Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29250 LG8 21047092 21051923 PREDICTED: protein REVEILLE 8-like isoform X3
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 21047229 intron_variant
T/A 21047275 intron_variant
T/G 21047277 intron_variant
C/A 21047286 intron_variant
G/T 21047290 intron_variant
G/T 21047297 intron_variant
C/T 21047303 intron_variant
T/C 21047515 intron_variant
T/A 21047539 intron_variant
T/A 21047544 intron_variant
A/C 21047709 intron_variant
C/A 21047918 intron_variant
A/T 21048225 intron_variant
G/T 21048821 intron_variant
T/A 21049568 intron_variant
A/G 21049569 intron_variant
G/A 21049700 intron_variant
A/T 21049708 intron_variant
C/T 21049800 intron_variant
C/G 21049807 intron_variant
A/T 21049812 intron_variant
A/T 21050018 intron_variant
T/G 21050357 missense_variant p.Gln131His
T/A 21050416 missense_variant p.Thr112Ser
G/T 21050453 intron_variant
C/G 21050471 intron_variant
C/T 21050561 synonymous_variant p.Val89Val
A/C 21051007 intron_variant
T/C 21051008 intron_variant
G/T 21051079 intron_variant
T/G 21051152 intron_variant
T/A 21051156 intron_variant
T/A 21051161 intron_variant
A/T 21051198 intron_variant
T/A 21051256 intron_variant
A/G 21051309 intron_variant
T/G 21051336 intron_variant
C/T 21051867 synonymous_variant p.Ser19Ser
G/T 21051889 missense_variant p.Ala12Glu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29250.1
MNSNTSNSQSMAVAASDVSGKKVRKPYTITKSRESWTEEEHDKFLEALQLFDRDWKKIEDFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVQKNGTVAHVPPPRPKRKAAHPYPQKASKNVLVPLPASIGYTSTNMLAPGFAKWDETSLLMNTGVSKSMTCQDELNSIRGNEADIGSKGITKITNSILSGVRNSTRTLQTSEIPKQGKQAPVIHGLPDFAEVYSFIGSVFDPDTNDHVQKLKEMDPINFETVLLLMRNLTVNLSSPDFEPIKKALSAYDVNGMAVGVGTGIDVKKQTNDLSCQTA*


CDS Sequence:
>Vu_29250.1
ATGAACTCCAACACTTCGAATTCTCAGTCAATGGCGGTGGCGGCGAGTGATGTGTCGGGGAAGAAGGTGAGGAAGCCTTACACCATAACCAAGTCAAGGGAGAGTTGGACCGAGGAAGAGCACGACAAGTTTCTTGAAGCTCTTCAACTATTTGACAGGGATTGGAAAAAAATTGAAGATTTTGTAGGTTCAAAAACAGTTATTCAGATTCGAAGCCATGCTCAGAAATACTTCTTGAAAGTTCAAAAGAATGGGACTGTGGCTCATGTGCCTCCTCCCCGTCCTAAGCGAAAAGCTGCTCATCCTTACCCACAAAAAGCATCAAAAAATGTTTTGGTACCACTACCAGCTTCCATTGGTTATACTTCAACAAACATGCTTGCACCTGGCTTTGCCAAATGGGATGAAACCTCCTTGCTGATGAATACAGGAGTCAGTAAATCCATGACCTGTCAGGATGAACTCAACAGTATTCGTGGAAATGAAGCTGATATTGGATCAAAGGGGATAACAAAGATTACCAACAGCATTCTTAGTGGTGTCAGAAATTCTACTAGAACACTACAGACTTCTGAGATACCAAAGCAAGGGAAACAAGCTCCGGTTATTCATGGTTTGCCAGATTTTGCTGAAGTTTACAGTTTCATTGGAAGTGTATTTGATCCAGATACAAATGACCATGTCCAAAAGCTGAAGGAAATGGATCCTATAAATTTTGAAACTGTTTTATTGTTAATGAGAAACCTCACTGTCAACTTGTCTAGCCCTGACTTTGAACCCATCAAGAAGGCATTGTCAGCATATGATGTGAATGGCATGGCAGTAGGAGTTGGTACAGGAATTGATGTGAAGAAGCAGACAAATGATCTATCATGTCAAACTGCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_29250::LG8:21051923-21053923(-)
TCCCTGAGATTTCACATGAAGGTTGTATCCGAATAATTGAGTCTAGAACGAGTCTTTATATCTGATTTGATTGTTTTCATGAGTGAGAGTTGCATGATAATATTTCTATGTTTGTTTTATGAAAACTCTTTTGCACATTAACTTACCCTATTGTTTTTTTTTTTTACGTTTTTTGTGTGTTTGTTTGTTTCTTTTGCGAAGATCACCTTATTGGTGTGAGCGAATGAGGAATATTTGTTGAAGTATATATGGTGAAAGACGATGATGTTATAGAGTTTTCTTCATGATCTTCTAATAGTTTTTCTTAGTTGTCTTATATATATTTTATTATTATGGTATATTTTTAGATAAAAAAAATATCTATTTTATTTTTTTCAATTTTATAATGTCTTATGTAAATTGTAAGTAACTAAAAATGAAATGTTACAAATAAAATTTAAATTACTTTTATTAAATATTGATATATCTTTTACATTTAGAAGATTCATCATTAAATATTATTTAATAACTTTCTTAAATAAGTTTTTCCAAATATTATTAGTTAAATTTATTAATTTATAATTTATTAAATAAGGTTTTTGGGTATTGGGTTCGTAGCAAACGGAATTCTCTGTAATTTTCCAAGAAAATTTACAAACATAAAAGGTTATATTTTTTTATTAATCACAAAACTACAAAAATTTAACTTTTAATTTGAAAAAATATATTTTTTCTTATGTTTCAATTTAAAAAAAAATATAGATAAGTTTATTAATAAATAATCTTAACAAAAGTTTTATTTCAATTATTATAAAAAACAATTATTTTCTGTAAACAAAAATGTCAAACCAAAATTTAATTAAAAAAAAACAAATTGTAGCTGGTTTCAATTGAATGTGGACAGGTTAAAGAGGCTGCTGTCCACCAAATTCTACCTAACACAATATAACGTTTTACCAAAGTAAGTATTTTATAAAGCATGCTATATCAGGAAATCCAACCCCATAAATCAATTTTTTTTATAATAGCAAGGAAATTAAGTTGAGAAAATGTGGTGCAGCGCACAGTCGGCAGCCTACCCTAAAAAGCAGAGGGAAATAGTGTTTCAGAAGTGGATAGGATTGTTCCACGTGTCGCAACACCGTTGGAGACAAAAAGTTTGCGTAGGCGATGGGTAACAAAAACAAACGAGAAGTGTTTGGCTGTCGAAGAAGGACCACCACATATTAAAAAAAACGTCAAATTATTGGGAGCCGCAAGATCCTTGTGGGCCCACTCCCTTACTCCCACCATTTCCACGCTGGCACTCTCCTTCACCAAACTCCATGGGATGCGACCCACATCACTTCTTCCCATTTTATTTTACATAAAAATACAATTTTGTTTTTAAATTTTAAATATTTAAAGATTATAAGAAAATCTTCCTCATCAAAACTTTTTTTAATTGAGAAGTTGGTCAATTAGATCAACATCCTCAACACAATTAAGGAAATTAATAAGATGATTTATCTATTTAATTGAAAAGTTGGTCAACCAAGTAAAATACAGATTTTGCAAGGGTGAGTAATCTCAACATTTTCCTTCAACTATCATTTTTTAAGTTTTGTATTAAAATTAGTTAGATTGTTTTAATGTTGTTGAATTTGTATGGATAAGCTTGCCTAACTAGTATTAATATAATGGAGGATGTGATAATATTTTGTTGTATGGTTTTTTAGGAAAGTAAAATATATGTATTTTTGTAGTACGGATTTAAAAGTGGAAGAAAATGAGAAAGATGGACGTATGGTGTAAGAAAAATTGTGTCCCGATGGGACCGGACAAGGGACGATGAAATGAGTTTAGTGGAAGTTGTGTTGTGTTGGGACAATTGGTGGCTCTCAAATTCTGCACCGCACATATACCCACCCTGCTTGCCACGCCACATTCATCTCACCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTTGCTTTCTATCTCTAAGCACCTGTGTGTAGAGAGTGAGTCTATGTTATTTGTGGCGGAGC


Gene Sequence:
>Vu_29250(-)
ATGAACTCCAACACTTCGAATTCTCAGTCAATGGCGGTGGCGGCGAGTGATGTGTCGGGGAAGAAGGTGAGGAAGCCTTACACCATAACCAAGTCAAGGGAGAGTTGGACCGAGGAAGAGCACGACAAGTTTCTTGAAGCTCTTCAACTGTGAGTCCGTTACCTTCTTCCCATCATAACTTCACTTCCTCTTTTTTTACTTTCATTCAACATGACTATGTTTGAGCTTCTTATCGCTAATTCAGTTGTTATTTTTTTTTTTTTTCAATTATCCTCATTTCCATGTCTTTCTTTATGTACGACCAAATCATAGCATTTGGCTACAGTTTCTAATTAGTTTTGGTCTCTCAGGAAACCCAATTGAGGCTGCATCAGTAGTATTCCTGTGCATCATTCTTGATTTGGTTATCTTTGTATTTCTGACGTGAGGTCACTAGGGAAATGCTTCTGTAGACAAATCTTAATAGGGTTTTGGCCATGATTCCGTGCTTTTCATCAGTGTGAAGGTTCTTCCAGTGCTACAAGTTTATTTATGTCTTTTCTCACCTAGATTTTGGATATTAGTTATTGAGCCTGTGCATTGGATTAATTTGCTAAACTGAATCAAAATTCTTCTAAGAGTGATCCAGAACAATTGTTAACACCTGTGGTTGAAAAACTCCTCTTAGAGAAAGTAATGAAATGGATAGAGGATGGCGTCACATCAAATAAGGATAAGGTCAAATCTTAATATTTAAGTAGAGTGTGAACCTTATTTTAGGTCAAGCTAGACATAAACTTAAGAATATCTAATTTCATATTCGAGATGTTGATTTCTCTGGATAAGGAAGTGTCTTGGAGATTCCCTCTATTGAGGATATGACCAAATCCTAATGTATAAATGAGATACAAACCTTACTTGTAAGTCAAAAGAGAGATGGAAATTTGAAAACTTGAAGATTAGTTTGATTCTTGGATTGTATGATATGGAAGAATTAGGAGAGGGTAGAAATGAAATGTACTCATCTTCAGTGTAAGCTGTAATTTTGGCTGAAACTGTATTTCAGTGTGTTTGTGCTCTATTTCCAATCGTCTCAACTTTACAATTACTTTAAAACAAGTGAAGTGGTCTGCAATCCAGCCATTGACTTCATGTGGATTATTCAGATTTGACAGGGATTGGAAAAAAATTGAAGATTTTGTAGGTTCAAAAACAGTTATTCAGGTTTGAAGTCTGTTTTTCAGTTCTCTGTTTATATTTTCTTTGTCGTGTCTATATTCTACTCGGGCATTATTTGTCACTAACTAATAATTTTTGTTAGATTCGAAGCCATGCTCAGAAATACTTCTTGAAAGTTCAAAAGAATGGGACTGTGGCTCATGTGCCTCCTCCCCGTCCTAAGCGAAAAGCTGCTCATCCTTACCCACAAAAAGCATCAAAAAATGGTTTGCTTCCATTTCAGATAGTGATATTGTCTGTTCCTAAAGGCACCACATTTAATGAAACTTTTTGATTTTCTAGTTTTGGTACCACTACCAGCTTCCATTGGTTATACTTCAACAAACATGCTTGCACCTGGCTTTGCCAAATGGGATGAAACCTCCTTGCTGATGAATACAGGAGTCAGTAAATCCATGACCTGTCAGGATGAACTCAACAGTATTCGTGGAAATGAAGGCATGCGTACTTCGTTTTGTTGTTAGTTTCAAGCCAATAATCTGCATTTAATACACTAAATGGGACTGTCCACCACTTATTATGTTATATGACGTTACTGATTCAGCTGATATTGGATCAAAGGGGATAACAAAGATTACCAACAGCATTCTTAGTGGTGTCAGAAATTCTACTAGAACACTACAGACTTCTGAGATACCAAAGCAAGGGAAACAAGCTCCGGTTATTCATGGTAATTTTCTGATGTACTGAATTTTTCTTTTATATTCATTTTCAGATTGAATTTAGTAACGGATCATCATTTGTCATTTTGACCATGTTTCACAGGTTTGCCAGATTTTGCTGAAGTTTACAGTTTCATTGGAAGTGTATTTGATCCAGATACAAATGACCATGTCCAAAAGCTGAAGGAAATGGATCCTATAAATTTTGAAACTGTGAGTTGAAGAACTTTGTTGCTGTAATTTGTCTGTCTTGAATTTATTCTTGACATACTGAGACATGTTCAAATTTTCCTTTACATCGAAACTTACTGCAACAAAGTATAAAATCATTCATATACCTTCACCTATCAGCTTTAGTTTTAGGATAGCTCGCTCATAACACTGTACAACACTTGCATGTCTATATGGTTTATTATTAGAGCCTATAAATTGGTCACGCTTAAGCCCAAGGAACACTTGCAGGAAGAGGTTTACTACACATATAATATAAAACTTATTCATGTACTTTTGCCAAATAGTTTAAGCTTTTGGGATAATTAATCCATGACATTTATAATGAAAGTTGTGATCATTATAAGTTCTTGGTTACTGACTTCCGTATATTTGCTGTTCCTCTGCAGGTTTTATTGTTAATGAGAAACCTCACTGTCAACTTGTCTAGCCCTGACTTTGAACCCATCGTAAGTTTCTATATCAATCCAACGATGACTACATAGTTTTTCCATAATTGCAAATAAAGTTAAATTTTGTTTGAATTGACTGGCCTGCAATATTTTGCATGATGATTAATCGTTTTAATTACTATGGTTCATGAAGATAAAATGCCAAATCCAAAGATAATACTTTGACTTTACCATATGTACGGTGTGCATCTCCTTGATGTTTTATGTGTGTGAGAAATTTAAACAAGAGCACGTTGATCCAGTTAGGAGTAAATGTATAATTAAAACCATTTGTGTTTTCACTTAATAGCTTAATCATTCAGGATTATTGGTTTATGACATGATATCTAGAGTTCAATCCTTGCCTTCCCCATTCTTCCGATACAATAGTTCCATTTCAGAAAAGGTGATATTCTTCAAGCTTTAAGCCGAAAACTGAGAGAGGCCATGTTAGAAATATAACATAAAACCATCATTCAAATGTCTTTTCCTAATCTTGTTGATGATAAAACGATTCATCGGGGGGGTGTCTTAGAAATGTTATATAATATGAAACCATTCTTGGTCATCACGTAACAAGTCTTAATTTTTCTGGATTGTCACAGTTTTTGTCATTATTACTACAAAATTGAGTAGCTAGTAGATAGGAAAAAACAGGAAAAATATTCAAAGGGGAGGTCACCCCCCTCACCACACTTTGTTCTCACATTTTCTTTTTCTTTTTGACTAAAAGTGATAGAATGGGGAAGCACCCCAATATTACTGGGGAAGGCACCAATGGCATGCTGGCCTACCCAGAGGATTACTGCACAGACATAAACAGCAAAAAAAATTATCTGTCACAACTACTCAACTAGCCCTTAAATGGAAGGGAATCTCGGAGGCCTCGACTTGTTCTCACTTTCTCATCACATGTAATAGGATTTCCATGTTATAGATATAGGCTCTTGTATTAAATTATGATTATCCCCTAATTACTTAACAAATTAAAGTAGTTATATATGAGATTAATAAGTTTGTGTAAACTTCTAGGTGTTTTAGTCTACTGAAAGTTTCCAAACAAAATCAAGTAATACTCAAATCCTCTCTATAAAAATTATAGTAATATCTTTAGGAGTCATTCTTAAAAAATACTGATAATTTTTTTAAAAGATAGTATGAGATTATTTGACAAAATGAAAATCAATTATATGCTCGATTCTTTTTCGATTTTAACTATATTAATACAATTTATATATTAATAAAACTTTATTAGTTATAAACTGTAATAAAATAAATATTTATCATGTACATTATATAGACTAAAATAGGAGTTTGATAAAATTAAGATGTACTTATCTTTTAATTATGATTTTTTTTAATGGGGGTCTAAATACCTTTGTTCATCAAAAGACAAAAAGATGAATATTCATTATGAAATTATTTTCCTTTCAAAACAAAAATGTAAACTTAAAACAAAATTTGCATGTGTGGGAAGTGATTGCCCCTTGTCAATATAACTAGGGGTGTGGACAAAATCTTTCATGGCTCAGTACAGGAAGTTTAGGTATGGCTTGTGAAAAAATTGTTCAAGCTTGGTTCATTTATTTGACTTGTTTAACTAATTGAAAAATGTATTGTTTTTGTTTTTATGAATATTTTTCTGAAACTACTTTTATTTTGTACTAAATGATAATCTACATATAGAGATGTGTGCTTCACATGCAGGTACGTGGAATTCAAACATTCTAGATTATTATATTCCCACAAAAAATTAGAACTTCTTGACTGTAAAAATAAGAGAACTTCAAAAAACAAAGTTTTAAGTATTTCCAACACTAAATATATAAATTAAAACAAAAGAGAGAGAAATTTTTTCATCAATTTAAATAAATGAGTTATTTATGAGTAGTCTTGCATTATCTTGGCCCATTTAAATAATTAAACTCAATCTCAAATTTATATATTTAATTAAATGAACGAACTTGATCAAACATTTGTTCAGTTGAGCTGGAATAGTTGAACAACTAACAAAGTTAAATTAATAATATGACAAGACAACATCAAATTTCACCTCTGTTTACTTTTTGTTTCAAAGTGCACCTCGTGATGCTTAGTCATTGTCACAACGAATGAAGCTGACTGTGAACTTTGTGAGTCTGTGAGTATGAAAGTTGACTAGTTTTATGTGTACCCTTTTGTTCAGAAGAAGGCATTGTCAGCATATGATGTGAATGGCATGGCAGTAGGAGTTGGTACAGGAATTGATGTGAAGAAGCAGACAAATGATCTATCATGTCAAACTGCTTAA