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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
ricebean (Vigna umbellata) under genetic enhancement of minor pulse

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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28914 LG8 15934524 15937269 myb family transcription factor PHL5 isoform X4
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 15934823 intron_variant
C/T 15934825 intron_variant
G/T 15934838 intron_variant
A/G 15934895 intron_variant
C/T,* 15934915 intron_variant
G/A 15935032 intron_variant
A/G 15935166 intron_variant
T/G 15935297 intron_variant

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28914.1
MNEYRIDCVGRIQQSYGLNGDLSSEFGNCSSQCFDIIQASHMGTCNQPLAMASGGFEEEPHIGQTKSSSSIISRFESPASAFYATEICMGFPQYDRLVGNPSLISQFSKISDAEFPLYQSPRQNHFLASLANQPAPNFELSNPLQAMLLSHVNSDQCVRSPEKSNKISSGNFPGSSFLPIEQPKLFIDDASSPSVPCIGNQDQRISFSSQQEMLSPTLSAEATPKAILRLMESDGLTIFHVKSHLQKYRIAKYMPQSTQGKSEKRTNVENVHLDAKTGLQIREALQLQLDVQRRLHEQLEIQRKLQLRIEEQGKQLKMMFDQQQKTSDSNLSTLNLGNTTNNDRPISSKDVQVSVSEGSKRLLIPSNIT*


CDS Sequence:
>Vu_28914.1
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Promoter Sequence:
>Vu_28914::LG8:15937269-15939269(-)
CTATTAAGCTAAACAATGATTTCAATTGATGTGAAAAATATTTACAACATCACTGCATACACTATTTTCTCTAAAACTATTGATTAAAATATTAACAATTAAGATTAATATAAAATTATGAATATAAAATTATGAAGTAATTAGAATCTCAATGATTATTTTCAGTGAATGGCTATAACTCTATATTTTTCTTGATTATAAGAGTAAAGTTACACTGTTGGAGCAGCCATTTAAAAATTAACAACTCAACATTAGAGATGGCAAAAGAATCTGCGCTCGCGGATATCCGCAAATAAAATCCGCGACGGATAGTTGATACCCGCGGATATTTACTACCCGCAACCCGCGGGTAGCAGATGGTTTAATACCCGCTTATAAATGGGTCGGGTGCGGGTATTATACTATCCGTATCCGTGGATACCCGCTACCCGCAAAAAATAAAAATAAAAATTTAATTTATATTTTATTAAGTTAAATTTAATTAAAATTAACATTAATTTATATTTTACAAGATTAAATTTAATTAAAATTGAATTTAAATTTATATTTAATTTAATTTATATTATATTTTATATATTTTTTGTAATTCTATTTAAATTTTATTTTAATAATTTATTAAAATATTTTTTTTAATATTTGCGGGTATCCGCGGATATCCACGGGTATCCGTGGGTTTTAAAATACCCGCGAATATTTTTTAAGCGGATATCCATGCGGGTAGCAAGTCGGGTAGCAGATGGATTTTCTTTTGTCGGGTCGAGTTGCGGGTAGGCACTATCCGTGCCCGACCCGTTGCCATCCCTCCTCAACATGTTATAAGTATTTATATGAATGAAATTGACCTACAGTTAAAAGGTACTTGATGCATTTTGACCAAATTAAATCAATGGCAAGAAGGAAGTGATACAAGTGATGAATAATACAGTGAATATGTGTATATTGTTTTACCTTTCGGTAATGGAAAGACCATAAAAGTTACTGATCAATGTTGGAAATTCTGTAGTTGAAATTCTGTTCTGCTTTTAAGATGAATATAAGAAGTTAGCTACACTTTTCAGTAATTTCTGATACCCCACTTTGCAAGATGCAGTTTCATGCAATGGAACAAGGTTTTTGAGTCTAATATATATTGTCTTCTTTTGGAAAGGAAGATTTGGCTATCTGTATGTTCATATTTATTACTACTGTGGGTGGCTAAAGCTATTTCTTCCGAATCCATTATAAGAATAGTTGCAGATCTTTAACCTGTGAATTTATGCCAGTATCTTTATCTAACATTTTATTATCACACTATAGATGCCAATAACAATATTCTACAATTTCAAGATCTTAAACTATTTAGTAATAGTTTGGGGCGGTTTTAAACCTCTGTTTGTGACTTGTTCAAGTTCGGTTGCTTTTAGCTTTCATCTTTCTTCTGATTCTCTTGCCTTTTCTTTTATATTCACTTCAAGACAACATTAGACAAAACTATTTTATTTGCTTATCGAGCTGTGTTGTTTTCTGTGTTATGTACTTCGGTTGTGTCAACAGAGAATAGACCAACAGGTGGAGTTAGGCTGTTTCAACTTAACAAGTAATTTGGATTTGAAGTCTTGGTTGTGTAACAGTTAAAAAAGTTTGTCATATATAACACTTTGGTTCAAACAAAATTGCTTTCTGTAGAGGATTTTGCAGTCTCAAAACAAAACAAAGAAATAACAAATAATGACCTTGCATGGTAGCATTTGGACAAATTAGATTCAAATCTTATTCCTGAAGCCTTCAGGAATATAAGACAGCACTTTATGCCATAAGGTTAGAATTTAGCCTAACCATTCTTACCTTTTCCAATCTTCTTGTTCATTTTCTGGTTCTTCTTTTCTTCTTCCCTTCACCATTCCCTTAATAAGGATCAACTTTCTCTTCATGCATGCTACTTCAGAAATTTGATCTGTTACTGAGAAACTCTTCTTGCCATCTTTGTTCAAATCTTGTGGGAACGTTTGGAGTGTCTATAA


Gene Sequence:
>Vu_28914(-)
ATGAACGAGTACAGGATTGATTGTGTTGGACGGATTCAACAAAGCTATGGTCTAAATGGGGATTTGAGTTCAGAGTTTGGCAATTGTTCTAGTCAATGTTTTGATATAATACAGGCTTCACATATGGGAACTTGCAATCAGCCACTTGCTATGGCCAGTGGTGGATTTGAAGAGGAACCACACATAGGCCAAACCAAATCATCTAGCAGCATTATAAGCCGTTTTGAATCACCAGCTTCAGCCTTTTATGCAACAGAAATCTGCATGGGATTCCCACAATATGATAGACTAGTTGGTAACCCCTCTTTGATATCTCAGTTCTCTAAGATCAGTGATGCGGAATTCCCTTTGTATCAATCTCCAAGGCAAAACCATTTCTTGGCTTCATTGGCAAACCAACCTGCCCCTAACTTTGAGTTGTCAAATCCCTTGCAAGCAATGCTCTTATCCCATGTGAATAGCGATCAATGTGTTAGATCTCCTGAAAAGTCTAATAAAATCTCATCTGGGAATTTCCCTGGCAGCAGTTTTCTTCCAATTGAACAACCCAAGTTGTTCATTGATGATGCTTCAAGCCCTTCGGTTCCTTGTATAGGAAATCAGGATCAAAGAGTAAGTTTGTTGCCATCTCCATCTTTAGTTTTCTCTGTTGTTCATATGGCTTATGTTGTTATTGCTTCTTTTCTACCCTGAAGGATTGTTGTGGCTCATACAATTTACCTGCTGCACAGATTAGCTTCTCTTCTCAGCAAGAGATGCTGTCACCAACACTCTCAGCAGGTAGTTTGCTAACTTCTTCTGGAAACTCTTCTTCAAATGGACCAGTAGTCTCAAGTAAAACAAGAATAAGATGGACTCAGGAACTTCATGAGAAGTTTGTTGAGTGTGTGAATCGCCTTGGAGGTGCTGAGAGTAAGGGCTTGTATTGGTTCCCTTTTATTTTGAAAACTGTTTTCTAAAGTAGTTTCATACTTTTTGTTTGTTTTCATCTTGTTCAACTTCATCCATTTCATCATCTTCCAGCATTAAGAGTAACCTTGTTTAGTTGCATTTTGAGAACTAGACAGTTTCTGAAAATAGAAACCAGACATAAACTAATTAACTTGCTGAATTTTTCTCTGCATATTCAACATCTGATAGTCTTCTTGTCTACTTCATTGTAGAAGCAACGCCAAAAGCTATATTAAGGCTGATGGAATCAGATGGATTGACCATTTTCCATGTCAAAAGTCATCTGCAGAAATATAGAATTGCCAAATACATGCCACAATCAACTCAAGGTAATTTATTGGCACTGTTTCAGTGTAGTTTCTACATCATGCCAAATATATTTTGCTGCTCAAATGTTGAGATTGTTATGTCACTCATTTTTTATTGAATATGCTCAAGTTACAGGAGGTTGAAACTACTAAAAACCCTATATTTTTTTTCATGTATGACAGAAACCTTGAATTATTAAATGTCAAATTGATTTTATTTCTCAGCTGGATGATAATGATACATGAAATCGCCAAAACTATTGAATAAATGCTGTTGTGAACATGACCTCCACTGCTTTATTATTCTCCTGTGATTCATGATCTTCAATGCCCTTATGGTTATTATTGATTTTCAGACTACTTTATCATGTTTCAGGGAAATCTGAGAAAAGAACCAATGTAGAGAATGTGCATCTTGATGCCAAAACGTAACTCTACTTCTTTTGCCTAAGCCCCTGTTACCATTCCACAGTTCAAATAGTTCCATTCATGGTTATTTTAATATTTTCATTAGATGATGTGACTCTAATCAACTGAGTTTCTTGTTCTTCATCGTCAGTGGCCTGCAAATTAGAGAGGCTCTTCAGTTGCAGCTAGATGTTCAGAGGCGCCTTCATGAACAACTAGAGGTATATCATTTACTTTTTGGCTACTGTATCTCCATGCTCTCCTAACCTTACAGCTTCATACTTGCTACTTCATGCTTATGTCTTAAATGACGTCATGGGAATATTAATCACACATTAATTGCTGTATCTAATTACATTAATTATTTTTAGAAGTTGGATACTGATCAGAGATAAGTTTACAATATAGAAAAAATAGATACACCTTATAAAGGGTATAAAGGGTTAAGAGGTGAACTTTAAGCCTAACTCACCCCACAAAATCAGTTTGTAAGTGAGGTTTGCACTCAGTTATATATTATGAATTGACTTTATATCTAGTCGATGTGGAACTTTCAACACAAAATAGTTTCGTAAAATTGAGTTAGACTTAAAATTCATTTTTTAACATAGTATCAGAATTATAAGTGAGAGTCTCTCCTAACAAAATTTGATGTTTATTGAGTTTATTGTTTTATTCACGAGTTGAGTTAAGCTTAAAGTCTTTATTTTAACGTTTATTCTTAATTTGTATGTGAAATGAAGTTGGTCAAATTTGCATACTTGCTTAACCAAGTGCGACGGGTGGAAAAGCCCAAAGTTATGAAAATCAGAACTGCTTGGCAATGTTCTGAGTTAAAATTTTCTTTCAATTTACTTCACTGTTTCCAGATTCAGAGAAAACTACAGTTAAGGATTGAGGAACAAGGTAAGCAGCTGAAAATGATGTTTGACCAACAGCAGAAGACAAGTGACAGCAACTTGAGTACTCTGAATTTGGGCAATACAACTAATAATGATAGACCTATTAGTTCTAAAGATGTTCAGGTTTCAGTTTCCGAAGGGTCTAAAAGATTACTTATTCCTTCCAACATAACTTAG

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