Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_29021 LG8 17207909 17217339 PREDICTED: ABC transporter G family member 22-like
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09131 Membrane transport   C 02010 ABC transporters [PATH:ko02010]
SNP Position Effect Amino acid change
T/C 17208091 upstream_gene_variant
T/A 17208101 upstream_gene_variant
T/A 17208159 upstream_gene_variant
G/A 17208160 upstream_gene_variant
A/T 17208184 upstream_gene_variant
G/A 17208198 upstream_gene_variant
G/T 17208337 upstream_gene_variant
A/G 17208389 upstream_gene_variant
A/C,* 17208494 upstream_gene_variant
T/G 17208536 upstream_gene_variant
A/T 17208538 upstream_gene_variant
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T/A 17208701 synonymous_variant p.Ser20Ser
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C/T 17209197 upstream_gene_variant
A/T,* 17209273 upstream_gene_variant
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C/T 17211179 upstream_gene_variant
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T/C 17211187 upstream_gene_variant
C/T 17211218 upstream_gene_variant
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T/A 17211934 upstream_gene_variant
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A/T 17212036 upstream_gene_variant
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T/A 17212124 upstream_gene_variant
G/C 17212192 upstream_gene_variant
C/A 17212201 upstream_gene_variant
T/A 17212279 upstream_gene_variant
G/A 17212530 upstream_gene_variant
T/C 17212759 upstream_gene_variant
T/A 17212909 intron_variant
T/A 17212914 intron_variant
T/A 17213224 intron_variant
G/T 17213395 missense_variant p.Glu169Asp
C/T 17213557 synonymous_variant p.Tyr223Tyr
G/A 17214005 synonymous_variant p.Lys264Lys
G/A 17214006 missense_variant p.Glu265Lys
C/T 17214009 stop_gained p.Gln266*
A/T 17214235 missense_variant p.Gln284Leu
C/T 17214793 missense_variant p.Pro400Leu
G/T 17215525 synonymous_variant p.Leu539Leu
C/T 17215526 stop_gained p.Gln540*
C/T 17215562 intron_variant
A/T 17215573 intron_variant
T/C 17215685 intron_variant
A/T 17216157 intron_variant
G/C 17216415 intron_variant
A/T 17216416 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_29021.1
MEKANSTSLVRTKSDQLVESIVAAMKSPPSSDHSANGVAEGGGTLSRKSSRRLTGASPGRGGGGKNTHIRKSRSAQISQMKLDFDDLSSGAALSRASSASLGLSFSFTGFTMPPEEIADSKPFSDDDIPEDIEAGPRTKFQTEPTLPIFLKFTDVCYKIVIKGMTTTEEKDILNGITGSVNPGEVLALMGPSGSGKTTLLNLLGGRLCHPISGGSITYNDQPYSKFLKSRIGFVTQDDVLFPHLTVKETLTYAARLRLPKTYTKEQKEKRALDVIYELGLERCQDTMIGGSFVRGVSGGERKRVCIGNEIIINPSLLFLDEPTSGLDSTTALRIVQMLQDIAEAGKTVVTTIHQPSSRLFHKFDKLILLGKGSLLYFGKASEAMTYFQSIGCSPLISMNPAEFLLDLANGNINDVSLPSELEDRVHMENAEAETPNGKPSPAVVHEYLVEAYETRVAEAEKKRLMVPIPLDEAVKSKVCSHKRQWGASWDEQYSILFWRGIKERRHDYFSWLRITQVLSTAVILGLLWWQSDTKNPKDLQDQAGLLFFIAVFWGFFPVFTAIFTFPQERAMLSKERAADMYRLSAYFLARTTSDLPLDLILPVLFLLVVYFMAGLRLSVAPFFLTILTVFLCIVAAQGLGLAIGATLMDLKRATTLASVTVMTFMLAGGFFVQRVPIFFSWIRYMSFNYHTYKLLLKVQYEHISPIINGIRIDSGATEVAALIAMVFGYRFLAYLSLRRMKLQSGA*


CDS Sequence:
>Vu_29021.1
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Promoter Sequence:
>Vu_29021::LG8:17205909-17207909(+)
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Gene Sequence:
>Vu_29021(+)
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