Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29085 LG8 18107604 18111887 PREDICTED: transcription factor E2FA
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09143 Cell growth and death   C 04110 Cell cycle [PATH:ko04110]
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 18108051 intron_variant
C/G 18108067 intron_variant
A/T 18108204 intron_variant
G/T 18108423 intron_variant
G/C 18109807 missense_variant&splice_region_variant p.Trp245Cys
T/A 18110291 intron_variant
A/T 18110336 stop_gained&splice_region_variant p.Lys282*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29085.1
MSTTAGPPDRRASPPRGAAGTTIRPALKRHLAFVTKPPFAPPDDYHSFSSIDSRRLADEAVVVRSPVSTSVSSLRSQIHLRGSRIWNVLFCVECDVKFTNCDYMKRKGGMNDSEGESHTQKWSNSPGYTNVSNITNSPFKTPVSAKGGRTQKAKASKEGRSCPPTPISNAGSPSPLTPASSCRYDSSLGLLTKKFINLVKHAEDGILDLNKAAETLEVQKRRIYDITNVLEGIGLIEKKLKNRIHWKGIESSTSGEVDGDISVLKEEVEKLSLEEQGLDDQIREMQERLRKLSENENNRKCLFVTEDDIKSLPCFQNETLIAIKAPHGTTLEVPDPEEAVDYPQRRYRIILRSTMGPIDVYLISQFEEKFEEINGAELPMIPLASSSESNEQVMTEIVPAECSGKEFEPQTQLSSHVYSDINASQEFAGGMMKIVPSDVDNDADYWLLSDADVSITDMWRTDSTVDWNGVDMLNPDFGIISRPQTPSSGFVEVPTPGANSNHK*


CDS Sequence:
>Vu_29085.1
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Promoter Sequence:
>Vu_29085::LG8:18105604-18107604(+)
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Gene Sequence:
>Vu_29085(+)
ATGTCCACCACCGCCGGACCTCCCGACCGCCGTGCCTCGCCGCCTCGGGGGGCTGCCGGCACCACTATCCGCCCCGCGCTCAAGCGCCACCTAGCTTTCGTCACTAAACCGCCCTTTGCTCCCCCTGACGACTACCACAGCTTCTCCTCCATCGACTCCCGCCGCCTTGCCGATGAAGCCGTTGTCGTTAGATCTCCTGTGAGTACATCGGTTTCCTCTCTCCGGTCTCAAATTCACCTCCGCGGCTCTCGAATCTGGAATGTCCTCTTCTGCGTTGAATGCGATGTTAAATTCACTAACTGCGATGTTAAATTTACTTGACGGAGATCTCCTTCGTGTTTTAACGGTTGTGTTGTGTGTTGTCATTCTTTTCTCTGGATCTTTTCCCTTTCCTTAGTGAATGAACGAGTTGATGATTATTCGAGGGTGCGATGGTGTTTCTGTTGTTTTTTGGGTTAATTTTCTAGTTTTTGGGGGAAAAGTGAAGTCAGTCTCTCAGTCTCAATCTGTCTCTGATGATTATTTGAGACTACGATACTGTTCTGTTATTTTTTTGGGTTAATTTTCTAGCTTCTGGGGAAGAAGTGAAGTTAGTCTCTCAGTCGCAAAGTGGCTAATCAGTGTAGGTTGGGGCATGGTCAGGTAGTTCTGTGCGATAATCAAGTGGGAAGGGGGTTTAGTGGAGGTTAATTGAGCGGGAATTTAATGGGTCACTTTTGATGTGGTCAGATTTTGATACGTGGTCTTTGCTTTTGGTTAAGGAGACCATGCTATAGCTGTCCAAGAGTTAGGTTTTGGTCATACAAAGTTATTGGGATGGGAGAACTTATTTTCTTTTCAAATAGTTAGGCGATTTGTATGACTGAATCTAAATCAATTCTTGAAGTTGAGTGATTATGAGTTAAGATCAAGCTCTTTATGGAAACTAAAATAAATAAGAGAAACAAGAAAGTGAGAGAAAGAATTTGGTCAACCTCAACTTCTGTAGCACTCGTACGAAGCTGGAGGATGTATGTCATAAAGTCATACAGTTGATCCTTCGAACATTTGTGATCTTTGCATGCTATCAATGAGCTAATTCTTATCTGTGTCCCTAACTCTCATTTGCAGTCCTGCATATTGATTTGTAATTGTTTACATACAGTTTTGCTATGCATAGTTAATCTAGTTTTAGTGGATAGGTAATGCTGGGTCGTGAGCTTCTTCATCTGTGACTCAATATGATAAGATTGAATTTCTTTTTTACGTGTGTTTATCCCCTTCTTTGCTTGATATTTCAAGGAATATTATATTTAGCATTGTTGTAATCGATTGTAAATATGGAAGGATGAATTAATACCTTTACTTGATTGCTACCTTATAATTTGTTGAAACTGATGTTGGTTGCAGTACATGAAGCGAAAGGGTGGAATGAATGACAGCGAAGGAGAGTCTCACACACAGAAGTGGAGTAACAGTCCTGGATACACTAATGTTAGTAACATAACGAATAGTCCCTTTAAAACTCCAGTGTCTGCAAAAGGAGGAAGGACACAGAAGGCAAAGGCTTCCAAAGAAGGCAGATCATGTCCTCCCACACCCATCTCAAATGCTGGTGAGAACATTTCCTTTTATCTTTATTGTTCAACAACATTCAGTATTCTGTTTGAGAAGATTTAGTGCTTGGAAACATTTTGTGTACAAAATATGAATTCTGATTTACATTTTCCTTGATGTGCTCCATCCATAATGTACTGTGTTTAATCAGAGTTTTTCTGATTCAGGTTCCCCGTCTCCTCTTACTCCTGCCAGCAGCTGCCGTTATGACAGTTCCTTAGGTAATTTTAGCGGCATTCTTAATCGATAAGCTCTTTTCAGTTCAGTCTCCCGTTATGTTTGATCAATGGAGTTATTTCAATGACAAAAGAATGACAACATCCACAACATCACAGGTCTCTTAACCAAAAAGTTCATCAATTTGGTCAAGCATGCAGAGGATGGTATTCTTGATCTAAATAAAGCAGCCGAGACTTTGGAGGTCCATCTTTTTTCTGCAAAAAAAGTTAAAACCAAAATATCTTATATTTATTCTTCCTCTATCATGTATGAATTTACTCTTTTTTTTTCCTTTTCCACAGGTGCAAAAGAGGAGGATTTATGACATAACGAATGTTTTAGAAGGCATTGGTCTCATTGAAAAGAAACTCAAAAATAGAATACATTGGAAGTACTGTGAATGTGACACATTTTAATTTTTTCTTTAATGTATGTTCCTTTGAATTTTGACATATATGTACTATTAGAGCAAAGTTCTTACATCAAACCTTGTGGATCCTAGGGGAATTGAATCTTCCACGTCTGGTGAGGTGGATGGCGATATATCTGTGCTTAAGGTAAGTAATGTAGGTGTTGTATATTTTCGAATGACCTATTGACACCCAAGTAGCTAACTGTTATAGAATTTACATTGTCACAAACATTTCTCATGTAACTTTGTTTGTGTGGCAAGCAAAATTTATTGGATCCAGAACTTATATTTTTCCCGATTCACCATATGAAGATATTTAAAAGGATTAAAGGCCTAAGTAGTTGTCCTTGTGGCTATGTCTGCAGGAAGAAGTTGAGAAACTTTCTTTGGAGGAGCAGGGATTAGATGATCAAATAAGGTTATATGCTTGCTTTTTGAAAAAGAGCACAAATTTGCTATTTCAAAACTGTTGGCCAATGCTTATTTTTCTAAATTTTTTGCAGGGAAATGCAAGAAAGATTGAGAAAGCTGAGTGAAAATGAAAATAACCGGAAGTAATCTACTCTCCATACTCATTCGTTTCTTAGATTTGTTTTCCCTTTGCCCTCCTTTTCATAAGAAATAACAAAATGTTGTCACAGTATTATAAATTTATACCAATTTCATATCTTTTTAGGTGCCTTTTCGTGACCGAGGATGACATTAAGAGCCTACCTTGCTTCCAGGTCATTTTTTCTTGCGTAGCACTCCCAGCTTATACACATTGCTTTAGCTGTCCTCTCATGTAAATTCTGATTATTGTTAAGGTTTTCCTTTTATTAATACTGGCGTATTCCTGCAAGCAGAATGAAACTTTAATAGCAATTAAAGCTCCGCATGGAACTACCCTGGAAGTCCCTGATCCTGAGGAAGTAAGTTTAGTGCATAAATTGATGAAAGGTTCATGCACTTTATAAAACAGATGTTCTAATGCATGATGGAGAATTATTGCTTCTATATGAATCAGGCTGTAGACTATCCTCAGAGGAGATATAGAATCATTCTTAGAAGCACAATGGGTCCCATTGATGTCTACCTCATCAGGTACTTTTCTTGGCTAGTTTTATTTACTGAACTTTTTTGTTTTTTTGTTCTTATGCTGTGCATCCAGAAATCACATTAGTCCGTATTTCCTATCCAATGTTCAATTCATCTTTGGTGTTGACAAGATATTCCCACGTCATTTTTTTAAGACTAACCCTCATGCTGGGGATGGTTTAGTAATCGTTTGCCGCGGTAGTCATTACAGTAACTTCTCTCCTTTTCTAGTTAATCTATCTAATCTATGCATTGTTTGTTTATTTCTTGGAACTTCTGAACTCTTTTCAGTCAATTTGAAGAGAAATTTGAAGAGATTAACGGCGCTGAGCTCCCCATGATCCCACTTGCTTCCAGTTCTGAGTCCAACGAACAAGTAATGACAGAAATAGTTCCTGCCGAATGCAGCGGAAAAGAATTTGAACCTCAAACTCAGCTGTCTTCTCATGTATACTCCGATATAAATGCTTCACAAGAGTTTGCTGGGGGCATGATGAAGATTGTCCCTTCAGATGTTGATGTAAGTATATCATAATTAAGATGAGTTCCCCCCCCTCCTCCCCCCTTCAAAATGGATGGTTAGTGATTAAGTTCTTCTGATGGTATTATTTTAAACTCCGCATTTAATGATCGGATAAGAGCGTTCACGGTGGAATGCATTGTTTGCTGATATTCTTTGTAATTTTCTGTAGAATGACGCTGATTATTGGCTTCTATCAGATGCTGACGTTAGTATAACAGATATGTGGAGAACAGATTGTATCCTTTTTTTAAATACTTTTATGCATTCTGTCGTCTGTGTCTCATGTTTTATTTATTGTAGTATACTTTATTCCTCAACTCCCACTAAAACAGCTACTGTTGATTGGAATGGGGTGGACATGCTTAATCCTGATTTTGGAATCATTTCGAGACCTCAAACTCCATCATCGGGGTTTGTGGAAGTGCCAACACCAGGAGCAAATTCTAATCATAAGTGA