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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28297 LG7 50006665 50010136 PREDICTED: probable disease resistance protein At5g66900
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28297.1
MAMILDAVVGRVLDELLSTVIAMKDRAVKFRATLENLHSILKKVEPMAREIDGLNKRLDKPATETQKLIDEMEKGKELVIECSKVDWWNCCYKASSQEKLQDLIDSITLYFQLDMQGNINVIVLENQMLLHQIHEKLVENVPRRIAGLCSPPEPPAFTVGLDVHLRALKFKLLNNHHVGSVLTVTGTGGSGKSTLAKKFCSDEEVKGEFKDNIFFISLAEVPKLSTIVERLFEHNGYEKPQFQSDEGAVDRLENLLKQIGKNPILLVLDGVLPESASLVEKFVFQIPNYKILVTSRFTIKGFGQPYVLKSLNEADALNLFRHHASLDQTSFKIPDTIVKKIAKGCSGSPLALIVTGKSLSLEEPVVWHNRARTLSRGQSVLSYSSNSDGLLTCLQKSFDDLDAKLAESFMDLSLFPEAQKIPAAALVDIYAEQRDEDDDIAMENIHDLVKRNVADLVVTRNTTSGTVDYNYHYVTQHGLLRDLAIHQTRNLPTEKKHRLIIDLRGNNIPKWWTTQNEYHIAAHSLSISTDEEFTSEWCNLQPNEVKVLVMNLREKKRSLPPFMKKMNKLKVLTITNYDVNRAELENLELLDYLSDLKRIRLEKVSIPFLSKTGVPLKNLHKFSFFMCNVNEAFKNSTIKVSDVLPNLKEMNIDYCDMEELPAGLSDTVSLKKLSITNCHKLSKLPTGIGKMLPENIGELGSLERLNCRGCNRLSELPYSVKDLESLRVVVCDEERAALWEPIRSMFSDLKLEVVLTDFKLDPLL*


CDS Sequence:
>Vu_28297.1
ATGGCTATGATTCTGGATGCTGTTGTTGGACGAGTGCTTGATGAACTGCTGAGCACTGTTATTGCAATGAAAGACAGGGCAGTGAAGTTCAGAGCCACCCTGGAAAATTTGCATTCTATCCTCAAAAAAGTAGAACCGATGGCTAGGGAGATAGATGGTCTTAACAAGCGATTGGATAAACCAGCTACAGAAACGCAGAAGCTGATCGATGAGATGGAGAAGGGGAAGGAGCTTGTTATTGAGTGCTCCAAAGTTGATTGGTGGAATTGCTGTTATAAGGCCAGTTCCCAAGAGAAACTTCAAGACTTGATCGATTCTATTACTCTGTACTTTCAATTGGATATGCAAGGAAATATAAATGTCATTGTGCTGGAGAACCAGATGCTGCTGCATCAGATTCACGAGAAGCTTGTGGAGAATGTTCCGAGAAGGATTGCAGGCTTGTGCTCTCCACCTGAACCCCCAGCTTTCACTGTTGGGCTGGATGTTCATTTGAGGGCGTTGAAGTTCAAGTTGCTGAATAATCATCATGTGGGGTCAGTGCTCACAGTAACTGGAACAGGAGGTTCGGGAAAGTCAACGTTGGCCAAGAAGTTTTGTTCTGATGAGGAAGTTAAAGGTGAATTCAAGGACAACATATTCTTCATCTCCTTAGCGGAAGTGCCCAAGTTGAGCACCATAGTGGAGAGACTGTTTGAACACAATGGTTACGAGAAGCCACAGTTTCAAAGTGATGAGGGTGCAGTTGATCGATTGGAAAATTTGCTAAAACAGATTGGAAAAAACCCCATATTGTTGGTCTTGGACGGTGTTTTGCCAGAGTCAGCATCTCTAGTTGAGAAATTCGTGTTTCAGATCCCAAACTACAAGATTTTAGTGACATCAAGATTCACAATTAAAGGATTTGGGCAGCCATACGTGTTGAAATCACTGAATGAAGCTGATGCTTTAAACTTATTTCGCCACCATGCATCCCTGGACCAGACCAGCTTTAAGATTCCGGATACTATTGTGAAGAAGATAGCAAAAGGGTGCAGTGGTTCTCCCTTGGCACTTATAGTAACCGGAAAATCTTTAAGTCTTGAAGAACCAGTGGTTTGGCACAACAGGGCGAGGACATTGTCGAGGGGTCAATCTGTTCTTTCTTATAGTTCTAATAGCGATGGGCTTCTTACTTGCCTCCAAAAAAGCTTTGATGACTTGGATGCTAAGCTTGCTGAGAGTTTTATGGACCTGAGCTTATTTCCTGAAGCACAGAAGATACCCGCAGCAGCACTTGTTGATATTTATGCAGAACAGCGTGATGAAGACGATGACATTGCAATGGAGAATATCCATGACCTCGTCAAAAGGAACGTGGCTGATCTTGTTGTCACAAGGAATACTACGAGTGGAACAGTTGACTACAATTACCACTATGTTACGCAGCATGGTCTTCTTCGGGACCTAGCCATCCATCAAACAAGAAATTTGCCGACTGAGAAGAAGCATAGGCTAATAATTGACCTCAGAGGGAACAATATCCCCAAATGGTGGACTACACAGAATGAGTATCACATTGCAGCCCACTCATTATCCATATCAACTGATGAAGAATTCACTTCAGAGTGGTGCAACTTGCAGCCAAATGAGGTCAAGGTTCTAGTGATGAACCTTAGAGAAAAAAAGCGCTCTCTACCACCGTTCATGAAGAAAATGAATAAATTAAAAGTCCTGACAATAACGAATTATGACGTCAATCGTGCTGAGTTGGAGAATTTAGAGCTGCTTGATTATCTTTCTGATCTCAAAAGAATCAGGTTAGAGAAGGTTTCAATTCCTTTCCTTAGCAAGACTGGAGTGCCACTGAAGAATCTGCACAAGTTCTCTTTCTTTATGTGCAATGTGAACGAAGCCTTCAAAAACAGCACCATCAAAGTTTCTGATGTGCTTCCAAATTTGAAGGAGATGAACATTGATTACTGTGATATGGAGGAATTGCCGGCTGGACTCTCCGATACTGTTTCCCTAAAGAAGCTAAGCATCACAAACTGCCATAAACTTTCAAAACTTCCTACAGGAATTGGAAAGATGTTACCAGAAAACATAGGGGAGCTGGGTAGTTTAGAAAGGTTGAATTGCAGAGGTTGCAACAGATTGTCTGAATTGCCATACTCAGTGAAGGACCTTGAGAGCTTAAGAGTGGTAGTATGCGATGAAGAGAGGGCTGCATTATGGGAACCTATCAGATCCATGTTTAGTGATCTAAAGCTAGAGGTAGTCCTAACTGATTTCAAACTAGATCCTCTTTTATAA


Promoter Sequence:
>Vu_28297::LG7:50010136-50012136(-)
AATTCATGATAATAACGTTACATTATTATATTATAGTAAATGAAATATCATTCTACAATTGTAATAGTATAATTAGTTTGAGAATGAGTTATAAAATAAAAAAAATTATATAAAAAATCATCAAAACACTATACAATAAATAAAAATATTAAAAAAAGTATAAATGATAAGATGTGTGCTTTACAAACTATTTGGTACATTATTAAATAAAATCGTATAAAGAAAAAAAAAATGTGTATGATAGAATGGAAAATATCTTGAATTTTTTTTTTCAAATATCAAACTAGTGAATCAATTAAAATATGATGGAAATGGTTTTAGCGAAAAAAAAAATCTCAAATGAAAGAAAAAGAAAGAATCAAAGACAGTAAAAAAAGGCAGGTTTTATATTACTTCCAAATAACCTAATGTTAGGCATCATCATGACACCTCGTTATGTTTATACCTAAACATTCATAAATAATTTGTCATTATATAAAAATTTATTAAAAAGAAAATAAAATAAAATTGTCAGAGGTGGTTACTGTCCTTAACAAATCAAAAAGATGAATTGATTTTAAATAATACCTTTAATAATTTTTTCGTAAAACATAAATTCTTTAATAACAATTTAAACAAAAAGAGTAAAAAAAAAAGAAAATCACACAAATAATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAATTATTTACAAAATTTCATAAATTTTTTTTATCGAGTTTTATCCTTTTTTTTAATCCAAACAACCACTTCTCCAATTTTTTTTTCCCTTCAACTTCATTTTATCTTCTTTTTTTCAAATTATCCTCGTTCCAAATACGTGCTTCCTGTTTGAACGTGTGGGTATCAACATTCTCAATAAAGTGATGCAAAATTCTTAATTAAATCATGCAAAATTCTCGAGTTTATAAAACTATAATATTTTGGTATTTCCATGGTGGAAACAATTCAATCTGTATACTCGTAGCTACTTACACCCATAATGGGATTGGGTCAAGATACACAAGTTTTCATATCACATAAACACTGACGACATGTAAATGCTTATGTAAACTAATTAGTCACTACAAATAAGATTAACTGGTTATCTTTATATTATTAATTAGTCACTACAAATAATCTTATTTTTTATGTCAACTGATGTCACATAAAATATATAAAAAAAAAAATCTCTTGGTTTTTACATTTTATTTATTTTTTTTACTTAATAAAATATATTATTGACAAAATATAAACATGTGATATTTCGGTGAGACCTATTCAAGAAAAAGGATGCTTAATTGAAAAGAATAATATATTAAAAATGGTTAAATTGAAAAGAATGAAAGGTGAGATGTTATTAGTTTTGAACTGTCGAACAAAACGAAATCCTTTCATTATTAAGCGAGTTGTCTCTAGAATACTTGACTTAGTAATTGAGGGAGTGATTTTGTCAACTTAGTCGAAGTCAGGATTCATAAAAGTCTTTGCCTGTGCCAAATTGTCTTCAATGTTCTCACTAAATTTTACTACAATAATACCACCATTTCTCTAATTATTTATTTATAAGAAGCACGACTATTTAAACAATTTCTTGACTACCTTATATCAATGTGAACATTCAAGAGTGCGTGAACCTCAACTTGCTCAAGTTATAGATTCTTGATCTCACTGATGTCAAAGCCATGTCAACACGAAACACGGTTTAGAGGGAAAGGGCCTCGTCAAAAGAAAGAAAACATAAATCCTATAAATCCAAGAGAATTTTGATGTGAACAAAAATATCTGGTACCGGGTTCTCCAACGTAACAGCGTCTTAGAAAGAAAGAAAAAAAAAACTTCGGAGCATTATTGTTGGCATTCTTTATTATTTCACCACACTTTTTCTATTTTCTTAATTCCGGTACCTTATTATTGAGTTTGTTTGGCTTACATACCAGTGTTAGAACTTAGATCAAAGTTTCAGGTTTTGGGTGTTTTTAGTTAATTAGTTTCTGTGTGCAGTAGTC


Gene Sequence:
>Vu_28297(-)
ATGGCTATGATTCTGGATGCTGTTGTTGGACGAGTGCTTGATGAACTGCTGAGCACTGTTATTGCAATGAAAGACAGGGCAGTGAAGTTCAGAGCCACCCTGGAAAATTTGCATTCTATCCTCAAAAAAGTAGAACCGATGGCTAGGGAGATAGATGGTCTTAACAAGCGATTGGATAAACCAGCTACAGAAACGCAGAAGCTGATCGATGAGATGGAGAAGGGGAAGGAGCTTGTTATTGAGTGCTCCAAAGTTGATTGGTGGAATTGCTGTTATAAGGCCAGTTCCCAAGAGAAACTTCAAGACTTGATCGATTCTATTACTCTGTACTTTCAATTGGATATGCAAGGAAATATAAATGTCATTGTGCTGGAGAACCAGATGCTGCTGCATCAGATTCACGAGAAGCTTGTGGAGAATGTTCCGAGAAGGATTGCAGGCTTGTGCTCTCCACCTGAACCCCCAGCTTTCACTGTTGGGCTGGATGTTCATTTGAGGGCGTTGAAGTTCAAGTTGCTGAATAATCATCATGTGGGGTCAGTGCTCACAGTAACTGGAACAGGAGGTTCGGGAAAGTCAACGTTGGCCAAGAAGTTTTGTTCTGATGAGGAAGTTAAAGGTATGAATGTGTCTATCTCATCATCTTTCACTTCTCGTATTCGTATTATTTGAAAAGGTAGTTTGATGGTCTTTTTGGTTCTATTGATCTCAAACCATTAGGTGGTTATTTAACTTCATTACTAGTTACTGGATACTATTGACTACCGAATCTAGTGAGGTTGCCACTTTTAGTCATAGTACGCAATCTATTAGCTTCAAGTAAATGTTTTGATGTCAGAATGCAACAAATGGGTTTTAGGCTGTATTTGGAAAGCCGTTACAGTTTCATCTAAGGGACATTTTACCCATTTTGAGGCAGAAACATTGAACTTGATGAAAATACAAGAACACTTAATCCATTAGGGGAATATCTGTGTGAATGTGGAGAGAATAAAATGATTTAAGTAGTTGAGAAATGAAAGTACTTTATATGTTCTTGATGATGTCCAAAATAATTGGCCTAAGAAGCTAGATCTTATTTTCTGTGAAGGTCATATTTTCACTTGTAAACATGTCTAAGGAATAGTAACTTCAGAATGATTATCCAGAGCTCTAAACATGTTGAAATTTGTTTAGGTGAATTCAAGGACAACATATTCTTCATCTCCTTAGCGGAAGTGCCCAAGTTGAGCACCATAGTGGAGAGACTGTTTGAACACAATGGTTACGAGAAGCCACAGTTTCAAAGTGATGAGGGTGCAGTTGATCGATTGGAAAATTTGCTAAAACAGATTGGAAAAAACCCCATATTGTTGGTCTTGGACGGTGTTTTGCCAGAGTCAGCATCTCTAGTTGAGAAATTCGTGTTTCAGATCCCAAACTACAAGATTTTAGTGACATCAAGATTCACAATTAAAGGATTTGGGCAGCCATACGTGTTGAAATCACTGAATGAAGCTGATGCTTTAAACTTATTTCGCCACCATGCATCCCTGGACCAGACCAGCTTTAAGATTCCGGATACTATTGTGAAGAAGGTATACTCTTTGTTGCTCAATTATGGTATTACAAATGTGGTGTGTGAAATAGTAACTACGGAATGCTTGTCTAAAAAAGTTTTCACCTTCCAGTAATGGTAATAGCAAAACAATGCTAAATGTTTTAGGAGCAATTTCTGATTTCATTGAACATATCAAATAAATTGCAGATAGCAAAAGGGTGCAGTGGTTCTCCCTTGGCACTTATAGTAACCGGAAAATCTTTAAGTCTTGAAGAACCAGTGGTTTGGCACAACAGGGCGAGGACATTGTCGAGGGGTCAATCTGTTCTTTCTTATAGTTCTAATAGCGATGGGCTTCTTACTTGCCTCCAAAAAAGCTTTGATGACTTGGATGCTAAGCTTGCTGAGAGTTTTATGGACCTGAGCTTATTTCCTGAAGCACAGAAGATACCCGCAGCAGCACTTGTTGATATTTATGCAGAACAGCGTGATGAAGACGATGACATTGCAATGGAGAATATCCATGACCTCGTCAAAAGGAACGTGGCTGATCTTGTTGTCACAAGGTATGGCGAATTACTGCTTCTCATTGGAGAACATCCATGCATTAAACCATACAAAGTCATTCCAAGTCATCTTGAAAAAATATTTGATATTTGAGTTATTCTCTAGATAGAAACCATGATCCTATTGGCGCTTTCTCCTATAAACTGTTACAAAATTTACTTCTACTAGATGAATAGAATATTGTTTGTGCTGTTTGCTGTGCATTGACTAATGAGAGATTGATTTATTTTCATTGATCAGGAATACTACGAGTGGAACAGTTGACTACAATTACCACTATGTTACGCAGCATGGTCTTCTTCGGGACCTAGCCATCCATCAAACAAGAAATTTGCCGACTGAGAAGAAGCATAGGCTAATAATTGACCTCAGAGGGAACAATATCCCCAAATGGTGGACTACACAGAATGAGTATCACATTGCAGCCCACTCATTATCCATATCAACTGGTATGTTCATCTTTCTATCTCGGTGCACATATGGTATGCACACATGCTGACAGAGTTCTCAAACACTAATTATTGAGTCTGATTTTGCAGATGAAGAATTCACTTCAGAGTGGTGCAACTTGCAGCCAAATGAGGTCAAGGTTCTAGTGATGAACCTTAGAGAAAAAAAGCGCTCTCTACCACCGTTCATGAAGAAAATGAATAAATTAAAAGTCCTGACAATAACGAATTATGACGTCAATCGTGCTGAGTTGGAGAATTTAGAGCTGCTTGATTATCTTTCTGATCTCAAAAGAATCAGGTTAGAGAAGGTTTCAATTCCTTTCCTTAGCAAGACTGGAGTGCCACTGAAGAATCTGCACAAGTTCTCTTTCTTTATGTGCAATGTGAACGAAGCCTTCAAAAACAGCACCATCAAAGTTTCTGATGTGCTTCCAAATTTGAAGGAGATGAACATTGATTACTGTGATATGGAGGAATTGCCGGCTGGACTCTCCGATACTGTTTCCCTAAAGAAGCTAAGCATCACAAACTGCCATAAACTTTCAAAACTTCCTACAGGAATTGGAAAGTTGGTGAATTTGGAATCATTGAGGCTTACTTCTTGTACAAATTAGAAGAGTTGCCAGACAGCATCACAAGCCTTCATAAACTGAACTTTCTTGACATTTCTGACTGTGTAAGTCTTAGGATGTTACCAGAAAACATAGGGGAGCTGGGTAGTTTAGAAAGGTTGAATTGCAGAGGTTGCAACAGATTGTCTGAATTGCCATACTCAGTGAAGGACCTTGAGAGCTTAAGAGTGGTAGTATGCGATGAAGAGAGGGCTGCATTATGGGAACCTATCAGATCCATGTTTAGTGATCTAAAGCTAGAGGTAGTCCTAACTGATTTCAAACTAGATCCTCTTTTATAA

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