Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29051 LG8 17570499 17573893 hypothetical protein LR48
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09151 Immune system   C 04612 Antigen processing and presentation [PATH:ko04612]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 17570774 intron_variant
G/A 17570973 intron_variant
A/G 17571061 intron_variant
G/A 17571277 intron_variant
A/T 17571722 intron_variant
A/T 17571929 intron_variant
A/G 17572164 intron_variant
C/A 17572305 missense_variant p.His112Gln
C/A 17572543 intron_variant
A/G 17572658 intron_variant
T/A 17572789 intron_variant
A/T 17572862 intron_variant
G/A 17573135 intron_variant
C/T 17573157 intron_variant
C/T 17573198 intron_variant
G/T 17573251 missense_variant p.Arg205Met
C/T 17573363 synonymous_variant p.Ser242Ser
A/G 17573390 synonymous_variant p.Gln251Gln
C/T 17573623 intron_variant
T/G 17573625 intron_variant
A/T 17573646 missense_variant&splice_region_variant p.Glu316Val
T/A 17573868 missense_variant p.Met390Lys
G/T 17573870 missense_variant p.Val391Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29051.1
MAMQTAYLKEHEGIVHNSVGQLSSGTSAPWWNGLGSQPVYGDYCGQNKPFSLEFSNYIDPFAGGKQAVRGAEPVIDRGHATQFSIFPDECKMLGDAQNPQPAIGLQPSLAEPTNNFDIGFNQPMMCAPYPCMEQFCGISAYGPQISGRIMLPHNMASDDAPTFVNAKQYHGIIRRRQSRAKAVLENKLIKRRKPYMHESRHLHAMRRPRGNGGRFLNTRNSNNGNGGNDSEVNNMGGLQFLSSASQSSEMLQSDVGINSPMETDECSPNMSSTEVNSMFSREGFDGFSVNPLGSSVLPLGSPVYPLGSSVHSLTNLENKWVWCDVAPNTPLEKDQMKKFSCTFLVFIVTNLVLENFVLSDLGKPFLAKLRPFIHGSPDSAKGFHDMDVLYMVMAMQST*


CDS Sequence:
>Vu_29051.1
ATGGCGATGCAGACTGCTTACCTGAAAGAACACGAAGGAATTGTTCACAATTCTGTTGGACAGTTGTCGTCTGGAACTTCCGCTCCATGGTGGAATGGCTTAGGATCTCAACCAGTTTATGGAGATTATTGTGGCCAAAACAAGCCCTTTTCGTTGGAGTTTTCGAACTACATCGACCCATTTGCTGGTGGTAAGCAAGCAGTACGAGGAGCTGAGCCAGTGATCGATAGAGGACATGCAACCCAGTTTTCCATCTTTCCAGATGAATGTAAAATGTTAGGCGATGCCCAAAATCCTCAGCCAGCCATAGGACTGCAGCCATCACTTGCTGAGCCCACCAACAATTTCGACATAGGGTTTAATCAGCCTATGATGTGTGCACCATATCCCTGTATGGAGCAATTCTGTGGGATCTCAGCTTACGGACCTCAAATTTCGGGACGTATAATGCTTCCGCATAACATGGCATCTGATGATGCACCAACCTTCGTGAATGCTAAGCAGTACCATGGAATCATCAGACGAAGGCAGTCACGTGCCAAGGCTGTTCTTGAGAATAAACTCATCAAACGTCGCAAGCCTTACATGCATGAGTCACGCCATCTACATGCAATGAGGCGACCAAGAGGAAATGGTGGTCGTTTCTTGAACACAAGAAACTCCAATAATGGAAATGGTGGAAATGATTCTGAAGTGAATAACATGGGTGGCCTACAATTTCTGTCCAGCGCCTCTCAGAGTTCTGAAATGCTGCAATCTGATGTTGGAATAAATTCACCAATGGAGACAGATGAATGCAGTCCAAACATGTCTAGTACAGAAGTGAATAGCATGTTTTCGAGGGAAGGTTTCGATGGCTTTTCTGTGAATCCTCTTGGATCTTCGGTTCTTCCTCTAGGATCTCCTGTGTATCCTCTTGGATCTTCTGTCCATTCGTTAACTAACTTGGAGAACAAGTGGGTTTGGTGTGATGTTGCACCGAACACGCCCCTTGAAAAAGACCAGATGAAGAAATTCTCTTGCACTTTTCTAGTGTTTATTGTGACAAATTTAGTTCTGGAAAACTTCGTTCTATCTGATTTAGGGAAACCATTCTTGGCTAAGCTTAGGCCATTCATCCATGGCTCACCAGATTCTGCAAAGGGCTTCCATGACATGGATGTATTATACATGGTAATGGCCATGCAGTCTACGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_29051::LG8:17568499-17570499(+)
ACTTCTTAATTTAATATATATCCCCACTAACACCTGTTCAAATATTTCCCCTTTATATATAATCACCTTCTCTACTCATATATTTGGTAAAAAGGTTGTAGAAAGATATAAGGATGGATTTTTGCAAGGGTGTCTATCATATTTAAAATTTTAAATTAGATTTTATAAATTTGAGATTTAGGATCTTAGATAAAATCTTAAGTAAAAGAAAGAAAAAATTGTTTTCTTTAAAGCAGATCTTCTCTTAAAAATATTAAAGAAACATACTAGTAAAGTGGGCTCTTACAAAACTCTTTTATCAACATAAAACTTACAATGAGGTCTTAAAAATGATAATATCTAGGAGGATCTAAGAAAAAATAAATTAAAACTTCATGTTAAAGATTCTTTAGCCACCTTCATTATAATAAGAGTTAAGAATTATAATATGATGTCTTAATTTATTTTATACTTTAATGAGTGTCATATTTGATTGTTAAGGTTTTCAAGACAGAAATTTTCTTTTATTCTTATAACCTAAATTTTTAATTTTACACAATGTCACTATATTTGAAATATAGATATCTTCATGATGTAACATTGATAAATAAGATATATATATTTTTATATTAGTTTTTTTTACTTTTAAATTTTACAATATTCTAAAATGGTATTATCATTAATTAATCAATGTACAATTTCCAATATACTCTCTTATACCAAGATATATATATATGTTGAATGTGAAACTAAATAATTTTATAATTCTTCAATAGATAATAGAATAATAAATCTAACAAACAATATATCTTTTAAATCTTGTTAAAAATGATAATTTTACAAAATTGGATTGTAAAATTAAATTCATATTTACTTATATACTATAATAAACTATAAACAGGTGTTTTCACTCCTCAATAAAATTCTAAATTTCAAAAAGTTAACCACAAATATGAGATTTTGAGACTTCAAACTTGTAAAAACATATTCTTACACCTAACAACCGATAAAAACTGGGACCTGTAATGTCTCCTTTTGAAAAGAAATCATCATCGTAAAACTTTAAACTTGGAGTGCATTGAAATGCGAAACTGTGTTCATATTTTATTTATTAAAATATTAGCACAAAACCCATAAAATTATTATAAATTAATCTAAAAATGAAAAAAATAATAAAAAGCGGAAAAACATAGTACTAAAAGGAGGCACATCCTTTCGACCCATCAATACCAAAGAACATAGGTGATTTGATTTCTACTTCTACATCACATGTACGAATTCTTTTTGCCCCTTTCTCTCACTTTGCTCCTTCTTCTCTCTTGTGTGTAAGTGTACTATGTGTGTGTGTGTTTTGCTTCATTAAGTACCGACATGACTCCAACCTGTTGGGGTGGTGATTCATCTACTACTTCTACTTCGTAGAAATCGATGCTGCTACTTATTCTTCTTCTACTTTTACTACTCACTCTCAGAAGTGAGTGTTATCCCTTTCTTTAGTTGCTCCTCCTCGTCCCAGATAATGCGTCTTCGCAGCTCAATCTGTTAAACTTTACTTTAACTTCAACTGCTATATTGTATATATCTGTGTATTTTTATCTTCGTGTTCCACTTGGAAGCATTAAAGTTTTGTTTTGAGACTCACGGTTCAGGATCTCAGCAACAATCTTGCTTTCTTTTATATAATTTTATTGGTATACTATGCTGATTGAAGTTTACTTTTTTGTCTTTTTTATATTTCAGCTCTCCTTTTGCTTGATGCTGGCGTCGATGAGTGGAGAAATCTGAGGCAGATTAGTGGTTTTTAGGTACTTCGTGGAGCTAAGAGAATCTTGAAAGCTAGAGGTAGACATAGACATGCCACCTTGTTATTTTGTTTGCCTTTGTTGGAAAATTGTTCTCTTTTTTAATTGCTTTTTTAGTACTTTTTTTTTTTCGTTTTAACTGTTTTTGAATCTTTTCTTACAGGAAGTAGTTTACTTTATCAACCTGGTGGTATTAAGACATCGTTTGGAGGCTGAAAA


Gene Sequence:
>Vu_29051(+)
ATGGCGATGCAGACTGCTTACCTGAAAGAACACGAAGGAATTGTTCACAATTCTGTTGGACAGTTGTCGTCTGGAACTTCCGCTCCATGGTGGAATGGCTTAGGATCTCAACCAGTTTATGGAGATTATTGTGGCCAAAACAAGCCCTTTTCGTTGGAGTTTTCGAACTACATCGACCCATTTGCTGGTGGTAAGCAAGCAGTACGAGGAGCTGAGCCAGTGATCGATAGAGGACATGCAACCCAGTTTTCCATCTTTCCAGGTATTAAATTTGGTTTTTGATGTATTTCTACCAGAGTTGCATCATTGCATGATTTGGTTCTATTGCTTATACCAAATTGCAATGCTTATGAATTGTTATGATAGTTGTAACTATACATAACAATTCATAAAAGATAGAGCAACATGCAACTGGTGTCTTATAACACAAATGCCTGTTTTGGAGAAATCTGAAACAAGGGAAGCTGTAGATTTGGGTAGTCTACCTTTTTTCAAAACAAAAAACATTTGCATGCACTATTTCCAGCTTTGCATGTATATATTTGAGTTACAGTATGTGTGTAATGGAGAGATCAAAGAGTTTGGTTCCTGTTGGCACTGAAATTAGTACCAAATTTGCAATGTAACTACGGAGTTACTGATATTTTAAACAAAAGGCTATGTTATCCAAGTCTTTGATATTCATTCAATTTTTTGTGTTATCTAAAGTGTTTGATATTCAATTTCTGGCTCTAACCAGCTTAAAAAGCTTGGACTTGCAGCTACTGAGATTGTTTCCGCCGAACTAAAACAACGTTTTTCCAGTGAAAGCCATGACTCGCGAGCACATATCAACCTTTGGTTATCAGCTTTGAGACATGGACAAAAAATGGAGAAATGGTCCCCCCTCCTTGCTTTCTGCATGGCTTCCTCACTCCTATACTACATATTCAATCTGAATAAATAAATAAATAAATATTTCTTTTAAGAAAAAATGACTGCAGATCTAGTTGAGTTTTTAAAAACATTCTTGAATTTTGAGGGCAAAACCTTTTCCACAGTCTACAGTTTCTCTTATGGGGCTTCTTCTCTGCCTTATGAGCCTCATTGTCTAATCAGTATACTTTTAGTGAAAGACAAAAAATGGGAAAGTAATTTTCAAAAAATGTCCACTAGCCTCTGGAGAACCTCTTGCATGGCCAATCAGATGATTTTGTTTGACCTAGCATTAGTTGAAGCTTGAAACTAATTTGTTGTACAACGGTATTATATTACAGGGTTTACCACACAAAGATGAGTTTAAGTTGAGGGTTGCTATTAGTTAATAATCATTAGGGCAGAGGCTGCATTAATGCGATGCATTCACTCAGACTTTTAACTCACTGTAGCAGACGCAGAGAAAGCAAAGGAAATTGCACTTATGACTTCTTCAGAGCGAAGACCATTTATTGATTGTTGAGCCAATTCTGGCACAGTGGTTTCTCCCCCCTCTTTTAGTACTGTTTCCAAAGTTACCTAAACAGCTTTAATCTTAAAAAGAGCTGTAAAAATATTATCAGGAAAAAAAAAAAAGTTACATCACTCTCATTTAACCTGCTGACAAAAATGAGATTATGCATTTTAAGGCCTTCCTTAACATTTTCTATTTATCTGAAATATCTTCTTTTTCCCTTTTAAATTTTTTTAAGTGAGAAATTTTGTTGCATTCAACGCTTGGAATTTTCCTATGCTAATCATACATTTCTTCTTCAGATGAATGTAAAATGTTAGGCGATGCCCAAAATCCTCAGCCAGCCATAGGACTGCAGCCATCACTTGCTGAGCCCACCAACAATTTCGACATAGGGTTTAATCAGCCTATGGTAAAACCTCTAACAAAACTACCCTTTTGTTATTTTACTATTTTATTTCTGCTGGGCATAATTTAAAATGTTTGGCACGTTTTCCTTCCTAGATGTGTGCACCATATCCCTGTATGGAGCAATTCTGTGGGATCTCAGCTTACGGACCTCAAATTTCGGTTTGTCTTTACCTCAATCAGTTTCCTAATCTAAATAAATCAAGTCTAGTGCTTTTAACATGCTTAAATGGGAATTATTTTATCTCTGCAGTGTATGAACATATGAAAAAGCAAGAAATCAATTCCTACAATTATCTATCCATGTTTATGAAAGTCTTACATAGTCTTTAAATGTAATAACTGAATTGTAGAATGTGTTACTGGGTTTATATGTCTGCATACCCTAGATATACATTAGGTTCTAAACAAAGGGCAAGGTGAATAAGCTAGTTCTTCCAGAAGAAAGAGAGATCTCAAAATTAAAAATCATTTAATAATCATGATTCCAGCATAGTTTATGCATCAGCATTATCGTTTTAATAAAAGAAGTTATCATTTGTTCACCTTCTGTAATCTTTCACTGTTTATTAATTCATATGTATGCATCCATATTTAATAAACTAGGGACGTATAATGCTTCCGCATAACATGGCATCTGATGATGCACCAACCTTCGTGAATGCTAAGCAGTACCATGGAATCATCAGACGAAGGCAGTCACGTGCCAAGGCTGTTCTTGAGAATAAACTCATCAAACGTCGCAAGGTATGATCATATGCGTGGGCATCCCAAAACTTTTTGTCATATGATGATACTCGAAAGACAACGTTTGGTAATGTCTGAATACTCGTGAAACAGTTTTCTTTTCGTTAATACGATTCGTGTTTGTCTTGCAGCCTTACATGCATGAGTCACGCCATCTACATGCAATGAGGCGACCAAGAGGAAATGGTGGTCGTTTCTTGAACACAAGAAACTCCAATAATGGAAATGGTGGAAATGATTCTGAAGTGAATAACATGGGTGGCCTACAATTTCTGTCCAGCGCCTCTCAGAGTTCTGAAATGCTGCAATCTGATGTTGGAATAAATTCACCAATGGAGACAGATGAATGCAGTCCAAACATGTCTAGTACAGAAGTGAATAGCATGTTTTCGAGGGAAGGTTTCGATGGCTTTTCTGTGAATCCTCTTGGATCTTCGGTTCTTCCTCTAGGATCTCCTGTGTATCCTCTTGGATCTTCTGTCCATTCGTTAACTAACTTGGTAGGTAGTGGAAATGGTGTTAGCATGCCCACTAGATGGGCTTAATGTGTTTGATTTTCTAGGAGAACAAGTGGGTTTGGTGTGATGTTGCACCGAACACGCCCCTTGAAAAAGACCAGATGAAGAAATTCTCTTGCACTTTTCTAGTGTTTATTGTGACAAATTTAGTTCTGGAAAACTTCGTTCTATCTGATTTAGGGAAACCATTCTTGGCTAAGCTTAGGCCATTCATCCATGGCTCACCAGATTCTGCAAAGGGCTTCCATGACATGGATGTATTATACATGGTAATGGCCATGCAGTCTACGTGA