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Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28682 LG8 12639644 12655569 PREDICTED: serine/threonine-protein kinase TIO isoform X2
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category   relationship type   keyword
Biological Process   involved in   embryo sac cellularization, embryo sac cellularization, cytokinesis by cell plate formation, male meiosis cytokinesis, protein phosphorylation, male meiosis cytokinesis, cytokinesis by cell plate formation, cytokinesis by cell plate formation, male meiosis cytokinesis, protein phosphorylation, cytokinesis by cell plate formation, male meiosis cytokinesis, cytokinesis by cell plate formation, cytokinesis by cell plate formation, protein phosphorylation
Cellular Component   is active in   cytoplasm
Cellular Component   located in   nucleus, phragmoplast, nucleus, phragmoplast
Molecular Function   enables   protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, kinesin binding, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein serine/threonine kinase activity, protein binding
Pathway   B 09132 Signal transduction   C 04341 Hedgehog signaling pathway - fly [PATH:ko04341]
SNP Position Effect Amino acid change
C/A 12640002 intron_variant
T/C 12640024 intron_variant
G/T 12640051 intron_variant
A/G 12640082 intron_variant
C/G 12640106 intron_variant
T/C 12640183 intron_variant
A/G 12640191 intron_variant
C/A 12640213 intron_variant
A/T 12640233 intron_variant
A/T 12640234 intron_variant
A/G 12640239 intron_variant
G/A 12640276 intron_variant
G/A 12640277 intron_variant
T/C 12640290 intron_variant
G/A 12640308 intron_variant
T/G 12640318 intron_variant
T/C 12640352 intron_variant
T/A 12640360 intron_variant
C/G 12640361 intron_variant
T/C 12640572 synonymous_variant p.Leu1388Leu
C/T 12640634 missense_variant p.Asp1368Asn
A/G 12640635 synonymous_variant p.Thr1367Thr
G/A 12640649 missense_variant p.Pro1363Ser
C/A 12640650 missense_variant p.Gln1362His
C/G 12640662 missense_variant p.Arg1358Ser
G/A 12640670 synonymous_variant p.Leu1356Leu
C/A 12640721 missense_variant p.Gly1339Trp
A/T 12640777 missense_variant p.Leu1320Gln
C/G 12640874 missense_variant p.Gly1288Arg
T/A 12640992 synonymous_variant p.Gly1269Gly
T/C 12641044 missense_variant p.Gln1252Arg
G/A 12641063 stop_gained p.Arg1246*
T/C 12641207 missense_variant p.Thr1228Ala
A/G 12641275 intron_variant
T/C 12641280 intron_variant
C/A 12641283 intron_variant
G/A 12641328 intron_variant
G/A 12641395 intron_variant
T/A 12641411 intron_variant
T/A 12641452 intron_variant
T/A 12641453 intron_variant
T/A 12641458 intron_variant
G/C 12641535 intron_variant
T/C 12641664 intron_variant
G/T 12641678 intron_variant
C/G,* 12641686 intron_variant
A/T 12641786 intron_variant
C/A 12641858 intron_variant
A/T 12641865 intron_variant
G/T 12641897 intron_variant
C/T 12641948 intron_variant
C/A 12641966 intron_variant
T/G 12641971 intron_variant
A/T 12641982 intron_variant
A/T 12641993 intron_variant
G/T 12642118 intron_variant
G/T 12642146 intron_variant
C/T 12642269 intron_variant
C/T 12642340 intron_variant
G/A 12642410 intron_variant
C/A 12642432 intron_variant
A/T 12642451 intron_variant
C/A 12642512 intron_variant
A/T 12642765 missense_variant p.Ser1178Thr
G/T 12642796 missense_variant p.His1167Gln
T/A 12642811 synonymous_variant p.Gly1162Gly
T/C 12642895 intron_variant
A/G 12642896 intron_variant
A/C 12642977 intron_variant
T/A 12642995 intron_variant
C/G 12643081 intron_variant
T/A 12643146 intron_variant
C/T 12643528 intron_variant
G/C 12643755 intron_variant
G/C 12644015 intron_variant
T/G 12644135 intron_variant
T/C 12644537 missense_variant p.Ile1036Met
T/C 12644584 missense_variant p.Met1021Val
A/G 12644767 intron_variant
T/C 12644779 intron_variant
A/G 12644813 intron_variant
A/G 12644830 intron_variant
C/A 12644839 missense_variant&splice_region_variant p.Glu1007Asp
G/A 12644980 synonymous_variant p.Gly960Gly
G/C 12644997 missense_variant p.Leu955Val
A/T 12645152 stop_gained p.Leu903*
A/C 12645451 missense_variant p.Asn803Lys
G/A 12645457 synonymous_variant p.Asn801Asn
A/T 12645478 missense_variant p.His794Gln
T/C 12645486 missense_variant p.Ser792Gly
G/T 12645666 synonymous_variant p.Arg732Arg
T/A 12645769 synonymous_variant p.Arg697Arg
G/T 12645788 missense_variant p.Thr691Asn
A/G 12645823 synonymous_variant p.Ser679Ser
G/C 12645996 missense_variant&splice_region_variant p.Leu622Val
C/G 12646036 intron_variant
T/G 12646081 intron_variant
A/C 12646107 intron_variant
T/G 12646126 intron_variant
C/T 12646324 missense_variant p.Ala584Thr
A/T 12646380 stop_gained p.Leu565*
G/A 12646555 synonymous_variant p.Leu507Leu
C/T 12646663 missense_variant p.Gly471Arg
T/G 12646748 intron_variant
G/A 12646803 intron_variant
A/T 12646887 intron_variant
A/G 12646982 missense_variant p.Phe428Ser
A/G 12647036 intron_variant
G/C 12647113 intron_variant
T/A 12647169 intron_variant
T/C 12647301 intron_variant
C/T 12647442 intron_variant
G/C 12647459 intron_variant
T/C 12647524 intron_variant
T/C 12647616 intron_variant
T/C 12647622 intron_variant
C/T 12647738 intron_variant
C/*,T 12647776 intron_variant
G/A 12647792 intron_variant
T/A 12647810 intron_variant
A/T 12647816 intron_variant
C/A 12647817 intron_variant
C/A 12647834 intron_variant
G/A 12647838 intron_variant
T/C 12647882 intron_variant
G/A 12648001 intron_variant
T/A 12648108 intron_variant
A/C 12648135 intron_variant
G/T 12648143 intron_variant
A/T 12648488 intron_variant
A/G 12648550 intron_variant
G/A 12648566 intron_variant
A/G 12648587 intron_variant
G/T 12648692 intron_variant
G/T 12648917 intron_variant
A/C 12648967 intron_variant
A/C 12648976 intron_variant
C/G 12649016 synonymous_variant p.Leu408Leu
T/G 12649023 missense_variant p.Lys406Thr
G/C 12649039 missense_variant p.Pro401Ala
A/T 12649047 missense_variant p.Leu398Gln
T/A 12649167 missense_variant p.Lys358Met
C/T 12649265 intron_variant
T/A 12649282 intron_variant
G/A 12649283 intron_variant
A/T 12649356 intron_variant
A/G 12649357 intron_variant
T/A 12649460 intron_variant
A/C 12649510 intron_variant
G/A 12649580 intron_variant
A/T 12649783 intron_variant
A/T 12649820 intron_variant
A/G 12649959 intron_variant
A/G 12649986 intron_variant
C/T 12649987 intron_variant
A/C 12650002 intron_variant
G/A 12650008 intron_variant
A/G 12650018 intron_variant
A/G 12650075 intron_variant
T/A 12650121 intron_variant
A/T 12650137 intron_variant
A/T,G 12650175 intron_variant
A/T 12650178 intron_variant
A/T 12650182 intron_variant
T/A 12650225 intron_variant
G/T 12650226 intron_variant
G/A 12650269 intron_variant
A/G 12650307 intron_variant
A/T 12650316 intron_variant
T/A 12650319 intron_variant
T/G 12650327 intron_variant
T/A 12650359 intron_variant
A/T 12650373 intron_variant
A/T 12650375 intron_variant
A/T,* 12650380 intron_variant
A/T 12650382 intron_variant
C/A 12650390 intron_variant
A/T 12650392 intron_variant
G/A 12650399 intron_variant
G/T 12650410 intron_variant
T/C 12650416 intron_variant
A/G 12650421 intron_variant
C/A 12650423 intron_variant
A/G 12650429 intron_variant
A/T 12650444 intron_variant
A/T 12650632 intron_variant
G/A 12650663 intron_variant
A/T 12650789 splice_region_variant&intron_variant
G/A 12650803 missense_variant p.His354Tyr
A/G 12650890 stop_lost p.Ter325Glnext*?
A/G 12650896 missense_variant p.Tyr323His
G/C 12650998 intron_variant
T/A 12651010 intron_variant
C/T 12651047 intron_variant
A/C 12651093 intron_variant
C/G 12651145 intron_variant
T/G 12651217 intron_variant
T/C 12651249 intron_variant
A/T 12651323 intron_variant
A/G 12651368 intron_variant
G/A 12651412 intron_variant
C/A 12651417 intron_variant
A/G 12651419 intron_variant
C/T 12651426 intron_variant
T/A 12651578 intron_variant
A/G 12651796 intron_variant
A/T 12651948 missense_variant p.Leu292His
C/T 12652101 intron_variant
G/C 12652223 synonymous_variant p.Arg244Arg
T/C 12652328 splice_region_variant&intron_variant
T/A 12652461 intron_variant
T/G 12652898 intron_variant
A/G 12652943 intron_variant
T/G 12653094 intron_variant
T/A 12653139 intron_variant
C/T 12653225 intron_variant
C/G 12653314 intron_variant
A/C 12653689 intron_variant
A/C 12653692 intron_variant
A/T 12653731 intron_variant
C/A 12653740 intron_variant
T/A 12653794 intron_variant
A/G 12653959 intron_variant
T/C 12654184 intron_variant
A/G 12654187 intron_variant
T/C 12654188 intron_variant
T/G 12654212 intron_variant
T/A 12654352 missense_variant p.Glu94Val
G/A 12654753 intron_variant
T/C 12654858 intron_variant
A/T 12654909 intron_variant
A/G 12654960 intron_variant
T/A 12654978 intron_variant
C/T 12655052 intron_variant
G/T 12655094 intron_variant
A/C 12655116 intron_variant
C/T 12655318 splice_region_variant&intron_variant
A/T 12655481 missense_variant&splice_region_variant p.Leu30Gln
T/A,* 12655505 missense_variant p.Lys22Met

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28682.1
MGVENYHVIELVGEGSFGKVYKGRRKHTGLTVAMKFIMKHGKTEKDIHNLRQEIEILRKLKHENIIQMLDSFESPQEFCVVTEFAQGELFEILEDDKCLPEGQVQAIAKQLLCDFGFARAMSTNTVVLRSIKGTPLYMAPELVREQPYNHTVDLWSLGVILYELFVGQPPFYTNSVYALIRHIVKDPVKYPDRMSPNFKSFLKGLLNKAPESRLTWPALLEHPFVKETSDEHEARELREINGSRMRSEAERMVEGKTIQTPTGKNNHMAGMEGHIASPLQSEAQLNGHNIDRTNSSVLDDSPGFSNQNIVESGCQRLDRLENNSRTVKSAKIIGQDNEALGHILLPLQKWSKGSQNICSDQDVPQSNQSLRILSNLVAAGAFNSSGRIDELIRELLVFTGSVIAIKSSEVTDMIAKGFSITKILLDNGGSCFSRSYLSHWVEFVEIYSQVVASNNDASGRVLYESSACITVMLSGVAQVLMSSQISGQETSNETANKILDHAKTMGLVDHLCLCLATSGSSLISGSSNMLRAASEACRAIWSLINALDILFMKKCAILFPINALRSHSLHRMEVLQHEQNLFDKADSAKIVDSMTRAFLRSKAVQVAVYYCFHQRLESAMNCCLQLLSRCCLHNEIVPAVLCGLPSSLPVTTVVSGGGDGTIVSEVFTVLSLCSSSVNKDAQSIEPSNVKFKLTTPSALVRHSCLVLAIIAQCLKSTGRNSAMFMLTTAPKKQLARLSVLSHHISHDDKIKASIEPQSASAMLALASILSLESGALVESPISEIAIPLIPRTSTLSDHLKFSCGNENELDPCNFSGKLSYWQGVRDGYVGLLDSRIKWGGPLAVQQLCASGIPLLLMGLLGNDVLNASHGTDHQNDRVGLSPIGVVWTISLLCHCLSGGALVYRQILIRNEHIKLISNLICDVHIKLVKCWIGPGGGKAGVRDLINAVIDILAFPFVALQNAPGLPSATASVSSGFLLNMGSPGQRVCMEDKGIVKAIEEDMGKYIKILVEVGVPGIILRCVDHMDLNDLGRPVAFLAKIVCHRPLAIQLVSKGLLDPNRMRKLFDCSGPKEVTLDALMIISDLARMDKVFYEYIKGATILEFLKDFLSHEDPNVRAKACSALGNMCRHSAYFYSSLARHQIVGILIERCSDPDKRTRKFACFAIGNAAYHNDLLYEELRRSIPHLANLLQMAEEDKTKANAAGALSNLVRNSDKLCEDIVSKGAVQLVAPTDEFKVQPSRCSHSMVGIRAAPRRQGVGLEDGGSGEELFEDGGREGFGGFTFDEGFEGDHGFKAFLALHRVIQVAVADELECAIKDGSEVVALVVGRRRTILGWGAAGTGGGGFLGCSPDSFWRRSLLLIRRRYQPLPSTDANRKCHHKCHLVAPSRALSLPQIEDQTKKKKRTTKALNPGRNDSGNESPLKIALFSLAKMCAHPLCRQFIRSSPLFPVIGRLQQSPESSIAKYASVIIGKVADP*


CDS Sequence:
>Vu_28682.1
ATGGGCGTTGAGAACTACCACGTGATTGAACTCGTAGGCGAGGGTTCCTTCGGGAAGGTATACAAGGGAAGGCGCAAGCACACGGGGCTGACCGTTGCAATGAAGTTCATAATGAAGCATGGGAAAACTGAGAAGGATATTCACAATTTAAGGCAGGAAATCGAGATCTTAAGAAAGTTGAAGCATGAAAATATCATTCAAATGCTTGATTCCTTTGAAAGCCCGCAAGAATTTTGTGTCGTTACAGAATTTGCACAAGGTGAGCTATTTGAGATTCTTGAGGATGATAAGTGCCTTCCGGAAGGCCAAGTTCAAGCAATTGCAAAGCAATTGCTTTGTGATTTTGGGTTTGCACGTGCAATGTCTACAAATACAGTTGTTTTGCGATCTATAAAAGGCACTCCGTTGTATATGGCTCCAGAGCTTGTACGTGAACAACCTTACAACCACACTGTAGATTTATGGTCTCTTGGCGTCATACTGTATGAGTTATTTGTTGGCCAACCACCATTTTACACAAATTCTGTATATGCTCTCATCAGACACATTGTTAAGGATCCTGTTAAATATCCTGATCGCATGAGTCCAAATTTCAAAAGCTTTTTGAAGGGTTTGCTTAACAAGGCACCGGAAAGTCGTCTAACTTGGCCGGCTCTTCTTGAGCACCCATTTGTTAAAGAAACCTCTGATGAACATGAGGCCAGGGAATTGCGAGAGATAAATGGTTCACGCATGCGCAGTGAAGCAGAACGGATGGTTGAAGGGAAAACCATTCAAACTCCAACAGGCAAAAACAATCACATGGCAGGTATGGAGGGGCATATTGCTTCACCGCTTCAGAGTGAAGCTCAGTTAAATGGTCATAACATAGACAGAACTAACTCTTCAGTGCTTGATGATTCCCCGGGATTTTCAAATCAAAATATCGTAGAGTCAGGCTGCCAAAGATTGGACAGACTTGAAAATAACTCTCGTACAGTTAAAAGTGCAAAAATAATTGGTCAAGATAATGAAGCGTTGGGACATATTCTGCTACCACTGCAAAAATGGTCAAAAGGATCTCAAAACATTTGCAGTGATCAAGATGTTCCTCAATCAAATCAGTCATTGAGGATTCTCTCAAACCTAGTTGCAGCTGGTGCCTTCAATTCTAGTGGACGAATAGATGAACTAATAAGAGAGCTTCTTGTGTTTACTGGATCTGTTATAGCCATTAAGTCCTCTGAAGTTACTGACATGATAGCAAAGGGTTTCTCTATCACTAAGATTTTGCTAGATAATGGCGGAAGTTGCTTTTCAAGATCTTATCTAAGTCACTGGGTTGAATTTGTTGAGATCTATTCTCAGGTTGTAGCATCAAATAATGATGCATCTGGAAGAGTTCTCTATGAATCCAGTGCTTGCATTACAGTCATGCTGTCTGGAGTTGCTCAGGTGCTCATGTCATCTCAAATTTCAGGCCAAGAGACATCGAATGAAACAGCTAACAAAATTTTAGACCACGCAAAAACGATGGGTTTAGTGGACCATCTATGTCTGTGTTTAGCCACATCTGGATCAAGTCTTATTTCTGGTTCTTCCAACATGTTAAGGGCTGCTTCTGAAGCATGCAGAGCTATCTGGTCTTTGATTAATGCACTGGATATTCTTTTTATGAAAAAATGTGCCATTTTGTTTCCCATTAATGCGTTGCGCAGTCATTCTTTGCATAGGATGGAAGTTTTGCAACATGAGCAAAATCTCTTTGACAAAGCAGATTCAGCAAAAATTGTTGATTCAATGACAAGAGCATTTCTTAGATCTAAAGCTGTCCAGGTTGCTGTTTACTATTGTTTTCACCAACGACTTGAGTCTGCAATGAATTGTTGTCTTCAGCTTTTGTCAAGGTGCTGCCTACATAATGAAATTGTTCCAGCTGTCCTTTGTGGTCTTCCCAGTTCCCTTCCGGTGACTACTGTTGTTAGTGGGGGTGGTGATGGAACTATTGTTTCAGAAGTTTTCACTGTTTTATCATTATGCAGTTCCTCTGTTAACAAAGACGCACAGAGTATAGAACCAAGTAATGTAAAGTTCAAATTAACAACTCCTTCTGCTCTGGTTCGACATTCATGTCTTGTTCTCGCAATAATTGCTCAGTGTTTGAAGTCAACGGGAAGAAATTCAGCAATGTTTATGCTCACTACCGCACCAAAGAAGCAGCTTGCTCGACTTTCGGTGCTTTCACATCATATTAGTCATGATGATAAAATAAAAGCCTCCATCGAACCTCAAAGTGCATCAGCCATGTTGGCTTTGGCATCCATTCTGTCTCTCGAGTCTGGGGCTTTAGTTGAGTCTCCAATATCTGAAATTGCAATACCTTTAATTCCTCGAACCTCTACACTAAGTGATCATCTTAAATTTTCATGTGGCAACGAAAATGAATTGGACCCTTGCAACTTCAGTGGGAAACTCTCTTATTGGCAAGGGGTAAGAGATGGGTATGTTGGTCTTTTAGATTCCAGAATCAAGTGGGGAGGACCATTGGCTGTTCAGCAGTTGTGTGCAAGTGGCATTCCTCTACTTCTTATGGGCTTATTAGGCAATGATGTTTTAAACGCATCTCATGGAACCGACCATCAAAATGATAGAGTTGGATTGTCTCCAATTGGTGTTGTATGGACAATTTCATTATTATGTCATTGTCTTTCTGGAGGTGCTTTGGTATATCGTCAAATTTTGATTAGGAATGAACATATTAAGCTCATTTCTAACTTGATATGTGATGTTCATATCAAGTTAGTGAAATGCTGGATCGGACCTGGTGGAGGGAAAGCAGGAGTCAGAGATCTAATAAATGCTGTGATAGATATCTTAGCATTTCCTTTTGTTGCTCTTCAAAATGCACCTGGCTTGCCTTCAGCCACTGCTTCTGTCAGCAGTGGCTTTCTTCTTAATATGGGCTCCCCTGGTCAGAGAGTATGCATGGAAGATAAGGGTATAGTTAAGGCAATTGAAGAAGATATGGGAAAATATATTAAGATACTTGTAGAGGTTGGTGTGCCTGGTATTATCCTTCGGTGTGTAGATCATATGGATTTGAATGATTTGGGCAGGCCTGTCGCATTTCTGGCTAAGATAGTATGTCACCGACCTTTGGCAATCCAACTCGTGAGTAAAGGTCTTTTGGATCCAAATAGGATGAGAAAGTTGTTTGATTGTTCGGGCCCAAAAGAGGTCACACTGGATGCTCTTATGATTATTTCTGATCTGGCTCGCATGGACAAGGTATTCTATGAGTACATTAAAGGTGCTACTATTTTGGAGTTCTTGAAAGATTTTCTTTCACACGAGGATCCCAATGTGCGTGCCAAAGCCTGCAGTGCTCTCGGGAACATGTGTCGTCATAGCGCCTATTTTTATAGTTCTCTTGCTAGACATCAAATTGTTGGTATCCTTATCGAAAGATGTTCTGATCCAGACAAACGAACACGAAAGTTTGCTTGTTTTGCTATTGGAAATGCAGCTTACCACAATGACTTGTTGTATGAGGAGCTGAGGAGATCGATTCCTCATTTAGCAAATTTGTTACAAATGGCTGAGGAAGATAAGACTAAGGCAAATGCAGCGGGAGCACTTAGCAATCTGGTTCGCAACTCTGACAAACTTTGTGAAGACATAGTATCTAAAGGAGCTGTTCAGCTCGTGGCTCCAACAGACGAGTTCAAGGTACAACCGTCTCGGTGTAGTCATTCGATGGTTGGTATACGAGCTGCTCCTCGGCGTCAAGGTGTAGGGTTGGAGGATGGTGGGAGTGGGGAGGAACTCTTTGAAGACGGAGGGAGGGAGGGATTTGGAGGGTTCACGTTTGATGAAGGTTTTGAGGGAGATCACGGGTTTAAGGCTTTTCTCGCGCTCCACCGCGTGATCCAGGTCGCGGTCGCGGACGAGCTTGAATGTGCCATCAAAGATGGTTCAGAGGTGGTGGCGCTGGTGGTAGGGAGGAGGAGGACGATTTTGGGTTGGGGTGCGGCGGGGACAGGAGGAGGGGGCTTTCTTGGATGTTCACCTGATTCATTTTGGAGGAGGAGCTTGCTTCTGATAAGGCGTAGATACCAGCCATTGCCTTCCACTGATGCAAACAGGAAATGCCACCACAAATGCCATTTGGTTGCGCCATCGCGAGCACTTTCCTTACCCCAGATAGAAGATCAAACGAAGAAGAAAAAGAGAACGACCAAGGCCCTAAATCCAGGCAGAAATGATTCAGGAAACGAATCTCCGCTTAAGATCGCTCTGTTTTCCCTTGCAAAGATGTGTGCACATCCACTCTGTAGACAATTCATCCGTTCATCACCTTTGTTCCCTGTGATTGGAAGGCTTCAGCAGTCTCCAGAATCATCCATAGCCAAATATGCCTCCGTCATCATTGGTAAAGTTGCTGATCCTTGA


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