Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28953 LG8 16431749 16433764 hypothetical protein Ahy_A09g045625
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Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/C 16431779 stop_gained p.Ser563*
C/T 16431811 missense_variant p.Met552Ile
A/T 16431812 missense_variant p.Met552Lys
C/G 16431880 missense_variant p.Gln529His
T/C 16431917 missense_variant p.Gln517Arg
T/A 16431990 missense_variant p.Arg493Trp
T/C 16431991 synonymous_variant p.Leu492Leu
C/A 16432024 synonymous_variant p.Val481Val
T/A 16432035 stop_gained p.Lys478*
C/T 16432277 stop_gained p.Trp397*
C/A 16432356 missense_variant p.Gly371Trp
G/T 16432519 downstream_gene_variant
C/A 16432695 downstream_gene_variant
T/C 16432903 missense_variant p.Ile288Val
G/A 16432904 synonymous_variant p.Ile287Ile
G/C 16432932 missense_variant p.Ala278Gly
C/A 16433197 missense_variant p.Gly190Cys
T/G 16433198 synonymous_variant p.Ser189Ser
A/G 16433227 synonymous_variant p.Leu180Leu
G/A 16433285 synonymous_variant p.Gly160Gly
T/C 16433459 synonymous_variant p.Pro102Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28953.1
MQIPWIVKYQYAATLFFVTIALTKVTCFQFNFPSFPDDSNLWVSKNSSIFLNAIQVSPDIRGPIHHYSGRVFYVEPYQLWKEKNNQNQIASFNTTFVLNITPETTPGGEGLAFILTSDRTVPENSDGQWIGIVNATSNGTSQPGILAVEFDTRHSFTEDGPDNHVGININSINSIQQVSLINTRLNLSSGQDVKFHIQYINDTISVFGAMSGTSEESMETLLVSAPLNLSSFLQKEVYVGFSASTSNYTQLNCVRSWEFSGDDIRDDDKSLLWVVYVAVPIVIVLIIIGGLVIFFLRRQKIRHMEGPEDAYPRIEDQIKYSSMAPKKFRLRELTKATGGFSLQNKLGQGGRRVINGVAQALDYLHDGCEKRVLHRDIKGSNIMLDSDYNAKLGDFGLARTIQQRNETHHSTKEIAGTPGYMAPETFLTGRATVETDVYAFGVLVLEVVCGKRPGNVYSQDDYKNSIVYWVWDLYGKGKVVGAVDVRLKKEEIKEEEVDCVLVLGLACCHPNPHKRPSMRTVLQVLNGEAAPPEVPKERPVFMWPAMPPSFKDAEDSSLIQGTLTPFTEITGR*


CDS Sequence:
>Vu_28953.1
ATGCAAATCCCTTGGATAGTCAAATATCAATATGCAGCAACACTCTTCTTCGTTACCATTGCTCTTACCAAAGTTACCTGTTTTCAGTTCAACTTTCCTTCCTTCCCAGATGATTCTAATCTATGGGTGAGCAAGAATTCAAGTATATTCTTAAATGCCATCCAAGTGTCCCCTGATATTCGAGGTCCCATACATCATTATTCTGGACGTGTTTTCTACGTAGAGCCATACCAGCTTTGGAAAGAGAAGAATAACCAAAACCAAATAGCTTCCTTCAACACCACTTTTGTTCTCAACATAACTCCAGAAACTACCCCTGGTGGTGAAGGCTTGGCCTTTATCTTAACTTCAGATAGGACTGTCCCAGAAAACAGTGATGGACAATGGATTGGTATTGTAAATGCTACTTCCAATGGAACTTCACAGCCTGGTATTCTAGCGGTGGAGTTTGACACAAGACACAGTTTCACAGAAGATGGCCCTGACAATCACGTTGGCATCAACATAAACAGCATCAACTCCATCCAACAGGTTTCGTTAATAAACACTCGGCTCAATCTATCTTCAGGTCAAGATGTCAAATTTCACATTCAGTACATCAATGACACAATATCAGTTTTTGGTGCCATGAGTGGAACTTCTGAAGAATCCATGGAGACCCTCTTGGTGTCTGCACCTCTCAATTTATCTTCCTTTCTTCAAAAAGAGGTTTACGTTGGCTTCTCCGCCTCAACAAGTAACTACACGCAGCTGAACTGCGTCAGATCGTGGGAATTCAGCGGGGATGATATTAGGGATGATGACAAAAGTCTCTTGTGGGTGGTTTATGTTGCCGTTCCAATCGTGATTGTTTTAATTATCATTGGTGGGTTGGTGATCTTTTTCTTGCGCCGGCAAAAGATTCGCCATATGGAGGGGCCAGAAGATGCATATCCAAGGATAGAGGATCAGATTAAATATTCCTCTATGGCTCCAAAGAAGTTTAGGCTAAGGGAACTAACGAAAGCAACTGGTGGATTCAGCCTTCAAAACAAGCTTGGACAAGGCGGGCGAAGAGTGATTAATGGGGTGGCTCAAGCACTTGACTACCTTCACGATGGGTGTGAGAAGAGGGTTCTCCACAGAGACATCAAGGGCAGCAACATAATGCTGGACTCAGATTACAATGCCAAGCTGGGAGACTTTGGATTGGCTAGAACAATTCAGCAGAGAAATGAAACGCATCACTCTACAAAAGAGATTGCGGGCACACCCGGGTACATGGCCCCAGAAACCTTCCTGACTGGGAGGGCAACGGTGGAGACAGATGTGTATGCATTTGGGGTTCTTGTGTTGGAAGTAGTGTGTGGAAAGAGGCCAGGGAATGTGTATTCACAGGATGACTACAAGAACAGCATTGTGTATTGGGTGTGGGATTTGTATGGGAAGGGAAAAGTAGTTGGTGCTGTTGATGTAAGGTTGAAGAAGGAGGAGATTAAGGAGGAAGAGGTGGACTGCGTTCTTGTTCTTGGCTTGGCTTGTTGCCATCCAAATCCACACAAAAGACCATCAATGAGAACAGTTCTTCAGGTTCTGAATGGGGAAGCAGCTCCACCTGAAGTTCCTAAGGAAAGACCAGTTTTTATGTGGCCTGCTATGCCTCCATCCTTCAAAGATGCTGAAGATAGCTCCCTCATCCAGGGAACTCTCACTCCTTTCACTGAGATCACTGGAAGATGA


Promoter Sequence:
>Vu_28953::LG8:16433764-16435764(-)
ATGGACGTGACAATTCTAGTTCTTTAAACATGAGGAGAAACGTGTAAACTACATGTAATCTACAATAAATTATTTAATAGATGTCCTAATATATACTTTGGTATATCCATTTTTTAATCATAATATCACAAAATATGTATTGATAATTTATATTACCGATTTTAATTATAACTATACATGATATACTAAAAATGCAGTATACAGTATTTTTCTATAATGAACAATAAGATAGTAATACTGTATATTTTTATATTTTAATCATAACAATAAAAAATATTTCTCAGAGACTGACTTTATCATGTACATCTCGTTAACATCAATAAAAAAAGATTAAATATTATTTTAGTGTAAGACTACATATTAATAAATTACTTATTTGTAGATAAAAAAATAAATTTAATAAACATTAAATTTCATCCGCTTAATTCAATTTTTCAAAATCTAAAATGAGACTTTAAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTTTTGAATTAATATTATCTTATCACGGGAAACTTTCAATAAAATTAAAATGTATTAAAATTTAAAAAATAAAAGAATTTTAATTTTGTTTCAATGATGAGAATTAAATATATTTAATTAAAAAAAATTGACTAATTAAAAAAATTACAATAAAAATTTATTTTATTAAAAACATAGTTATTTTTATTGTCATATACATACTTTTACTTTGTCAACTATGGATAACTATTTTAGCAAATATTGACTTGTAATAACTATTACAATCTGACAGAAAATTATAAGGAGAAACCATGACAGAGTTTAAGGTACAGTGGCAAAGTACAGAAAACGGCAACAAAGAAACTTGCAAAGGTGATTTTGGTGTTGGCAAACACAACTTGGTGATTTTAGTCATTGAAAATTATATTTTTTTCAGTCAAACTTTTTATTTTATATATTATTATGATGCGTCAAGATTGAATCAAAAGCATAGAAAAAGTCATAATTTTTATTTTATTTTATTTTCTAACTAGTTGATCTTGGCATATGAAATATTCTGTTAAAAGCAAACTCAAGGTAGGTTCAGTGGCATAATAATTTGACTTGACTTTTATGATCTGAAAGGGTTAGTACGTAGAATAACGTGTAAAAGTAGTTAAAACCATGGACGAAACACCTATCACATGTGATAATATAACCTTGAATAATCATTAATAAATAGCATGATAAATTCTTTCTTCCTCATCAGGTCAAAGATCAAAACCATGTATATTTTTATGGCTTTCGAACTCAAGTTCCATAAATATTTAAAATTATCGTATCACATAACCACTTCTGTAAATGTTTCAAAGTAGTTTATGATATTGTATAAACTGTTTTTAATAACGTTTTCCAATCTTTTTCCATTGATGTTTAATATGTTAAATGAAATTAGTTTCACTGTATTTTCTTTGACAATAAAATAACTTATTCATAAGCATTTGCACGAGAACTTAACTATAGTTTCATTATATTTTCAGCACTTTATTTAATAGAATTTAATAAGTTGTTTACCATCTTAAGATAATTTTTTTTAATCTATATACCAATTACAGAGACCAAGACTTTTACATTTCCTAATTAAACTTTATTTAACATAAGCTAAAAAAATCTTTAACTATTTCAATGCGTTCATACTTAATTAATATCCAACCTTTTCTGAATATGTATGAGAAACCTATTCTATTCCGCCGGCATTTTAAGTGTTATAATATTATTTTAATGGCATATGTTAACACCACCAGCCATTTTTTTTTCCTTTTCATTCCACAAACCGGAAACGCGAATTTTCTCAGGAAGAGACAACAATGTTTAGATAATTAAAAAAAAAAACAATTGACCAACCCATATGTGTGATACATGGTTTATATAAACAAAGGAATGATGCATCATAAATATTTCAGAACTCAGAATTGGCCTTCAATTTTTCCGGTGGTTGTCTAAAATCATTGCAAACCCTTCAAAACAGAAAT


Gene Sequence:
>Vu_28953(-)
ATGCAAATCCCTTGGATAGTCAAATATCAATATGCAGCAACACTCTTCTTCGTTACCATTGCTCTTACCAAAGTTACCTGTTTTCAGTTCAACTTTCCTTCCTTCCCAGATGATTCTAATCTATGGGTGAGCAAGAATTCAAGTATATTCTTAAATGCCATCCAAGTGTCCCCTGATATTCGAGGTCCCATACATCATTATTCTGGACGTGTTTTCTACGTAGAGCCATACCAGCTTTGGAAAGAGAAGAATAACCAAAACCAAATAGCTTCCTTCAACACCACTTTTGTTCTCAACATAACTCCAGAAACTACCCCTGGTGGTGAAGGCTTGGCCTTTATCTTAACTTCAGATAGGACTGTCCCAGAAAACAGTGATGGACAATGGATTGGTATTGTAAATGCTACTTCCAATGGAACTTCACAGCCTGGTATTCTAGCGGTGGAGTTTGACACAAGACACAGTTTCACAGAAGATGGCCCTGACAATCACGTTGGCATCAACATAAACAGCATCAACTCCATCCAACAGGTTTCGTTAATAAACACTCGGCTCAATCTATCTTCAGGTCAAGATGTCAAATTTCACATTCAGTACATCAATGACACAATATCAGTTTTTGGTGCCATGAGTGGAACTTCTGAAGAATCCATGGAGACCCTCTTGGTGTCTGCACCTCTCAATTTATCTTCCTTTCTTCAAAAAGAGGTTTACGTTGGCTTCTCCGCCTCAACAAGTAACTACACGCAGCTGAACTGCGTCAGATCGTGGGAATTCAGCGGGGATGATATTAGGGATGATGACAAAAGTCTCTTGTGGGTGGTTTATGTTGCCGTTCCAATCGTGATTGTTTTAATTATCATTGGTGGGTTGGTGATCTTTTTCTTGCGCCGGCAAAAGATTCGCCATATGGAGGGGCCAGAAGATGCATATCCAAGGATAGAGGATCAGATTAAATATTCCTCTATGGCTCCAAAGAAGTTTAGGCTAAGGGAACTAACGAAAGCAACTGGTGGATTCAGCCTTCAAAACAAGCTTGGACAAGGCGGGTTTGGAACTGTATATAAGGGGCTACTGGAAAATAAAGAGGTAGCTGTAAAGAGAGTTTCCAAAAACTCACGCCAAGGGAAGCAAGAGTTTTTAGCAGAAGTGACAACAATCGGAAGCCTTCACCATAGAAATTTGGTGAAACTCACTGGTTGGTGCTATGAGAATAGAGAGCTTCTCCTTGTATACGAGTTCATGCCTAATGGAAGCCTAGACAAGTACCTCTTTGGTGACAAAGATTGTGGTGATAATTATGACTTTGAAGGAGGGTATTCTATAACATTGGACTGGGAAACTAGGCGAAGAGTGATTAATGGGGTGGCTCAAGCACTTGACTACCTTCACGATGGGTGTGAGAAGAGGGTTCTCCACAGAGACATCAAGGGCAGCAACATAATGCTGGACTCAGATTACAATGCCAAGCTGGGAGACTTTGGATTGGCTAGAACAATTCAGCAGAGAAATGAAACGCATCACTCTACAAAAGAGATTGCGGGCACACCCGGGTACATGGCCCCAGAAACCTTCCTGACTGGGAGGGCAACGGTGGAGACAGATGTGTATGCATTTGGGGTTCTTGTGTTGGAAGTAGTGTGTGGAAAGAGGCCAGGGAATGTGTATTCACAGGATGACTACAAGAACAGCATTGTGTATTGGGTGTGGGATTTGTATGGGAAGGGAAAAGTAGTTGGTGCTGTTGATGTAAGGTTGAAGAAGGAGGAGATTAAGGAGGAAGAGGTGGACTGCGTTCTTGTTCTTGGCTTGGCTTGTTGCCATCCAAATCCACACAAAAGACCATCAATGAGAACAGTTCTTCAGGTTCTGAATGGGGAAGCAGCTCCACCTGAAGTTCCTAAGGAAAGACCAGTTTTTATGTGGCCTGCTATGCCTCCATCCTTCAAAGATGCTGAAGATAGCTCCCTCATCCAGGGAACTCTCACTCCTTTCACTGAGATCACTGGAAGATGA