Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28391 LG8 5388435 5389504 PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor ERF024-like
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category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
A/T 5388523 synonymous_variant p.Ala152Ala
T/A 5388528 missense_variant p.Asn151Tyr
T/A 5388593 stop_lost p.Ter129Leuext*?
G/A 5388646 synonymous_variant p.Asp111Asp
G/T 5388729 synonymous_variant p.Arg84Arg
G/T 5388742 synonymous_variant p.Leu79Leu
T/A 5388882 intron_variant
G/A 5388923 intron_variant
T/A 5389104 intron_variant
G/C 5389133 intron_variant
A/T 5389169 intron_variant
G/A 5389170 intron_variant
T/C 5389173 intron_variant
A/T 5389199 intron_variant
C/A 5389251 intron_variant
A/T 5389279 intron_variant
C/T 5389280 intron_variant
T/A 5389308 missense_variant&splice_region_variant p.Lys66Met
T/A 5389350 missense_variant p.Glu52Val

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28391.1
MYSHNATGSSRASSETARYRGVRRRSNGKWVSEIREPRKPTRIWLGTFPTPEMAAVAYDVAAYALKGKDAELNFPDSASSLPVPDSLSARDIQMAAAAAAAAAGAAKDAMQTPTNNNSSGVQEKQAGTSNEFVDEDLIFDMPNVLVNMAEGMLLSPPPFDIGLEPNSPENMEHETSLWNFP*


CDS Sequence:
>Vu_28391.1
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Promoter Sequence:
>Vu_28391::LG8:5389504-5391504(-)
TTAGTATTCCTTTATGGTCAAACGCTAATTAAAGAATACGATGAATGATGCATTATATGCTTTTTCTATTGTTTAAATCTTGTTTAGGAAAAGGTATACAATATGGTTGACAATTGTATGAGTCTGTTTTGATATGTGATTATATTTATAGTTCATATAGTTTTTGATTTTGTATTTCTTTTTAAACCTTTGACATGTTACGATAGAGCGAGACACCCATTTCTTTCCATTTTACAAGAGACTGTGTTTGTTGGTGGATAAAGAATAAATGTTTTTTTTTCTTAATGAATTGTATTAAAGTAATTGTAAGTATTTAGGTACAAGTTTCGTATGTTGGGTTTGACCGTGATTTCTCAGATTTTGGAGACACAGCTTTTATGTATGGCATAATGCAGTCGCATTGTTATGTCATGTGGTACAAATGTTTTTTTAAATTTTGCTGTGCTCAAATTAGTATTTATTTTGATGATATGGTAAATTTATTCTCTGTCATACTCGTTGTATTTCTTATGTATGATGTTGTGTGATCAATTGTGTTTAATTTGCAATGTGTTGGTGTACGTAGAAAACTGTCATGAGCATCGAAATCTCTTGTCAGCTGTTGTCAAAGGTTTCCATACATAGTATTTTGATGGTTTATGCGTCTCGTCGTTACGATACGATCAAGCGGTGTGGGAAAATAATTACTAAGCCTCACTTTATACCTAGAAAAATCATAATTTGACTAAAAAACTCCATTTAATAACTTGTTTTTATAATATAATAATATGTAACAGTATTTTAAGCTAAAAAAAAATTAAAATATTAATATTTTACATGGTAAATACGTATTAATTTTCACCTTTTTTATTACATTACTCTTTTGGTCTACCATTTCTTTCTCTTTCCCTATTTGAATATTTTTCCAGAATGATACGAACGAGGCAGTAAAAGAAACACTTTCCAAATATAAACACATATTGCTCCCCCATTTCTTTCACTATTCGGAACATAAATTGGAACTAAACTGAATTAATGTATTTACGAAGGAGAACTTAATACTTTTGATTTGAAGCTTGAAAGAGGGTGTTCTACCTCTCGCGCGATCCATTGAACCTATTCACTTGTTTCTTCAAAAATAGTTAACAACTCCATTAAATTCCTCCCATCGCTTTCAGCAGCGAGATTCCCTGTCTATTGTGGCTAAAACACAAAAAAAGAAGAAAAGAAAAAAACACTTCCTAGGTGTAATGAAATTAGTAATGATGCAAAATCAATCGCACATAGAAATCCCTAAACTAAAAAATCTAGACAAACTTAAACCATACACGACAATTTGTGGAGAAGCTAATAATTATTAATTTCCATGATGCTGACGAAACAAAACTAGCCTCGTACTGTGCTGTCTCGGAACGAAAAATATATTCATGGATGATCACTTGCGACAACATCAGAAAACCCTACCTAATTAAATGGTTGGAGAATAAAACATGTCTTCTCGTAAATTTGATTTGCCATGGATGAGAGAGAATCCTACGTCAGTAATAATCCTATGTGCTATCTCGAACACTTGGCACTCCTGCTGCACAGGACTGTATAAATAAGAAGAAATATCCATGTTTTATGATCTCGAAAATCATTGTTGGAAATAATTGAAAATGGAAAACAGGGTTTTAGTGATGTTATACACTATTGACAAAGTGCACTATCACTGTGGATAAAATTTGACGTTGGATAAGTTATGCGAATTGAATTGATTTTTTATTATTTTTTTCTGAGATTTTATTTTGTAACAGAACACGCTCTCCGACCTAAGAATCGTTGGCAAAGCCATGCTGGATTACACTCCAACCATTTACAGGCCGCAATTCAGAAACAACTGGTTTGCACTTTCCTTCCGCTACTCCTTCTCCCGCCTTCGTTAAACTCACCTCCATAAATGGCTTCACTCAATTGCCATACACTTTCACTCACAACACACGCCTTCACATCACATAGCCACCGCCGCCGCCACCACCACC


Gene Sequence:
>Vu_28391(-)
ATGTATTCTCATAATGCAACCGGCAGCAGCAGAGCCTCTTCCGAAACCGCCCGCTACCGCGGCGTGCGCCGGAGGAGCAACGGAAAATGGGTGTCTGAGATCCGTGAGCCAAGAAAGCCCACCAGGATTTGGTTAGGCACATTTCCCACACCTGAAATGGCCGCAGTGGCTTATGACGTGGCAGCTTATGCTCTCAAGGGTAAGAATTTGTGACAGGAGAAAATGTTTTTTTTTTTATATATATCTTTTCATAGTTAATTTTGGTATCAGTATATTAAATAGTTTTCAAATTTTAAAAATTACATTAATTTTTAATTTTTTTAAAATTTATAAACTGTCGTTAAATATTACGTTGACATGAAAAAAAAAATCTCTAAATCAATAATTTAAAGGTATAACAAAATAAAATTATGTTTAACTAAAAAATACATTATTTTTTAAGAATAACATTGTCCGTACTTGACAATGTTATTACATTTTCCGTACATGACATCTATATTTCATATGATATTCCTTTAAGAAATATTATTAGACGTAAAATACGAAAAACTTTAATTATTAATTGAATTAATAAAACATAACCTCAAATAAAAAATGAGACTTAGATTTTCAATAATAATAAAAATAGTTTATAATTTTTATTTTGTTTTGGTTAATATCAATGTATCCGTACGTGATATGGTATCTGATATAAATACACGTATGTATGATATCTGATAATAGGTAAGGATGCGGAGCTGAATTTCCCTGACTCCGCTTCCTCCCTTCCTGTCCCCGATTCACTCTCGGCGCGTGATATTCAGATGGCGGCAGCCGCTGCGGCGGCGGCTGCCGGAGCTGCGAAGGATGCTATGCAGACGCCAACGAATAATAACTCTTCAGGGGTACAAGAGAAGCAAGCAGGGACGAGTAACGAGTTCGTGGACGAGGATTTGATCTTTGACATGCCTAATGTTCTGGTTAATATGGCTGAGGGAATGCTGCTTAGTCCTCCTCCTTTTGACATTGGTCTGGAACCTAACAGCCCAGAAAACATGGAACATGAGACAAGCCTGTGGAATTTCCCTTAA