Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29469 LG8 26008383 26010260 PREDICTED: probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase RKF3
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 26008441 missense_variant p.Ser20Tyr
C/A 26008499 synonymous_variant p.Ser39Ser
G/C 26008670 synonymous_variant p.Ser96Ser
C/A 26008761 missense_variant p.Leu127Ile
A/G 26008878 missense_variant p.Ser166Gly
T/C 26009018 synonymous_variant p.Leu212Leu
T/A 26009108 synonymous_variant p.Ala242Ala
G/T 26009254 missense_variant p.Gly291Val
T/A 26009948 synonymous_variant p.Pro411Pro
C/T 26010080 synonymous_variant p.Pro455Pro
C/T 26010113 synonymous_variant p.Leu466Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29469.1
MTPLNPFILLLLFCFLSLPSSSLSACPLNFTVLGTTKPSSFDSSRCQVISQALRLVQSDYLRRSGFFLAPSNASDSCWQSFQSYVNLFDPTYNIRSSCGYQTSWISQGCVNVTTRQEFEALVPQSALQSVGKNCNQSLENNSPCALCTSSLSSIPHLGQSVGNLTSCTDYSSIYAAAFANYLGPSDPGTAKCLFSLEFPSAGSSASKRRKLLFGLVSVVCVVVFCLLAFGFWAYRKFEKKVARDMDVRVVETGFISGLDSMDQSTTLIRFTFDDIKKATKNFSRDNIVGRGGYGNVYKGLLPDGSEVAFKRFKNCSAAGDASFTHEVEVIASVRHVNLVALRGYCSVTTRLEGYQRIIVCDMVKNGSLHDHLFGSNGMNNDGQPSALTDWAWSLVRTGKALDVIEDGMPQPGSPQVLEKYVLIAVLCSHPQLYARPTMDQVVKMMETDESVPSIPERPIPFVAGRLDIDRSVSSSGSGQLSSPTGYQTYTLESDSQLTNSREERSSSSRVLCTD*


CDS Sequence:
>Vu_29469.1
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Promoter Sequence:
>Vu_29469::LG8:26006383-26008383(+)
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Gene Sequence:
>Vu_29469(+)
ATGACTCCTCTCAACCCCTTCATCCTCCTCCTCCTCTTCTGCTTCCTTTCTCTCCCATCCTCTTCCTTATCCGCCTGTCCCCTCAACTTCACCGTCCTCGGCACCACCAAGCCTTCCTCCTTTGACTCCTCCCGCTGCCAGGTCATCAGCCAGGCCCTCCGCCTCGTCCAGTCCGACTACCTTCGCCGCAGCGGCTTTTTCCTCGCGCCCTCCAACGCCTCCGACTCCTGCTGGCAAAGCTTCCAGTCCTACGTTAACCTCTTCGACCCCACCTACAACATTCGCTCGTCCTGTGGCTACCAAACCTCCTGGATCTCCCAGGGCTGCGTCAACGTCACCACCAGACAGGAGTTCGAAGCTCTGGTTCCTCAATCCGCTCTTCAGTCCGTAGGAAAAAACTGCAATCAATCGCTCGAGAATAATTCTCCCTGCGCCCTCTGCACCTCCTCCCTCTCCTCTATCCCGCACTTGGGACAGTCCGTCGGCAACCTCACCAGCTGCACTGACTACTCTTCTATCTACGCCGCCGCCTTCGCCAACTACCTCGGCCCCTCCGACCCCGGCACCGCCAAGTGCTTGTTCTCCCTCGAATTTCCCTCCGCCGGTTCCTCCGCCTCCAAAAGAAGAAAGCTTCTTTTTGGGCTTGTTTCTGTTGTCTGTGTCGTGGTTTTCTGCTTGCTGGCTTTCGGCTTTTGGGCTTATCGCAAGTTTGAAAAGAAGGTGGCTCGGGATATGGATGTTCGTGTTGTGGAAACCGGTTTCATTTCTGGGTTGGATTCCATGGACCAGAGCACCACCTTGATCAGGTTCACTTTCGATGATATTAAGAAGGCAACTAAGAATTTCTCCCGGGATAACATAGTTGGAAGAGGGGGTTACGGGAATGTGTACAAAGGGTTGCTTCCTGATGGGAGTGAGGTTGCGTTTAAGAGGTTCAAGAATTGTTCGGCTGCTGGTGACGCGAGCTTTACTCATGAGGTTGAGGTTATTGCTAGCGTGAGGCATGTTAACCTTGTTGCCCTGAGAGGTTATTGTTCTGTCACGACTCGTTTAGAAGGTTACCAGAGGATTATTGTTTGTGATATGGTGAAAAACGGGAGTCTCCACGACCATTTGTTTGGTTCCAATGGGGTGAAACTGAGTTGGCCAATTCGTCAGCAGATTGCTCTAGGCACCGCTAGAGGGCTGGCTTATTTGCATTATGGGGCTCAACCTGCAATTATTCATAGGGATATTAAAGCAAGTAATATACTTTTGGATGATAAGTTTGAAGCCAAGGTTGCTGATTTTGGACTGGCGAAGTTTAACCCTGAGGGGATGACGCATATGAGCACTAGGGTGGCTGGAACCATGGGGTATGTTGCTCCGGAATATGCTTTGTATGGACAGTTGACAGAGAGAAGTGATGTGTTCAGTTATGGGGTTGTGCTTCTTGAGCTTTTGAGTGGTAGGAAGGCGCTTCAGATGAACAATGATGGTCAACCATCTGCTTTAACCGATTGGGCTTGGTCATTAGTTAGAACCGGAAAGGCTTTGGATGTAATTGAAGATGGCATGCCACAACCTGGTTCACCACAAGTTCTCGAGAAGTATGTGTTAATTGCTGTGCTTTGCTCTCATCCACAGTTGTATGCTAGGCCAACAATGGATCAGGTTGTTAAAATGATGGAGACCGATGAATCAGTGCCCTCAATACCCGAACGCCCAATCCCTTTTGTCGCTGGGAGGCTCGATATTGACAGATCTGTGAGCAGTAGTGGCTCTGGTCAGCTCTCTAGTCCAACGGGTTATCAAACATATACTCTAGAAAGTGATAGCCAATTAACTAATTCTAGGGAAGAAAGAAGCTCCAGCTCCAGGGTTTTATGTACAGATTGA