTATTTTAAAAATAATATTTTAATGAACAACTTGATCAATCTGATCATATCTCCTTCCATGCTACGTAGGAATTCTTATCCTTCGAAATTTTTTTTTTTTTTTTTGCTATTCACTTTTTACTATTCACTATTCACTATTCACTATTCACTTTTCTTAAAAATTCTGAATAAGTTAAAAATTTGAACCTCTAAAATTACAATAATTTTATATCCAAAAATTTAATTTTTTTCTATCCATAAAATTATTATTACAAATAAAATGGTAAAATTTACTATTATAAATATTTTTCACGAATCTTACATTTTTCATCTTTAATGTGGTATTGAAGAATAAATGAATGATATTTAAATAACATTATAATTATAATGTTGGTAAAATAAATTTTAGAATAGTTTATTTATATGATTTTTTAAAATCCAATTCAGATAAATAATTGTATCTAAAATATGCTAACTTTACAAGATTATCAGTAATTTTGAAATTGTTTAGATTAAAAGTAAAAGATTAACGGTTTGAAAATAGTTTCATAGAATTATTAAAATTGTTGAATGTCTTAATATATTTAATCTTTGATGTAAAATTACATCAAAGTGAAGAAAAATGTGAAAAATAATAATAACACGTAAAAGAAATTATTGTGATTGTGATGAGATTAAACTTTTGATTGTTGGAAATCATAGAAACTAATTTTTAATAATAAAAAGAAAAACACAAGTTTAAGTGTATATGTACATTCTAATATACAGCTGTATATATGTCCAGGCGTTAAATTTTATAATAATTACCGTTTCTTATAATATATTTTTTATGCAAATTATTGAGATTGACCCTTTTATGGAAATAGATTTTTAATGGGAGTCATTCTTCTGGAAGGAAAAACCATTATTCAATCGGTGAATAAGCTATTATTGCCATAAATGGAAATTCCCCTTTTCCTAAAAAAATTAATTTTAATAATTTTTTATTGAAATTATTAATTACCCATAGTTTTATAACATTAAAAACATTAATAATGCAGTGCAGTGTACAGAAGTATATAACATTTGTCTGAGGCTAGGCTCAACATTCAACCTTAATTTAATTTTTGTTGTTTTTGTCTGCTGGTTTTGAGTTGAAGTTTAAAGAAAAGAGAGAAGAGTGTGTGTGGAGAAACAGTGACAGAAAAC


Gene Sequence:
>Vu_29773(-)
ATGGGAAGAAGTCCTTGCTGTGAGAGATTGGGATTGAACAAAGGGTTTTGGAGTCCTGAGGAAGATCGCATTCTCATCGATCATATCAACACACATGGTCACAAAAATTGGCATGCCCTACCCAGACAAGCTGGTACTGCTTTCTTATTCAATAAAATCTGATTTTTGTTTAATGTTTAATGTTTAATGTTTAATGTTGTCGTTGTTCTTCATGTTTTCTTATCCCTTAATTTAAACAATAGGGCTTTTGAGGTGTGGGAAGAGTTGCAGACTCAGGTGGATAAATTATCTTAGGCCAGATATTAAACGAGGCAATTTTACAAAAGAAGAAGAAGACATGATAATCCAGTTGCATGAAAACCTGGGGAATAGGTAAAAGTTTTTTAATCTTAACACTATATTATTACTGATATACTTCAAATTTTGGGTTGAAACCTGAAATATTTTATAGAATTTGATATCGATTGTTTTTTGGGTGTTCTTTTTCTAAAGACTCAACCATAAAAATTAGATGGGTGTGAATTTTTTTTTATGGAATGTTGGTTTAGATAAACTGAGTTTTTCTCACAACAATTTGAATTGATTTAATTTAGAATAAAAAATTTCTTAGAATATGGTTTTATTTTATTGGATTTAAACTTTATTTTAAAGGTCTTAACTCATGGTTAGAGGTGATAAGAACGATGGTTTGACTCCAAAAACTGTGCACTACACGAGAAAGAAGAACAGAATTTAATTTAATTTTTCAAATCTTTTAAAACATTAAAAAAAAGCATCTATAAGAAAGATCTAAATTTTCTTGAATTATTTCTCTTGCATGAAATTAAGATGATATATGCATGGTGTAAAAAATGAAATAAAGTAACAGAGGTGAGAAAAAAAAAAGTGTTTCTGATGCAGCATTGATATGTGAAAATATAAAGTGCAGATGGTCAGCCATAGCAGGAAAGTTACCAGGTCGAACAGACAACGAAATAAAGAACCTATGGAACACCCACTTGAAGAAGAGGTTGTCCCACCAAGACAAAGACACGAATCAAAACGAGTCCTTGGTCCGCACACAAATTTCCAAACAACAACAACAACAACCCGTGAATGCTCTTCCCACAGATCATGTCATCGGAACCACAGACGAAAAAAAGGCACTGTCATCTCCACAGTGGGCAAGCAGTGACGTGTCAACCCTCACCACTTCTACCACCAGTGACAGCAGAGACCACAGTGCTACTGCTATTGATCATCAACACCGCTTGCCCGTGAAGCCTGAATCGCTCGATGATGATTTCTGGTCTCAAGTTCTCTCACCTGGTAAGTCCGGCGACACCGCCAGTTTTCCGGCCACCGGCGCGGGTCACCGGGACTTCCAATGTTCACTCTCTCCGTTGTTGACTTCCAAAGGAGTGCATGCGTCAAGTGCGTACGATAATGTCAACTTTTGGTACGATGTGTACATGGGAGAACAAGAATTACGAGATTTCTGA