Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29261 LG8 21442754 21446406 probable serine/threonine-protein kinase PBL7
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 21442950 5_prime_UTR_variant
A/G 21443027 5_prime_UTR_variant
G/T 21443255 downstream_gene_variant
C/T 21443345 downstream_gene_variant
G/A 21443579 downstream_gene_variant
G/A 21443590 downstream_gene_variant
G/A 21443773 downstream_gene_variant
T/C 21443787 downstream_gene_variant
T/C 21444009 downstream_gene_variant
T/A 21444221 splice_region_variant&intron_variant
T/G 21444229 synonymous_variant p.Val103Val
G/T 21444265 synonymous_variant p.Gly115Gly
G/A 21444459 downstream_gene_variant
C/G 21444610 synonymous_variant p.Val200Val
G/C 21444653 missense_variant p.Gly215Arg
A/T 21444665 stop_gained p.Lys219*
G/A 21444877 synonymous_variant p.Glu289Glu
T/A 21445042 downstream_gene_variant
A/G 21445043 downstream_gene_variant
G/A 21445214 downstream_gene_variant
T/G 21445515 downstream_gene_variant
A/C 21445553 downstream_gene_variant
C/T 21445568 downstream_gene_variant
G/T 21445688 downstream_gene_variant
T/A 21445706 downstream_gene_variant
A/T 21445721 downstream_gene_variant
C/G 21445790 missense_variant p.Pro312Ala
C/T 21445791 missense_variant p.Pro312Leu
C/T 21445993 synonymous_variant p.Thr379Thr
G/T 21446007 3_prime_UTR_variant
T/A 21446025 3_prime_UTR_variant
A/G 21446029 3_prime_UTR_variant
T/A 21446182 3_prime_UTR_variant
A/T 21446366 3_prime_UTR_variant
A/T 21446373 3_prime_UTR_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29261.1
MGWIPCSGSSNTKKKLKKKLEKMEVQNSLVDPIKTTPGMLKRNSSMNSKDSTKNGNPDHIAAQTFSFRELATATRNFRAECLLGEGGFGRVYKGRLENINQIVAIKQLDRNGLQGNREFLVEVLMLSLLHHPNLVNLIGYCADGDQRLLVYEFMSLGSLEDHLHDISPGKKQLDWNTRMKIAAGAARGLEYLHDKANPPVIYRDLKCSNILLGEGYHPKLSDFGLAKLGPVGENTHVSTRVMGTYGYCAPEYAMTGQLTLKSDVYSFGVVLLEMITGRKAIDNSRSAGEQNLVAWARPLFKDRRKFSQMADPMLQGQYPSRGLYQALAVAAMCVQEQANMRPVIADVVTALSYLASQKYDPNTQTVQSSRLAPGTPPRTKRG*


CDS Sequence:
>Vu_29261.1
ATGGGTTGGATTCCGTGTTCTGGAAGTTCAAACACTAAGAAGAAGCTAAAGAAGAAGTTAGAGAAGATGGAAGTGCAGAACAGTCTTGTTGATCCGATCAAAACCACCCCAGGGATGTTGAAGAGGAATTCATCCATGAATTCCAAAGATTCCACTAAAAATGGAAACCCGGATCACATTGCTGCACAGACATTCTCATTCCGTGAGTTGGCAACTGCTACTAGAAACTTCAGAGCTGAATGTCTTTTGGGTGAGGGAGGCTTTGGCAGAGTCTACAAGGGGCGTTTGGAAAATATTAATCAAATTGTTGCAATTAAACAACTTGACCGAAATGGACTACAAGGGAACAGAGAATTCCTTGTTGAAGTTTTGATGTTAAGTCTTCTTCACCACCCTAACCTTGTCAACCTGATTGGTTATTGTGCTGATGGGGATCAAAGGCTTCTAGTTTATGAATTTATGTCATTAGGATCATTGGAAGACCACTTACACGATATTTCTCCTGGGAAGAAACAACTTGACTGGAACACGAGGATGAAAATAGCTGCTGGGGCTGCAAGGGGATTGGAATATTTACATGACAAAGCTAATCCTCCTGTCATATACCGTGATTTAAAATGCTCCAACATTTTGCTTGGTGAAGGGTATCATCCAAAGTTATCTGATTTTGGTCTGGCTAAACTTGGCCCTGTGGGGGAAAACACCCATGTATCAACAAGGGTTATGGGAACCTATGGATATTGTGCACCAGAGTATGCAATGACAGGTCAACTGACTCTGAAATCAGATGTTTATAGCTTTGGTGTTGTTCTTCTGGAAATGATTACTGGAAGGAAAGCAATTGATAATTCAAGATCTGCAGGAGAGCAGAATCTTGTTGCATGGGCCAGACCCTTGTTCAAAGATCGAAGAAAATTCTCACAAATGGCTGATCCGATGCTCCAAGGTCAATATCCTTCAAGAGGGCTATACCAGGCCCTTGCTGTTGCAGCTATGTGTGTTCAGGAGCAGGCCAATATGCGTCCAGTTATAGCTGATGTTGTCACTGCTTTGAGTTACCTTGCGTCACAAAAATATGATCCCAATACACAGACTGTACAAAGCTCTCGCCTTGCTCCTGGAACTCCTCCTAGAACCAAGAGGGGATAG


Promoter Sequence:
>Vu_29261::LG8:21440754-21442754(+)
TCCAAAAGTAAAACATGTAATGAGGGCTCGAGGGCAGTTTCATAAAGCACACAGAAACACACATACAACATTAACCACTAGACGACCTTAATCTCATTGGCAGTTTAATGCAAATATTAATATTTTTGAATACCTATTTTGAAAATTAAAAATAAAAATAATTATAAAATAATTTTTTTTATAAACTCTTAAACACTTTTCTCACCCATACCCTAATTAAATATTTAATATTAGAAATTATAAAATAAACGATATTTTTATTTTATCCGGGTCTTACATTCATAGTGGCTAGGGTTTGGTTGGAATTAGGCGATTTGGGTTTGATTTATGGGTTTTATGTTGCTTTTCTCTGCTTTGAATTATAGGTTTGTGTTGATGGTGGTGACGGCGGCATGATGACCTGAGGGTTTGGTTGTGGCGCGTTTCATTCTACGGCAGCAGCGACGGTTAGGGTTTCACAGTGGTGGCACAAGGGTTTCTGGCCTTAGGGAAATTAGGGTTTAACGGTGTCCTCCTGTCCTTTAACATTAACATTGTCACATCATTGGATCACAACTACTGCGTCATAAAAAATTGGACAGATCATAGTTGTCACATCATTGCAACATTATGTTTTTAACATCGTAAGGCAAAATGACCAACTTGAACCGTTTTTAAGGAAATATGAGATAATAGTGAACTTTTTTGAAAGGTATGACGACTTTGAACACAATACCCTAAACTAGGGACCAAATGATGTATTAAACATATTTTCAAATTAATAAAATGATATATTACACTTGTTTAACATTAATTCAGGCTTTTCCAATAAAAAATCATAATGAATTTTAAAGAGTACACGTTGAGGAAATGGAAAGTAAAAGAAATTTAAGAAAAACATTACTTTTTCTTTGGTGGATAGGAAATACTCGGACGACTGATTATACCTTCAATCTTCCATTTTTAATTTGTTTAAGTAAAATAAATAATCAGTTCAATATAATAATTAATAGGTTTAATTGCTTCCTTTGTCCCCAGTTTGGTTGAATTGTGTCAAATTCATCCTCATTTTTAAAAAAGTTTCATTGTCGTCCTCACGTGGTATAAAAGTGTCAATTGAATACAAACATAGAAAAAATTTGTGTCAAAGTAGTCATTTTTCCTATATCTCTGTGTCTTCCTTTCATATGTCACTTCTCTGGAGCTATGAAAAGCCTTAAATTGGATAAGGTAAAATGAATATCTGTACTTGATTGTATGAAAGGAAGACACAGATATATAGGAAAAATGACTACTTTGACACAAATTTTTTCTATGTTTGGATTCAATTGACACTTTTACACCACGTGAGGACGACAATGAAACTTTTACACCACGTGAGGATGACAATGAAACTTTTTTAAAAATGAGGATGAATTTGACACAATTCAACCAAACTGGGGACAAAGGAAGCAATTAAACCTAATTAATAATATATTTCATTTTTAGTATAATAAAAAAACATTTCTAATATAAATTATTCATGTACTAGTTTTTAATTAATAGGTTAAGCACATTTAATATATAATAATTATTACATGTTTTTATTAATTATAAATTATTATTATTATATTTTGAAAAAAGAAACACAAATAATAATTATTATAGATACAAATATGGTTAATTATCTCAATTATAAATCAATTTTAAATAAAATTAATAAAATTAAAATTTTTATATTAAAATTATTTATTTTATCATATTGAAAGAAAATATATTAATATTTAATATTTTAAAAAAACATTTAACCTTTCAAATACAATGAAATATACCAACCTTCTTTTTGTGTAATGATAATTGAGGATTAAAAAATATCTTGTAAAAAACAATTTAAGATTAAAAAAAATAAGCTTCTGTGTAATAACCACATAAAAACAATTTTTTAAGTATAACGACCAAAAATTGAAATCAAAGTAAACTATAAAAGCCAAAAACACAATTAAACCTAATTTATATATTTGGACACAGACACTTAAACGACA


Gene Sequence:
>Vu_29261(+)
ATCGTCAAAGGGGATGTGAGCAAGAAGTTTGTCTCAGCCTTGATCCAGTGTGGCGCATCTCAGCCAATGATGGTGTTTTTCCGACCAAAAGGAAACCAATGACGAAATTTCTGCTTGAAAATACTACGAAAATTGAAAACCAATCCTAGACAACCGCACAATCACAAGAGACACTGGTGATTATGATTACATTAAAGCAACACCAAGTGTAAGAGAGAGAATGCTGAGGTGACTCATTTTCATGTGAATTTTGACTGATCCATTGATTCTTCGACAACCATCTGCATATCTGCGTGAAAAGGGAAGAGGGAAAAACAAATTGAAACATGGGTTGGATTCCGTGTTCTGGAAGTTCAAACACTAAGAAGAAGCTAAAGAAGAAGTTAGAGAAGATGGAAGTGCAGAACAGTCTTGTTGATCCGATCAAAACCACCCCAGGTAGCGATGTTGTTGATTTTGTTGGAGTTGGGTGTAAAATCAAGTCATCAATTGTTTGGGATAGCGAGACCCCTCTTGTGAGACTTGTGTTTTCCCTCGATTTCTTTTGTTCCTTTCTTATGAAGATTAATTGGGGTTGAATAATGATAGTAACGATAACATGTCTTCTCTCATTTGTAATGAATGAAATTTTGTGATTTTATGCATGTGGTAGACCAGATTGAGTCCTGGATGAGCCAACTTCTTAGGTAAAGATAGGTTGAATTTCATATAAAAATATGACAGAATGCTTTTATTTAACACTTATGCTCCTCTGTAGTGTTGAATCTAAAAATTTGTGCATTTGATTTCTTTCTTTTAGCTTATTGGTTTTCACAAAGAATACATGTCAGCTAAAAGTTGTACTGATGATGTTAATTTTGAAATTATGCATCCTATGAGACCAAGTCAGTATGTGATTCTTCTTCTGGAATTTGATAAATGAAACATACCATGTGATACTTTTGAACTGTAGACACTGAAGAAACACAAATTGGTGTTGGATGTTAAATCTAAACCGGCTGTTGTTTATATTTCTTCACGCTTAAATCATTAGTTTTTGGAGTTGAACGCAGGGATGTTGAAGAGGAATTCATCCATGAATTCCAAAGATTCCACTAAAAATGGAAACCCGGATCACATTGCTGCACAGACATTCTCATTCCGTGAGTTGGCAACTGCTACTAGAAACTTCAGAGCTGAATGTCTTTTGGGTGAGGGAGGCTTTGGCAGAGTCTACAAGGGGCGTTTGGAAAATATTAATCAAGTGAGTTTGTTTTTCATGATTTCTTCGTTTATGAAGAATATGGAAATTCTTAGGGAAATGAAGAAATGCTTCATTTTTTTTCTTGGTATTCATCATTTCTCTCTCATCCACATTGCTATCTGACAGCCATAGTAACACCTTATGAGTTTTGCCAGCAATGGAATGAGGTTTAAATTTGTGTAGTTTGATATGGCAACATGTTTCATGCTTTCTAACGTTGAATGTAGATTGTTGCAATTAAACAACTTGACCGAAATGGACTACAAGGGAACAGAGAATTCCTTGTTGAAGTTTTGATGTTAAGTCTTCTTCACCACCCTAACCTTGTCAACCTGATTGGTTATTGTGCTGATGGGGATCAAAGGCTTCTAGTTTATGAATTTATGTCATTAGGATCATTGGAAGACCACTTACACGGTATTTTTATTACAAATTTGTATGTCATCTCTTTCAATTCTTTATGTATTGGCTTCAAGTATATATTGTTAATAAATATTTGATACTCAGATATTTCTCCTGGGAAGAAACAACTTGACTGGAACACGAGGATGAAAATAGCTGCTGGGGCTGCAAGGGGATTGGAATATTTACATGACAAAGCTAATCCTCCTGTCATATACCGTGATTTAAAATGCTCCAACATTTTGCTTGGTGAAGGGTATCATCCAAAGTTATCTGATTTTGGTCTGGCTAAACTTGGCCCTGTGGGGGAAAACACCCATGTATCAACAAGGGTTATGGGAACCTATGGATATTGTGCACCAGAGTATGCAATGACAGGTCAACTGACTCTGAAATCAGATGTTTATAGCTTTGGTGTTGTTCTTCTGGAAATGATTACTGGAAGGAAAGCAATTGATAATTCAAGATCTGCAGGAGAGCAGAATCTTGTTGCATGGGTAAGAAAGTCCTACTGTTAGGCCTGACTCGTAATTTATAAGCAGGAACGCTGTATTATAAATCATCCAATATAACACTGGATCGCTTCATTTGCATACTAATAGCCAAAAGGTAGTGTGGTGTGGTTTAAATAAGGGCAGGCAAGTATTTCAATATGAATTGGGCATACCTGGTAAATTTTACTTGCACAAGTGGACTTGTGATAATTTGTGGAAAGTACTTAAAGTCTACCACAATTATCTGTTATCTCTCCGTTTATTGTAAATATTCTGTTATATTGTAAGTAACCAGGTAGAAATGGATTATTTTTTTTATTAGGAAACTATTTGATCTCTTTCCTAAATATAGGACTTGCAAGTTCGTTATTTCATTTTTCATAGGGATTTGCTATTAGGGCAACCTATGGTTTTGCTCCCTTTTATAAGAGGTGTTTTGTATCTTTTCTCAAACAGTTCAAAATATTACCTCCCAGGTGAAATCATTTTCAGTCAAATAGTTAATAGTTCTCAGTTATAGATCATTAGCGATGTATAGATCATTAGCGATGTACATTGCTTTCAAGAAGAAATGGTAATTCAAAAGTTCTTTCAACTTGATATTTTCTTCCGTTTTCTTTTTTTCTTTTCCTTTCTTTTGGTAGGCTTTCTGATTTCATCATCTTTATTTTGTTCCCTTCTCAACAAAATCTTGTCATAAAATGAAATTCCTACCGTGTTGTTGAAATTGGTGCTCAAAGTTCTGCATATCCCATAAATTTTCTGACTGGCTTTACCGTATTCAATTGTGATTTTGAAATTTGATGCCTTGTGTTTTCTCCTTATTTAAGTAATTTGATTAAATTGCAGGCCAGACCCTTGTTCAAAGATCGAAGAAAATTCTCACAAATGGCTGATCCGATGCTCCAAGGTCAATATCCTTCAAGAGGGCTATACCAGGCCCTTGCTGTTGCAGCTATGTGTGTTCAGGAGCAGGCCAATATGCGTCCAGTTATAGCTGATGTTGTCACTGCTTTGAGTTACCTTGCGTCACAAAAATATGATCCCAATACACAGACTGTACAAAGCTCTCGCCTTGCTCCTGGAACTCCTCCTAGAACCAAGAGGGGATAGTGATATGGAGCTCAATGTTTTTTAATGGTAGTCTGGTGCAAATTTCAAACATCTTACCGTATACTGAAATATATATAGATTTGTAGATGTTAATACTGGTTGTCTTATGGTGGTGTTTTTCGTTCAGAGCATAGTTGCTAAAATTGTTGTAAAATTTTGTTGTACTTCTGGTGCACTTAAGTGCTCCTATTTTCCATTTGGAGCCAAGATGGAATATCCACTTCCTTTTCCCTTAGTTTCGATTTTTAAAGCAAATTACTGGATTCATGATTCATGTTCCTTCTTTCTTGGCATAGTTGTAAATTTTTCTTTATCCTGGTCGTTTGTACAGTAACGAAAGCTCTGTAAAATTTGGCTTTTAAAACTAAGGAAGTATAACATAATATCATGTGTTATCTCCT