Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29426 LG8 25281635 25286472 PREDICTED: zinc finger CCCH domain-containing protein 32-like isoform X1
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/T 25281915 missense_variant p.Arg6Leu
C/T 25281924 missense_variant p.Ala9Val
G/C 25282113 missense_variant p.Met34Ile
T/A 25282338 intron_variant
C/G 25282346 intron_variant
A/G 25282562 intron_variant
A/G 25282566 intron_variant
T/A 25282661 intron_variant
T/A 25283099 synonymous_variant p.Pro186Pro
A/T 25283102 synonymous_variant p.Thr187Thr
T/C 25283135 synonymous_variant p.Ser198Ser
T/A 25283136 missense_variant p.Ser199Thr
C/T 25283543 stop_gained p.Gln303*
G/A 25284068 upstream_gene_variant
T/A 25284252 upstream_gene_variant
T/A 25284452 upstream_gene_variant
T/A 25284470 upstream_gene_variant
T/C 25284909 upstream_gene_variant
C/T 25284965 upstream_gene_variant
C/A 25285556 upstream_gene_variant
A/G 25285719 upstream_gene_variant
G/A 25285733 upstream_gene_variant
A/T 25285736 upstream_gene_variant
C/G 25285740 upstream_gene_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29426.2
MDLYGRTPARNGSNPVNQPEWRSPGTDTALEESMWHLTLGGGESYPERLGVPNCVYYMRTGVCGYGGRCRYNHPRDRAAVAAAVRATGEYPERVGEPPCQYYLKTGTCKFGASCKFHHPKNGGGYLSQAPLNVYGYPLRPGEKECSYYLKTGQCKFGISCKFHHPQPAGTSLPASAPQFYQQVQSPTVPLPEQYGGASSSLRVARPPMLPGSYVQGAYGPVLLSPGVVPFPGWSPYSAPVSPVPSPGAQPAVGGTSLYGMTQLSSPTSAFARPYTPLPSTSGPLGSSLKEQLFPERPGEPECQYYLRTGDCKFGLACRYHHPRDHIVARPLLNPVGLPLRPGVQPCAFYLQNGHCKFGSTCKFDHPLGSMRYSPSASSLIDVPVTPYPVGSLLSQLAPSTTSSELRPELMSGSKKESFSARIPSGNSSGTTVGLIFSQGGSVSLSDVQLSSQSSASASSSRSTRQSGEIR*

>Vu_29426.1
MDLYGRTPARNGSNPVNQPEWRSPGTDTALEESMWHLTLGGGESYPERLGVPNCVYYMRTGVCGYGGRCRYNHPRDRAAVAAAVRATGEYPERVGEPPCQYYLKTGTCKFGASCKFHHPKNGGGYLSQAPLNVYGYPLRPGEKECSYYLKTGQCKFGISCKFHHPQPAGTSLPASAPQFYQQVQSPTVPLPEQYGGASSSLRVARPPMLPGSYVQGAYGPVLLSPGVVPFPGWSPYSAPVSPVPSPGAQPAVGGTSLYGMTQLSSPTSAFARPYTPLPSTSGPLGSSLKEQLFPERPGEPECQYYLRTGDCKFGLACRYHHPRDHIVARPLLNPVGLPLRPKTGCTTLRILFAKWTLQVWLDVQI*


CDS Sequence:
>Vu_29426.2
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>Vu_29426.1
ATGGACTTGTACGGTCGGACCCCCGCCAGGAATGGATCCAACCCGGTTAACCAACCCGAATGGCGCTCACCGGGCACCGACACTGCTCTCGAAGAATCCATGTGGCATTTAACGTTGGGTGGTGGGGAATCTTACCCGGAGCGGCTCGGTGTGCCCAATTGTGTGTATTACATGCGAACTGGTGTGTGTGGATATGGAGGCAGGTGTCGTTACAATCATCCTCGTGACCGTGCTGCGGTTGCTGCGGCAGTAAGAGCTACAGGGGAGTACCCAGAAAGGGTGGGGGAACCTCCGTGTCAGTATTATTTAAAAACGGGAACCTGTAAATTTGGTGCATCCTGTAAATTCCACCATCCTAAAAATGGAGGTGGATATTTAAGCCAAGCTCCACTAAATGTCTACGGATACCCATTAAGGCCTGGTGAGAAAGAATGCTCCTACTATTTGAAAACGGGGCAGTGCAAATTTGGTATATCTTGTAAATTCCATCATCCTCAACCTGCTGGTACGTCATTGCCAGCATCTGCACCTCAATTTTATCAACAGGTGCAGTCTCCTACAGTTCCTCTGCCTGAACAGTATGGAGGAGCTTCTTCAAGCTTGAGAGTGGCTAGGCCTCCTATGTTGCCTGGTTCATATGTTCAAGGGGCCTATGGTCCTGTACTTCTTTCTCCAGGGGTTGTCCCATTTCCCGGATGGAGTCCTTATTCGGCACCTGTAAGTCCTGTGCCATCTCCTGGTGCTCAACCTGCCGTTGGGGGTACATCTTTATATGGAATGACCCAGTTATCATCACCAACATCAGCTTTTGCAAGACCATATACTCCCCTTCCCTCTACTTCTGGCCCTTTAGGAAGCAGCCTGAAGGAACAATTATTTCCTGAAAGACCTGGTGAACCTGAATGCCAATACTATCTGAGAACAGGGGACTGTAAATTTGGATTAGCTTGTCGATATCATCATCCTCGAGATCATATTGTGGCACGGCCACTTCTTAACCCTGTTGGACTTCCTTTACGTCCGAAAACAGGGTGTACAACCTTGCGCATTTTATTTGCAAAATGGACATTGCAAGTTTGGCTCGACGTGCAAATTTGA


Promoter Sequence:
>Vu_29426::LG8:25279635-25281635(+)
ATGTTGCATTTCTCTAAAAAAAACTATAATATTATGACTAGTTGAAATAATAGCCGGATATACTCACTCCACAATACTTAAATCTATAACATATTTTTATAGGGATGAATTATAAAATTAAATATATTAGTTTAAGATAATAGGTTGGTATTCAAACAATATTGTCTTTTGATTGCTAAAATTGAACATAAACAAGTGATCAAACAAATACCTAAATATTCTAATTCAAAAATTTAGTACTTTCAATACGTGTAATCCTGTTTCATCTTTCTGTGTAAAAACAAAATGAATCATATTTCGTCCACATAAGGAAAGGAAGAAGAAAAAGGAATTCAACACAGAACAAAATTTAAATTCAATATTTTATCTAAAAATCTTATATTGGATTTGGACTTTATATTATGAATGTTTTGTTTTTTTCATTTGAATTGTCTTATGGAAAGAATGAAACTCAAGTCATTGTCCAGAACATTTCTTCTTTCGCATGTCGATTAATTTTTTTTAGAGTTTAGGATGAGAGAAACACAAGTATGATTAATGTTCATGATTCATGGTAGGTGGTGTTATTTCTGTTGTTTATCATTTATTATAAAAAGTTGGAGAGAGACTATAAACAAGAGATATAATATTAGGAAAAACAATGAGAAAAACATGCAATAATAAATATTATTTACTTCTTTTAAAATAATAATAGATTGATTGGTATAAATTAGTGGTTTGGTATCATATTAATGGGACCCTATACTTGTGCAGAGGAGTACTATATAGAAATTCCATAAGTAAAGTGTCACATGAAATGAAATGCATTCAATGTTTTTTAAAATTTTTCTTTAATATGGGTTAACATAATTTTAATATATCTAAAAAGAACCAATTTTATTTTAATCTATATAAATGTTTGTCTTTGTTTTATTTTTGAGATATAAAATTGGTGTGTAGGTGTCAAATGATTTTCTTTTGTTACTTAAAAAATACTATCAAAATACACGAATGAATAATATAAAAAAGTTGGTTATTGATGAATTCTTAATGAAGTTACTTATGCTTTTCTTCTACATTTCACAGTTAAAAAGCAATGCAATCATTATCATACCCTTATTTTTTAAAATGTAATTGTATTATCACCCTCCTTTAATCATTATAAACTAAAAAGAGGAGAGATGATTGTGATTGATGGTTGGCATTACAAATAATAGTGATAATTATGAAAATAAAACTGATATAATAATGCAGGTTTAAATTTAAGATGTATGCTATTTCAATTTTTCTAAATAATCTTATTCTTAAGAGTTGAGAGGGATGTATCCCATTTTCATTTTTTTTATCAATCTTGATCATTTTATAAAAACTATATGTAAGTAAATGTTATGTCAAATTATGTGACGGTAAAAATTAGACCGGATATAGAGTTGGATCCTGGTCATAATTAATAAAATTAACAATTTAATTGATAAAATAAAATAAAAAATAATTTTTTTTAAAAAGCTTCATTATATACCATTATAAATGAAGACATGAAGGCCAAAGAAAAACAAGACATAAACATTAAATGCTCTAACTAAAAAGAGGAATCACCATATTTTCAAACCAGAGTATCTATTTTAAAAATTAAATTTAAGCAGCAAAATTTAATAATCCCAATTTTTTAAACTGACATTAAATAATTCCTCGTTACATTTAATCTCTTCCTTAGGCTATACATAAAAAAAAAAACTCACTTAAAAAGTTTAAAATGAAAAGTATCACATTGAATATCAAACAATTCTAGAATTGATCGGTAACTCTAATCCCAAATAAGAAAAAAAGAATGAAAAAACATAGAGAGAAGGTCATCCAGGTAATTTCACAGAAGGAAGAGTGTCGGTTACCTGTTAAGTTAGCTTAGGTCTTGCTTTTTCAGTTTAATTAAAACATGACAGGATAAGATGATGTTGGAAGGAACATAACATTTTGCGCTATTTGGCGGGTACGCAGACACCCAAATCACAAAAAAAGAAAAA


Gene Sequence:
>Vu_29426(+)
ACGAAAATTAATAGGAAAAACAGAGAAAGAAAATCGGGCTGAAAAGCGCAACACAGTGAACACACCACATCAGACATCGTACAGTCATAGAGAAAAAGGGAAACAAAAACACATACATATTCACTCACTAACACCGCTCAAACCAGTCTCTATCTAGTGGGTTCCAAACAACACCACACCTCTCTCATCTTCCAGAACATTCTAGACCGTTCTAGCTGGAAACTGCTTCTTCACTTCAAACACCCAGACTCTCACACCTTTTCCATGGACTTGTACGGTCGGACCCCCGCCAGGAATGGATCCAACCCGGTTAACCAACCCGAATGGCGCTCACCGGGCACCGACACTGCTCTCGAAGGTCTTTCTCTCTTCTCTGCTCCCTATCTTAGGGTTTGCTTGATGTGGAAGCTGACTTGTGTTAGTTTAGGGGTTTCTCTGTGGCTTCTGATTAGGGTTTTTCGGTTTCTGCAGAATCCATGTGGCATTTAACGTTGGGTGGTGGGGAATCTTACCCGGAGCGGCTCGGTGTGCCCAATTGTGTGTATTACATGCGAACTGGTGTGTGTGGATATGGAGGCAGGTGTCGTTACAATCATCCTCGTGACCGTGCTGCGGTAACACTTTCCATCACTTTGAGATTCTGCATTAGGTTAGAGTTTCATGCAAGTGTCTAGTTGCTGTTGCTTTTTGGTAGGCATTGTTTTCGTGTCTCTTTTGGCTCTGTGTTGGTGTTATTACTTATTTCCGAAGGTCGATGTTGTGTATGAATGTTCGTTTACTGTGTAGTTTGTTTTTTTTTCTTTCCTTTTTAGCGAGGAAGGGGGGATTGCATTTTGACTTTCTCAATATGAAATGTACTTCCAAAGTGAGAATTGGAGAATGTGGATGACGAAGTTTTTTCTTTATTACATCTTATTGCTAAAGTGTATAAATATCAATGCGTTAGGTTGCTGCGGCAGTAAGAGCTACAGGGGAGTACCCAGAAAGGGTGGGGGAACCTCCGTGTCAGGTATGCTATTTTTGGCCTCTTTAAATGTTTTTTCTCAAATAAAATCTACCAATTTCTTCTTATATTTCTAATTTAATGTGGTTATTAATACTTGGTGTTTCTGATGAGCAGTATTATTTAAAAACGGGAACCTGTAAATTTGGTGCATCCTGTAAATTCCACCATCCTAAAAATGGAGGTGGATATTTAAGCCAAGCTCCACTAAATGTCTACGGATACCCATTAAGGCCTGTATGACACTTCTTGTTCCTCTTGTCCGTCATGTAATTGACAGTAGTATAAATAATGCCATGTTGAACCATGCCTTTTGTTTAACAGGGTGAGAAAGAATGCTCCTACTATTTGAAAACGGGGCAGTGCAAATTTGGTATATCTTGTAAATTCCATCATCCTCAACCTGCTGGTACGTCATTGCCAGCATCTGCACCTCAATTTTATCAACAGGTGCAGTCTCCTACAGTTCCTCTGCCTGAACAGTATGGAGGAGCTTCTTCAAGCTTGAGAGTGGCTAGGCCTCCTATGTTGCCTGGTTCATATGTTCAAGGGGCCTATGGTCCTGTACTTCTTTCTCCAGGGGTTGTCCCATTTCCCGGATGGAGTCCTTATTCGGTGAGAGGGACATGTGTGCGCGTCTTGTGGAAAGTCATCTTTTTTGTGTTAACTTTTAGGAGTTGCATTATTCTGAAATTTTTAAATTGGTGTAGGCACCTGTAAGTCCTGTGCCATCTCCTGGTGCTCAACCTGCCGTTGGGGGTACATCTTTATATGGAATGACCCAGTTATCATCACCAACATCAGCTTTTGCAAGACCATATACTCCCCTTCCCTCTACTTCTGGCCCTTTAGGAAGCAGCCTGAAGGAACAATTATTTCCTGAAAGACCTGGTGAACCTGAATGCCAATACTATCTGAGAACAGGGGACTGTAAATTTGGATTAGCTTGTCGATATCATCATCCTCGAGATCATATTGTGGCACGGCCACTTCTTAACCCTGTTGGACTTCCTTTACGTCCGGTATGTGGTTATTCACTTGATTTGATTATTCAATTGTCTGTTTAATTTCTAGGATTTAATTAAATGTTTTTATATGTCACTTTATAGTTATAGATGTACATATACAAGAGTGTGAAAATGATGTTTATTTTGCTTAGGGCACAGTACTTGCATTTCCTACGTATTAGACATTAAAATCTGCATGTGGTCTAGACAACCTGTCCTTTTATTTGACTTGGGCCCTAATAGCATTAGGTACTCAATAACCCGACTTCTGTTGCACTAGGGTCAACATGGGCAACGGTTGATCTGGAGTAACAGATAATATTAAACTTTTTCTTTGGAGTAACAGATAATATTAGACTTTTGCTTTGCACAATGATAGTGTTGGTCGTTGGTGGCACAAGATTATCAAACTGGAGAGTCTACGTCATATGAAAAAGTAAATATAATACCATTCCAATTCAACTTTTCAATCCCATAAATTCTATAATAACTAAGTTTAGTGGTGTATGACTATTATAAGTTTAAACTACAATAAATAGATACGTTCATACAATTACAAAACATAAGTTCTTAAGGTGAAAACAATTAAATAACTAAGAATGGAAAATTGTTTAAGTTTGTGTCTCCAATCCTCTAACAACATCATCTCCAAGATCATTATCTTCATTGCCATCAAGCTCTTTCCCTGATAGAAAAGTGGGCATCATCAATATTGGCATAAAAACTAAATTATCAACAGAGTGCATCTAGAGTTGGGTCAGCTGAACTTGCTCCTCCTATGTCTAGAGGGTGAGGAAACTTCTATATTGTTTGAACCATTCCCGCTTCCCTACATTTTTCAATTTTTGCAACGTGATGTGATGCTGAGGCGGTTGGAGATAGAGGGCAGAATCAGATCATGAGTACTAGCTGATGAGGGGCACACTCTTTTTGTTTGGAGAAGTTGCAAGCCAAACCCATATCCTTCATTGTGATATGGGTTCTCAAAATGTGTTTGAAATAGTCAAATGACATGATTTTATGTCAGTTTTTTTGCCAAACAATGGATTCGGTGAACTTGTAAGTCTATCATGTGTGAACTCAGTTTGGTCGAGTATGCTTGTCCACCAAGAAATTAATTTGGAGAGAAGTTTACTTGTGGCCAATGCATGAACCTTTTGAGTTTGTGAGTTGATCCGTGAGTTTGATAACCATGGATGATTTTATGCACACACAGGGCCCTCCACTCAAAAAGTATTTGGACTTTGAAATCCTCATTTCAGGTTAGGTCAAGAATCAACCTTCCTAAAAGATTAAGCCGTTCAACAGAAGTCTGTGTTACACACTCATTCTATTTTTCTTTTAAGTTGATTATGATATTAATGTGGCTTTCTGTATGGACACATCTAAAATTTAACAGTTCAAGGTTTTGACAACAAAAGCTACTATCTTGGACTGTTAAATTTGGTTATCATTTTTGAAGGATTCTCCAGCTTAGGAAAACCCTGCTGTTGGTGAAATCTAATTTGGATGTGATGGTTAACGCATTTCAGTTTCCAACTACAACTTCCAATATAGTGATGATGTGGTTGATTTCTATCTTGAATTGAGATTTGCATGTTTGCTGTTGCATCATCTTTGGGGGGATGTCATATGGAAACATAGGATCTGTATTGGGGACTACAGTGGACAGGATATGATTTCATCATTACATTGTATGTTCATTTTGGTTGTGGGCTTGTAGTTAGCTACTTTTTACCTTGTTGGGGAAAAATGTTACTTATACACCAATTTGATACATGACAGGTCAAGTTACTCCTTTTAAATATGCATAGGTGCATATATTTCAGATGCAATAATCTACGCAGTTGTGTGCACTTGTGATTGTGATTACTATGCATCTGCAAAGAAAATTATCGTTGATGAATTTGGCTGCATTATGCAGTAGTGGTTATAACTTATGAATTCATATATTTGTTTTTCCTCTTATTTATAACTGTGTCAGTGGTGTATAGAGTTTAGTGACCGGATAAGTATTTATATTATTTGATTGAAGCATGAGTTTTATTGAAATAATTGATTGTTCTCAAGCACAACCTCATGTGTTGTGACATTGCTATTGTTTGTTTTTTTATTTTGAGATTTTTTTTCTTAATTGATTTGTTTTCTAGAAAACAGGGTGTACAACCTTGCGCATTTTATTTGCAAAATGGACATTGCAAGTTTGGCTCGACGTGCAAATTTGACCATCCTTTGGGATCCATGAGATACAGTCCATCGGCATCTTCTCTCATTGATGTGCCAGTTACTCCATATCCAGTTGGTTCTTTGCTGTCTCAGCTGGCCCCTTCAACAACCTCTTCAGAGCTTCGGCCTGAACTGATGTCAGGGTCCAAAAAGGAATCCTTTTCGGCCAGAATACCTTCTGGAAACAGTTCCGGTACCACTGTGGGTTTAATATTTTCACAAGGTGGGTCTGTTTCCCTATCTGATGTGCAACTCTCAAGTCAGAGTTCTGCCTCTGCTAGCAGTAGCAGAAGCACCAGACAAAGTGGTGAGATACGTTGACATGGCTAGTGCAAACTTGAAAATGTGTCCTCATTATCCATTGGATTGATTTCACAGGCCTCCATTGCTCTGTCTATACTCCTCTGTGCTTTAATTAAAACTGTTCAAAGATTCACTTTCGCTGTTTAGAAATCCATCATCCAATTCGGTTTTAAGAGCCTATACTAGGTCATTCACATTTATGCTCTCATCTGATTATATTATTATTATCTCAAATAAGCTTTAATAGAAAACTTAACACTGTCTATTCTTCGCCCCTTCGGAATGTTTATTATTTTACC