Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28433 LG8 6084714 6086776 hypothetical protein
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category   relationship type   keyword
Pathway   B 09151 Immune system   C 04612 Antigen processing and presentation [PATH:ko04612]
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 6084832 missense_variant p.Cys13Tyr
C/T,A 6085046 missense_variant p.Ala59Asp
C/T 6085209 intron_variant
G/T 6085225 intron_variant
T/C 6085371 intron_variant
C/G 6085376 intron_variant
A/G 6085386 intron_variant
G/A 6085389 intron_variant
G/A 6085455 intron_variant
T/A 6085672 intron_variant
C/T 6085840 intron_variant
C/A 6086144 intron_variant
G/A 6086156 intron_variant
G/T 6086170 intron_variant
A/C 6086460 missense_variant p.Met148Leu
A/G 6086588 synonymous_variant p.Gln190Gln
C/T 6086607 synonymous_variant p.Leu197Leu
G/A 6086698 missense_variant p.Arg227Lys

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28433.1
MFGQFSVQCSNSSACSTLNTTGRKSIEGVIRSSVRGQDITLPPSQMCHNQPLAHTAFHLAEPCFSGLLASPYGPQPNIHPAQLIGMPTARIPLPLDLSEEPIFVNAKHSTSLLNVTMFVFQPYLHESRHLHALKRARGSGGRFLNTKKHEESKPISQNHDIDVSRCTHLNLRGNMSESKARQLNYRDGASTTTCSDISSASNSGDLFQQHQPDIRLCGYPSHIGRNMQGYSADISGSGGGGGGANQHRLSVLM*


CDS Sequence:
>Vu_28433.1
ATGTTTGGTCAATTTTCAGTTCAGTGTAGCAATTCTTCTGCTTGTTCGACACTTAACACAACTGGGAGAAAGAGTATAGAAGGTGTAATCAGGTCATCTGTTCGTGGTCAGGATATTACCTTACCTCCTTCACAAATGTGTCACAACCAGCCACTTGCTCATACTGCATTCCATCTTGCTGAGCCATGCTTTAGTGGCCTACTAGCTTCTCCATATGGCCCACAACCTAATATTCATCCTGCTCAGCTGATAGGAATGCCTACTGCTAGAATTCCTCTGCCACTTGATCTTAGTGAGGAGCCTATATTTGTGAATGCAAAGCATTCAACTTCTCTCCTTAACGTTACCATGTTTGTTTTTCAGCCATATCTTCACGAGTCTCGCCATCTACATGCATTGAAGAGAGCCAGAGGTTCTGGTGGTCGCTTCTTGAATACAAAAAAGCATGAAGAGTCTAAACCCATTTCACAAAACCATGACATAGATGTTTCGAGGTGTACTCATTTGAATCTGAGGGGAAACATGTCAGAATCTAAGGCTCGTCAGTTGAACTACAGAGATGGTGCTTCCACAACCACCTGTTCAGATATTTCTAGTGCATCTAATAGTGGTGATCTCTTCCAGCAACATCAACCTGACATTAGATTATGTGGTTACCCTTCTCATATAGGAAGGAACATGCAGGGTTACTCTGCTGATATCAGTGGTAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCAAACCAGCATCGTCTATCAGTCCTTATGTGA


Promoter Sequence:
>Vu_28433::LG8:6082714-6084714(+)
AGAAGACCAGTAAGCAGCAAAGAAAAGCAAAGGCAAAGGTATGGATACCTAAATTGAAATTGCATGATTGAATGGTTTGAAACTGATTGTGAAGTATGTAAGGGGTGTGCTCTTATCTTGAAATTCAATTAAAGAAAGAATAACAAATGCAATGAACTAGTACGAGGCATTCACTTGTACTAATAATAACAATAAAAGAATTTGTGAAATAGTTGTTATGATATATGATTTGGTATGGACTATATTATTTAGGTTTGTTGTTCCATGAAAGAATAATGAATAATTCTATTGTGGTTTATTTTGGTATTTAATCCGTGAGTGATGAATTTGAAAACATAAACCATGCATAAGTGTCTCTGCCATTGGCTCTAATCAGTCATAATTAGGCATGAGACATTTTACCATGTGTAGGTTTAGATTACCCTTTTCAGTTTAGTATGAAGGTTATTTTTTTATAGATAGTATCTAGGATACCAGTAAGAGGTTCCCATTTCTTTTATACCATTTCTGAATCATTCAAAACTTAAGTAGGTTTATATATGGTGAAGGAAACAAAGTCAATTTAGACTTACAACTTAGTATGGAAACTTGGATTCTTAAATTTCAATTACAAGTGCTTAGTTTGCCTTCAATAACTAAGAAATATAATCTCTGCCAAGAAAAAAAATTATGATCAAAACAACAGTTTAATAAGATAGTGGTTAGTTTAGTTAAAAGCAGTTAGTAAACAAAATCTGATATGTTGATGTAATTAATAAAAACAACTACTACTAATCTGAACACAACATTATAGGTTAACCTACAAAAGCTTGAAAAAATAACAATTAGCTTAAAACATCAAAGAAAGTTCAAAATCATTTCCTGCTTCGTATTAAATCATTGCTATGTTCATAGTGTCATCAATTCCAAGAGTCAATTATGTGTTGTTCTGTTCTATTCTTTAAATCCAACTCTGTAGAGTTAATGTTGGTTTGAAATCTGTTACTGCACTTTATTGTCAAAGGAAGCAAAGATTGTTATGCTAACTTTGAATCTAACTTTGAATCTAACTTTGAACTTGATTGTTGTGCAGAATTAAAGGAAGCAAAGAATGCTAAAAACACTAAGGCAGTTATTTGGGAGGAGGAAAGTGCAGAAAGGCTTGGAAAGATCTCCAGCCTAGTGCCACACACACAATAGCTGCCAGTGGAAGGAGAGATGTTGCTGCAGCAGAGAGCTGGGAAGGAGGAAGGCAAGGAAGCCATGGAGACACTGCTGAAAAGAGTGGCTGAGCATAGGAGATTAAAACCAATAAGCCATTTCTTTCCTTTTCTTTTCTATTGTAGTGATAAATTTTTGTTATTAGCTTGCATAGTCATAGATAGCATAGTTAATAATAGGATAGAAAATATGTTGTTCTACATAAAACTAAAAAGAATTAATTTTGATCTTTGGCCTATTTGAACAAATTTTCTTCTTAGTTATATCGTGGTTTGTCTGTGTTGTTATTAGGAAGCCTTACTCACTCACACATTGAGGACAATGTGCCTCTTAAGTGTGGGGGTGGGAAGGTATAAATTTAAAAATACTTGTTCTGATGTAAATAACTGTGTTTAACATTAGTTTTAGTAATAAAATAGGGATAATTTTTTTTTCTCTGAGCTGTTTTTCCTTTAGCTTAGGTCTGGTTTAGTTTTAAATACTTAGTGTAGTTTACTATTCTTGTTTTAGTGTGTAAATACCTTTCATAATCTGTTTTTGTTTTTTTAATAGGAATTAGCTAGTTTTTAGTTTTGATTGTTAATACTTCTTAGATTCTTTTACTTTCATTGATTCTGTTAGAACTTCTTTTAGGTTTCTTTCTTTTCCTGTTCCTATTTTCTCTTCCTTCTTTTAGTTTCTTGTTCTGTTGTTGTTTTCTTAGTAGTTATTTTAGATTCTTTTCATTTTCTAGGTTCTGTTTGAGCTTGTAAATTAGGATTTGCTGTTTTAAGATTTCTTTTGTTAGATTGTTTAGTGCA


Gene Sequence:
>Vu_28433(+)
ATGTTTGGTTTAAAGCTCTAGAAGTACTTTTTGTGTTATCAGAAAACACTTTTTGCTTAATGGATGTTGGTAAATACTTGCTATAGGTCAATTTTCAGTTCAGTGTAGCAATTCTTCTGCTTGTTCGACACTTAACACAACTGGGAGAAAGAGTATAGAAGGTGTAATCAGGTCATCTGTTCGTGGTCAGGATATTACCTTACCTCCTTCACAAATGTGTCACAACCAGCCACTTGTAAGTTGATGTATGATTGTATCTCAGTGGACTGATATTGTTTGCAAATCTCTTTTCTTATAATTTGCTTTTCAGGCTCATACTGCATTCCATCTTGCTGAGCCATGCTTTAGTGGCCTACTAGCTTCTCCATATGGCCCACAACCTAATGTAAGATATTGGAATTTATTCATTTTTTTTTCACTATTTTCTTATTCTTGTCAGCTTGTCTTCAGCACAGTGAGTTAAAGATTTATCATTCAAACAAATTGATAAAATAACTGTATGAGTATGAGTGGCATCAGGTTATGGTGTATCTGGAAAGTACTTTGTTTAGATCTGGTGTACTGAGTTTTTCACTTTCTAATTGCTCCACTCTGTGATTTCTGATTTTGTTATGATGTTGACTTACAAATAGGTTAAAGGTCTTTCGGGAAAGCATGTTGCCCTTATTATTAACAGTTTTAATTTGATTGGAAGCTTTCTGAGAGACTTTTGGATATATGTTACTATAAGTAGATGCTATTGTGGTTGATTCTTGTATTAATGCCATCATTATGCATATTTAAATGAATCACCAATAGTGCCTTTATGTTACTTATTATTATACGTGCTTAATTAGTTTTACTATTTTTTGTGCCACTGTTAGCTTGCCAACCTTACAGATTCTCATAGTTCATAAAGTATGCTTATGAAGAATCTTTTTGGTTTAAAAATGTTTCTTTGCTCTCCTTTGCACCTCATTTGTTCTTATTCTTTCATCCTTTGTATTATTATTTACTAAAACACTTTTTTATTATGGTGGAGAGCTTGTTTCTTATCTTTCACTCAAGGTGTTCTTTATTTTATAGACTTAACAATCTGACATGCATTCTTTACCAGACAGCATGGTTACTCTTGCTAACCTTTATGCTGAGTTGTTGGAAAAAGAAATTGAGCCTTTTATGGATAATCAAGCTTTTGAGTATTTGGATTCTCTTATGACGTGTTCATTCTTTATTTTAATTAAATGACCTAACAAAGTTACATAATGCCTTCAAACTTCCATCATGTTAGTAACACTAAGACATTATGTGCATTTCTATAATCTAAACCATGCTATCAAAATATGGCCAGATTCATCCTGCTCAGCTGATAGGAATGCCTACTGCTAGAATTCCTCTGCCACTTGATCTTAGTGAGGAGCCTATATTTGTGAATGCAAAGCAGTACCATGCTATTCTGAGGCGCAGACAATACCGGGCAAAACTTGAATCATAGAACAAACTCATCAAAGAACGGAAAGTAAGTGCACTTCTGCATTTTAGAAATGCTGTAAAATCACTCTTTAACACAAGTGTTTGATAAAACATAAAAGAGTGATTTTACAGCATTTCTCATACTTCTCTTTTGTTTCCTTTTCCTTCTAAGTTCAACTTCTCTCCTTAACGTTACCATGTTTGTTTTTCAGCCATATCTTCACGAGTCTCGCCATCTACATGCATTGAAGAGAGCCAGAGGTTCTGGTGGTCGCTTCTTGAATACAAAAAAGCATGAAGAGTCTAAACCCATTTCACAAAACCATGACATAGATGTTTCGAGGTGTACTCATTTGAATCTGAGGGGAAACATGTCAGAATCTAAGGCTCGTCAGTTGAACTACAGAGATGGTGCTTCCACAACCACCTGTTCAGATATTTCTAGTGCATCTAATAGTGGTGATCTCTTCCAGCAACATCAACCTGACATTAGATTATGTGGTTACCCTTCTCATATAGGAAGGAACATGCAGGGTTACTCTGCTGATATCAGTGGTAGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGCAAACCAGCATCGTCTATCAGTCCTTATGTGA