Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29506 LG8 26633410 26644378 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G 26633582 intron_variant
G/A 26633897 missense_variant p.Glu102Lys
C/T 26633901 missense_variant p.Ser103Leu
T/A 26633989 intron_variant
G/T 26634399 intron_variant
T/A 26634877 intron_variant
G/T 26635054 intron_variant
T/C 26635344 intron_variant
T/C 26635402 intron_variant
C/G 26635422 intron_variant
A/T 26635468 intron_variant
T/A 26635475 intron_variant
G/C 26635480 intron_variant
C/T 26635481 intron_variant
A/T 26635755 intron_variant
T/G 26636098 intron_variant
C/G 26636101 intron_variant
T/C 26636455 intron_variant
G/A 26636456 intron_variant
G/T 26636460 intron_variant
G/T 26636461 intron_variant
C/A 26637433 missense_variant p.Asp264Glu
G/T 26637599 missense_variant p.Gly320Trp
G/T 26637605 missense_variant p.Ala322Ser
A/T 26637790 intron_variant
A/T 26637795 intron_variant
G/C 26638127 intron_variant
G/A 26638279 intron_variant
T/C 26638297 intron_variant
A/T 26638397 intron_variant
C/A 26638403 intron_variant
T/C 26638700 intron_variant
C/T 26638768 intron_variant
T/A 26639218 intron_variant
C/T 26639251 intron_variant
T/A 26639268 intron_variant
A/G 26639272 intron_variant
G/T 26639338 intron_variant
T/C 26639339 intron_variant
T/C 26639348 intron_variant
T/C 26639354 intron_variant
T/A 26639565 intron_variant
C/T 26639843 intron_variant
C/G 26639847 intron_variant
C/T 26639905 intron_variant
A/T 26639948 intron_variant
A/T 26640215 intron_variant
C/T 26640338 intron_variant
A/G 26640343 intron_variant
A/C 26640952 intron_variant
G/T 26641094 intron_variant
T/C 26641272 intron_variant
A/T 26641505 intron_variant
A/C 26642013 intron_variant
G/T 26642147 intron_variant
G/A 26642156 intron_variant
A/G 26642157 intron_variant
C/A 26642171 intron_variant
C/T 26642417 intron_variant
T/C 26642622 intron_variant
T/C 26642633 intron_variant
T/C 26642665 intron_variant
G/A 26642679 intron_variant
G/A 26642692 intron_variant
A/G 26642697 intron_variant
T/C 26642722 intron_variant
G/T 26642726 intron_variant
C/T 26642730 intron_variant
C/A 26642733 intron_variant
T/A 26642734 intron_variant
C/A 26642740 intron_variant
T/C 26642771 intron_variant
G/T 26642776 intron_variant
C/A 26643104 splice_region_variant&intron_variant
T/C 26643285 synonymous_variant p.His406His
G/A 26643381 synonymous_variant p.Gln438Gln
C/A 26643408 synonymous_variant p.Gly447Gly
C/A 26643589 missense_variant p.Gln508Lys
C/T 26643692 intron_variant
A/G 26643718 intron_variant
G/T 26643783 missense_variant p.Lys539Asn
G/A 26643855 synonymous_variant p.Lys563Lys
G/A 26643861 synonymous_variant p.Thr565Thr
G/A 26643990 synonymous_variant p.Arg608Arg
T/C 26644296 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29506.1
MAAPLGNKLQSMLQAAVQSVHWTYSLFWQLCPQQVILVWGDGYYNGAIKTRKTVQPMEVSAEEASLQRSQQLRELYESLSAGETNPPTRRPCAALSPEDLTESEWFYLMCVSFSFPPGVGLPGKAYARRQHVWLTGANEVDSKTFSRAILAKTVVCIPLLDGVVEFGTTDKIQEDLNFIHHVKTFFAEHHHPLPPKPALSEHSTSNPISSSDHIPAVMYTVADPPAADPSLNDEMDEDEEEEDEEEEEEEEEGAESASEDETRDRIARRVTTPEMEDVTRAEPSELMQLELPEDIRVGSPNDGSNNLDSDFHLLAVSQGGNAAGQAESSVRWGPSEEALQVQLPASAPHLLDDLTQEDNHYSETVSNILQNQSSRWPTSPTSVGYITYSTHSAFTKWSSRASHLFHPAVDGPSQWLLKYILFTVPYLHAKNPADTSPQTAADPKLRGKGTPQDELSANHVLAERRRREKLNERFVILRSLVPFVTKMDKASILGDTIEYVKQLRRKIQELEARNRHTEAEHRSKLPEVTVQRTSSNSSKEQQRSGVTVMEKRKVRIVEGVAAKATAVEAETATSVQVSIIESDALLEIECVHREGLLLDVMQMLREVRIEVIGVQSSISNGVFMAELRAKVKEHANGKKVSIVEVKKALNQIIPHPLH*


CDS Sequence:
>Vu_29506.1
ATGGCTGCACCACTAGGCAATAAACTCCAAAGCATGTTGCAGGCTGCGGTGCAATCTGTTCACTGGACTTATAGCCTCTTCTGGCAACTTTGCCCACAACAAGTGATTCTGGTTTGGGGTGATGGGTACTACAATGGGGCAATCAAGACTAGGAAGACGGTGCAACCAATGGAGGTGAGTGCTGAGGAGGCATCTCTCCAAAGAAGCCAGCAACTTCGAGAACTCTATGAATCACTGTCCGCCGGAGAGACAAATCCGCCAACTCGACGGCCTTGCGCCGCCTTGTCGCCAGAGGACTTAACAGAATCAGAATGGTTCTATTTGATGTGTGTCTCATTCTCCTTTCCTCCTGGTGTTGGGTTGCCTGGAAAGGCATATGCTAGGAGGCAGCATGTTTGGCTCACTGGTGCAAACGAGGTGGACAGCAAAACATTTTCACGAGCTATTCTAGCCAAGACAGTGGTGTGCATTCCTTTATTGGACGGCGTCGTTGAGTTTGGTACAACGGATAAGATTCAAGAAGACCTTAACTTCATCCACCACGTGAAGACATTCTTCGCAGAACACCACCACCCTCTGCCGCCCAAGCCCGCCCTGTCCGAGCACTCAACCTCCAACCCCATCTCCTCTTCCGACCACATCCCCGCCGTCATGTACACTGTCGCAGACCCACCCGCAGCCGATCCCTCCCTAAACGATGAGATGGACGAAGATGAAGAGGAAGAGGATGAGGAGGAGGAGGAAGAAGAGGAGGAGGGGGCGGAGTCCGCCTCTGAGGACGAGACCCGAGACCGCATTGCTCGCCGGGTCACGACGCCGGAGATGGAGGACGTGACGAGGGCGGAGCCCAGCGAGCTGATGCAGCTGGAGTTGCCGGAGGATATCCGGGTGGGATCTCCGAACGACGGATCGAACAACTTGGACTCGGACTTCCACTTGCTGGCGGTGAGTCAAGGAGGGAACGCGGCGGGGCAGGCCGAGTCGAGCGTGAGATGGGGCCCGAGTGAAGAGGCATTACAAGTTCAACTACCAGCTTCAGCCCCTCATCTATTAGACGACTTGACCCAAGAGGACAATCACTACTCTGAAACCGTGTCCAACATTCTCCAAAACCAGTCTAGCCGGTGGCCCACATCGCCGACCTCCGTTGGCTACATCACATACTCCACGCATTCAGCTTTCACAAAGTGGAGCAGCCGCGCCAGCCACCTCTTCCATCCGGCAGTCGACGGCCCCAGCCAGTGGCTCCTCAAGTACATTCTCTTCACCGTCCCCTATCTCCATGCCAAGAACCCCGCCGACACCTCTCCCCAGACCGCCGCCGACCCCAAGCTGCGCGGCAAGGGAACGCCGCAGGACGAGCTGAGCGCCAACCACGTGCTCGCGGAGCGCCGCCGCCGCGAGAAGCTGAACGAGCGGTTCGTAATCCTGCGGTCACTGGTCCCCTTCGTCACCAAAATGGACAAGGCATCCATTCTGGGTGACACCATCGAGTATGTTAAGCAGCTGCGGCGGAAGATCCAGGAGCTTGAGGCGCGCAACCGGCACACTGAGGCGGAACACCGTTCCAAGCTCCCTGAGGTAACGGTTCAAAGGACGAGCAGCAATTCGAGCAAGGAGCAGCAGAGGAGTGGGGTGACGGTGATGGAGAAGAGGAAGGTGAGGATCGTGGAAGGGGTGGCGGCGAAGGCGACGGCGGTGGAGGCTGAGACGGCAACATCAGTGCAAGTTTCGATCATTGAGAGCGACGCACTGTTGGAGATCGAGTGCGTCCACAGAGAAGGGTTGCTTCTTGATGTGATGCAGATGCTGAGGGAGGTGAGGATAGAGGTTATTGGGGTGCAGTCATCAATTAGCAATGGGGTGTTCATGGCGGAGCTGAGGGCTAAGGTGAAGGAACATGCGAACGGGAAGAAGGTGAGCATTGTGGAAGTGAAGAAGGCACTTAACCAAATCATTCCCCATCCTCTCCACTGA


Promoter Sequence:
>Vu_29506::LG8:26631410-26633410(+)
TTTAATGATTGTATGTACTAGATATAGATTCTTACGTTTCTGCATGCGGCTATGTGCGTGTATATATTTATGTGATGGATGCGTCGTTATCAAACCAAACCCCCCTTTAATTTTGAAATAGAGTTAAAATTTTCTTTTCTCAAATCAAAACTTTATGTTCCTATCAATATTTTATTTCGTGTATTTTTATGCTAATAATGTATATATTTTTCTCTTAATATTGTATGCACTTAGTTGTCTAGCTTTCAAATAAAGGAAATTTAAGGAATATTTGCAGGTTTCTTGGCTCTCCATTCTTGTTATGAAGCCTTTACTTTTTCTTACATAGCTTTTAAATTTATAATTATTGCCATTTTTTAAAATTAAAACATTCAGAAACAAATATTAGTCACAAATTATTTAGAATTAATTAATCATGGTATAACATAATAGCGTAATGCAAAGAGGCAGTTAGACCAATGAATTTTTTAAAATTAAACTTGTGTTTATTATGGAAAAAAGATGACTAATTGATTGTACAGTAGCATCAAAATTTAGATAAGATATTCTATGATACTCAATATCACACTAGTACAGTCAACGGAAACGACAACGATTATTTTCTTCCATAGACAACAGTTTTAGAATTGAAACATATACATACGAAGCAAAAAGTCTACCTCTTTTTGTCTCGGTTGGGGATTGAGACAAAAGAAATAAGATTTTGCCTCGGTTCAAAAATAACCGAGACAGTAGGGTTTTACCACTTCTTTTTAAAGAACTTTTCGTCTCGATTTTCTTTTGAACCGAGAGAGTATTTTATTATCCCAATGAAAAGTAAACTTCATCAATCACACCAAACTTGAACGGAACTTAAACGAAACTTGAAGGGAACTTGAACGGAACTTAAAGCTGTTTTTTTTTCTCTTAAAGAAGTACAAGGTTAACATTTGATGTTAGAAGATTCCATAATTTCAATTTGCATATTCCACATGTGCATCACGAAACAAAGATAAAATTTTCCAATTTAATAGCATTTTTTATTGTTTCCGAAAAAAAAATATTATCAACAAATATTTGTTTAATTCATAGGAAAATAAATTGTCCATGTAAAAATGTTATTAACAGATAACGTAGTTAAGGTCCTAGTCTCGCCTTATTTTATAATATAAGTAAAATAAATTTAAAATTTTATATCGTATGACCTTGTGGTTGTGACTAGAATTTAGTGGGCTGACATAATCCTCATGTTTTTTTCATGATACGCCGGTGCTTAATTTCCACGCATCTATTTCAATTTTCATTTTTATTTCATGATAACCATTGTTGTTAGTATTTGTTACACACATGATTCCTTTCTATCTGTCTTTTACTCATCAAGTATATATACCCAAATACATTTTAGAAAATCATTTTCTTTTCCTTGTCACTAACAAAATCTTGAAGGCTCTCCAAAACAAACACAACTAACAAACCAGCAGGCACCCTCAAACCACATAGCTAGCTACCACTGTCTGGTAGACCAACCAGTCAAAACCATACACTTTCTTCAGTTTCAAAACCCTATTTCTCTCTCTATCTCTCTCTTTCTGATCATTAACCAACAAACGTTCCTAGATCTTCTCCTTACAGAGATTTGGTAATTCTTGGATCGCCCGCATATCCACCTCAAAGTCATACACCTTTTTAAACATCTCTTTCTCTCCAATACGCAAACCACACATCCATCTGCAGGTCTATACTTAATTTCTTGACCTTCTCTTCTCTTTTCAGAACTCCCTTTACCTTATTTTCTCCCTTCCTTTCACTCCCAATAAATTAAACCTTTGATTTTCCGCTCAGATCCACGCAAAACAATCTTTTTTTCATTGCCTATTAACTTCTCATCAAAACCAAGAACCCTTTTCTTTTTCCTTTTTCTCACCTTTTTCCCACTTTTGGCTATGTTTTTTCAAGCAAACTAGACATGGTTCCAGAGAAGTAACCAAAAGCCTTCTGTTCCGAAACCCTGTTAGGAACAA


Gene Sequence:
>Vu_29506(+)
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