Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28793 LG8 14325073 14326875 PREDICTED: TP53-regulating kinase-like
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Annotations  
category   relationship type   keyword
Pathway   B 09181 Protein families: metabolism   C 01001 Protein kinases [BR:ko01001]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 14325183 upstream_gene_variant
G/A 14325249 missense_variant p.Thr196Ile
A/G 14325792 upstream_gene_variant
C/G 14325803 upstream_gene_variant
G/A 14325818 upstream_gene_variant
G/A 14325819 upstream_gene_variant
G/C 14325869 missense_variant p.Leu181Val
C/G 14325973 upstream_gene_variant
C/T 14326055 upstream_gene_variant
G/T 14326222 missense_variant p.Leu102Ile
G/A 14326243 missense_variant p.Pro95Ser
C/G 14326334 synonymous_variant p.Val64Val
C/T 14326492 synonymous_variant p.Arg44Arg
T/A 14326533 missense_variant p.Arg31Trp
G/T 14326583 upstream_gene_variant
C/T 14326686 upstream_gene_variant
G/T 14326716 upstream_gene_variant
G/A 14326759 upstream_gene_variant
A/C 14326813 splice_region_variant&synonymous_variant p.Ala21Ala
C/T 14326872 missense_variant p.Ala2Thr

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28793.1
MATETDSRDSALSLLKQGAEARVFESSFVGRRCVVKERFSKKYRHPTLDSKLTLKRLNAEARCVTKARKLGVCTPVLYAVDPVLHTLTFEYVEGPSVKDIFLEFGSRGLGEEGLDNIATQIGHAIGKLHDGGLVHGDLTTSNMLLKNGTNELVLIDFGLSFTSTLPEDKAVDLYVLERAILSMHSSCGNVMDRILTAYRKSSKQWSSTLNKLAEVRQRGRKRTMVG*


CDS Sequence:
>Vu_28793.1
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Promoter Sequence:
>Vu_28793::LG8:14326875-14328875(-)
TAATATGATGAAACGAATGGTATAAAAATGTTATGGATATTGTATGATACTTATTTGAATAGAGTGTGGTTTAAAATGTTGAAATATAAGTAATACTTAAAAGGATGATAATGTTAATGTTGGATTGAACATATGGTTGAAATTTGTATACCATGTAACTATATTGTTAACTATTTAACTTATATGTGGATATGTGATATGAATAAGGAAGAAATTATGTGGGATACCAATGTTATGAAATAGTTTGGTTAGAGATTTTATGTGAACTCTCGTTAAGTATGGAATCTACATGTTGAAATATCATAACTTTAATAGACTCACAAACTCATACAAATGATATATAATAATTATAGTTTATATGCTTAACATCAGTTAATTATTAATTATGAAATGCTATTAACATGATTGTTACTGGGGTTAAAAGATAACATCGACATCAGTATTATTACTATAGTATTGATTGTACAGGTAATAATAATAGTAAGAGTGGTTATAATTATACCTAATTCACTCCAAGAATGTTTTGAAAGAAGATTACCTGTAAGTAAAGATCAAGATAGAAACAAACATTCCGAAGAGTTTAAAGATAAAATAAAATAGTTTTTCATGTCATAAACTACATTGGATATTATTCATTGTATTTGAATATTCCTATAGTAGCTCAGTCTTTAATTTTGTTTCCATATAAAGTTGAAATGAATAAATTGTTTAACTACTTATAAAGAATTATAAAATACCAACTTTTCTTTTTATCTCGTAATTTTCCGATCTATAAAATCAATTGATCTTAAAAACAACTCTGAAAAATGAAACAATTTATAATTAATCCAACTAAAATAATATTTGTTGTCATGAAATATCATGTGTTTTAATATTCATTTAATTTTTCTAACATCCTCAGCAAGGGACTAAAGTGCAAAAGGAAAACATTAAACAACTCAATTTTTTTTCTAGTTTGCTTTATTTATAAAACAAACAAGAGTTTTCAAATGTCCTCCCATTACAATGGACCAACTTTGTTGATAAAAACCACCTAATTCAATTTAAATCTTATATTACTTAAATTCAATTCACTTTCCATTTTAGTCTTATTTTTCTTTATTTCGAAAAGTTATTAAATAAATAATGAGGTATGCATGAAATAAATAAAACACAATTTAATTTGTTTTCATTGCATATAGAAAAAAACATTAAAATTTAAAAAATCTTACATTTGAAGTATTTATTATAAATTTAATATACTTTATATATTTGTCATGTATTTTAATCATAAAAATAAATATTTATCTTATAAAATAAAATACACATAATAAAATATTAATTATATATGGATGCATAATTTAAGGACCAAGGAAATTAGGATCCTAACGGAAAACCAGAGTCATTCACAGTATCAACTGCAAATAACCAACACTACCTTTAACCTTCTTTTTTTTCCTCTGTTCAGTACATCGCAACCCACTAACGTTTTAGGTACATTTTCTACCCATTTCACTCTAATCTTTTTCTCCCTTTTCTTTTTTCTTTTTCTTCCGCCCTGTGCTTCCAGTAAATGTTTTTATTCTGCATGCTATGTGTTTGATGAAAAGCTTGAATGGTTCTGTACTGAAGTGGGTCTTGTAGTATGTAATTTTTGTTGTTCGTTGCTGGTTCTTTAGTTAAGAGCATGCATTTCTTATATATTACTTAGCCGGTTGAATATTGTGAATCAGTTTGTCTTCTAGATTTCTACCCGTTCCTTATTACATATTTTTTTGTCGCTTTAATTCCAATTTTTTTGGCTCATTGCATAACTGCCACAAAGGGACTCTCCTTTCTCCTTGTCAGCAACAAGTACACGCATACTGCACACCCTCCAAATTTTCTTCTACATCTTCAACACTGATAATAAAGTTTCTGGTAGCAGCATTTTTTTTTCTGTTGTATAACTTTTTTTTTTCTTTTCTGGGCTGGAAAAGGGTTAAACGCCAGGAATTTCACTGCCAGAAACGTTCAACACC


Gene Sequence:
>Vu_28793(-)
ATGGCAACTGAAACTGACTCAAGAGATAGCGCTCTCTCTTTGCTCAAACAAGGAGCGGAGGCTGTAAGTATAACTGTAAAGTGTCTCTGGATTTGTAGTGCAATTAAATCTACCTTCTGTATAAAATTTCAATCTTTCTTCTTTTATTGCTGCACCCACCTTGAAGTGCAACTGATTTCTACCTTTTGTGTAGAGTTTCAATTTTTTTTTTCGTTTACTTGTTCTACCCACCTTCATGGATTTTATTTTATTCATGAACTCCTGATTTATCTTGTTTTCCAAATCTTTATGCCTCTTTGATGTGCTTTTGTGTAGAGGGTTTTTGAGTCTTCTTTTGTGGGAAGGAGATGTGTTGTCAAGGAGCGCTTCTCAAAGAAGTACAGGCATCCAACTTTGGATTCTAAATTGACACTGAAGCGCTTAAATGCGGTTAGATTTAGAAAAAAAGAATTGTAATTTCCCCCCATATTTAAGCATTGTTTTTGTTGCTTTTCTTGTTTCACCGATGCGATGCGATTTTGGAGCAGGAGGCGAGGTGCGTGACCAAAGCAAGGAAACTTGGGGTTTGTACTCCTGTGCTGTATGCTGTGGATCCTGTGTTGCACACTTTAACGTTTGAGTATGTCGAGGGCCCTTCAGTCAAGGATATATTTCTTGAATTTGGTTCTCGTGGCCTTGGTGAAGAGGGTCTGGACAACATTGCTACCCAAATTGGTCATGCAATTGGAAAACTGCATGATGGTGGTCTTGTTCATGGTGATTTAACAACATCAAACATGTTGCTCAAGAATGGTACCAATGAGTTGGTGAGTTCATTCATGCCTTCTTAGATCATGTGGTATCCAATTATCCTCCATTCATGTTATGCACCCTGAGAAATATTATCAATTTGTGTTACAGTAGCCAAATGAATTGTTTGTAGGTTCTTATTGATTTTGGTTTGAGCTTTACTTCAACTCTACCGGAAGATAAAGCAGTTGATTTGTATGTTCTGGAAAGAGCTATTCTGTCAATGCATTCTTCATGTGGGAATGTGGTAAGCCAGCTTTCCAATTTCCCCTGACTGCCATTCGATATAGAAAATTGAGATGAAAACAGGATTTTATTTGTCTGATTTGAGAATTTAAATGAGAGTGCACTCCAAAGTCGGCCATAAATAAAATATGGCACATTAATTTTCTTAAGCATGCTTTTGGTTAATATTTTAATTGAAGAAGATAATGGAGCTCTTCTGCCATGCTTGTGATTAGCCTTTTGACCATTCACCAATGGATAATAAAGAAAGGTTTTTTTTCTATTTCTTTTTTTCTACTGTTACGGTATTGAATAGGATTAGCTCCTCCATTGTGAGATGAGTGCATCAAGTTTTGTTGGGGGTCAAAGAGACAGTATTGAATAAGATTAACTCCTCATCGATCAAGAATCAATCTTTCTTTTTGCCAGAGAGGATTAGATTTACTTAAACTAGCCCAGAAATCCATGCCATTCTAGTGAAGGTGAAGGGGACTGAATCATTATTATTCTGAAATGTGCTTTCTGCTTAGACAAATAGAAGTTTTGAACAGATAATCAATTCAGTTTTAGGTTAATTTCGGATTTTATCTGGACAGATGGATCGGATACTTACTGCATACCGGAAGTCATCAAAACAGTGGTCATCCACATTGAACAAGTTGGCAGAAGGTTAGCTGCCTCATATACTTGTATAAATTGAACTTTTCTTAAGCACCGTCTTCTTACCTCCATACATTTTAACAACTTTTAGTGAGGCAAAGAGGACGAAAGAGGACCATGGTTGGATGA