Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28604 LG8 11493432 11493797 hypothetical protein
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
C/G,* 11493441 missense_variant p.Gln119His
G/C,* 11493476 missense_variant p.Leu108Val
C/A 11493629 missense_variant p.Ala57Ser
C/T 11493717 synonymous_variant p.Glu27Glu
C/T 11493754 missense_variant p.Arg15Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28604.1
MDKVSVLNKAIEYVRSLEQRVKDLEIENKKRKIESEGCLKVSKSNMVGYDFSWTSHACYDGDEATKKCSKVEARVAGKDVLIRVTFEMQRNIVQNVMAKLEAHNLFVLCSNVLPLGISQVW*


CDS Sequence:
>Vu_28604.1
ATGGACAAGGTTTCTGTTCTTAACAAGGCCATAGAATACGTGAGGTCTCTTGAGCAGCGTGTGAAAGATTTGGAGATAGAGAATAAGAAGAGGAAGATAGAATCAGAAGGGTGCTTGAAAGTGAGCAAAAGCAACATGGTTGGTTATGACTTTTCATGGACCTCTCATGCTTGTTATGATGGTGACGAAGCTACCAAGAAATGTTCGAAGGTTGAAGCAAGAGTTGCAGGAAAAGATGTACTTATCAGAGTAACGTTTGAGATGCAAAGGAACATTGTGCAGAATGTAATGGCCAAGCTTGAAGCTCATAATCTCTTTGTTCTTTGCAGCAATGTTTTGCCTTTGGGAATTTCCCAGGTTTGGTAG


Promoter Sequence:
>Vu_28604::LG8:11493797-11495797(-)
ATGATTTTTTATGATGGGTAAAATTGATCTATTATGACAAGTGGATTAACGTCATAGTTCTGACAATCATAATAAGTCTGCACATTTTATGATGTAGCGAAAAAGAACATCATAATATGTTCAGCCTACTATGACGTACTTTATATCACTTGTCATATTATATTTAGTATATTATGATAAACATTCCGTATAATATGGTCAATTTACTATGACGTAATCCAATTTAATTATATAATACGTGGACTTTACGACGTAGTTACTTTCACCTATTATAATATCTTCCATGTATTATGACAAGTAATTGTTTACTTGTTATAATACATGCTATTTAGAATTAACATATTATAACTAGTGTTGTCAAAATGGGTCACCTAACCTAACCTAGTCAGTCCCATCACATGTTGATCACTTAGTGAGTCAATCCAATCTAACTTATTTATTTATTAGCTAGCCGAAAAAATTCGAACCTGCCTGACTCATGAGGGGTATGAGTTAAATAGGTTGATTCACTGACTCACTTAATTACAAATTTTTTTTTTAAATCTAAAATAAAAAACAATGTTAAACTTCAAAGACCATTCAAAATAAATAAAATTAACATACAACTTAAATATAATAAAAAAACAAACTTTAATGGCTTTTTCAAACTTTACTTATTTATGTAAGTAAGGTGCTAAATAAACTTTTTTACTAATGATAACATGATCAGGAAATATACTGGCGTTATCTTTTTTTATACAAAAGGGATGCAAATAACTTCAATATGAGCAAATAATAATATTAAAACAAATACATAAATGCCATATGATATAATTTTGATGGTGAAAAATATTAATTAATTCCACTTAAAAAGAGACTCTCAATTGAACAAACATCTTATCATAGCAACAAACTTACGAAACAAATAAAAAAGTTCCATATGTTTTTTTACGTTCACTTGTTTTCTTAAATTTATGATTTGTCCTATTAAATTTTAAAAATGTATTTTTATAACAATATATATTTAAAATGAATTAAGAATACATAACTGAAATCTTGGTTATTATATAATACATGAATTACCTAAAGTCTAGATTTATGTTATAAAAGTGGCTTAGAATTTTAAAATTCAATGTTATTTCTTTTTGACAAGCTCTTTTTCTCTCATTACACACTGAGATATAACAGTGGATGAATAATTTGTCCCTTGACAATTTGATTGCCCGAAATATAAAAAAGCATATAACAAATCTAATTTACCCTTTTTGATACAAATTTATCTCATAATTTAAACCTCGAAATCTTTTTCTCCAGAATCTAGTTCAACTTGCTCAAGTTAAACACTTATAATGGTTCCAACATTTTCTTATGTTGATTTACAGAATAATTACAAAATCAAATTGCAATGCCATTTGTCGAGGAAAAGTGAGAGGGTCGTGGCATTAGCCTCAGCCACATATCGTCTTTCTCAAAGTACCAATACTCTAATCACACACTATCAATCAATTATTGGCATACTTTAAGTGGTTTTGACATGAACTCTGTTGGAGAAGAATTTAAGGGGGACAGTTCAGTGGTGCCTGCAGACGACTCATTGAAAGAAAACAGCATTATCCTTCTAAGCAAATTTTCACCTTTGGAAAATAACACTGGCTTTGACATGACAAGTCTCACACAGCAACATGCTTCTCCACGACCAAAGTCTTGTGTTCTGTCATTTGAGAATTTCACTTCAGTGCCAATTTTGATAAGAAAACATGACAACATCTTTGTGAACACTTAAAGCAGACACAAGAAAAAACCAGAGAACCCCTCAAGAGGGAAAGAAACTCTTCTCAGACACTTGATCACATAATAGCTGAGAGAAAAGGAGAGAGAGTATCACCAAAAATTTTCATTGTCTATTTTTACACCTATTACTGAACTGATGTAGATTGTTCAATGGGTGCAAAGATGATTTTGCTTTGCATGAAGTCCAAAAATGGATGTAAGAAACTTGTAATTTCTAAAGATGTGTGTAG


Gene Sequence:
>Vu_28604(-)
ATGGACAAGGTTTCTGTTCTTAACAAGGCCATAGAATACGTGAGGTCTCTTGAGCAGCGTGTGAAAGATTTGGAGATAGAGAATAAGAAGAGGAAGATAGAATCAGAAGGGTGCTTGAAAGTGAGCAAAAGCAACATGGTTGGTTATGACTTTTCATGGACCTCTCATGCTTGTTATGATGGTGACGAAGCTACCAAGAAATGTTCGAAGGTTGAAGCAAGAGTTGCAGGAAAAGATGTACTTATCAGAGTAACGTTTGAGATGCAAAGGAACATTGTGCAGAATGTAATGGCCAAGCTTGAAGCTCATAATCTCTTTGTTCTTTGCAGCAATGTTTTGCCTTTGGGAATTTCCCAGGTTTGGTAG