Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29659 LG8 28910796 28913742 hypothetical protein PHAVU_007G048800g
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 28911092 missense_variant p.Asn494Asp
G/T 28911100 missense_variant p.Pro491Gln
T/G 28911482 upstream_gene_variant
T/C 28912463 upstream_gene_variant
G/A,* 28912476 upstream_gene_variant
A/T 28912485 upstream_gene_variant
A/G 28912495 splice_donor_variant&intron_variant
C/A 28912519 stop_gained p.Glu288*
G/A 28912609 stop_gained p.Gln258*
C/A 28912640 upstream_gene_variant
C/A 28912672 upstream_gene_variant
A/G 28913115 synonymous_variant p.Leu131Leu
T/C 28913234 missense_variant p.Thr92Ala
G/T 28913395 missense_variant p.Pro38His
T/A 28913589 upstream_gene_variant
T/C 28913663 upstream_gene_variant
C/A,G 28913673 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29659.1
MSSLTRPDTFQSTAQKHVCDNGNGNYTANNTYSSNLNTLLSTLSSNTQINYGFYNFSYGQNSDIANAIGLCRGDVESERCRGCLKNSTLAIQQRCPNQKQAVLWSDLCMLRYSNETIFHKMETSPGYYWWNLVNVTELNQFSQVLGNLMKQLRGIAASGDSRRKYAAAENATALNFQTIYGAVQCTPDLSQQECDQCLEGAISEIPNCCNGKVGGRVLRPSCNLRFETYRFYGTETTLDPVPEAPPPSTNTISSKESGNTTIIVIAVVVPTVVVVILLICLLLYLRRRKARKNLAVKEEQDDDDEDEDGIKIAESLHFNFDAIRVATEDFSDSKRLGQGGFGAVYWVNPAMKAQLDWEKRYKIIRGIARGLLYLHEDSQLRIIHRDLKASNILLDEEMNPKIADFGMARLVLLDQTQVNTDRVVGTYGYMAPEYAMQGQFSVKSDVYSFGVLILEIVSGQKNSGINNGENMEDLLSFAWRNWKEGKAINVVDPSLNSNSRNEMMRCLHIGLLCVQENFLDRPTMANIILMLDSYSMSLPIPAEPAFYVNNRTRSLSEMQSWEYNSRETGSSEPILKSAQESENEVSITELYPR*


CDS Sequence:
>Vu_29659.1
ATGTCGTCTTTGACTCGGCCAGACACCTTCCAAAGCACCGCCCAGAAGCACGTATGTGATAACGGCAACGGCAACTACACAGCCAACAACACCTACAGCAGCAACCTCAACACCCTTTTATCCACTCTCTCTTCCAACACACAAATCAACTACGGTTTCTACAACTTTTCATATGGCCAAAACAGTGACATAGCAAATGCCATAGGGCTGTGTAGAGGAGATGTTGAGTCAGAGAGGTGCCGCGGCTGCCTCAAAAACTCCACACTCGCTATACAACAGAGATGTCCAAACCAGAAACAGGCAGTTCTGTGGTCCGATCTATGCATGTTGCGCTACTCTAATGAAACAATATTCCATAAAATGGAAACTTCTCCGGGTTATTACTGGTGGAACTTAGTTAATGTAACAGAACTGAATCAGTTCAGCCAAGTGCTCGGGAACTTAATGAAGCAACTAAGAGGGATAGCTGCATCAGGTGATTCCCGTCGTAAGTATGCTGCGGCAGAAAATGCAACTGCTTTAAATTTTCAGACCATATACGGTGCCGTGCAGTGCACCCCTGATTTGTCTCAACAAGAATGTGATCAATGCTTAGAGGGGGCTATCTCAGAGATCCCAAACTGCTGCAATGGCAAGGTAGGAGGTAGAGTTCTTAGACCAAGTTGTAATCTTAGATTCGAAACTTACAGATTCTACGGAACTGAAACAACATTAGACCCGGTTCCAGAGGCACCTCCTCCATCCACCAATACCATTTCCTCAAAAGAAAGTGGCAACACAACAATAATTGTCATTGCGGTAGTTGTGCCTACTGTTGTTGTTGTTATTTTGCTCATTTGTCTCTTGCTATATTTAAGGAGGAGGAAGGCAAGGAAAAATCTTGCAGTTAAAGAAGAACAAGATGATGACGATGAAGATGAGGATGGAATTAAAATTGCTGAGTCATTGCATTTCAACTTTGACGCAATACGAGTTGCTACCGAGGACTTCTCTGATTCTAAAAGACTTGGACAAGGTGGATTTGGAGCTGTTTACTGGGTAAATCCAGCCATGAAAGCACAGTTGGATTGGGAAAAGCGCTACAAAATCATTAGAGGTATTGCTCGAGGTCTTCTCTACCTTCACGAAGATTCTCAGCTACGAATTATCCATCGAGATCTTAAAGCAAGCAACATTCTCTTAGACGAAGAGATGAATCCTAAGATAGCAGATTTTGGCATGGCAAGACTGGTTTTATTGGATCAAACTCAAGTAAACACAGATAGAGTTGTTGGAACCTATGGATACATGGCACCGGAGTATGCAATGCAAGGACAGTTTTCAGTGAAATCGGATGTGTACAGTTTTGGTGTACTGATTCTTGAGATTGTGAGCGGCCAGAAAAACAGTGGAATTAATAATGGAGAAAATATGGAGGATCTACTAAGCTTCGCTTGGAGAAACTGGAAGGAGGGGAAGGCTATAAATGTTGTAGATCCATCACTTAATAGCAATTCACGGAATGAAATGATGAGATGCTTGCATATTGGTTTACTATGTGTTCAAGAAAATTTTCTAGACAGACCAACCATGGCTAACATAATACTGATGCTTGATAGCTATTCTATGAGTCTCCCTATTCCTGCAGAACCAGCATTTTATGTGAACAATAGAACTAGAAGCCTTTCAGAGATGCAGTCATGGGAATATAATTCAAGGGAAACAGGATCAAGTGAACCGATACTTAAATCAGCTCAGGAATCAGAAAATGAAGTTTCAATTACTGAGTTATACCCTCGCTAA


Promoter Sequence:
>Vu_29659::LG8:28913742-28915742(-)
GAGTAGATTGAAAAGGCAAAATTTGACCTTAGCTCGTCGATGAAGAAGGGTAGCGCCCATCAAGCAAATAATGGTGGAGCAATTAGGGTTCGCAATGAGCGCGCCTTTTCCCGTTCCAGCTTTGATGTGTTGCATCGCTCCGGGGTTCACTTCAGGAATAACCAGCGGCACCTTCTCGTCCATCCGAAAGGCGGAGCTATTGTCCACCACCACTGTCCCCCGATCCACCGCGGCGGGGACGAACTTCTTGCTGATGGACCCGCTGACGCTGAAGAGCGCGATGTCAACGCTGTTGAAACTATCAGTCGTGCGCTCCTCCACGACGTAGTCCCTGTCCTCAAAGGTGATGCAGCGGCCGGCGGAGCGCTGTGAGGCCAGCATTTTGATGGAGCGGTAGGGGAAGTCGTGGTCAGAGAGGACAGAGAGGAACTCCTAGTCGACGGTGCCAGTGACGCCGACGACGGCAATGCAGTATGCTTTTAACTTATTCTCGCATAATGCATCTGTTCTTTCGAATGGATATAACGAAGAAACGGAAATGAGTGAGAAACGGAAATGGGGAAGGAAGGAGAGGAAGTGAAACAGAAATGGGGAAAGAGAGTAGAATCCGTGATAGATGGGTGGAGGTGTAGTCCGGTAAAAAAAAATGAATAGAAATAGAATTTTTAAATTAATTAAAAAAATTTAAATGGTAAAAGTAAGGTGGTTTTAACCTGAGGATAAAATTGAAATTAAAACAATTTGGAGAAGTGGAGGAAGCATGGTGTGGTGGTGGAGGGAGAATACCCAAGAGTAAGAATGACAAGACAAAGATAATAGGATAAGAGAAGCTTTACTCCTTCTACCACCACGACATACTTTCTCCACTTACTCAAATTCTTTTATTTTCAAAATTATCCTTAAGTTAAATGTTAAAACTTTTTTTACTTCTACCTCGAATTTTTAATTTATTTTCCAAACTCTAATTTTACCTTATTCATATTCCCTGAATGGAGTTGATGCACTCCACCTCCATGTCAACTCAATATTCTTCTACCTAGTTGTATTCACATAGATATAGATATTTAATTGTCTTTTGTTAATGAAATACATAAAACTATCATGTATTCGATTATACCTAATAATTATTATTGAATTTTAGTTAATTAATATTTTAAATTTGAATGATGAAAATAAAATTAATAATGAAAACCTATTAATCATTAAAGAATAATTTAAAATTTGTGTTCACATATTTCTATTTTTTTATTTAGACTTATAAAATTGAATTTATTTTGTAAGATTAAATTTTTAGAATTTATATTTTGTTGTAATTCATTTAAATTTAATTTCTAAAAAAGTTAAATTTATTTGCACTAATTTTTCACCGTATTTAAGTTTTTTTTAATCTATTCTAAGTTTTTATTTTATTTTTTTTAAATTAAAAAGATATAAAATATATATGTGGATATCCAGTGATATAAAAAAATATACTACAATATTTTTTCATATACTTAACTGATAACATGGTAACTAACGAATTTGTCAAATTAAATACAACTAGGTAGAAAAAGATTGAGTTGACATAGTGTAAAGGTGCAACTGATGAGTATGAATGAAGTAAAATTAGAGTTTAAGAAATAAACTAAAAATTAGTAGTAAAAGTAAAAAAATTTTAACCTTTAACTTAAAAATAATTTTAAAAATAAAAGAATTTAAGAGGACGAGGAAGCATGTACCGGTGGTGGAGAGAATAACACTCTAATAAGAGATATATGCGGATACTAAATACCTAAAACGCATTTCATGCATCCGCGGGTACTGAGTCTTTTTTCCAACCCTATACAAGAGATTTAATCTATTATCTATAAATTGTATTTTTTTTTTTTTTACAAATTCGATAGTTAAAATCACTTTTTTTAAGTGATTTAAGCTCTCTTTAAAGTAGATTCCTCTTGTAGATTATTTTAGACTTCCTTTCTTTTAAGTTGACCTCGAAGGAGCTAGGAAGGTCATCGGGT


Gene Sequence:
>Vu_29659(-)
ATGTCGTCTTTGACTCGGCCAGACACCTTCCAAAGTTCGGAATTTTGACTGCTAAATGCAAAACCACTTGAATTAAAAAATGCATCATTTGACTAACCGTTGATTCTACAAATAGAACATAATAATTGAAGGGCAGTTTGGTTATAAAGTGATAGCAGCATCCTTTGGGCATTCATGGTAATACACACTCAAAGATCAGAATGGCCGTGGTCTCCTGCATTCTTATTATCTTTTTTTGTTTTCCATTTCTAAAATTTATATCTGTAGGCACCGCCCAGAAGCACGTATGTGATAACGGCAACGGCAACTACACAGCCAACAACACCTACAGCAGCAACCTCAACACCCTTTTATCCACTCTCTCTTCCAACACACAAATCAACTACGGTTTCTACAACTTTTCATATGGCCAAAACAGTGACATAGCAAATGCCATAGGGCTGTGTAGAGGAGATGTTGAGTCAGAGAGGTGCCGCGGCTGCCTCAAAAACTCCACACTCGCTATACAACAGAGATGTCCAAACCAGAAACAGGCAGTTCTGTGGTCCGATCTATGCATGTTGCGCTACTCTAATGAAACAATATTCCATAAAATGGAAACTTCTCCGGGTTATTACTGGTGGAACTTAGTTAATGTAACAGAACTGAATCAGTTCAGCCAAGTGCTCGGGAACTTAATGAAGCAACTAAGAGGGATAGCTGCATCAGGTGATTCCCGTCGTAAGTATGCTGCGGCAGAAAATGCAACTGCTTTAAATTTTCAGACCATATACGGTGCCGTGCAGTGCACCCCTGATTTGTCTCAACAAGAATGTGATCAATGCTTAGAGGGGGCTATCTCAGAGATCCCAAACTGCTGCAATGGCAAGGTAGGAGGTAGAGTTCTTAGACCAAGTTGTAATCTTAGATTCGAAACTTACAGATTCTACGGAACTGAAACAACATTAGACCCGGTTCCAGAGGCACCTCCTCCATCCACCAATACCATTTCCTCAAAAGGTACTTCTTTTTCTTCTCACTTTTCCTATTCACCCAAACAAACAGCAACCCACATTAGTAATTAGGCATTTGGGTATTTTACAATCCTTGAAATGTCTTACCGGGTAGAGGATTCTTGTTTCTGCAGAAAGTGGCAACACAACAATAATTGTCATTGCGGTAGTTGTGCCTACTGTTGTTGTTGTTATTTTGCTCATTTGTCTCTTGCTATATTTAAGGAGGAGGAAGGCAAGGAAAAATCTTGCAGGTAAGTCTAGTTTGTGATTTCTTTTTTTGTTGGAGCAAACCCGAATGCTCCCACAGCGGTATTGTTATTCGAACATATTCGAAAAACTAACTAGTTTAAATCCGTTTCCTTCATGAAGTTAAAGAAGAACAAGATGATGACGATGAAGATGAGGATGGAATTAAAATTGCTGAGTCATTGCATTTCAACTTTGACGCAATACGAGTTGCTACCGAGGACTTCTCTGATTCTAAAAGACTTGGACAAGGTGGATTTGGAGCTGTTTACTGGGTAAGTAACCCTGTTGATTCAGACACACATCGTCAAAAAAACTTGCTATAATTAGCTTCAGTTAGCAAATTATCTACTATACCTGACAGAGATATATTTTCAGGGTAGGCTCCCCAATGGACAGATAATTGCAGTGAAAAGGTTGTCAAGAGAGTCTGGACAAGGAGATACGGAATTTAAGAATGAAGTGCTTTTAGTGGTGAAGCTTCAGCACCGGAATTTAGTTAGGCTACTTGGTTTCTGTTTGGAAGGAAGAGAAAGACTACTCATCTATGAATTTGTTCCCAATAAAAGCCTTGATTACTTCATATTTGGTACCTTTGCATATATATATATATATATATATAAATACACTGCTGCTCTATATTTCAGTTCTTGCTCAACACAAACCTAATTATTCGTAGAGTTAAAACTGTTGGCGGCTATATGTGCAGATCCAGCCATGAAAGCACAGTTGGATTGGGAAAAGCGCTACAAAATCATTAGAGGTATTGCTCGAGGTCTTCTCTACCTTCACGAAGATTCTCAGCTACGAATTATCCATCGAGATCTTAAAGCAAGCAACATTCTCTTAGACGAAGAGATGAATCCTAAGATAGCAGATTTTGGCATGGCAAGACTGGTTTTATTGGATCAAACTCAAGTAAACACAGATAGAGTTGTTGGAACCTAGTAAGTATTAAAATATATGTTATAGCTTGTTTATCATTAATGAATTTGTAACTCTTGAAAGAGTTAGAATCTATCTGTTTCATATTTAACAGTAATTAAGAACAAAGCTGCCAGTTACATTAGAAATTGAAACACAAGGAAATTAATAATCTTGTCCATATTGGTGTGTAGTGGATACATGGCACCGGAGTATGCAATGCAAGGACAGTTTTCAGTGAAATCGGATGTGTACAGTTTTGGTGTACTGATTCTTGAGATTGTGAGCGGCCAGAAAAACAGTGGAATTAATAATGGAGAAAATATGGAGGATCTACTAAGCTTCGTAAGTCTTTCTTTTGTCACTATTGATTACATGCTCAAAAACAATAATGTAGAAGTAAATCAATGATCTGATAAAAAAATTTGCAGGCTTGGAGAAACTGGAAGGAGGGGAAGGCTATAAATGTTGTAGATCCATCACTTAATAGCAATTCACGGAATGAAATGATGAGATGCTTGCATATTGGTTTACTATGTGTTCAAGAAAATTTTCTAGACAGACCAACCATGGCTAACATAATACTGATGCTTGATAGCTATTCTATGAGTCTCCCTATTCCTGCAGAACCAGCATTTTATGTGAACAATAGAACTAGAAGCCTTTCAGAGATGCAGTCATGGGAATATAATTCAAGGGAAACAGGATCAAGTGAACCGATACTTAAATCAGCTCAGGAATCAGAAAATGAAGTTTCAATTACTGAGTTATACCCTCGCTAA