Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28444 LG8 6365871 6367624 PREDICTED: DNA ligase 1-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
T/A 6366183 missense_variant p.Lys414Met
G/T 6366402 missense_variant p.Ala341Glu
T/A 6366924 missense_variant p.Lys167Met
C/A 6366982 stop_gained p.Glu148*
T/A 6367012 stop_gained p.Lys138*
C/T 6367014 missense_variant p.Gly137Glu
C/T 6367019 synonymous_variant p.Lys135Lys
C/T 6367061 synonymous_variant p.Ser121Ser
A/T 6367101 stop_gained p.Leu108*

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28444.1
MEPNGLGAGMFSGLVGVENSLPPQQQQNPHHLQNHPQMVPYGPHHDTDPHHQHHNQSIKQGYPQYSSVKTKQQQQSALSDDDDDTSDPKKKVSLWQRMKWTDTMVRLLIMAVYYIGDEGGSEGTDKKKSSGMLQKKGKWKSVSRAMMEKGFYVSPQQCEDKFNDLNKRYKRVNDILGKGTACRVVENQSLLETMELSSKMKEEVKKLLNSKHLFFREMCAYHNSCGHVNNNAPQQGETGGEVSQSQAQAQVQPQQQQQPPQQQQQQRCFHSSEVGNLGGLRMLKMGNGEENDDDSDEDDESEDDSDEEEDDSGEGGSRGHVGHGHEDMEDDNDGRSMRKKARKVRGVGVSAVMMQQLNAEVSGVFQDGGRSAWEKKQWMRSRILQLEEQQLSYQSQSYELEKQRLKWARFSSKKEREMERAKLENERRRLENDRMVLLIRQKELELMSLQHQQQQQQHSST*


CDS Sequence:
>Vu_28444.1
ATGGAACCCAATGGGCTAGGCGCGGGAATGTTCTCTGGGTTGGTGGGAGTGGAGAACTCTTTGCCTCCGCAGCAACAGCAAAACCCTCACCATTTGCAAAACCACCCCCAGATGGTTCCCTATGGCCCACACCACGACACCGATCCACATCATCAGCATCATAATCAATCGATCAAACAAGGGTACCCTCAATATTCTTCGGTCAAGACCAAACAACAGCAACAAAGTGCCCTCAGTGACGATGATGATGACACCTCGGACCCCAAGAAGAAGGTGTCGCTGTGGCAGAGAATGAAGTGGACTGACACCATGGTGAGGCTTTTGATAATGGCGGTTTATTACATTGGTGATGAGGGTGGCTCGGAAGGGACTGATAAGAAGAAGTCCTCGGGTATGCTGCAGAAGAAAGGGAAGTGGAAGTCGGTGTCGCGGGCCATGATGGAGAAAGGGTTCTATGTTTCTCCTCAACAGTGTGAGGATAAGTTCAATGACTTGAACAAGAGGTATAAGAGGGTGAATGATATTCTCGGGAAGGGAACTGCTTGCAGGGTTGTGGAGAATCAGAGTTTGTTGGAGACGATGGAGTTGTCATCAAAGATGAAAGAGGAGGTTAAGAAGTTGCTCAATTCCAAACATTTGTTCTTCAGGGAAATGTGTGCTTACCATAATAGTTGTGGTCATGTGAATAACAATGCTCCACAGCAAGGAGAGACCGGGGGTGAGGTGTCTCAGTCTCAGGCTCAGGCTCAAGTGCAGCCTCAGCAGCAGCAACAGCCTCCGCAGCAGCAACAACAGCAACGTTGTTTTCATTCATCAGAGGTGGGGAATTTGGGGGGTTTGAGGATGTTGAAAATGGGAAATGGGGAAGAGAATGATGATGATTCGGATGAGGATGATGAGTCTGAGGATGATTCGGATGAGGAGGAAGATGATTCGGGAGAAGGTGGTTCAAGGGGTCATGTGGGGCATGGACATGAAGATATGGAGGATGATAATGATGGAAGGTCAATGAGGAAGAAGGCAAGGAAAGTGAGGGGAGTTGGTGTGTCAGCAGTGATGATGCAGCAACTGAATGCTGAGGTGAGTGGTGTGTTCCAAGATGGGGGTAGGAGTGCTTGGGAGAAGAAGCAATGGATGAGGAGCAGGATACTGCAGTTGGAGGAGCAGCAATTGAGCTATCAGAGTCAATCATATGAGTTGGAGAAACAAAGGTTGAAATGGGCAAGGTTTAGCAGCAAGAAGGAGAGGGAAATGGAGAGAGCCAAACTTGAAAATGAACGAAGGAGGCTTGAGAATGATAGAATGGTTTTGCTCATTCGACAGAAGGAGCTTGAGCTGATGAGTCTTCAACACCAACAACAGCAACAACAACATTCTTCTACTTAG


Promoter Sequence:
>Vu_28444::LG8:6367624-6369624(-)
TCATCATTGAGAATGATGTCCAAAATTTCTCTATATATTGCTTGATAGAGATAGTTTTTTATCTTTAAATCCTTAAATTTCTGCTCTTCCATTACTTTAATTTCTGCCTCTGATGCAATAGCTTTGTCTGGAACAACGTTTACTCCATGTTCCACCAAATGCCAATATTCCTTTGATCGAAGGAAATTCTCCATAAGCTTTGCCCAGTGATAATAATGTCCATCAAATTTAGGAATTACAGGTTGTGCATACTTTGAATCAACTATTCTTCAGAATGATTGTTCCACTCACTTTCTACCTAATGTTTGATTTAAAACCCCGGTGTCTCACTCAACTCACTCAGAATTTCTGGTTCAGGCCTCTGTTATGGTACTCTGATACCATATTATTAACTGACACAGGTAAATAAGATTTTCTGAAATACTGAAATACTACTTATTTTTACACTTTGTAAAAGTTAATTACAGTTATTTAAAGAAATATGCAGAAGCTCAAAATATTATCCACTCCATGCCCCTGAAACTTGGTTTCCTACAATTAAGGAGCTAAATTGTTAGCATCCTACATCCCTAATCAATATGACTTAAATTTATAGAATCAAAAAATAAAACAATTTAAATGCAAAACAGAATTTTAAATAACAACTACTAACATAAAAAAATACACATATAGCCAAATGTGCTCTAATCACGTAGTGAATTCATTTGTTTAGTTTTTAAGTTTTAGAAACTTTCTCCTCTTCTATTTTTCTCTTAAAATTTCATAATTTTCGTTTTGTTTTCCTCACTCATTTTTGTTCTTTATTTATTATTAATAAAAAACTAAATTTGTCGGTTCAATTTATAAAATCAAGAATATCCACTCTGAATTGAGTATTACAATGAATCTTAAAGATCTATGATGAAAAGAATTATATGATCTTCGAATCAATGAATTCACCTCTCGTTTGCTAACTTTTTTTTGTTTCTTATTATGTTTGCATCTTTCTAATAATATAATCCTCAAATTAATTTGTAAGAGAAAAATAATAAAAATCATATAAAATATATATGTATCATTTAAAAATAAACCTAATTTATGCTATATTGCAAAATTTTGAAAGAGAATTTAAATACTTTGATTTCAAGAACATTAAAAATCATAATTTATAAATTTTAAATTCGATGATCCAACCCAACAATATAATAAAAAAAGTAGTATTTATCTCATAATTTTATCATACAAAATCCTTTTATATTTTATAATATAAATAATTTAATGATACCTATTATTTTTATGTATTTTATTTTAAAAAGTGCTAATTTTTAAGATTATTTAATCCAAAGATTATTCTAAGTCAATCGTTTTTATGTATAAGATGTGATAATTTTTAAGAAATGATTTTATCCAACAAAATAATCTAATTCAATCTATGATTGAGTTGCTAAACAAAAATAAACATATAAATAACTTTAACTTAACCTAACTCAACTAAATTTAATTAGATTGGATAAATCATATTAAATTAAACCCAATGAATATTACTTTTTTATTCTTCTAAATACATAATGTAAAGCTCATAACTATCTAATCACTGAAGCAAAATCAAGTCCCTCACCCTATTGGCCCTTTTTACACAACCAAATCCTCCTCTTTCATATGCATGTTCCATTTGTATGAGTTAAGTTTATAAAAATTTAATTGCATAAAATAAAACCAAAGTTAAAGAGAGAGAAAGAGACAGCGCGCGCACATAGTAAGATTTTATGGTTTTAGTTTTATGGTATCATATCATTGTTGGCGCTTTGAAACGGCACATACAACATAAGTCGGCGTGGCGTGGCGTGAGTCCCCCAAGTTTAGCACAAAACCTGTGGGTTGGTTAAACCCTCACTCCAACCCAACCACAAAACCATGGGCAGTTTTCTTTTCTCTCTTTTTCATCAACAAAACCAGTTGCTTCAAAACCCAATGTATCAGTACACTCTCTTATATTATCTTTACTCTTCTCTTTCCCCGAC


Gene Sequence:
>Vu_28444(-)
AACACAATCTATCATCAACTCCTATGTAATCCCATACTAAACTGCTGTTTCACTTTCTGTCCTTCCTTCTCTCTCACATCATCTTCTTCCACCTTTTTTTTTCCTTTCTTCAACTATTCGATTAAGGGTAAGCGCATTTCTTCCAAAGTTTGTAGCTTTTGCTTGTTTTGTTGAGTTTTCAAGAGCTGGGGTTTCTTGTTGATGGAACCCAATGGGCTAGGCGCGGGAATGTTCTCTGGGTTGGTGGGAGTGGAGAACTCTTTGCCTCCGCAGCAACAGCAAAACCCTCACCATTTGCAAAACCACCCCCAGATGGTTCCCTATGGCCCACACCACGACACCGATCCACATCATCAGCATCATAATCAATCGATCAAACAAGGGTACCCTCAATATTCTTCGGTCAAGACCAAACAACAGCAACAAAGTGCCCTCAGTGACGATGATGATGACACCTCGGACCCCAAGAAGAAGGTGTCGCTGTGGCAGAGAATGAAGTGGACTGACACCATGGTGAGGCTTTTGATAATGGCGGTTTATTACATTGGTGATGAGGGTGGCTCGGAAGGGACTGATAAGAAGAAGTCCTCGGGTATGCTGCAGAAGAAAGGGAAGTGGAAGTCGGTGTCGCGGGCCATGATGGAGAAAGGGTTCTATGTTTCTCCTCAACAGTGTGAGGATAAGTTCAATGACTTGAACAAGAGGTATAAGAGGGTGAATGATATTCTCGGGAAGGGAACTGCTTGCAGGGTTGTGGAGAATCAGAGTTTGTTGGAGACGATGGAGTTGTCATCAAAGATGAAAGAGGAGGTTAAGAAGTTGCTCAATTCCAAACATTTGTTCTTCAGGGAAATGTGTGCTTACCATAATAGTTGTGGTCATGTGAATAACAATGCTCCACAGCAAGGAGAGACCGGGGGTGAGGTGTCTCAGTCTCAGGCTCAGGCTCAAGTGCAGCCTCAGCAGCAGCAACAGCCTCCGCAGCAGCAACAACAGCAACGTTGTTTTCATTCATCAGAGGTGGGGAATTTGGGGGGTTTGAGGATGTTGAAAATGGGAAATGGGGAAGAGAATGATGATGATTCGGATGAGGATGATGAGTCTGAGGATGATTCGGATGAGGAGGAAGATGATTCGGGAGAAGGTGGTTCAAGGGGTCATGTGGGGCATGGACATGAAGATATGGAGGATGATAATGATGGAAGGTCAATGAGGAAGAAGGCAAGGAAAGTGAGGGGAGTTGGTGTGTCAGCAGTGATGATGCAGCAACTGAATGCTGAGGTGAGTGGTGTGTTCCAAGATGGGGGTAGGAGTGCTTGGGAGAAGAAGCAATGGATGAGGAGCAGGATACTGCAGTTGGAGGAGCAGCAATTGAGCTATCAGAGTCAATCATATGAGTTGGAGAAACAAAGGTTGAAATGGGCAAGGTTTAGCAGCAAGAAGGAGAGGGAAATGGAGAGAGCCAAACTTGAAAATGAACGAAGGAGGCTTGAGAATGATAGAATGGTTTTGCTCATTCGACAGAAGGAGCTTGAGCTGATGAGTCTTCAACACCAACAACAGCAACAACAACATTCTTCTACTTAGATCTAGGGGTGATGATTTTTCTGAGGTTAGTTGTATGATAGAGGAAGCTATGGCATACAAAAGTTGTAGATTAGGCCTGTAGGGGAAACTAGTTGTTCTCGTTTTGTGGTACTTGTGAAGTTAGTTCTTATTAACGAAAATCTAAATACCCTTTTGTGGATTTTTAC