Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29132 LG8 18575457 18576107 PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor 1B-like
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04016 MAPK signaling pathway - plant [PATH:ko04016]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 18575513 synonymous_variant p.Ser19Ser
T/A 18575516 synonymous_variant p.Pro20Pro
T/A 18575557 missense_variant p.Met34Lys
T/A 18575560 missense_variant p.Leu35His
A/G 18575591 synonymous_variant p.Glu45Glu
C/T 18575780 synonymous_variant p.Asn108Asn
G/A 18575801 synonymous_variant p.Ala115Ala
T/C 18575804 synonymous_variant p.Tyr116Tyr
A/G 18575876 synonymous_variant p.Ser140Ser
G/A 18575925 missense_variant p.Val157Ile
G/T 18575939 missense_variant p.Lys161Asn
G/A 18575942 synonymous_variant p.Arg162Arg
A/T 18575976 stop_gained p.Lys174*
A/G 18575984 synonymous_variant p.Lys176Lys
G/A 18576018 missense_variant p.Glu188Lys
T/G 18576080 synonymous_variant p.Ser208Ser
G/A 18576094 missense_variant p.Arg213Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29132.1
MDSSSILYSSNSSESSVGSPHHHLPFNENDPEEMLLYGMITSYQEQNNSCKLVIKEEEVNSQQHKSSSSNSNGKSFRGVRRRPWGKFAAEIRDSTRHGIRVWLGTFDNAEAAALAYDQAAFVMRGSAAVLNFSVEKVKESLRDMDCSFSQLEGCSPVVALKRRHSLRRKMTTKKKKEETQESDSVRLENVVVLEDLGEEYLEQLLMMSSSDARCTW*


CDS Sequence:
>Vu_29132.1
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Promoter Sequence:
>Vu_29132::LG8:18573457-18575457(+)
TATATAATGAGTTTCACATTTAAATTCTTTATTTATTAAATCGGTTTGGATATATAAAAATAATAATAATAATTTGTAAATATTGACACCGTACCCTTATTTAATATACATTTTGTCTCAAGAATGCCTATATTTTTTAAATTATCTTCATTTAAAAAGTGAATGAATTTAAAGTAAATTACGAAGTTTTGCATTTTATTTTTCTTTCCGCTTCTCCACTTAAGTTAAAATATAGGAATATATTTCATAATATGAAATCTTGAAACATTATACAAACACTGTTGGGCACATAAAGCATGAATAGTGGTACAAATGTAAGATCAAAATAATGTAATTTGGTTTTCTTGATTTGACATTAATATATTTTAATAATTTTTTAACAATAAATTACGTTTACTATTTTATTATTTGAAACAGATCAATTATAAATCACTGCGTTGAAAAAAAATTGTAAAAAAAAAATGGTTGGAAAAGATATTTTTCTATTTAAAAATCATAATTTTCCTTCTGAACTTGACGTGGTTTACGTATGTTCAATGATTTCCAACCTAATGATCGCCGTAAATAGAGGGGATGCACTCCTACCATAAAATGGGTCGAAAATTTAAGCTAATTTTATTAAGATCGGTTGAACTAATACATTAATTTTATTTATACATATGTATTTGAAAAATATTTAAATATTTAATTATTTTTAAATTTCTAACTGATTAATGTTTTTAATATGATAAGTTAAAATTATTGTTAATTTTACTTATTTAATTATTTTATAGCAATTAATAATTAAAATTTAATTTATAAATATTAATGATTTAAGTTATGCTATATTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAACTATTTTTTAATATTAGAAAAGTGTGATGTTTGATCCGAAATATTTAAAGATGTATTAGAAATTAATATTAGAATAAAAAATATGTAATAAGAAATTCAAAGTTTTTTATATTTTTTTAAAAAATTATTCATTGTGTTGATAAATTAATTAATTTATTTTTTATTAGTAAATAGATATATTTTATTTATGTTATTGAAGTGTAATTTTTGTTATGAATGTGTGTGGTTTTTCTATGTTTTGTATTATTATTTTTTATTTAAAAAAGTTTTCATTGATGAATTTTGGAGTGTCAGTTAAGAGGTCAAAGTTATAGTAAATTTTAAGATGAATTTGTTTGTAAAGTGAAAAAGTCTAGTTAAATGATTAATACGTGAATAAAAGTTACAAAATTTAAATTTAGTTTAAAACAATAGTAAAATATATTACAAAATATAGTTTTTAATTAATAAAAAGTAAGTTTTTTATATAAAAAATTCATATTAACATAATTATTTTTGTGATTAGTATTTATTAACAACACTAAATTAACATTTCTCTTAAGAAAATACTCCACCTGACACGTTACTTCCTCTCCCCACCAAAACATCCAACACACTTTGTTTCATTAATTTATTACAAACATGAATATTATAAATGAGAACTTTTATTGTAATTCTTAATCTCTTTTTGTCCTCCAAAAAGAAGAATATAATTAAAAATAAAGTATTGGAAACATGGTTTGAGAATAGCCAACGGTATCACCTTTAATATAACACCAATTGATTCAATATTTTCCACACTAGCCGCTTATGTAAAAAGACTATTGAGATTGACTCTAGAATAATAATATTTTCTCCTTTCATATCAACTATATATATTGTTGGAAATTTAGATAACATATTTATAGGGATTAAAATTGTTTAATATAAACAATCAAGAATTAAAAATGACTATATCTAGAAATTTCTATGGAGAAAAAATTAAAATGGATTTAAGCGTTTATTTATCCAAGTGTGAAGTAGGTATAGGTGTTGACTCTTAAATTTCATTCCCTATATAAGCTAAAAGCCGTGTGTTCCAAAACTAATCCAAAACAGAGCAACTCTGTTTCCTTCGTATCCCTTCTTCAA


Gene Sequence:
>Vu_29132(+)
ATGGATTCTTCTTCCATTCTCTATTCATCAAACTCTTCAGAATCTTCAGTGGGATCTCCTCATCACCATCTCCCTTTCAACGAAAATGATCCCGAAGAGATGCTTCTCTATGGCATGATCACATCATATCAAGAACAAAACAACTCATGCAAACTCGTCATCAAAGAAGAAGAGGTGAATTCACAACAACACAAAAGTAGTAGTAGTAATAGCAATGGTAAGAGTTTTCGAGGTGTGCGAAGACGACCATGGGGAAAGTTCGCGGCAGAGATAAGAGATTCTACTCGACATGGCATAAGGGTATGGCTTGGAACATTCGACAACGCCGAGGCTGCAGCGTTGGCGTATGACCAAGCTGCCTTTGTCATGCGAGGCTCTGCCGCGGTACTCAACTTTTCCGTGGAGAAAGTAAAGGAGTCATTGAGAGATATGGATTGCTCATTCTCTCAACTTGAAGGTTGTTCTCCCGTTGTGGCCTTGAAGAGGAGACATTCATTGAGACGCAAAATGACTACAAAGAAAAAGAAAGAAGAGACACAAGAGAGTGATAGTGTTAGGTTAGAAAACGTGGTTGTGTTGGAAGACTTGGGAGAAGAGTATTTGGAACAATTGTTAATGATGTCTTCTAGTGATGCTAGATGTACTTGGTGA