Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28926 LG8 16110331 16114159 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/G 16110739 missense_variant p.Trp169Arg
T/C 16111518 intron_variant
G/T 16111595 intron_variant
A/T 16111613 intron_variant
C/G 16111875 intron_variant
C/A 16112433 intron_variant
C/T 16112491 intron_variant
G/A 16112601 synonymous_variant p.Ser58Ser
A/C 16113400 intron_variant
A/C 16113440 intron_variant
A/T 16113444 intron_variant
A/T 16113461 intron_variant
A/C 16113543 intron_variant
G/T 16113600 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28926.1
MVQPAQPPRCQVQGCNADLSGAKAYYSRHKVCAMHSKSPTVIVAGLEQSSSQVTSEINFRVSDSLCQKMLLGFICSLNLIKESEAAAGDLPAIMSAGESLHPAPSDNNGRAGGFLMEFASYPKLTLRNTLPTPRSAEPLPGNHAATWQTGSDTPSEFFMHGSGSGGTSFIGSKHPFVESYTGVTDSNCALSLLSNQTWGSRITQPSVELNNNNNNNNLLNFNGTSITQFTAASSQVAAIHQLPNATSWYLKTLDSPEGVPDLGLGQISPSLHSHLHGELDLPHQGRRHYMDLGDSRACESSQWSL*


CDS Sequence:
>Vu_28926.1
ATGGTGCAACCGGCTCAGCCTCCTAGATGTCAGGTTCAGGGCTGCAATGCAGATCTGAGTGGAGCTAAGGCTTACTATTCTAGGCACAAGGTTTGTGCCATGCACTCCAAGTCTCCAACGGTCATTGTGGCTGGTCTGGAACAGAGTTCAAGCCAGGTTACATCTGAAATTAATTTCCGCGTCAGTGACTCATTGTGCCAGAAAATGCTACTGGGTTTCATCTGCTCTCTGAATTTGATCAAGGAAAGCGAAGCTGCCGCCGGCGACTTGCCGGCCATAATGAGCGCCGGCGAAAGCCTCCACCCAGCTCCATCAGATAACAATGGTAGAGCTGGTGGCTTTCTCATGGAATTTGCTTCATATCCAAAGCTTACATTGAGAAACACCTTGCCAACTCCAAGATCAGCCGAGCCACTACCCGGAAACCATGCTGCAACCTGGCAGACCGGCTCAGACACACCATCTGAATTTTTCATGCATGGATCAGGGAGTGGTGGAACAAGCTTCATTGGTTCCAAACATCCTTTTGTGGAAAGCTACACCGGAGTCACTGACTCAAACTGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAAATCAAACATGGGGTTCCAGAATCACACAACCAAGTGTTGAACTGAACAACAATAATAACAACAATAACTTGTTGAATTTCAATGGAACATCCATAACACAATTCACTGCTGCTTCCTCACAGGTTGCAGCCATCCATCAACTTCCAAATGCCACCTCATGGTACCTGAAGACCCTTGACTCGCCGGAGGGTGTTCCTGATCTCGGCCTAGGCCAAATTTCGCCGTCTCTTCATAGCCATCTTCATGGTGAGCTTGATCTGCCACATCAGGGTAGGAGGCATTACATGGATCTTGGGGATTCCAGGGCCTGTGAGTCTTCTCAGTGGTCACTTTAA


Promoter Sequence:
>Vu_28926::LG8:16114159-16116159(-)
AATTCTGTACTAGTGTACTCTAATACCTACAATTTATATTAAATTCTATAAATATAATGAGTATGATATATTTAAAATATAAACAATTACAATCTTATAATAATTAAAGCTATTTTTTTAAAATTTAGTAATAATTAAAATAATTTAACATTTTAGTAATGATCAGATATAGTTATTAAAAGAAAAAAAAAGATTTTTTATTTATTTTTACTACAAATTAAAATTCTTAGTAATTTAGAAAAAAAATAATAATGCATTAATATTAATTTTTCTCTAATAATAAATACATAATGATTATTAAAAACGAAATACTATTGTTTTTTATTAAATTAAAAATAAATATACAATACTTTACTGTATGAAATGACTAAATATTTAAGTTTTATTTATATTAAAAAGTAGAAGCTCCATTTTCTATCCTGCATTGTTCAGCTGCGTGGTCCTTGGATTTGTACAGACAAGTTCTCACATCTCACTGACAACTTTCTTAAGTAACTTTTATTTTCTTTTATCTTTACATGTAACTCTTCCACCAACCCCCACCTTTATCCTTTATCACTTCTCTCTCTTTCTTTCCAAAGAGTAACATCATAAATTTAAATATTTTTATTAGAATAAAATTTCCAAAAAAAAAATTAAGTATAATAACAAAAGGACTAAAACAAACTAAATACTTTAACTTGTTTTGTCCTAATTTTTTAATACACAATAAGATACTATTATAATATTTTCTACTTTAAGACAAACTAAATACTTTATAAGACATTATAATAATTTTCTACTTTAAGGTATATGATAAAGATAGTATTTAATGATATCTTAACAAACTTAGTATTCCAGTCGTAGTTTTCACATCTATAACCGTCCACGTGCACATTAGTCCGAATCTTTTGAAGATGAGTAGGTTCATAGTACAAAAGTGATAATTACAACATTGAAATAGGAGTTTATATAATAACATTAATAAAAAATAATAATAGTAAGACATCAAAAGTAAGAGAATAAAAATGAGAAAATCAAACATGAAGCATGAAATATGTCATTAATCTTTTTCTTCTCATATATTATAGAAAAAAGAGGTCTTGTTAGGTAAACATTAATTAGGATAATAAATAATGATAATTTTAAAACATAATTTTTTGTGACTTAATATGTTCTAAGAGTAATAGTAATTCTAGGTTTTTTAATTATCTACTTAGATCTTTTAATTTTTTTGGTTTATGCAAATGGTAAACGAGAAAATGGCGGTTTCAACTACGTTGAACATTCTTAATAAGATTTCCACCTTTATTAATTGAATTGGAATATTTAACTGGACTGTGCATATTTTCTTGATTGTTGAGCTTAAAACGAATGAACTTTGTAATGATAAGTTCATTTTACGGGACAAATTAAACCTAATAGGCCATAGATCTAAAAATTATGAACACTTAGTATATAGTAGGTTTCTCTGGCTGAAAAATATAATTTAATTTCTAAATATCATAAAATATTTTAATTATTTAACATGCTCAGAAAATATATATTATAACAACACTACATGTGACATTTGATAATATAGTTATATATATTTTCAATAGTTGCAATATTTAAAAACTGACCACCAAATATTAATTTGTATTCACGGATCATATTAGCTAATCAAACATTATTCTATTATTACGAGAATGAATCGTAAAATCACAAAGATAAATTTTTCATGTTCTAAACCATAATTTGCTAAAGATGTTTAGTTTCATTCTATATATAATTCTCCCTCATTTTTTGTCAAATAGATAGAATTTAAACTATAAAGTGAAGAAGAAGATAGTCTCTCTTTCTTTCTTTACTGACTGGGTTATATAAATAAATTGATTTAATTTTAAGAAAATAGCTGTATATTTTACTTCATCCACGTAACAAATACTTGTATTTATGTATTGTTTTAAAGTTAAAAACAGACGATCGAAAATAATAAAAAAGATGAATATAAAGTTTGAAAAATAAACAAAAATAAAAAA


Gene Sequence:
>Vu_28926(-)
ATGGGTAGCTAGAGAAGGCTTGAGCATCAGCATCAGCAGCAGAAGCAGCGAGCAGCAAGAATGAGTTTTTCTGGTTCAGTGAGCAAAGCAGCAGTACCCTCTTCCTCCTCATCACCCAACTCTTCCACTGAGTCGCTTGATGGGTTGAAATTTGGCCAGAAAATCTACTTTGAGGATGTGAGTGTTGGAGCTGCTGCAACCACTCAAGGGGCCAAAACAAGTGGTGGGGTTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCAAAGAAGGGAAGGGGTGGCTCAGTGCAACCGGCTCAGCCTCCTAGATGTCAGGTTCAGGGCTGCAATGCAGATCTGAGTGGAGCTAAGGCTTACTATTCTAGGCACAAGGTTTGTGCCATGCACTCCAAGTCTCCAACGGTCATTGTGGCTGGTCTGGAACAGAGGTTTTGCCAACAGTGTAGCAGGTTACCCTCTTTCTCTCTCTTTGTTTTTCTTTATTATTGACTTAATAAAGGAAATTTTTCTTTTCTTTCTTATTCTTTAGCTTCTTGCTATTTTTGGTGTTGTTTCTATATTGGGTAGTCTTCTTCTTTTACTTTCATCATCTTACATCCTGCTTTGCTTTTTGCTATTTTTATCAGTTTTCCTTACTTTCGTCATTTTGCATCTTCGTTTTTGCTATTTTTAGTGATTTTCCTTCTTTTTAGTGTTTTTTTTTTCTATTTTTAGTGCTTTTGTTATATTGCTAGTTTTTGAAAAAAATAATAATAGTCAATTAGTGATGTGTTTGGATTAATTTCATGGTTAAAAATGGTCAATTATTTTTTCCAATGATGAAGGCAAACATGGTGCATCCATTTTTTCGTGGTTATTGACTAAATATTTTGCATTTGTTTTTAGACAGAGTTGCTTGTTTTAAATTTCAGGGCATTCAGCAAGCTGTTTCTGTTCCTTGTGATTGCTTTCTGTAGAATTTCTATTGTTACTGTTGATTCATGGGCTTCCCTTCATAAATTAAGTGTGTGTGAAGTGAACTGTTGCAAGTTTTGTTTTGTCTTTTGGTTTCTGATGCTACTTATTGATTCGAGAATGGCTCATTTTTCTGGATTTGATGTATCTGTTGTTACCGTGAGTTATAAATGATAGCATACAATAGAAAAGAAGTTACCGTGAAAAGAAAGGGGATTTATCAAGGGAAGGCAAAAAAGAGGTCTAGAAATGAGAGTGAAACATGATTTAAGCTGCATAACAAGTGAAAAAATGTGGAATGGACTCAGATAAGTGAAGAATTCATGATTGCTGTTTAGGCATACTATACTACATCTTCAGAACTGTCAATATGTAGGTCAATATTTGGAATAATGAATTCATGAAATACTATTTCCCCTTTTAATCTGGTACGTGAAGAGGGTAGGAAAGTGAGGAAGAGACTCATATCTTTTGGAAGTTAGATGTTAACAGAGGAGGGATTGAGCTCTTAAATAAAGATTATCATTATGGCACCTGAATTCTGATCCAGCTCTTAAAAACTGTTTATCCTTTTCTGTTTAATAGTTCAAGCCAGGTTACATCTGAAATTAATTTCCGCGTCAGTGACTCATTGTGCCAGAAAATGCTACTGGGTATTTTTTGGGATGTTTTTAATGGCCAAATGATACTGACATGTGTGTAATATTGGAAGTGGAAGGTTATCATGACGGAAAAATGCTACTTTTCTGGATTGAGATATCTTATGGATGATTCTCTTCATGAAGAACTAAAGTTTTCAAATTAAGATGTTCCCTTTGTAAAATTTCCAACTTTTGAAACATACAAATTTGTGCTCTAAAATAATGATATGGATCTCATACACCTTCACTGATCTTGTGTGATGTGGGATCTGTATTGTATTTTGAAAGAAAATCTCATCTAAGTGACTTCATGTTTAATCTTACTCACTGACAACGATGGATGTTAATCACTTACGTTGAAAAATGGTATTTAACAACTAAAAAGTGTTGGGAATTTTTGAATGGTGTATCCTGGTTTATGGATATTGTACATATTGAAACCCTTTGAGTGGGAAAAAGACTTCGGTTGTTATTTTTTCTCTTCTGCTTTCAGACATGGTTGGAAACATATGGTTTTGATTATCCAATATTTGTGGCTAATTGGTTACTAATTGAAGTTAAAGTTCAGTTTTATTCAACTAAGGGTAGTTGAGAGGATGGTCTGTAAGTGTTATTTATAGTAACTGACTTTCATGTTCATTTTCATTTTCATGGAAGCTGCATTGGTACACACACATACACACACACACCTTAAGCATGTTGTATATCAGTCTAAATTGTGTTTAACTCAAGTTCAGTTGTCTTCTGTTTCATAAGAAGAGTTTAAACATACCTTAAGCCAGCCTGCTATTTAAGCTTTATCTGAGTTTGTAATTTGGCGTTATTATATTTTATATATAGTTTCTGTGACCTTCCTTAAATTGGAAGGGTATTATGTCTTGGTGTTACATAATCTTAAATCATATTCCCTTTACTTCAAATCTCAATTGTCTAAGACACCTACCCATCAAGGCTATGTTTTTTTGCCCATGCCATTGCAACCCTCAGTTTAAAACCTTTGGTTCTGTTGCCAATTATGTTATCCATCATCAAATGCACGAACATTTCTGCATGTACTGATAAGAAGCAATCTTGACATATTAGAAATTCTCAATCGTTCTCTTTTGTAGCATACTACTTAAACCTGGTTATGTTTCTGAAATCTTGTGTCTGCTCATACTATCTTTTGTAGCATGCTTTACATAAGCTTGGTGGCCGATATATTTCAGAACTGCTAATATTCTCTTTGTTAGTCCTTGCCCAGGTTTCATCTGCTCTCTGAATTTGATCAAGGAAAGCGAAGCTGCCGCCGGCGACTTGCCGGCCATAATGAGCGCCGGCGAAAGCCTCCACCCAGCTCCATGTTAACATCTCGCAATGGCAGGCTTTCGTCCTCTATTTTTGGTTAGAATTTATCAGAACATCAATTCCAAACCTCTCTATGTACTTAGTGCATGTTTGGTTTGGCATGGATCAAGTCAAATGTTGATTTATAATCCAAATCCAAATTGAAACTACTTTGAGTAATTTCCATGTTTTACATCCAAAACATGGATTCAACTCCAAACCAAACATGCACTTATGTATCCTAGGACGTATCAATAATTTCAGGTTTTGCTCTTGCTTGCCTATAAAACATTCAACTGTTTCACTCATGTTCAGCAGATAACAATGGTAGAGCTGGTGGCTTTCTCATGGAATTTGCTTCATATCCAAAGCTTACATTGAGAAACACCTTGCCAACTCCAAGATCAGCCGAGCCACTACCCGGAAACCATGCTGCAACCTGGCAGACCGGCTCAGACACACCATCTGAATTTTTCATGCATGGATCAGGGAGTGGTGGAACAAGCTTCATTGGTTCCAAACATCCTTTTGTGGAAAGCTACACCGGAGTCACTGACTCAAACTGTGCTCTCTCTCTTCTGTCAAATCAAACATGGGGTTCCAGAATCACACAACCAAGTGTTGAACTGAACAACAATAATAACAACAATAACTTGTTGAATTTCAATGGAACATCCATAACACAATTCACTGCTGCTTCCTCACAGGTTGCAGCCATCCATCAACTTCCAAATGCCACCTCATGGTACCTGAAGACCCTTGACTCGCCGGAGGGTGTTCCTGATCTCGGCCTAGGCCAAATTTCGCCGTCTCTTCATAGCCATCTTCATGGTGAGCTTGATCTGCCACATCAGGGTAGGAGGCATTACATGGATCTTGGGGATTCCAGGGCCTGTGAGTCTTCTCAGTGGTCACTTTAA