Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29177 LG8 19068054 19070365 PREDICTED: uncharacterized protein LOC108324372
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09182 Protein families: genetic information processing   C 03000 Transcription factors [BR:ko03000]
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 19068365 upstream_gene_variant
A/C 19068428 upstream_gene_variant
T/C 19068440 upstream_gene_variant
A/G 19068545 missense_variant p.Ile128Val
T/C 19068657 missense_variant p.Met165Thr
A/G 19068759 missense_variant p.Gln199Arg
C/G 19068966 missense_variant p.Ser268Cys
A/G 19068970 synonymous_variant p.Thr269Thr
T/C 19069075 synonymous_variant p.Pro304Pro
G/T 19069076 missense_variant p.Val305Leu
C/G 19069082 missense_variant p.Pro307Ala
C/T 19069157 missense_variant p.Pro332Ser
A/G 19069528 synonymous_variant p.Leu455Leu
C/T 19069531 synonymous_variant p.Pro456Pro
T/G 19069532 missense_variant p.Leu457Val
C/T 19069762 synonymous_variant p.Asp533Asp

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29177.1
MSSSSQEHKSNGNEENNLRKGQWTEEEDAILAAYVREHGSGNWNTVQQNTGLLRCGKSCRLRWTNHLRPDLRRGAFSIEEQNKVIGLHALMGNKWAKMALELPGRTDNEIKNFWNTRLKKRKRVGLEIYSDGIEPVFDAHNTETSLATNTHRDSEVVGTSSQHAMLNHSGNTQNQPPRVQPISMVRENMNLSVEPEENQMHDVIQHDVIQHDVIQASTSSCVPHVVFNNSSNTQNQPLYAQPTSMVRGNMNLSVKPEENQMHVVTQASTSSCVPHVVFNNSSNTQNRPLYAQPTSMVRGNMNLPVKPEEKQMYDVPQACTSSCVPHVVFNNPSNTQNRPLYAQPTSMVRGNMNLPVKAEEKQMYDVPQACTSSCVPHVVFNNPSNTQNRPPYAQPTSMVRGNMNLPVKPEEKQMYDVPQACTSSCVPYVFNNSSNTQNRPLYAQPTSMVRGNMNLPLKAEEKQMYDVPQACTSSCVPHVVFNNPSNTQNRPLYAQPTSMVRGNMNLPVKPEEKQMYDVPQACTSSCVPHVVFDNSNNTQNQPLYAQPIFEEHHDLCSDWLSRDWAYDDYAELPPFLPSCDDYAKLPPLPLSCDDLPFAESMSLRENSEAETNRYYEPRSPRSNGYLETMFYPPKVSQEPDDFPMQGELNVGNSGEISDQKKPEDEDEDDLGDVIWIENQHGPYKDSSCGYVHPFLKP*


CDS Sequence:
>Vu_29177.1
ATGTCCTCGTCCTCACAAGAGCATAAAAGTAATGGTAATGAGGAAAACAATCTAAGGAAAGGGCAATGGACAGAAGAAGAAGATGCAATACTGGCAGCATATGTGAGAGAACATGGATCAGGAAATTGGAACACAGTGCAGCAAAACACTGGACTACTTCGTTGTGGGAAAAGTTGTCGTTTAAGGTGGACAAATCATCTAAGACCAGATCTGAGGAGAGGTGCATTCAGCATAGAAGAACAAAACAAAGTCATTGGGTTACATGCGTTGATGGGAAATAAATGGGCCAAAATGGCACTGGAGTTGCCAGGACGAACAGACAATGAAATCAAGAACTTTTGGAATACTAGATTAAAGAAAAGGAAACGAGTTGGCTTAGAAATCTACTCAGATGGCATAGAACCTGTGTTTGATGCTCACAACACAGAAACCAGTCTAGCTACCAACACTCATCGTGACTCAGAAGTAGTAGGTACATCATCTCAACATGCGATGCTCAATCATTCCGGTAACACTCAAAATCAACCACCCCGTGTACAACCAATTTCTATGGTTCGTGAAAACATGAATTTGTCTGTGGAACCTGAAGAAAACCAAATGCATGATGTCATTCAACATGATGTCATTCAACATGATGTCATTCAAGCATCTACATCATCTTGTGTACCACATGTGGTGTTCAACAATTCCAGTAACACTCAAAATCAACCACTCTATGCACAACCAACTTCTATGGTACGTGGAAACATGAATTTGTCTGTGAAACCTGAAGAAAACCAAATGCATGTTGTCACTCAAGCATCTACATCATCTTGTGTACCACATGTGGTGTTCAACAATTCCAGTAACACTCAAAATCGACCACTCTATGCACAACCAACTTCTATGGTACGTGGAAACATGAATTTACCTGTGAAACCTGAAGAAAAGCAAATGTATGATGTACCTCAAGCATGTACATCATCTTGTGTTCCACATGTGGTGTTCAACAATCCCAGTAACACTCAAAATCGACCACTCTATGCACAACCAACTTCTATGGTACGTGGAAACATGAATTTGCCTGTGAAAGCTGAAGAAAAGCAAATGTATGATGTACCTCAAGCATGTACATCATCTTGTGTTCCACATGTGGTGTTCAACAATCCCAGTAACACTCAAAATCGACCACCCTATGCACAACCAACTTCTATGGTACGTGGAAACATGAATTTACCTGTGAAACCTGAAGAAAAGCAAATGTATGATGTACCTCAAGCATGTACATCATCTTGTGTTCCATATGTGTTCAACAATTCCAGTAACACTCAAAATCGACCACTCTATGCACAACCAACTTCTATGGTACGTGGAAACATGAATTTACCCTTGAAAGCTGAAGAAAAGCAAATGTATGATGTACCTCAAGCATGTACATCATCTTGTGTTCCACATGTGGTGTTCAACAATCCCAGTAACACTCAAAATCGACCACTCTATGCACAACCAACTTCTATGGTACGTGGAAACATGAATTTACCTGTGAAACCTGAAGAAAAGCAAATGTATGATGTACCTCAAGCATGCACATCATCTTGTGTTCCACATGTGGTGTTCGACAATTCTAATAACACTCAAAATCAACCACTCTATGCACAACCAATTTTTGAGGAACATCATGATTTATGCAGTGATTGGTTATCGAGAGATTGGGCGTATGACGATTACGCAGAGCTGCCTCCATTCCTACCATCATGTGATGACTATGCAAAGCTGCCTCCATTGCCACTATCATGTGATGACTTACCATTTGCTGAGTCAATGAGCTTGAGAGAGAATTCTGAGGCTGAGACTAACCGGTATTATGAACCACGTTCTCCACGTAGCAATGGGTATTTGGAAACTATGTTTTATCCACCAAAGGTTTCGCAAGAACCAGATGATTTTCCCATGCAAGGGGAGTTGAATGTGGGAAATTCCGGAGAAATTTCCGACCAGAAAAAACCTGAAGATGAAGATGAAGATGATTTGGGTGACGTGATTTGGATAGAGAATCAACATGGTCCTTATAAGGATTCTTCATGCGGCTATGTCCATCCTTTTTTGAAACCTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_29177::LG8:19066054-19068054(+)
GATTTGTTCCAATTATTACTGTTTCAATTTGATCGATCAAAGTAACATGTTATAACAATCTCAGAAGAAGAGGGTGAAAAAAAAGTTAAGTGAGTCAATGAGCCAACCCGTTTAATCCATCAACTTGTGATGGGTCGGGTCGGATTCAAATTTTTTCAACTTGTTAATAAATGAGTCAGGTTGGATTGACTCACTAAGTAACTAATTCGTGGTGGGTCAGGTTGGGTCGGGTCGGGTCGGGTTACCCGTTTTGACGTTCTACCTTCAGTCAAATGAACTTTTTAATTATGAAAGAGATTAATTATTTGGGTTAAAGGCATGCTATTACATATTTGTATCCTTTATTTTTATGCTAAATATTTCAAAATTCATCAAATACATTAGTGTAACATTTTTTTTTACCAGCACGTTACCGTCATATGGAATTAATAACTAATAATGTAATTTTTAAAAAATTATATATGATTCATGCTTTCTTTTGAAATATATTTTTCATTAACGATTCCGTAAATTACTATCAATAATTAATATTTAAAATGTATAAGAATAAATATAAATGTTTATATAATTTTAATTTTGTATAATTATTAGGAATACTTATAAATATGACATTGGAATAATTTTATTATATCAATAAATACATTAATCCCATTTGTTGCACAGAAAAATATTAGTAAAATTTATCTGGGACTACATAGAAAAAATAATAATATTTAATAAAAATTGAGAATATCAATATTTTTAAATGATTAAAACTCCTAGTATATATAACTTTTTTTTTCCAAAATTATCTTTAAATATAACTATTTTTTCTAAAATATAAAATTATGTGTCCTTAATTTTTTTCGTTGTATTTAACTTATAGTGACTAAATAAAAAATAAAAAATAAAAATATTTCTGTTAATTTTTTAATTGCCATATTGATTCATATTATTTTTTAGAATTTTAAAAAGATTGCAAACATACTTGTAACACCTTTTGTACACTATAAGTATTTTATAATTTTATTCTTCCACTCATTGATTTTAGTATGTAATCATTAATATTTAGTATATATCTATTTATCTCTCTCTATATATATTATATAATTTATCTTGACATTTATCTTTTTTTTGAAATTTGATTTTAAAAAATCTTAACCACATAAGGATTTGAATATTTTGGGAAGATTTTATTATTAAATCTTAACCATCTACTAGATAAAAATTTCGTTCTTATAATTTTGTGTAATTTTTTTTAAGAAGAGATAAAAGTTTATTAGATCATTTAAAATATAACTAGTTTACAATTTAAAATTTAATTTTTTTTATATTATTATACTTAAATTTCATTATCTTGTTATATTAATATAATAACAATATTGATATTGAAACTGATTGAAATACTGATAGCAGTTATTATTATGAGAATATTAATTGATATCAGTTATTATTGTGATAATATTAATTGATAAGGGAAGATATAGCAAATTCAGATAGTGTTACTCCTTTAAATACAACACCTCCTTCATAATTAATAACCTACTGTACACAATAAATCTGAAGCGTAAACAGTTATCTATATGACGAGATTTTCATTATGATTACTGCAATCATAGTAGCAACCTTTCTCCTACTTGTTTAGAGGTTTTTTCTTTCATTTGTTTTTGCTTTATAGTAACCAAGTACATTCTATGCATATTTGTTTTGAAACTTTTCATAAGATTTATGTGTTGGATTCCAACTTACATCATGCAAAACCATGCAAATGTAGTTCTCGCAGGTTGCTGTGCCGTACGTGATTTACAAAGTTGAGAGTGAACAAATTGTTTTTTACAGTTCAAAGCTGCAAGATTTCAAACAGTATCAGAAACTAGTGTCAGTGATCATATAGGTTGAACTATGGTTGTAATGTTGTATGTGTTGATACACTTCTTATAACATTATTAAAAATGGTGATTTCTATTTTACCGTGTATTATATTATTCACTAACTTTGATTTCTTTATTTTATAGCAACCA


Gene Sequence:
>Vu_29177(+)
ATGTCCTCGTCCTCACAAGAGCATAAAAGTAATGGTAATGAGGAAAACAATCTAAGGAAAGGGCAATGGACAGAAGAAGAAGATGCAATACTGGCAGCATATGTGAGAGAACATGGATCAGGAAATTGGAACACAGTGCAGCAAAACACTGGACTACTTCGTTGTGGGAAAAGTTGTCGTTTAAGGTGGACAAATCATCTAAGACCAGATCTGAGGAGAGGTGCATTCAGCATAGAAGAACAAAACAAAGTCATTGGGTTACATGCGTTGATGGGAAATAAATGGGCCAAAATGGCACTGGAGGTTTGAATAATGCTCTTTTACTTCACGTATTTTCTTTCAAAAGCACTCATATATTCATCAAGAGTTACTCAAATGTTATGTTATATATGCTCTTCCATGTTTTGGTTTAGTTGCCAGGACGAACAGACAATGAAATCAAGAACTTTTGGAATACTAGATTAAAGAAAAGGAAACGAGTTGGCTTAGAAATCTACTCAGATGGCATAGAACCTGTGTTTGATGCTCACAACACAGAAACCAGTCTAGCTACCAACACTCATCGTGACTCAGAAGTAGTAGGTACATCATCTCAACATGCGATGCTCAATCATTCCGGTAACACTCAAAATCAACCACCCCGTGTACAACCAATTTCTATGGTTCGTGAAAACATGAATTTGTCTGTGGAACCTGAAGAAAACCAAATGCATGATGTCATTCAACATGATGTCATTCAACATGATGTCATTCAAGCATCTACATCATCTTGTGTACCACATGTGGTGTTCAACAATTCCAGTAACACTCAAAATCAACCACTCTATGCACAACCAACTTCTATGGTACGTGGAAACATGAATTTGTCTGTGAAACCTGAAGAAAACCAAATGCATGTTGTCACTCAAGCATCTACATCATCTTGTGTACCACATGTGGTGTTCAACAATTCCAGTAACACTCAAAATCGACCACTCTATGCACAACCAACTTCTATGGTACGTGGAAACATGAATTTACCTGTGAAACCTGAAGAAAAGCAAATGTATGATGTACCTCAAGCATGTACATCATCTTGTGTTCCACATGTGGTGTTCAACAATCCCAGTAACACTCAAAATCGACCACTCTATGCACAACCAACTTCTATGGTACGTGGAAACATGAATTTGCCTGTGAAAGCTGAAGAAAAGCAAATGTATGATGTACCTCAAGCATGTACATCATCTTGTGTTCCACATGTGGTGTTCAACAATCCCAGTAACACTCAAAATCGACCACCCTATGCACAACCAACTTCTATGGTACGTGGAAACATGAATTTACCTGTGAAACCTGAAGAAAAGCAAATGTATGATGTACCTCAAGCATGTACATCATCTTGTGTTCCATATGTGTTCAACAATTCCAGTAACACTCAAAATCGACCACTCTATGCACAACCAACTTCTATGGTACGTGGAAACATGAATTTACCCTTGAAAGCTGAAGAAAAGCAAATGTATGATGTACCTCAAGCATGTACATCATCTTGTGTTCCACATGTGGTGTTCAACAATCCCAGTAACACTCAAAATCGACCACTCTATGCACAACCAACTTCTATGGTACGTGGAAACATGAATTTACCTGTGAAACCTGAAGAAAAGCAAATGTATGATGTACCTCAAGCATGCACATCATCTTGTGTTCCACATGTGGTGTTCGACAATTCTAATAACACTCAAAATCAACCACTCTATGCACAACCAATTTTTGAGGAACATCATGATTTGTAAGTAGTAACATTTCTTTAGTTGAATTGCAATATTTTTATGATTGTTGCCTTCTTGCATTAGAGTCACTTATTCATCTCAAAATAACAAGTTTTAGTAACTGATAGATGCAGTGATTGGTTATCGAGAGATTGGGCGTATGACGATTACGCAGAGCTGCCTCCATTCCTACCATCATGTGATGACTATGCAAAGCTGCCTCCATTGCCACTATCATGTGATGACTTACCATTTGCTGAGTCAATGAGCTTGAGAGAGAATTCTGAGGCTGAGACTAACCGGTATTATGAACCACGTTCTCCACGTAGCAATGGGTATTTGGAAACTATGTTTTATCCACCAAAGGTTTCGCAAGAACCAGATGATTTTCCCATGCAAGGGGAGTTGAATGTGGGAAATTCCGGAGAAATTTCCGACCAGAAAAAACCTGAAGATGAAGATGAAGATGATTTGGGTGACGTGATTTGGATAGAGAATCAACATGGTCCTTATAAGGATTCTTCATGCGGCTATGTCCATCCTTTTTTGAAACCTTAA