Genomic Resources - Ricebean Portal

Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

Gene Details:

Gene ID	Chr. No.	Start Position	End Position	Function	View on
Vu_29672	LG8	29003462	29011113	PREDICTED: protein PHOSPHATE STARVATION RESPONSE 1 isoform X1	Map

Annotations

category		relationship type		keyword

SNP	Position	Effect
G/T	29006617	intron_variant
A/T	29006649	intron_variant
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A/T	29007166	upstream_gene_variant
T/A	29007189	upstream_gene_variant
G/T	29007259	upstream_gene_variant
T/G	29008259	upstream_gene_variant
A/G	29008260	upstream_gene_variant
G/A	29009410	upstream_gene_variant
A/G	29009414	upstream_gene_variant
G/T	29009692	upstream_gene_variant
T/A	29010246	upstream_gene_variant
T/A	29010254	upstream_gene_variant

View accession wise SNPs

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29672.1

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CDS Sequence:
>Vu_29672.1

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Promoter Sequence:
>Vu_29672::LG8:29001462-29003462(+)

AGGTATAATTAGCTCCTTGCAGTTCTTTAAACCTTGTATTGTAGTTCTAGGATTGATTTTTAGAAAAACATAATGAATGTTGTGTTTCAAAGCAGAACCAGACAACTACTGAGGGTGTGTCGGTACTCTAAGACATCCTATACAATTTTTATCAACAACAAAATAAAGATCAGAAAACAAAAAATCTAAAAATCTAAAAAAAAAAGAAATAGAAAATCAAAATTATTAAGGACAAATTGAAGCTTGTTGTTACATTTTTTTTTTCAATTCATTAGCCTGTTCTGATTGTATATAAATAATGTTTTTCATTTTTCATTGTGTGTTATACTTGTAGCGTTCATATAATAGTCTTTTTCTAATAGGTTTACGTATACTCCAAAGTTTATAGACACGGTGCTGTTGACCTTTTTATCCTTTTCACATTATTGAGGCCACTTGTGCGGCAGAAGAATCTTGCTAAATATTTAGTTTTTCTATTTCATGAACTTTATGAAAACTGTTTTTTGTCATCACTGATTAACATCCAATGACCAAAAACAAACATAATTTAAGTTTCATGTGTTTACAAGTTTTATGTTTCATACATTATGGTATGTAGTGCTTCATCATTTATGTTCTAGCTTCCATTCCACCTGAAAATTGTTTCAATAATTTAAGACTAACCAATGCTCTTATAACTATGAAGACATTTTGTTTGTAAGTGGTGTTTTGGATTAGTGACGGCTATTTCGACACCACATGATCTAGAAGCACATATCAAAACGGCAACAATTTTGAGTAAAATAAGGAGCACTGGAATATTGATGAACAAACTTTTTTTATTATATCTTCTTAATTTTTCAACAATTATTAGAAAAAGTCATTGGAACAATTGGAAGTGGTTTAATAAGAAGAAGGACATAGAAAATACCAACTTAATATTTTATTAAATACAAAGTCGTTTTCCCATCACTGTAATAAGCAATCATTAACTTTTGAAATGAAAGCATAATTCCTCTGAGTTTGTTAATTAGTAGAGGTGTTTTTATCAGTTTAGTGATTTTGTTTTATTGGAGCTTGTAAACTTTACATTGAATTGTCACACCAATACATCTTTTTTCTTAGTGCACCCATCACAAACTAACGGATATTACTTAGAATTTCTTCTATCAAAGCAAAATATGCCATTTAAAAAGTCACGTCCTTTCTTACTTTTATATTTTGACACTAATTATTTTTATACCCATTTTATAACATTTTTTACTATCTCACACTCTTTTTTTTTAATACAAAAGTTTACTTTTATTAAAATCATTTTACTCGTATAGTAATCAAATGATGTCAAAGATTTTTTTTTAATATTATAGTCTCTATAAATTATTTATTGAATGAACAAAATGTTTAAATTTATGTTTTACTTAAAATCATTTTTATATAATAACAAGCGAATATTCTTCTTTTAACAGAAAATAAATTCGAATACTTGAGACGCCGCGTAAGGTAAAAATAAAATGATTGTATGGGAAATATGATAATATGATATTTTTTTATACCTTTTAGAAAGAAAAAAACATGCAATAGCAATTTCGTTAAAGTAGAAAACAACGCAAGATCCAATTCATATAAAAAATATTCGGAATTGCATGGGAACGAATGCAGGTGCAGGAAGCGCAGAGTCCACGCTATCGAGATTGTCGATCACGCGAGTGGGTGGCGCGTGTACGGGGCTTGTATTTGTAGCACTGCATAGCAATAGCACAGTGAGAAGACAAAGCGCACTCGTTTCGTTGGTCATCGTTCACCTGCCGGTGACGGAATTCAAAAACACCCGCCTCTTTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTGCTCTGACCAGAATCTGTTCCATTCATCTTCTCTGGTTTCGATTCCAATTCGCTGGGGTAAGAATTCGATACACCGTTTTCTTAGTCGTGTAGGGGAATTTCGGGGTA

Gene Sequence:

>Vu_29672(+)

ATCTGATCTCATTATGTTTTGCTTCATTTTCACGTTTTTTGTTGCGTTACTTCACTCCACTTCGCATCGCATTGCCCAACTCCACTTCCCTCGCAATTCCGATCCTACGCTGGTTTTCTTACCGCCTCTGTTTCTCTCTCTCACTCTTGTTTTTTCCTTCTTAAATTTGAAGTTTATTGTTGATTTCATTGATTTTGTATATGTTATATCAATTTGCATGCCTATTCGTGCGAGTACGAATTTCTTTCGTCCTTTTTTTATGTGTTGTTTGCTGTGTGAAAGTGTTTGAAAATTGGTCTGTGTTTTTCTTCTTCTTTTTTGTATTGGATTGGCATCATCTTTCTCTGAACTCTAAACTTCATAGAAACAATATAGAAAGAACCTAAAACGTTTAGCGGTTAAATACTCATACTCCATTTGTATTTCATTGAGAGAGAGAATAGATGTTGTTCCGCTTGCTAGGCTGTAACCACTCTTCTTCTCATGTTTGGTTTGTAAATCAAAGGTATTGTAAAAAGAGAATTCTAATCTTTAAAAATAGATGGATTGACGCGTTTGAAGGAAAGATGGTTACGAATACGAGGAAACTATGCTCGGTCTGTTCTTTAGCCTGTGATAGACTTGTGTCAGAGAAAGTTTTATGTTGAAAAATGAAAGATTGGGGATGAGAATTTCACTCTGTATTTGGAGTTTGTTGTCTGTAGTTGGACTGCATGTCTTTCTTGCAGTATTTATTGTGTAAATTGAGAGAAAGGTAGCAATGCTATGGTTGCGTAATGATCGCAAGAGGTGGTTCCATATTGGGAGTAGCCTGTGGGCTATTGGTTTATCTTCTGGTATTTAGGCGCCTGAAATCTCTTCGTAGTTTCATTTCTCTAACTGGACAGAAAAAAATTTAGGTGAAGCCGGAGATAACTTGATTATCAGTTTCTCTTGCTACTGCTGATGAAAATAAGAGTGGTTTTGAATTGGGGATGGAGAGATAGAGAGAAAATGGTCGTGCTTTAGAACTATTACAGGAATTAACCTAATCACAGTGGACTATCAACTATTACAGAAATTAACTTAATGTCTTGCTTTTGAACTTTGAGGTTTGTGATCAACTGCAATGATGATTTCATTAGTCTGTTTCTGGTTTTTACTTGCTTTGAGGATTGGGCATGCTTTTTATCTAGTCTGTCTTTGATAATGAGGTTTTATAATCTTCAGAAGTTCTTACTAGTGAGTTGCTTTCTTTATTGAGTAACTTTTTTATATTACAGACTAGAGTGCTTTTTCCTTTCACAGATCTGAAGATTGATGACAAATAGTCTGGTTTGGGTATCAAAAACAAAAATCAAGTTGAGTGGTATTTTGCTGGTGAGCATTATGGGATAAAATGCAGGGTTTAAGATTTTATAAATTCACTGAAAACTGATATTTTATTCTTTCAATCAACAATGAAGGAAAATAATGGAAGCACATCCTACTTTCTCCATTGAAAGATCAAAGCAACTCAATAGCATGGGGATGTCTGGAGCACTTTCTTCATCTTTGTCAATCCTTCCAATACCCACAGAAGATATGTATCCTAGGCTGCCTGAATCACAATTGGATATTGTAGATCAAGAACTTATGACAAGACCTTATACTCATTCAAGTTATTTGAATTCCAACGGAGTAGTTGGGCATATTTTTTCGTCTTCCTCTGCAAATTCAATTGACCTTCATCACTCATCTCTTTCACCTGATGAAAAAAACTCTTCTAACGCTCATTTTATTTCACAATCATCAACCAACATTGCCCAATTTCCATTATCATATTCTTCGAGTACTGCACCACCAACTTCAGCAACACCAACCCATTTTTCCAAAGAAAACAGTGCTTCCTGGCATACAGAGTCCCTGCCAAGTTTTCTGGATTTTCCTGCACATGACTCAATGGACGATAATAGGGTAGAAAGTAGTGATTGCCCTATAATGGCATCCGAGGAGTATTCTAAGCAAAATGATTGGCAGGAGTGGGCTGAGCGGCTAATCAGTGATGATGACACTTTGACTTCTAATTGGGATGACCTTCTCACTGACAACATTCGAGACATTGAGCCAAAGGTGAACTATTTCATAACTCAAATCAATATTAGCTTTCAGAGTAAACTGATACATAATTTATTCAAGGAATATGTTCGGATCTCATTTTGTGGCTTTAGGTGCCATTCCAGGTTGCAAAACCACTTTCACAGTTTCCAGGACATCAATCCCAAGGTCTACAACAACTTCCTGCTTCATATGGAGACAATTGCTCTGGAGCTACCCTCTCCTCCTCAGCAAATTCTACTCCTGCCAAGTCACGAATGCGTTGGACACCAGAACTTCACGAGGCGTTTGTGGAGGCTGTCAACCAACTTGGGGGAAGTGAAAGTACAATAATCTATTTTTCTCTGTTTGGTAACTTTAGCCTTACTTTGCTAAGCTTTGTTCTTATTTTATTTTTTTCCTGTTTTTCTGTCTTCTTTCTGCAGGAGCTACTCCAAAGGGTGTGCTGAAGCTCATGAAAGTTGAAGGATTAACTATATATCATGTGAAAAGCCATTTGCAGGTTTGTGCACTTTGCTTTTAACTCCTTTGGTTTGTTTGGTAGCATGTGTACGTTTACTGAAACATATTTGTCTCGAGATGAAGAAATACAGGACAGCTAGATATAGACCGGAGTCATCTGAAGGTACATAAATTATGTCTCGTATAATATTTACCAGCATGCATTAATTATAAATACCTGTTTTGTTTGAGTATTCTGTGATGCTAATTATTGTAGGAATAAAAGTAGATCATTCTTGATTGTAAACTAGGTTTCTTTAATATGCTTTTCAAACATAAGAAAATGTTTTACTAATTTATTAAATACCAATTAATGCATGGTATCTTGTGCATTCAAGGGTTACATTAATGCAAATCACCTTTAGCGACAAACTATTGAATCGTGTAAAGCACTTAAAATCTTAAACCGATGTTAATGAGTTTAATCCTTTGCCTGTAAGATCGAGTTAGATAATACGCACTTGGATTCTTTTCCAATACTATGCATATATTAGTTGTGAAGGGCTTACCTTAATATCTTTTGAAAATGTAGACACTTCAGAAAATCTAAACGTATTTGAATATACTAAGAAAATTAAGATTTAAATAACCTTTTGGTCATACCCCCTTTATAAGGCAAAAAAAACCTCACGGATGCTGGTCTCATATATAAGCAAAATTTTAATTATTTTTACCCTATTATAATGAAATTATTCATAGAAAACCCTTCCTTTAATTTAGATTTTATTTCCAGTGACTCTTGTTTACTCTTGATATCAAGTTCCAATGAAAAATAGTTTTGGAAAGAAGTTTATTTTTTATTTGGAATTGTTGCAATTAAATAATTCTAACCAACTTTCTTGAGTAGCATAAATTAGATTTTTGGCTCATATTCAAGATTTGAGAAAGTATGTTTTTTTTTCGTTTGATTCTCAGAACTTTTTTTTTTTTCTGTTTGCATCCTTATTAAAAGAAATGTTTCATTTTAGTCCGTGAAGTTGTGGTCATTAGTCACGATGGTGCGGCTAACACAAATTGAATAAGTAGTTTAATTCCTAATGACAAAACGAAAGCTTTCTCATTTAGAAGGAGCCTATTCAAAAAGTTTATGATTGTTCATTTACAGTTAAGACACTAAAATTTTAAAAATAAATTAACAGGAACACAGACCTAACAAAAAAAAAAAAAAGAGGAATAAAATAGAAAGGTGCATCTATCATATATACTAAAAACTTGTACAAGTCTAATATTAGACTTTATACATGACAGTAAGGGGGTGAAGCAATTCATAACTAATCTTAGCCTCTTGGATATTTCCCAATTCTCTGTCTCTCCATGAACCACCCTCTGCATCAAGAAACCTATGTTTGCTCAAGAAACTCAAAAATCACCAACTTTGTCTGACAAATTGACCAAGACCCCAGTGATTGTTGTCTTGAAGTTTTGTGTCTTGAGTCAATTCCTTGAAACTAGAGTCATAATCATCTGTGTCGTAAGCTGATCAACAGTTTGCTCGTTGACTACTGTTGGCAGGAGTTGCGGAGAAAAAAGCAGGTTCCATTGAAGAGATGTCATCTCTAGATTTAAAAACGTAAGTATATACTATTTACTTCTTTTTAAATAATATATGTAATGCAGTATTACCATAAATGCTGATACATCAAATTGATAGACAGAAGCTCATTCATTAACATGACTTTTGCTGGTGCAAATGTTACATTCCCAGAAGAAATTGAATTGATTATGTTGCACGTTATTGTATATGGAATCGCTGTTAAGTTTGTTTAGATGGCAGTTACTATTTGTATCTTACCACTTAACCTGAGAGGAATGAATATAAGGATTAAAATAGAAGAGGCTTTGTTACTGTATCTTGGAATAGAAGCTACGACAAGGTCCAAAAAGTATTAGTCTTTGGATCACCAAGTGGCTTAGAATTTTCAGTGACCCCGGATTAAGACCACAATAAGGCCAATATATGGTTCCATGTAAAGTTTTTAGTAATATTTCAGAAACAGTAATTATTATGATGACTTTACTATTGTATTACTGACAGTGGTATTGAGATCACTGAAGCTCTACGACTACAAATGGAGGTTCAGAAGCGGTTGCATGAACAGCTTGAGGTGTGAACTTCATTTCTCTAGAATTTATTTCGAACATATATCAATGAATTGAATGTATTTGTATATGAAGGGTGTTTCAAAGGTTTGTTCAGCTTGAAAGATGTATTTATATAGTTATCCATATTTTGGAAACTATATCAGTCATTGATCATAGGCACAATTAACTAGTCATGAACCGTGGTCAAAACATTCGTATGGTTACACAAGATCAAGTTAACATGACTCCTATATACTTATTAAACTTTACTTAATATTAAAAAAATATTGAAATATTTACATATAACATATATTAATAAAATAATACTAATAAAATAATAA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