Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28927 LG8 16132887 16134676 PREDICTED: myb family transcription factor PHL5-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/T 16132907 missense_variant p.Asp246Asn
C/T 16134368 synonymous_variant p.Pro103Pro

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28927.1
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CDS Sequence:
>Vu_28927.1
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Promoter Sequence:
>Vu_28927::LG8:16134676-16136676(-)
CTGACATAATTATTATATGAGGTTGTTGAGTGCATCAAAGTAATTATGCGTGTTTTATAATTGATTGGTTGCATGTTAGCTCACCCTACTTGTTTGTGTTTGTGTATGTGCGATGATCGTATAATTCGTTATACGGGAGCAGATGAAGGAATGTTGTCTGATTCAGTGCCAATGAAGAAAGAGATAGAAGAAGAAATTAGAAGAATTCGAATTATATTTATTAGTTTATAGTTGAAATATGAGTTTAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAACTATGAATTATCAAGTGTGAGATTAAGGAATATTAGCTTAAATGTAATGCTATAATATATCTATTAAGAATTATCAACTGTGAGATTACGGGATGTTACAATACGTACTTAACTTCAATTAAACTAATGCTATATCCAATAAACAATTACATTATATTTTATTAACATCATCCTAAGAGAGTGGGTTTAAGTAAATTGCAAGTAATATTATTTAAATTTTTGGGACTGTCTCAGTGAAAGTTACTATCAGCATTCATTGCATTTGAGAAAGCCATTGTTACACTGTTAGCATATGTGCTTCTACAGTTTTTAATTCTAAATGCAAAAAAGTCAACACTATTATCGATTTGTATGCTTTTGTACTAGCTTTTAATTATCTTTTTTTATAGTAAGTACACATTCACTTAACAGTTTAAAATATTAATATTTTAATCTTATTTTCTAGTTTTAAAGTGTTTATGTATTCTATTATATCATTAAATCAATGATAAATAAGATTTTTTTTTCAGTTGTGAAAGTATAATTTTCTTATTATTGCGCTAAATAAGTTTTTTTTTTTAAGTTGTACTCCAACAGCAGAGATGCTGTACTGCAAATGAAAGCAGTACTAACACTCCGGTTTTTTTTTTTCTTTCTCTACTTCATCTCTTTTCCAAGTGAAACTTCTCCTATTACTTTTTCAAGTAAGAAAAATAAAAGAAAACATAATATACGTTTTCTTTCATAAATCAAAATTATAATATACAAAAATTAAAAATAAAATGTTAAAAAACTATATTCAAACATACAAATTAACTGTTTTTACAAGACTCAACTCCACTCGTTGAACACAGATACTTGTTGACTCTACTTGAATTTATGTTTCTTCATAACCAGGTCAATCAATTAAATAACAAAAAAACCATTAAATAAAAACTATTTTTTGAAAAAAAAAAACTGTTAATAAAATTATTCATATATAGTTTACTAATTTATAATCTAAAAATTATTGACTAATTTATATACTATAGTGATTAATTAACTGTAGTGAATTATAAACTAAAAGTTATTTTTAAATAGTTTTCAAATTATAATTTCTATTTTATAACTTAGTATCTAAATTAGTTATTATAATAATTAATTATTGTTGATCTCTAAAATTGATTTTTGTTTAATGATATTTTTTGTAGTGATTTAAATATGTATTTTAACTAGGTTTTGGTTAAAGAATGTTATTTCGACGAGTCAATAATGTGCAATAAATATGAATATTAGATCAGATTTCATACTTCTTTTAATGAAATTTTTAGTTTGGAGTTTTTTAAATAGTAATTAATTAGTTTTTTCAGGAGGATAACATTGTCTGCGTGGACGTTATGTCGTCTTGTACAGCTTTTTGGAACCGATTTCATTTCGTCCTTGGTCTCGTGCATACTAACTTTAATTTTTTTATTATTTTATTAAACTTATAAATTAGGTGGTTAAACTTGGAATCTGATATACTTGCATACTATTTACGTACAGAAATAAATTGAAAATTAAGCCAATGATAGGTAACAGTGACAACTTTTAAGCACACATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAACATCAAAGAATTAGAAGTTTTCATCACTAAGACTACACT


Gene Sequence:
>Vu_28927(-)
ATGTATCATTCTCCGCAGGAGTTGAACGGAGTTCATAACAGTGTGGCCAACGTTGGAGGCTCAGAAAACAACAGCTTCAACTTCCAACATCATGAGCAACATCTGTTTGATGTCCCCGTTTCATGTTTGAACTTCGATTCGCAAAATTTTCTGTGCCAGTCTTCTGGAGACCACTCGCCTCCACTGTTCGGAAGTGTTGTTGATTCCTTCTTATTCAGCCATGAAGACACGTTCTGTGAAACGTATAATGTTTACGAGCATTTCAGAAACGAGAAAAAGAACATCTTGGAGGGTGGTGCTTCTGCCCCGGTTAATGGGGTTCGTGCTTCGTGTTTATGATTGGTGTTTTGTTTTTGAGTGAGGTCTATGAATTTGATATTGGATTTTTGCTCTCTCAGGTTGAGGTTGTTTCTGCCACTTCTGGAAACTCAGCTTCTAGCATGGTTCCAACGAGGAAAAAAGGAATAAAATGGACCAAAGATTTGCATCAACAGTTCGTAGCAGCTGTTAACAATCTTGGTGGTGCTCAAAGTAAGTTAATTAAGTTCAAATTAGAGGACAAAATAGAATTATAGTCACTTGTGTTTTAAATTTCAGTTTGGTGGGATAAGTTTGAAGATATTTCAGTTTGATTTCTTCAAGTTTCTCAATTAGAACAAATTAATCCTTTTATTAGTGAAACATGACAAATTATGAAAAATTATCACATTAGAGAACAATGTCAAAGATATAAGGAGTTGCATTTAACTTTGTATAAAGTTTAAACTATGGAGAAGAGAAGCTACAAATAGTCATGAAAATTTTCGTTGTCTTTTTTTTTCTAACTTGCAGAAGCAACGCCCAAGGCAGTGCTAAAGATGATGAATTCAAAGTCCCTGACAATTTTTCATGTTAAAAGCCACTTGCAGGTTGCAATCTTTTCTTAACGAATTAGCTTTATGTTCTTGAATTCTATGTTACTTACTAGTGTAACATAATTGGCATTACTTGGGTGCAGAAATATCGATCCACTATGTACGTGAAGAACACTTCCAGAGGTATAAATTCTTGTTCAATATGTTCATGTATGTATAGCAGAAATGGATGCCTTGTTATGTCATGTAATTAACAGTTATGCTTTTAGTCATTATCTTGCTTATTATTGTCAAATATTACTTAAATAATAAAAAGAGTTTGAATTAATTGCATATATACTCTTCTATGGATTAAATCACCTCCCACTGTTGTCTTTCCAATGCAGAAGGGCACGAAGAAAGTCATGGCAGAGACATGGTGACTGAACTTCAGCAGAAAATGTAACGTAGTACCATGCAACAGTTATTAGGTTTATTCAATTATTAGGTTGTTTAGATTAACTAAAGTATAAAATCTCATATTCTAAAAATTCTTCTAATTTTTCATGTGCAGAAGTTAATTTTATTTTTGTTATTTCTCATTTTTCTAGCAGCTAAGAAGCTGGTCCAAATGTCTGATCTTTTTTCTCAAAATTACTTCCATATCACTTTATACAAATGTTTCTAAAACGTAATTGAATGTTTCTGGCAGATGTATGCAAATTGAGGAGTCAAGAAAACTGCAACTTGAGATTGGGAGGGGTATTCAAGAACAATTAGAGGTGCGTGAAAATTTTCATTTTCAGATTTTCAAAATTTGTGAATGTTAATTCTAAAAAGATAATCCCAAATCTACTCTTATCTTTTTACTTTTCTGGTTTTCAGCTGCAACGAAATCTGCAAATGCTAGTCCAAGAACAAAAGAAACAGGTCAACGATGCAAACAAAGTAAATTGA