Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28955 LG8 16458468 16460483 probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.5
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/G 16458500 missense_variant p.Ile514Leu
G/A 16458510 synonymous_variant p.Ile510Ile
C/G 16458599 missense_variant p.Ala481Pro
G/A 16458666 synonymous_variant p.Cys458Cys
A/G 16458675 synonymous_variant p.Gly455Gly
T/C 16458695 missense_variant p.Asn449Asp
T/A 16458721 missense_variant p.Lys440Met
C/G 16458864 synonymous_variant p.Gly392Gly
T/G 16458954 synonymous_variant p.Thr362Thr
A/G 16458957 synonymous_variant p.Ser361Ser
C/G 16458966 synonymous_variant p.Thr358Thr
G/T 16459124 intron_variant
G/C 16460043 synonymous_variant p.Ala147Ala
T/C 16460305 missense_variant p.Asn60Ser

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28955.1
MQIPWIVKYQYAATLFFVTVALTKVTCFQFNFPSFPDDSNLLLLGRSRIFLDAIQVTLDNRNSIENYSGRALYSKPYQLWKQKNNQNQIASFNTTFVLRITPETSPGGEGLAFILTSDRTVPENSDGQWLGIVNATSNGTSQPGILAVEFDTRHSFTEDGPDNHVGININSINSIQQVSLMNNRLNLSSGQDVKFHIQYINDTISVFGAMSGTSEESMETLLVSPPLNLSSFLQKEVYIGFSASTSNYTERNCVRSWDFSGDDIRDDDKSLLWVVYVGVPIVIVLIIIGGLVIFFLRWQKIRHMEGPEDAYPRIEDQIKYSTMAPKKYKLRELTKATGGFSLQNKLGQGGFGTQRNETHHSTKEIAGTPGYMAPETFLTGRATVETDVYAFGVLVLEVVCGKRPGNVYSQDDYKNSIVYWVWDLYGKGKVVGGVDARLKKEEIVEEEVNCVLVLGLACCHPNPHKRPSMRTVLQVLNGEAAPPEVPKERPVFMWPAMPPSFKDAEDSSLIQGTITPFTEITGR*


CDS Sequence:
>Vu_28955.1
ATGCAAATCCCTTGGATAGTCAAATATCAATATGCAGCAACACTCTTCTTTGTTACCGTTGCTCTTACCAAAGTTACCTGTTTTCAGTTCAACTTCCCTTCCTTCCCAGATGACTCTAATCTACTGCTGCTCGGGAGATCAAGAATATTCTTAGATGCCATCCAAGTAACCCTTGATAATCGTAATTCTATAGAGAATTATTCTGGACGTGCTCTCTACAGTAAGCCATACCAACTTTGGAAACAGAAGAATAACCAAAATCAAATAGCTTCCTTCAACACCACTTTTGTGCTCAGAATCACTCCGGAAACTTCTCCTGGTGGTGAAGGCTTGGCCTTTATCTTAACTTCAGATAGGACTGTCCCAGAAAACAGTGATGGACAATGGCTTGGTATTGTAAATGCTACTTCCAATGGAACTTCACAGCCTGGTATTCTAGCCGTGGAGTTTGACACAAGACACAGTTTCACAGAAGATGGCCCTGACAATCACGTTGGCATCAACATAAACAGCATCAACTCCATCCAACAGGTTTCGTTAATGAACAATCGGCTCAATCTATCTTCAGGTCAAGATGTCAAATTTCACATTCAGTACATCAATGACACAATATCAGTTTTTGGTGCCATGAGTGGAACTTCTGAAGAATCCATGGAGACCCTCTTGGTATCTCCACCTCTTAATTTGTCTTCCTTTCTTCAAAAGGAGGTTTACATTGGCTTCTCGGCCTCAACAAGTAACTACACGGAGCGGAACTGTGTCAGATCGTGGGATTTCAGCGGGGATGATATTAGGGATGATGACAAAAGTCTCTTGTGGGTGGTTTATGTTGGCGTTCCAATCGTGATTGTTTTAATTATCATTGGTGGGTTGGTGATCTTTTTCTTGCGCTGGCAAAAGATTCGCCATATGGAGGGGCCAGAAGATGCATATCCAAGGATAGAGGATCAGATTAAATATTCCACTATGGCTCCAAAGAAGTATAAGCTAAGGGAACTAACGAAAGCAACTGGTGGATTCAGCCTTCAAAACAAGCTTGGACAAGGCGGGTTTGGAACTCAGAGAAATGAAACGCATCACTCTACAAAAGAGATTGCAGGCACACCCGGGTACATGGCCCCAGAAACCTTCCTGACTGGGAGGGCAACGGTGGAGACAGATGTGTATGCATTTGGGGTTCTTGTGTTGGAAGTAGTGTGTGGAAAGAGGCCAGGGAATGTGTATTCACAGGATGACTACAAGAACAGCATTGTGTATTGGGTGTGGGATTTGTATGGGAAGGGAAAAGTAGTTGGTGGTGTTGATGCAAGGTTGAAGAAGGAGGAGATTGTGGAGGAAGAGGTGAACTGCGTTCTTGTTCTTGGTTTGGCTTGCTGCCATCCAAATCCACACAAAAGACCATCGATGAGAACAGTTCTTCAGGTTCTGAATGGGGAAGCAGCTCCACCTGAAGTGCCTAAGGAAAGACCAGTTTTTATGTGGCCTGCTATGCCTCCATCCTTCAAAGATGCTGAAGATAGCTCCCTCATCCAGGGAACTATCACTCCTTTCACTGAAATCACTGGAAGATGA


Promoter Sequence:
>Vu_28955::LG8:16460483-16462483(-)
AATAAATTATTTAATAGATATCCTAATATATACTTTGGTATATCCATTTTTTAATCATAATATCACAAAATATATATTGATAATTTATATTATCGATTTCAATGATAACTATACATAATATACTAAAAATGTAGTATACAATATTTTATTTATAATAAACTATAAATTAATAAGTGATTCGGTATTTTTTATATTTTAATTATAACAATAAAAATATTTCTTAGAGACTTTGATTTTTACATTGCAACGGACACCTCATGTGTTCACCATACATGACTTCAATAAAAAAAATAGTTAAATATTATTTTATTTCATAAATTTAGATAAAAACATTACAAAACTTTGTAAGGTGATATTTATTTATTTATTATAATTGATCTTATTTTTAGTTATTGTGAAACATTGAAAACTTTTCCTTAAAATATATACATCTTGTTAAAATATATACATCTCATATGTATGATAAGATATTAATAGATATTTATTAGTATATAGAAAAATAGATTTAATAAACAACAAATTTCTTTAAAATATATTATAAGTTATGAGTGTGATATCATGGATGAATATTTAATTAAAATCTAATGTGAGGTTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTAAATTAGTTTTATTTCTAATAGATGAACGTGAGATTTTCAACAATGTATCAAAATGTAAACTAATTTTAGTTTTGTATTCAAGTTTAAAAAATAAAAATATACTTAACTCAAAAAAATATTAATTAAAAAATGTTTGACTGGTTAAAACTTATCATCGTTGTATTTTCTAGACTACATGTATCACAGTATTTTTGTTCATATTATGAAAAGTGTCTATGCTACATAGTGCATGACAGAGTTTAAGGTCGAGAGTGACAAAATGCAAAAGGCGACGACTAAGAAACTACTCGGAAAAGTGATTTTAGTCTTGGCAAACACAACTTGATGATTTAGTCATTGAAAATCAACGTTTTTCCAATCGAACTTATTATTTCATATATTATTATATATGATGCGTGAAGATTGAAGAAAAAGCAAAGAAAAAGTCAATATTGTATTTATATTCAAACTAGTTGATTTGTGACTGAATATTGTGTTGAAGGCAAACTCTAGGTAGGTTCAGTAACATGACAATTTGACTTGACTTTTGTTAACTGAAAGGGTTAATTAGTAGCATCTATACAACGTTAAAATCGTTAAAATCGTTAAAATCGTTAAAATCATAGATGAAACACCTATCACAAGTGATAAATGCCTTCGGAATACTCATGCAGTCAAAGATAACCATGTATATTTTAATGGCTTTTGGAATTCAAGTTGTACAAACTCAACTTGTGGAAAATGTTTGAGAAGCTATAAAAACAGTTTATGATACTGTATAAGCAATTTTTAACTGTTTCCAGTCTTTTTCATAGATGAAAATAGTTTCACTGTATTTTCTTTCACTATAGAATAACTTACTCATAAATATTTACACTCAACTAGTGTTTCATTATGCACTTTTAGTAAACTTAAGATATTAATCTATGCCAATTACAGACCAAGACTTTTACCTTTCCAATAAAAATTTCTTTAAGATAAACTAAAAGATCTGTACAATTTCATAATGTCTTCATACTCAGTCCATATGCAACTTCTTTTATGTCTGAAAAATCTACTATTCCTCAGAAACTCTTAAGTGCCATAATATTATTTTAATATATAACATCACCAGCCGTGCTTTTTTATTCTTCTTTTTCATTCCACAAACCGCGGAAACAAGAATTTTCTCGGAAAAGGATAACCTAAAGAGGCAATGATGTTTATATAATTATAAAAAAATCAATTGACCCTACCCAAGTATATATACATGATTTATATAAACAAAGGAATGATGCATCATAAACATTTTAGAACTCAGAATAGGCCTTCAATTAATCCCTTTTTGGCGACCCTTCAAAAATCAAGCCACTCTTTGCCTTTTCAAAACGGAAAT


Gene Sequence:
>Vu_28955(-)
ATGCAAATCCCTTGGATAGTCAAATATCAATATGCAGCAACACTCTTCTTTGTTACCGTTGCTCTTACCAAAGTTACCTGTTTTCAGTTCAACTTCCCTTCCTTCCCAGATGACTCTAATCTACTGCTGCTCGGGAGATCAAGAATATTCTTAGATGCCATCCAAGTAACCCTTGATAATCGTAATTCTATAGAGAATTATTCTGGACGTGCTCTCTACAGTAAGCCATACCAACTTTGGAAACAGAAGAATAACCAAAATCAAATAGCTTCCTTCAACACCACTTTTGTGCTCAGAATCACTCCGGAAACTTCTCCTGGTGGTGAAGGCTTGGCCTTTATCTTAACTTCAGATAGGACTGTCCCAGAAAACAGTGATGGACAATGGCTTGGTATTGTAAATGCTACTTCCAATGGAACTTCACAGCCTGGTATTCTAGCCGTGGAGTTTGACACAAGACACAGTTTCACAGAAGATGGCCCTGACAATCACGTTGGCATCAACATAAACAGCATCAACTCCATCCAACAGGTTTCGTTAATGAACAATCGGCTCAATCTATCTTCAGGTCAAGATGTCAAATTTCACATTCAGTACATCAATGACACAATATCAGTTTTTGGTGCCATGAGTGGAACTTCTGAAGAATCCATGGAGACCCTCTTGGTATCTCCACCTCTTAATTTGTCTTCCTTTCTTCAAAAGGAGGTTTACATTGGCTTCTCGGCCTCAACAAGTAACTACACGGAGCGGAACTGTGTCAGATCGTGGGATTTCAGCGGGGATGATATTAGGGATGATGACAAAAGTCTCTTGTGGGTGGTTTATGTTGGCGTTCCAATCGTGATTGTTTTAATTATCATTGGTGGGTTGGTGATCTTTTTCTTGCGCTGGCAAAAGATTCGCCATATGGAGGGGCCAGAAGATGCATATCCAAGGATAGAGGATCAGATTAAATATTCCACTATGGCTCCAAAGAAGTATAAGCTAAGGGAACTAACGAAAGCAACTGGTGGATTCAGCCTTCAAAACAAGCTTGGACAAGGCGGGTTTGGAACTGTGTATAAGGGGCTACTGGAAAATAAAGAGGTAGCTGTAAAGAGAGTTTCCAAAAACTCACGCCAAGGGAAGCAAGAGTTTTTAGCAGAAGTGACAACAATCGGAAGCCTTCACCATAGAAATTTGGTGAAACTCACTGGTTGGTGCTACGAGAATAGAGAGCTTCTCCTTGTGTACGAGTTCATGCCTAATGGAAGCCTAGACAAGTACCTATTTGGTGACAAAGATTGTGGTAATAATTATGACTTTGAAGGAGGGTATTCTATAACATTGGACTGGGAAACTAGGCGAAGAGTGATTCATGGGGTGGCTCAAGCACTTGACTACCTTCACGATGGGTGTGAGAGAAGAGTTCTCCACAGAGACATCAAGGGCAGCAACATAATGCTGGACTCAGATTACAATGCCAAGCTTGGAGACTTTGGATTGGCTAGAACAATTCAGCAGAGAAATGAAACGCATCACTCTACAAAAGAGATTGCAGGCACACCCGGGTACATGGCCCCAGAAACCTTCCTGACTGGGAGGGCAACGGTGGAGACAGATGTGTATGCATTTGGGGTTCTTGTGTTGGAAGTAGTGTGTGGAAAGAGGCCAGGGAATGTGTATTCACAGGATGACTACAAGAACAGCATTGTGTATTGGGTGTGGGATTTGTATGGGAAGGGAAAAGTAGTTGGTGGTGTTGATGCAAGGTTGAAGAAGGAGGAGATTGTGGAGGAAGAGGTGAACTGCGTTCTTGTTCTTGGTTTGGCTTGCTGCCATCCAAATCCACACAAAAGACCATCGATGAGAACAGTTCTTCAGGTTCTGAATGGGGAAGCAGCTCCACCTGAAGTGCCTAAGGAAAGACCAGTTTTTATGTGGCCTGCTATGCCTCCATCCTTCAAAGATGCTGAAGATAGCTCCCTCATCCAGGGAACTATCACTCCTTTCACTGAAATCACTGGAAGATGA