Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29427 LG8 25288276 25292359 PREDICTED: zinc finger CCCH domain-containing protein 32-like isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 25288363 5_prime_UTR_variant
G/A 25288382 5_prime_UTR_variant
A/T 25288392 5_prime_UTR_variant
A/T 25288396 5_prime_UTR_variant
A/G 25288449 5_prime_UTR_variant
T/A 25288574 5_prime_UTR_variant
C/G 25288578 5_prime_UTR_variant
G/A 25288585 5_prime_UTR_variant
C/T 25288599 5_prime_UTR_variant
T/A 25288786 splice_region_variant&intron_variant
G/T 25289034 splice_region_variant&synonymous_variant p.Ala79Ala
G/C 25289161 downstream_gene_variant
T/A 25289198 downstream_gene_variant
G/T 25289224 downstream_gene_variant
C/T 25289492 missense_variant p.Pro97Ser
A/T 25289554 downstream_gene_variant
T/C 25289614 downstream_gene_variant
T/G 25289618 splice_region_variant&intron_variant
C/T 25289626 splice_region_variant&synonymous_variant p.Tyr101Tyr
A/G 25289806 downstream_gene_variant
T/A 25290190 downstream_gene_variant
T/C 25290264 synonymous_variant p.Tyr258Tyr
G/A 25290383 missense_variant p.Gly298Asp
T/A 25290384 synonymous_variant p.Gly298Gly
C/T 25290390 synonymous_variant p.Pro300Pro
G/A 25290477 synonymous_variant p.Arg329Arg
T/C 25290596 downstream_gene_variant
C/T 25290693 downstream_gene_variant
T/C 25290912 downstream_gene_variant
G/A 25290980 downstream_gene_variant
A/C 25291046 downstream_gene_variant
T/C 25291358 downstream_gene_variant
T/A 25291425 downstream_gene_variant
A/G 25291431 downstream_gene_variant
G/A 25291516 intron_variant
T/A 25291605 intron_variant
T/A 25291645 intron_variant
G/T 25291646 intron_variant
T/C 25291954 synonymous_variant p.Ser411Ser
G/A 25291967 missense_variant p.Glu416Lys
T/C 25292050 synonymous_variant p.Asp443Asp
G/A 25292062 synonymous_variant p.Ser447Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29427.1
MDLYGRAPVRNGSNPVNQPEWPSPGIDAALEESMWHLTLGGGESYPERPGVPNCVYYMRTGVCGYGSRCRYNHPRDRAAVVAAVRATGEYPERVGEPPCQYYLKTGTCKFGASCKFHHPKNGGGYLSQAPLNTYGYPLRPGEKECSYYLKTGQCKFGVTCKFHHPQPAGTPLPASAPQFYQQVQSPTVPVPEQYAGASANLRVARPPVLSGSYVQGAYGPVLLSPGVVQFPGWSPYSAPVSPVLSPGAQPAVGATSLYGVTQLSSPTSAFARPYTPLSSTTGPSGNILKDQLFPERPGEPECQYFLRTGDCKFGLACRYHHPRDHIVARPFLSSIGLPLRPGVQPCVFYLQNGHCKFGSTCKFDHPLGSLSYSPSVSSFIDVPVTPYPVGSLLSQLAPSTTSSELRPELMSGSKKESLSARIPSSGTSVGLIFSQGGSISLSDVQLSSQSSAPLGSSRSNRQSGEIR*


CDS Sequence:
>Vu_29427.1
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Promoter Sequence:
>Vu_29427::LG8:25286276-25288276(+)
GTGCTTTAATTAAAACTGTTCAAAGATTCACTTTCGCTGTTTAGAAATCCATCATCCAATTCGGTTTTAAGAGCCTATACTAGGTCATTCACATTTATGCTCTCATCTGATTATATTATTATTATCTCAAATAAGCTTTAATAGAAAACTTAACACTGTCTATTCTTCGCCCCTTCGGAATGTTTATTATTTTACCTAATTTATTGCTCTTGTGTGATTATTGTGGTTACATTTTACGAAGGTAAATATGGTTTGCTTGCAGTTTTGCTACTGCTATTACCCTCAATCTCCACACATAACAGGTTTAAAGAATATTTCTTTTGCAAAATTTAACCGAGTTATATTTACTTTTCTATATCTAATGGCAATTTGACCTTGCTCTTGGAGGTGGAGGTTGGTAGTGTTTTGGTACTACTTTTATTCAATACATCTCTTTTGCATTTTTTTTTCTGCTTTGCACTATTGCATTCATGCATGTCTTGCGTATTGGCAGATATATTATGCATTCTATAACTATTTTTGAATCTGAGAAATATTCTAAGTCAGTATTTTAAAACGTTAGTTAATGAAATAAAAATAAAAATTTAAGTATTAATAATATATGTGGTAATTTTACTGAAATATTTAATCAGTGTCAGAATTTAAGAAAATATTTCTTTTTAAATAATAAAGATTTAATAAATAAAGTCTGATTTTCTGTGAAAAAAAAGAAAAATGCTTGTTATGAAATGAAGATGTGTGAAGAGGAGTAGCTGTGTTTAAACTCTTAATATCTTTTCAAATTCAATGAATGTTTTATCATTGGGAGGTATTAAATTAGTTTTCAAACACTTCTAGTGGTTGAAAGTTGAACCTTGTTAAGTTCATATGTTAAAATAGTTTGGAAGGAAAACTAATCTTTCGTTCGTTACTAAATAACTTAAGAATCTTCTAGTTTTAATCAGAATAGCAACCTACATATTTTCTGTTAACCCATGACAAACATTTTATGTTGTTAACACATGACATTAGTGTCTTTTTAATTCTTAGATTGTTTTTTAAATAACACTCACTTTCTTAGTTTTATTTAAAAATACCATATTATGTAAAACGTAAATAAAAATTATGCAAAAATAAAAATGAAAATTTTAAATATAAAAATAACAAGTATTATCAACAAAAAAAATGAATGATTTACTTAGAAAATATCATAAAAGTTACATTTTTAGAAAATATATTCTAGTATTAAAATAAGTAAATACCCATTCACAATATGATTAAATCTATTATTAACTCATTTTAGAATTTATGTGTGTTTTTTTTTATAAAAATATATATGTAACCAAGACAAAAGGTGGAACTGTTTATTTATTAAAATAAAAATTTATTTAAGGAGAATTTATACAAGATTAGAGTAACTTTCTTATCATTAAACTATTAAATTTTCTTTTATATAGTAATCTGTATATTTATATTTAAAAATTTTAATTGTAAAAGTTATGTAATTTTTAGTAGATGTTACTTTTAAATAAAATACAAAAAGAGAGCTGTGATGCAATTGATTAAAAACCTTTATTAAAAATGCACAAGAATTGTATATTATTCTAAAACTAGTAAGATGTAGATGTGATTCAGCATAAATACAAGAAGATGAGTCCAGCTTTCTGAATTATTATAGTAATAAACAAAACTTAGTTATGAAAAAATAAAGAGGCACGCTCTCAGACGGCATTTGGGAACCCTTCTCTTGTCCCCACACAAAGAAAAACAGCTTAGAATTTAAACAGTTCAATCAGAAATCTGTCCACAAAACTATACTTCTAACGGGTGAAAATGAGTGAAATCAAATCACCTTGGAATTTGAATTTAATTTGAGCTAAACTTGTTATATTCATTTAGCTAACTTGAATTTTATCTATTATTATTTTAATGAATTAAAATAGAACTTTATGTTAAGAATGTAATATTATATTATATTGGAATGGAATAATATAAGTGTGTGAAAAGTGGAAGGAGAGTTA


Gene Sequence:
>Vu_29427(+)
ACGTCACTTTACAAAAGGATGAGTGTCGGTTACTGGTTAAGTGTGAACCCCGTTTTCTGATTTTAAACTGTGGCGGGTAGACAGAGATGAAGAGAACAAAAAACCGGAATTAATACAAGAAAAACAGCGAAAGAAAATGGAGCTGAAAAGCCCATCACAACAAGAGACCGTACAGTCCTAGTCAGAGAGAAGAAGCAAAACAAAACACACACTCTTTCACTCTCACACTCACACGCACACACGCACGCTCCAACGCACGCCCTGTACAGTGAAGCTGTGAAAATCCCTTTTCTGTCTCTCCGCTTCCAAGCCACCCAACAACACCAGCTCTCCGATCTTCCACATCCTTTAACGCCTCTCTACTACCAACCACCTTCTTCACTTCAGACACTCCAACACAAACCCGTTTCCATGGACTTGTACGGTCGGGCCCCCGTCAGGAACGGATCCAACCCGGTCAACCAACCCGAATGGCCTTCACCGGGCATCGACGCTGCTCTCGAAGGTCTTTCTCTCTTCTCTTCTCGTCTGTTAGCTTTTATTAATCTCCAACCTGTGCTGTGTTATTTTGGGGGGTTTTCAGTGGCTTCTAATTAGGGTTTTGGTTTTTCTGTAGAATCCATGTGGCATTTAACCCTCGGTGGTGGCGAATCTTACCCGGAGCGGCCCGGCGTGCCCAATTGTGTGTATTATATGCGAACCGGTGTGTGCGGATACGGTAGCAGGTGTCGTTACAATCACCCTCGTGATCGTGCTGCGGTAACCCTTTCCATCACTTTGAGATTCTGCATTAGGTTAGAGTTTCATGCAAGTGTTTTTTGTTTTTGTAGTAGGCATTGTTTTCGTGCCTTTTTTGGCTCTGTGTCGGTTTTATTGCTTATTTCTGAAGGTCGATGTTGTGTAGGAATGTTCATTTACTGTTTAGTTAATTCTTTTCCTTTTTAGCGAGGAGAGTTGTATTTAATTTTTACTTTCTTAATGTGAAATGCCACTTGAAAGTGGGAATCCGGTTTGAAGGATAGTCTTGTTGTGTTGCATAAGTCTATTTTAGTTAGAAAAAAAAGAGAGTTAGAAGAATGTTTATGTAGATAGCGAGTATTTTATTTCATCTTATTGCTAAAGTGTATGAATATGAATTGACTCAGTTGAGTCAAATGCTGCTTAGGTTGTTGCGGCGGTAAGAGCTACAGGGGAGTACCCTGAACGGGTGGGGGAACCTCCATGTCAGGTCTTGGTTTTTGTTTTATTTCCATAAATGATTTTTTATGTTAAATCTGCAAATTTTTAACTCGTATCTTTCCAATTTAAAATGGTTATACTTATTCTTCTTGGTCATTCTGGTTAACAGTACTATTTAAAGACTGGAACCTGTAAATTTGGAGCATCCTGTAAATTCCACCATCCAAAAAATGGAGGTGGATATTTAAGTCAAGCTCCACTAAATACTTACGGATACCCATTAAGACCGGTATGACTCTTCTTTTTGTTCTTCTCCCCACCTGTAGCTCGCAGCAAACAATGCAATTGTTAACTGTCTTTTGTTTGAACAGGGTGAGAAAGAGTGCTCCTATTATTTAAAAACGGGGCAGTGCAAATTTGGTGTTACCTGTAAATTCCATCATCCTCAACCTGCTGGCACACCATTGCCAGCATCTGCACCTCAATTTTATCAACAGGTGCAGTCTCCTACCGTTCCTGTGCCTGAACAGTATGCAGGAGCTTCGGCAAACTTGAGAGTGGCCAGGCCCCCTGTATTGTCTGGTTCCTATGTACAAGGGGCTTATGGTCCTGTACTTCTTTCTCCAGGGGTTGTGCAATTTCCTGGATGGAGTCCTTATTCGGTGAGAGGGACATGTGTGCAAAGTGAAAAGTCAATTTTTCTTCATTTGGAAGTTGCTTTCTTCTGACAAATTTTAATTTGTGTAGGCACCTGTAAGTCCTGTGCTATCTCCTGGTGCTCAACCTGCTGTTGGGGCCACTTCTTTATATGGAGTGACCCAATTGTCATCACCAACATCAGCTTTTGCTAGACCATATACTCCGCTGTCCTCTACTACTGGACCTTCAGGAAACATACTTAAGGATCAATTATTTCCTGAAAGACCCGGTGAACCCGAATGCCAATACTTTCTGAGAACGGGGGACTGTAAATTTGGATTAGCTTGTCGATATCATCATCCTCGGGACCATATTGTTGCACGGCCATTTCTTAGCTCAATTGGACTTCCTTTACGACCGGTATGTATGGTTACTCACTTGATTTGATTATTTGTCTTATTGTCTGGTTAACATTCTTAGATTTATTTAAATTTAAGTGGTATGGTACTTTACAGAGTTACAGTTATAATTTATGATGTTATCCATATAAAATGTACATATCTACACATGACAAATGTATGAATAACACATCTATTCTGCTCAGGGATCACTATTATTTCCTACTCATTAGAAATAAAAAATTTGTAGGTAGTCTAGACAAGCTGCTCTTTTTGTACCTTGGCCCTTATAGTATTAAAGTATCCCTGCATAGCAATTAACTCATAGTGTGGCTTCAGTTGCACTAGGAACAACATGGACAGCAATTGACCTGGAGTAAGAGACAATATTAAACTTTTGCTTTGCACGATTAGAGTTGGTCCTTGACAGAACATAATATAAATATGTATGTATAAAGCTGTCTGCACGAGCCTTTTAGGCCCGAGATGTGGAATGTAACTTCTTATTTACAAGAATGGGGATAGCTAAGATTGTACTCTTGATCATATATTTTAAAAGCTTCTATTCACTCTAGTTTCCTTTTTAAATTCATATGGCATAAAAGTGACTTGCTCATATGTCTGAAATATAAAAATATAAAAATTCTGCCTTTCCTGCTTCCACTGAAATGGCCAATGTAGTGATGTCCATGATGCCAAATTGTGACACGGTTAGTTGCTGTTCTATCTTTAGTTGCGTGATTAAAGTTTCATTATGTTTGGAGGGATATGTGATGGAAACATAGGATCTGAACTGGGGGTTATGGCAGAAAGGATTTGGATTTATAGTTCCGTTGGAAGTAAATTTTGGTTGTGGTAAACTATGTTTCTTCCTTATTGAGGAAACATGCTATTTACTGAGCTATTGGACATCACAATAGAACAAGTTACTCGTTTTGGATTCAGGATGCCCCTTGCATAGATCTCATGCAAAATAATCTTCATTTGTGACCGAAATGCATGTGCAAATAAAATTATTTACAATGGAGTTACGCACTTGTAGAATTAGTGTTTATAGGGTCATCCATTCGTATATTTGTTTTTCATCTCATTTACACTAGTGTTTAGAGTTGTTAGTGGTTTGAATGCATTAATTTTATGTGGAAGATTTAATTGTTCTTAAGCACATTCTCATGTTTCATTGCAGCATTACAATTTGCTTTTTATATTTTTTTTTGGGATTTTTCTTAATTAATTTGTTTTCTAGAAAACAGGGCGTACAACCTTGCGTTTTTTATTTGCAAAACGGGCATTGCAAGTTTGGCTCCACATGCAAATTTGACCATCCTTTGGGATCTTTGAGCTACAGTCCATCGGTATCTTCTTTCATTGATGTGCCAGTTACTCCATACCCGGTGGGGTCTTTGCTGTCTCAACTGGCTCCTTCTACAACATCTTCAGAGCTTCGGCCTGAACTGATGTCTGGGTCCAAAAAGGAATCCCTTTCAGCCAGAATACCTTCTTCTGGTACTTCTGTCGGTCTAATTTTCTCACAAGGTGGTTCTATCTCGTTATCTGATGTGCAACTCTCGAGTCAGAGTTCTGCCCCTCTTGGCAGTAGCAGAAGCAACAGACAAAGCGGTGAGATACGTTGATCAGGCTAGTGGAAAACCTGAAAATGACTCCTCATTAGCTATTGGAAGTGACTACACAAGCCTCCATTGCTTCTGTTTATAGTCCTCAGTATTTTGATGGCAACTGTTCAAATTTTCACTGTCTTTGTTGAGAATTCATTATCCAATCCTGTTTAGAGCATATACTAGGTGATTCTCATCTGATTATATTATTATCTCCAATAAGCATCAATTGAAAACTCAATATTGTCTATC