Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28928 LG8 16147591 16150243 myb family transcription factor PHL5 isoform X4
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 16147892 intron_variant
T/A 16147938 intron_variant
T/C 16147983 intron_variant
T/C 16148044 intron_variant
G/A 16148139 intron_variant
T/C 16148141 intron_variant
C/T 16148157 intron_variant
G/A 16148221 intron_variant
C/T 16148231 intron_variant
C/T 16148254 intron_variant
A/T 16148747 intron_variant
A/C 16148782 intron_variant
G/A 16148931 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28928.1
MFDIIQASHMGTCNQPLAMASGGFEEEPHIGQTKSSSSIISRFESPASAFYATEICMGFPQYDRLVGNPSLISQFSKISDAEFPLYQSPRQNLFLASLANQPAPNFELSNPLQAMLLSHVNSDQCVRSPEKSNKISSGNFPGSSFLPIEQPKLFIDDASSPSVPCIGNQDQRISFSSQQEMLSPTLSAEATPKAILRLMESDGLTIFHVKSHLQKYRIAKYMPQSTQGKSEKRTNVENVHLDAKTGLQIREALQLQLDVQRRLHEQLEIQRKLQLRIEEQGKQLKMMFDQQQKTSDSNLSTLNLGNTTNNDRPISSKDVQVSVSEGSKRLLIPSNIT*


CDS Sequence:
>Vu_28928.1
ATGTTTGATATAATACAGGCTTCACATATGGGAACTTGCAATCAGCCACTTGCTATGGCCAGTGGTGGATTTGAAGAGGAACCACACATAGGCCAAACCAAATCATCTAGCAGCATTATAAGCCGTTTTGAATCACCAGCTTCAGCCTTTTATGCAACAGAAATCTGCATGGGATTCCCACAATATGATAGACTAGTTGGTAACCCCTCTTTGATATCTCAATTCTCTAAGATCAGTGATGCGGAATTCCCTTTGTATCAATCTCCAAGGCAAAACCTTTTCTTGGCTTCATTGGCAAACCAACCTGCCCCTAACTTTGAGTTGTCAAATCCCTTGCAAGCAATGCTCTTATCCCATGTGAATAGCGATCAATGTGTTAGATCTCCTGAAAAGTCTAATAAAATCTCATCTGGGAATTTCCCTGGCAGCAGTTTTCTTCCAATTGAACAACCCAAGTTGTTCATTGATGATGCTTCAAGCCCTTCGGTTCCTTGTATAGGAAATCAGGATCAAAGAATTAGCTTCTCTTCTCAGCAAGAGATGCTGTCACCAACACTCTCAGCAGAAGCAACGCCAAAAGCTATATTAAGGCTGATGGAATCAGATGGATTGACCATTTTCCATGTCAAAAGTCATCTGCAGAAATATAGAATTGCCAAATACATGCCACAATCAACTCAAGGGAAATCTGAGAAAAGAACCAATGTAGAGAATGTGCATCTTGATGCCAAAACTGGCCTGCAAATTAGAGAGGCTCTTCAGTTGCAGCTAGATGTTCAGAGGCGCCTTCATGAACAACTAGAGATTCAGAGAAAACTACAGTTAAGGATTGAGGAACAAGGTAAGCAGCTGAAAATGATGTTTGACCAACAGCAGAAGACAAGTGACAGCAACTTGAGTACTCTGAATTTGGGCAATACAACTAATAATGATAGACCTATTAGTTCTAAAGATGTTCAGGTTTCAGTTTCCGAAGGGTCTAAAAGATTACTTATTCCTTCCAACATAACTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_28928::LG8:16150243-16152243(-)
TTGGTTTAGACCATATAAAGATTTGTGAATCATTATTAATTTGGTGTCACTCAAGTATAGAAGCATATATTTTCACTAAGTCTTTATGAATTATATTAATAACAAACTTGGTTCATACGATTTGTATGCAATAACTTGATGAAAGTGGTAAATATATTATCTTTATTTTATATTTATCTTTAATTAGTTTGTTATTATTTTTTATTTATATTTTAGGCTTAATCAATATTTTTTTATTATAAATAGAGAATCTATGTTTATATTTAAACAGAAAGAAGATTAATCCATATATAATTTTTATTATATTCAACTTATATGATATATTATTTTTTTTATTAAAGATGTTTATGTTATTATATATACACCACACTTCTTTTTCACTTTTTATATTACCAAACAAGTGGATCTTTCTCTTTTTATGTTATAGACAACCTAAAACGTAATCTCATTTTATACTTTTTCTTTCCTAAACCAAACATGCTATTAAGCTAAACAATGACTTCAATTGATGTGAAAAATATTTACATCACTGCATACACTATTTTCTCTAAAACTATTGATTAAAATATTAACAATTAAGATTAATATAAAATTATGAAGTAATTAGAATCTCAATGATTATTTTCAGTAAATGGCTATAACTCTTTATATTTTTCTTGATTATAAGAGTAAAGTTACACTATTGGAGCAGCCATTTAAAAATTAACAACTCAACATGTTATAAGTCATTATATGAATCAAATTGACCTACAGTTAAAAGGTACTTGATGCATTTTGACCAAATTAAATCAATGGCAAGAAGGAAGTGATACAAGTGATGAATAATACAGTGAATATGTGTATATTGTTTTACCTTTCGGTAATGGAAAGACCATAAAAGTTACTGATCAATGTTGGAAATTCTGTAGTTGAAATTCTGTTCTGCTTTTAAGATGAATATAAGAAGTTAGCTACACTTTTCAGTAATTTCTGATACCCCACTTTGCAAGATGCAGTTTCATGCAATGGAACAAGGTTTTTGATTCTAATATATATTGTCTTCTTTTGGAAAGGAAGATTTGGCTATCTGTATGTTCATATTTATTACTACTGTGGGTGCCTAAAGCTATTTCTTCCGAATCCATTATAAGAATAGTTGCAGATCTTTAACCTGTGAATTTATGCCAGTATCTTTATCTAACATTTTATTATCACACTATAGATGCCAATAACAATATTCTACAATTTCAAGATCTTAAACTATTTAGTAATAGTTTGGGGCGGTTTTAAACCTCTGTTTGTGACTTGTTCAAGTTCGGTTGCTTTTAGCTTTCATCTTTCTTCTGATTCTCTTGCCTTTTCTTTTATATTCACTTCAAGACAACATTAGACAAAACTATTTTATTTGCTTATCGAGCTGTGTTGTTTTCTGTGTTATGTACTTCGGTTGTGTCAACAGAGAATAGACCAACAGGTGGAGTTAGGCTGTTTCAACTTAACAAGTAATTTGGATTTGAAGTCTTGGTTGTGTAACAGTTAAAAAAGTTTGTCATATATAACACTTTGGTTCAAACAAAATTGCTTTCTGTAGAGGATTTTGCAGTCTCAAAACAAAACAAAGAAATAACAAATAATGACCTTGCATGGTAGCATTTGGACAAATTAGATTCAAATCTTATTCCTGAAGCCTTCAGGAATATAAGACAGCACTTTATGCCATAAGGTTAGAATTTAGCCTAACCATTCTTACCTTTTCCAATCTTCTTGTTCATTTTCTGGTTCTTCTTTTCTTCTTCCCTTCACCATTCCCTTAATAAGGATCAACTTTCTCTTCATGCATGCTACTTCAGAAATTTGATCTGTTACTGAGAAACTCTTCTTGCCATCTTTGTTCAAATCTTGTGGGAACGTTTGGAGTGTCTATAAATGAACGAGTACAGGATTGATTGTGTTGGACGGATTCAACAAAGCTATGGTCTAAATGGGGATTTGAGTTCAGAGTTTGGCAATTGTTCTAGTCA


Gene Sequence:
>Vu_28928(-)
ATGTTTGATATAATACAGGCTTCACATATGGGAACTTGCAATCAGCCACTTGCTATGGCCAGTGGTGGATTTGAAGAGGAACCACACATAGGCCAAACCAAATCATCTAGCAGCATTATAAGCCGTTTTGAATCACCAGCTTCAGCCTTTTATGCAACAGAAATCTGCATGGGATTCCCACAATATGATAGACTAGTTGGTAACCCCTCTTTGATATCTCAATTCTCTAAGATCAGTGATGCGGAATTCCCTTTGTATCAATCTCCAAGGCAAAACCTTTTCTTGGCTTCATTGGCAAACCAACCTGCCCCTAACTTTGAGTTGTCAAATCCCTTGCAAGCAATGCTCTTATCCCATGTGAATAGCGATCAATGTGTTAGATCTCCTGAAAAGTCTAATAAAATCTCATCTGGGAATTTCCCTGGCAGCAGTTTTCTTCCAATTGAACAACCCAAGTTGTTCATTGATGATGCTTCAAGCCCTTCGGTTCCTTGTATAGGAAATCAGGATCAAAGAGTAAGTTTGTTGCCATCTCCATCTTTAGTTTTCTCTGTTGTTCATATGGCTTATGTTGTTATTGCTTCTTTTCTACCCTGAAGGATTGTTGTGGCTCATACAATTTACCTGCTGCACAGATTAGCTTCTCTTCTCAGCAAGAGATGCTGTCACCAACACTCTCAGCAGGTAGTTTGCTAACTTCTTCTGGAAACTCTTCTTCAAATGGACCAGTAGTCTCAAGTAAAACAAGAATAAGATGGACTCAGGAACTTCATGAGAAGTTTGTTGAGTGTGTGAATCGCCTTGGAGGTGCTGAGAGTAAGGGCTTGTATTGGTTCCCTTTTATTTTGAAAACTGTTTTCTAAAGTAGTTTCATACTTTTTGTTTGTTTTCATCTTGTTCAACTTCATCCATTTCATCATCTTCCAGCATTAAGAGTAACCTTGTTTAGTTGCATTTTGAGAACTAGACAGTTTCTGAAAATAGAAACCAGACATAAACTAATTAACTTGCTGAATTTTTCTCTGCATATTCAACATCTGATAGTCTTCTTGTCTACTTCATTGTAGAAGCAACGCCAAAAGCTATATTAAGGCTGATGGAATCAGATGGATTGACCATTTTCCATGTCAAAAGTCATCTGCAGAAATATAGAATTGCCAAATACATGCCACAATCAACTCAAGGTAATTTATTGGCACTGTTTCAGTGTAGTTTCTACATCATGCCAAATATATTTTGCTGCTCAAATGTTGAGATTGTTATGTCACTCATTTTTTATTGAATATGCTCAAGTTACAGGAGGTTGCAACTACTAAAAACCCTATATGTTTTTTCATGTATGACAGAAACCTTGAATTATTGAATGTCAAATTGATTTTATTTCTCAGCTGGATGATAATGATACATGAAATCGCCAAAACTATTGAATAAATGCTGTTGTGAACATGACCTCCACTGCTTTATTATTCTCCTGTTATTCATGATCTTCAATGCCCTTATGGTTATTATTGATTTTCAGACTACTTTATCATGTTTCAGGGAAATCTGAGAAAAGAACCAATGTAGAGAATGTGCATCTTGATGCCAAAACGTAACTCTACTTCTTTTGCCTAAGCCCCTGTTACCATTCCACAGTTCAAATAGTTCCATTCATGGTTATTTTAATATTTTCATTTGATGATGTGACTCTAATCAACTGAGTTTCTTGTTCTTCATCGTCAGTGGCCTGCAAATTAGAGAGGCTCTTCAGTTGCAGCTAGATGTTCAGAGGCGCCTTCATGAACAACTAGAGGTATATCATTTACTTTTTGGCTACTGTATCTCCATGCTCTCCTAACCTTACAGCTTCATACTTGCTACATGCTTATGTCTTCAATGACGTCATGGGAATATTAATCACACATTAATTGCTGTATCAAATTACATTAATTATTTTTAGAAGTTCGATACTCATTAGAGATAAGTTTACAATAGAGAAAAAATAGATACGCCTTGTAAAGGGTTAAGAGGTGGACTTTAAGCCTAACTCACTTCCCACAAAATCAGTTTGTAAGTGAGGTTTGCACTCAGTTATATATTATAAATTGATCTTATCTCTAGTCAACGTGGGACTTCCAACACAAAATAGTTTTGTAAAATTGAGTTAGACTTAAAATTCATTTCTTAACGTAGTATGAGAATCATAAGTGAGAGTCTCTCATAACAAAATTTGATGTTTATTGAGTTTATTGTTTTATTCACGAGTTGAGTTAAGCTTAAAATCTTTATCTTAACGCGTTTATTCTTAATTTATTCTTAATTTGTAAGTGAAATGAAGTTGGTCAAATTTGCATACTTGCTTAACCAAGTGCGATGGGTGGAAAAGCCCAAAGTTATGAAAATCAGAACTGCTTGGCAATGTTCTGAGTTAAAATTTTCTTTCAATTTACTTCACTGTTTCCAGATTCAGAGAAAACTACAGTTAAGGATTGAGGAACAAGGTAAGCAGCTGAAAATGATGTTTGACCAACAGCAGAAGACAAGTGACAGCAACTTGAGTACTCTGAATTTGGGCAATACAACTAATAATGATAGACCTATTAGTTCTAAAGATGTTCAGGTTTCAGTTTCCGAAGGGTCTAAAAGATTACTTATTCCTTCCAACATAACTTAG