Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29588 LG8 27901941 27906802 transcription factor UNE12
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 27902122 5_prime_UTR_variant
T/A 27902221 missense_variant p.Leu20His
G/T 27902342 missense_variant p.Lys60Asn
A/C 27902599 downstream_gene_variant
G/A 27902617 downstream_gene_variant
G/T 27902824 intron_variant
G/T 27902892 intron_variant
T/C 27902956 intron_variant
G/A 27902957 intron_variant
T/C 27903506 intron_variant
A/*,C 27904645 intron_variant
T/A 27904680 intron_variant
A/G 27904713 intron_variant
G/A 27904796 intron_variant
T/C 27904845 intron_variant
C/A 27904852 intron_variant
C/T 27905015 intron_variant
C/G 27905150 intron_variant
A/T 27905926 missense_variant p.Glu226Asp
G/A 27906462 3_prime_UTR_variant
T/G 27906670 3_prime_UTR_variant
G/C 27906671 3_prime_UTR_variant
T/C 27906685 3_prime_UTR_variant
T/C 27906686 3_prime_UTR_variant
C/T 27906736 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29588.1
MANHPSEPPTDDFLDQILGLPTFASADHADASPMMLQLNSGDAAFHAPPYQLGLSLEQGKGGFLSPEDASGSGNRFRDDVVDTRPKNVFHGQPMPTTVPTAPHPPAVRPRVRARRGQATDPHSIAERLRRERIAERIRALQELVPSVNKTDRAAMLDEIVDYVKFLRLQVKVLSMSRLGGAGAVAPLVTDIPLSSVEEEGSEGRNQPAWEKWSNDGTERQVAKLMEENVGSAMQFLQSKALCIMPISLASAIYPSQPSDPSSIVKPETNPPS*


CDS Sequence:
>Vu_29588.1
ATGGCCAATCACCCTTCCGAACCTCCCACCGACGACTTCCTCGACCAAATCCTCGGCCTCCCCACCTTCGCCTCCGCCGACCACGCCGACGCTTCTCCGATGATGCTCCAACTCAACTCCGGGGACGCCGCCTTCCACGCGCCGCCATACCAGCTGGGCCTCAGCTTGGAACAAGGTAAGGGAGGCTTCCTCTCGCCCGAAGATGCTTCTGGAAGCGGCAACCGCTTCCGCGACGACGTCGTTGATACCAGGCCTAAGAACGTTTTTCATGGGCAACCCATGCCAACTACTGTTCCGACTGCCCCACATCCACCAGCAGTGCGACCTAGAGTACGCGCTAGAAGAGGACAGGCTACAGATCCACACAGTATAGCTGAAAGGTTGCGCAGAGAGAGAATAGCTGAAAGAATCAGAGCTTTGCAAGAACTGGTTCCTAGTGTCAACAAGACAGATAGAGCTGCCATGCTGGACGAAATTGTGGATTATGTCAAGTTCTTAAGGCTTCAAGTAAAGGTTTTGAGCATGAGTAGATTGGGTGGAGCTGGTGCTGTAGCACCACTAGTAACCGATATCCCATTATCATCGGTAGAGGAAGAAGGCAGTGAAGGAAGAAACCAGCCTGCTTGGGAGAAGTGGTCAAATGATGGCACAGAAAGACAGGTAGCTAAGCTTATGGAAGAAAATGTTGGGTCTGCCATGCAGTTTCTTCAATCAAAAGCACTCTGCATCATGCCTATCTCACTGGCATCAGCAATATACCCGTCACAACCATCGGATCCTTCTAGTATAGTTAAACCTGAAACTAATCCACCTTCATAG


Promoter Sequence:
>Vu_29588::LG8:27899941-27901941(+)
TGGACAAACGACCTTTTAAGATGGGATTACGTGGCATGATGTGTATTGTTTAATCAGACGTGACACCTATTTATATATATAAATATTAGTTTTGAATTTCATTTATCTTACTATTATTATTAATATTTAATATTTTCCTGCATAATCAAAGTCTAATATGGACTTGTAGGCCCAACTAGGTCAAACCCATCAATCCAAAAAGTCCAGCCGTGATGTCGTCGGTGGCCACCGCGACTCCCATCACAACCGCTACACATTCAACCTGCGTCCACCCTCCAGGTTGCTTCGAAGGTGGAAACAACCAATGTCAAACCCAATCGCAAAAACAAAACACATGCGCCATACCACGAGATCAGAACCTCAATCGCAAAATCAGAAAACTAAACAGAAACCGAAAAGCAATATCGAAAAGCCTAAATTCCCAATTCGCAGTCCAAACGCAAGAAACCCCTACGCTGCGACATTGCCATCGATTCCACTACCTTAACCACTGTGCAGTAAAGAAGGAGGTCGCGCTTGTTCTGCCGGAACACGCCTCCCCTAGTGGCAATAACAACCCAAAGGAAAACAGAGGGGAAGAAGGGTTCTCTACAAATCGCGATCCAGAAAAGGGAAGAGAAAAGAAGGCTCTCTCCTAGCAATAAGAGCTTGTGCGAAGGTGGAAGTGGAAGAAACTCTCTCCTAGTAACCCTCTCACTTCACCAATTTCACCGCCAATTGCTCCTTCTCTGCTCTGGCCACGACATGACCCCGACTCTATTGCCCCGCTCAATCGCGCTGATTCCAAAACGGCATCGCCAGGCTTTCGGTGTGATTTCCCCAATCTGATTTCGATCTAGAAAGAAAGGGTTGCACTTAATTTAATTTGTTTAGCCCACTTTGCCCTTAATTAAATTTGATTTCCCCTCTTTGCACTCAATTTTTTAATACAAAATACATTTTACACACGTTTTTAATGCCACCTCAGATTAAACAAAAACCTCAGCATGCCATGTAAGATAATCTTAAACGGTCGTTTGTCAAATTTAACAACAAGCCTCTATTTGATTCAATTTTACAAAAATAAGGACCCAATTGAGACGCTGAAAAAGAAGGGGACCTATTTGAGATTTTGGGGCGAAAATAAGGACCTAAAGTGACATTAAACCTTACAAAAATGTAATTGCGTCTATTTTCTATATTGATTATAACTAGAACAAATATAGAAAATTCTCTTTTAATACAAAAATATCATTGTATCCACTTTCTATAGTTGTTATAACTATAACCGATATAAAAAATATTATCTTATTTACAATTATATCATTGCATCACTTTTTATATCTAATGGATTATAACCGATATAAATAGTCGTTATAAAAAGTATATTTTGCACTGCAAATAATTGTTTGAGTTTTTTCACATAAATGAATAAAACTGAAAGTATAAGCTTAATTAATAATTTGATTCTTATGTTTAAGTTTTGATTCATATTAGGTTTTATATTTTGTTTGACTCAATTGAATACTATTTAAAAAAAAACTCAATGTGCTTTTTAGAAAGAAATGTCATGTATCAAAATTTTCAACATCTTCAATCTTAAAACTCATTATTTTGACACATGACACCTTTAAAATAAAAATATTTTAGATTTTAATACGTGAGAAATCAAAATTTTAATGTAACTTACTGAGAAGTTGATAAGTAAAACTTGAAACTATATTAACATCAATCTAACAGAAAGAATTACATTAAAAGTTTTTTAAAAACAAAATCGGGAACGAAATTACTAAGCGTAAATGGTATATGTTAATATTGTAATTATCTTAATAAAAATCTACGGTATATGATATGATGAATATTGAAGCATTGACCTTAGTGACAGTATTAGAACCACTAATAGAAACATAGGTTAGTCGTGGAATTGGAGAGACCGAAAAGAAAAAAGCAAAGGTTGATTCCTTGGTGCAAGCCCATAGAAAGTAATGGTTTAAAAGTGGGGAAGGTTTGCAGAAGAGACA


Gene Sequence:
>Vu_29588(+)
AAGATGAGTATGGAAAGTGTAAATTATGAATAAACTGAGTGCCTTTGATAAGAAGCAGGCATAGAGCCAAAGTCCTGGTAGTTCTGGGCATAGTCTCTCACACTTCAACTGCAAAGTGACGACTGAGTAGAAACCCCAAACTAACAAACCAAAATTCTCATCTCATATCTCATGTAGACACAAAACAACATCATCATTTCATTCCTCTCTTCTATCATCGTCATGGCCAATCACCCTTCCGAACCTCCCACCGACGACTTCCTCGACCAAATCCTCGGCCTCCCCACCTTCGCCTCCGCCGACCACGCCGACGCTTCTCCGATGATGCTCCAACTCAACTCCGGGGACGCCGCCTTCCACGCGCCGCCATACCAGCTGGGCCTCAGCTTGGAACAAGGTAAGGGAGGCTTCCTCTCGCCCGAAGATGCTTCTGGAAGCGGCAACCGCTTCCGCGACGACGTCGTTGATACCAGGCCTAAGAACGTAACACAATCAATCTTCTCGTTTTCTAGTTTCTAAAACTTTCCTAACACATGACTTTACGAATTAATATGTATGTTTGTGTGTTTTAGTTTCTCGCTCCTTTGGGGTACGATCATCTGTTGAAACGAAATTGCGCAGCGTGGTTTTAGTGAGAGAGAGAAAAAAAAAACAGTTTATTGTAGTGACCAATTTTGGCTTCCTTTTGTTGGTGATGCTATGATCATCAACGGATTGCTCTCATTGGACTTTTTTATTTCATGAGTGGATAACCTTGGTAATACTTGACTTGGGGTATGGCTTGTAGATAATAATTTAAGTTGATGATGAATGAACTGTGACTAGATATTACGAACTGTGAGCTAGGGGTCTTATATTAGGGGAGTGAGGAAAGAAAGAGGAAGGAAGGAATGATGGTGGTTTGGTTCGGTGGAAATGAGAGAAAAGTTAACATCAGGATTGCATAGAAGAGAAAGACTTTCTGCTCAAGAATGAGAAATTTTCAGACACAATCCATGTATTCTTAGAACATAATTGATTATGTTCTCAAAGAGAGATTGTGTTTAAAAATAACGCACAAATGATTGTTGCTGCTTTTACTATAAAAAATATCTTCATTTTCATGGTCTTTCTCATCTTTCTCTTTCTAACTAAACCACCTCTATTTCCACACATTTCTGACCTCTTTCTCTTCCTTCTTTTTCCCTTCTACTTCCTCTATTTTTTTCCTCCCTTCCAAATGAGGAATTAACATGGAAATTAGGCCTTGACATTAGTACTAAGGGTCATTTTTTCCTGAATTCTTTTGACATCTTAAGGCTTGGATAAACATCTCTATTTAAGTACTTGTTAGAGAAACAGACTAGAAGCTAAGATGAAGTAAATTTCTCCCATAAACTAAATTAGCTTATGCATAAGTGGAAATCAGCTTTTGCAGAAGCTAAATAAAATAAGCTTTATAGGTTAAACTTCTTTCTCTTACGAATGGTTGTGGAGAAATTTATCAAAACTGCACCTAGATCATATAAGATTTGTTTTATTTGAGTATTGCGAATAAATGCTGACTTCTTCCAAATTTCAATATTTCTTTTAATGTTTTTTCTGATTTTAGGAGTGCCAGGGCGAAAATTGGTGATCAAGTATCTTTCCTTTTCTCTGATAGATAGTCATGTTGCAGGTTTTTCATGGGCAACCCATGCCAACTACTGTTCCGACTGCCCCACATCCACCAGCAGTGCGACCTAGAGTACGCGCTAGAAGAGGACAGGCTACAGATCCACACAGTATAGCTGAAAGGGTGGGTCACTGGATATTTTGAAGAATACAAACCTTTTACTTGTTGTAGAGATTATTATTCATAATAATGACAAAATAACTTAAGTTATTTTCATGATTTGTTAATTTTTATTTTCCATGTTGCTATTCAATGACAGTTGCGCAGAGAGAGAATAGCTGAAAGAATCAGAGCTTTGCAAGAACTGGTTCCTAGTGTCAACAAGGTATTCTTGGATATGCAGTTTTATTCCTAAATGTGTAGTTTGATACTTATCTATAGGACTTGTGAGATTTTGTCCGTGATAAGTGATGGATTGTGTTTCATCACCAGACTCAATAATCAAACGCTTCATTAATTTGTGGATAAACATATTTATACAATGTCAGCAAAAATTTGATACTTACTGTCAATTACTAGCAGAAACAAAGAGTGCTAAAAATTAGAGATTTTCAAGGAGTGTGTGTGTGAGTGTCTCCGTAATTTGTCTTGTTTGATTTTTTAACTATTTACTTGGTTAGATGTTAGAACTTGGAACACAAACCATCTACACAACAGGGATTCTTTTTGCACGAAAAAAGCTATTGAGATATAATGGTTAAATTCATTGAAATGCGATTACTCTTGGTTTATCTATGAACTTTGTCACCCCTCCTTCAAATGGTTTTCTCTAATGAACTATGAATTACATTTAGTCTGAAGTGACCACAGTACAGTGCATTGTTCAGTGGTTTATGAATGCAATGACTGGAATAAAATGTTAATTTTGGATGTTTTTGTTTGGTTTAGGAAAAATAGCTGGAATATAGATTAAAAGATGGTTGATTTTCAATTGATGCTAAATGTTTTTTTTTCTTGTTTTCTTTATCAATGTACCTTTAGCTACTTAAGTAAGTCATAGATATGAAACACTGGGCTCTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTATATATATATATATATATATATTTAATATCTTCCTTAAAGAATGATTTAATGCTAACCTATTCGGTTGAGTTTAGAAAGCTATACATTTTATAATGCTCAAATCAGTCCGAATTGAGTCTGTGTTTTTAAGTAAAACCTCCCGATAGTCATGTCTCACATGTTTTCTGTTTAACAGCTCATATTTATTTGTTTATTACAATATAATTCATAAAGGAAAACTCTTCTATCATAGGGATTGGAAAAGAGTACAACATTTGCCTTTGTTCTGATTAGGTGTGCTTGAAATCTAGAGTTTTTGAAGTATTAAACTATACTGTATTTCGTATAGAGGTTTCATTACTGACTTGTGATCTGCCGTATTTCTCATAACCCTCAACAGTATTGTTTTTCCATTGTTTCTAATGAAATTGTTATGTATCTGTTCAGACAGATAGAGCTGCCATGCTGGACGAAATTGTGGATTATGTCAAGTTCTTAAGGCTTCAAGTAAAGGTTAATACTCTTCTGATCTGCATGGATTTCACGTTTCATGTTTATCTTTAATAGATCTCAATTTATGCTTAACCTCAGCTTTTTGTTTGATTCATAGTTTATTTTGTTAAATCTGTTAAGCTTTGCCTTTTTCACCACTTTTCCCTTCAACCCTGGCTTATGAACCATTAGTGCCACTTTGGATTAGTACTATTATCCCCTGGATTGTATTCCATTTTACTAGTGAATATATAAATATGATCAAATGACGGAATTTTCACTATTTTGTGATATTCCTTTTTTAACTATCCTATAGCACCCAGGTCAACTCTGGACTGGAATTTTTCCACCTGTGGAAAGTCTGAGTTTCAGTGTTTGTGATTATGAACAGTAAGCCAATTTCTACAAGCATAGTAACCAATTTCATTGATTTCTCTAAACACTTGTGGGAGTACAATTTACTGTTTGAATATGAAAGTGACAGTAAGGCATTTCGTAGAATCCAAACTTGTCAACAATGTGAAACTAGAGTGCAGTAGACTTTCAATGATTTGCTATTCATCTGGCTTTCAGGTTTTGAGCATGAGTAGATTGGGTGGAGCTGGTGCTGTAGCACCACTAGTAACCGATATCCCATTATCATCGGTAGAGGTAATTGTTCTAACTAATGTTAGTTGGCAAAAATTTGTTTCTCTCCAATTTATCAAATTTAGTATCTATCAGGAAGAAGGCAGTGAAGGAAGAAACCAGCCTGCTTGGGAGAAGTGGTCAAATGATGGCACAGAAAGACAGGTAGCTAAGCTTATGGAAGAAAATGTTGGGTCTGCCATGCAGTTTCTTCAATCAAAAGCACTCTGCATCATGCCTATCTCACTGGCATCAGCAATATACCCGTCACAACCATCGGATCCTTCTAGTATAGTTAAACCTGAAACTAATCCACCTTCATAGACAGACCTCAGGCACAGATGCACCATCCAGTGGTTCCATCAAGGACTCACCTAATACTGCTAGGACCCACATGTTATTTGTCTGTTTCAAACACCCTTAGTCTTAGTCATTGGTCAGTATCAATTTGCATTCAAAGTAGGATGCCAATAGTCTTTTCCTTTTTGCCGTTCTTTCACCTTTTGTCTAGCAGGGTTTGATGTCAGTGGCCTTCAACATATAAGCAAAGCCTATCTTGATAAATTTCATGTAAAGGGAAAGAAATTGTCGAAGTTCACTTGATATGCTCTTCCTTTTTTTTATCAATTGGTGGGGGTTAGTGGAACGTGATGGAAGCGCTTTTATAGTGGGGCTTAGTTTTTGTAGTGGGCAGTGGGACCTTCTAAAAGGTTAGGGTGGTGTGTATTTTTATTAGTGATGTAACTCTTAGAGAATTTGAAATGCAGAGGTGAAATGGATAATGGTTGCTTTAATTAAGAATGCTGGGTGTTGCTAGTCCAGTGGAAAATGATGGTGCTTATGTTTCTTTGGCGTGGGCTTGAATTATTTGTTTAAGGGTAATTGGACTCCATTTTCCGAATGAAGGGAGAAATGGAAAGTTTGGTTGCATCTTAATCCAATTCATACCAGTCACTGAGCTACCTCGTTCAAATCTCTACTGAACTCGTGTACGTGTGAATATGAATAGAAAAGTGATAGACCAAGGTTTTCCTGTGCGTGTTAAATTTTGTCAATGAC