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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28285 LG7 49677721 49678380 PREDICTED: agamous-like MADS-box protein AGL61
Map

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category   relationship type   keyword
No SNPs found.

Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28285.1
MMKKKCSSGRQRIPIEKIPKKSHLQVTFSKRRSGLFKKASELCTLCGVEIAIIVFSPADKAFSFGHPQVESVVDSYVTSNSSPEYNRSGGGHQLVEAHRSANIRNLNAQLTQIVNELEMEKRRGEELDRAWKTRQSQFWWEIPVNELGLQELQHLMFSLEELKNTVAKYATQIMSMDQTSIGPTVTGPGPIGFTLGPYDAFDTKHADIYANAPGLSFPY*


CDS Sequence:
>Vu_28285.1
ATGATGAAGAAAAAGTGCAGTTCAGGTCGGCAAAGGATTCCGATTGAGAAAATACCAAAAAAGAGTCACTTACAAGTAACATTTTCGAAGCGTCGTTCGGGACTCTTCAAAAAAGCGAGTGAGCTCTGCACACTCTGTGGAGTAGAAATCGCAATCATCGTTTTCTCTCCCGCGGACAAGGCCTTTTCGTTCGGCCACCCGCAAGTTGAATCCGTCGTTGATTCTTACGTAACTTCAAACTCATCACCAGAGTATAATCGCAGTGGTGGAGGTCACCAACTCGTTGAGGCTCATCGCAGTGCTAATATTCGTAATCTCAACGCGCAACTCACTCAGATTGTTAACGAGCTAGAGATGGAGAAAAGGCGAGGAGAAGAGCTGGATCGAGCGTGGAAAACGAGACAGAGCCAATTCTGGTGGGAGATCCCCGTTAACGAACTTGGATTGCAAGAGTTACAGCATTTGATGTTTTCGTTGGAGGAACTGAAAAACACTGTTGCAAAATATGCTACTCAAATAATGTCCATGGACCAAACTAGTATTGGGCCAACAGTTACTGGACCCGGGCCCATTGGATTTACCCTTGGGCCTTACGATGCCTTCGACACCAAACATGCTGATATTTACGCTAATGCCCCCGGTCTGAGCTTTCCATATTAA


Promoter Sequence:
>Vu_28285::LG7:49678380-49680380(-)
TATACACTTAATTTTTCAATTTAAGTTGTTATAATATATTTTTGTAGATCAATAATATTTATTGTTTGATATTAATTATAATTTTATAGACCAATGTCCGAGGAGACTACTTCGTTGTGGGTGTATTTTTTTTTTCAATTGATGTTTTTCGTGATTATTTTTTAATGATGCTTGAATTAATTTTGTTATCATCAACATAAATATTAATTTTTGTCAACAGTTTGTTTGTTTTTTCAATATTAGATTGAAAAACTATGAGCCAACATTAATATATAATTGTTATTTTATCAATATACTTGGAAAATTGTCACTTGACATTAATAAAAATAGTTAGAAAAAAACCGTCAATTATCAAGATCATATAAATAATCTTGATCAATGTCAACATAAATAATTGTGTTCGACATCGATAATTTTTTTTTAAATATTGGTTAAAAAAAGTGACAAATTTTGACAAAAATAAAACATCAATCCAAATCGATTATATGAAATAATTAATTTTTATAATTTTTAATTCTTAACAACTATTTAGCATTTAACTAAATTTTTATATATAATAATAATTAAAATACTTTATTTAAATAAATAATTAAAATTCATTATTTTTTCTATTCAAACAAAATATTTTAAAAATAAACTAATTTTAAAAAATAAATTTAATTTCAATGTAATTATATATCTTAAAAATTACAAAATTTTGTAAACCAATATAATTTTAAGCCTAACACGAACCATGGTTAGAGTTTCCGGCTTAAGTGTGCTGGTAGAAAAGAAAAAGATGTGATAAGTATATATTTAATGTTGAAGTTAATCATTAGCTTTAAATAACAAGAAGTTACACACAAGATGTTATTTTATATTCATCATGGAGATTAACTATTTATAACTTCCTGATTAACTCCATCCTTGAAATGAAAACTCAATTAAGAGTCTAATAATTAATTTTTTAATAAATTATTTTCTATCTTCTTTTTCTTGTATTATTTTTTTCATTTCTCGTTCAACCCATTTTTTCATCATATATGTAAAATAGTTAGTAACTTTATCATTGATCAGTATTAAGGAATTTAAATTATTATTTTTAAGTTGAGTTTTTTGTTTCAACTGCAATTTTTTATCCACAAATATCAAAACTGATCAAAGTTTAAAGATCAAACGATTAGTTTTTTGAAATGATATATTAAAAAGGCTAAGAGTTTTACATACTCCAACACACGCAATTGTTCACACTGTTTTTAGTCATCAAAAGTATTATGTCAAATAAATAATATGTCCGAAGATAGTTGTAAGAACTATTAATGATATGGTAATATTATTAATTTAATAATAACCATTTAAAAAATATATCAAATATGATTTTTGATTAATTAATAGTACAAAAACTTTTATACCCATAACATATGGGTATTAAATTCTTTAATATAATGCATAAAATGAAATGTACGTCAATATGTATGAAATAAAAGTCTACAAAAGAAACCCCAAATGGAATGAAAGAGAATAAACCTAGAAAATCAGAATTCAATACAGTTAAAACGTCTCACTGGGTAACATCGTCAATTTTCTTTTCCTCAATCTTAAATCTCGATATTTCTTTATATGATTTTATTCTCAGTTTATAATGTAATTATATTACCATTTACCCTATGACCAATATTTCAACCGAAAAGAAAAATAACAGAGTATAGTTAATTGTACAAAATTGATGCAGAAAGTAAATGTTAGGATAAAATATATAACATACATAGAGGTTTAAAATAATTAATTTTAGAAAAGTGAAAATCTTCTGATAAGGCGAAGTAAGAGATTGGAGATATGATATAATGAAGCATTAAGATTTAGGATTTGATAACTTGCTAATCCTGGAGTTTTTATAAAGAGTAATAAAACATTATGATAGGAGAGTTAAGTTTGTGAGTTGGCACACCTTAAACGTGAAATATAAATAGTGCATTATGTTCTCCAACTCCAGAACGCCAAATCGCAAACACCTTCAAAGC


Gene Sequence:
>Vu_28285(-)
ATGATGAAGAAAAAGTGCAGTTCAGGTCGGCAAAGGATTCCGATTGAGAAAATACCAAAAAAGAGTCACTTACAAGTAACATTTTCGAAGCGTCGTTCGGGACTCTTCAAAAAAGCGAGTGAGCTCTGCACACTCTGTGGAGTAGAAATCGCAATCATCGTTTTCTCTCCCGCGGACAAGGCCTTTTCGTTCGGCCACCCGCAAGTTGAATCCGTCGTTGATTCTTACGTAACTTCAAACTCATCACCAGAGTATAATCGCAGTGGTGGAGGTCACCAACTCGTTGAGGCTCATCGCAGTGCTAATATTCGTAATCTCAACGCGCAACTCACTCAGATTGTTAACGAGCTAGAGATGGAGAAAAGGCGAGGAGAAGAGCTGGATCGAGCGTGGAAAACGAGACAGAGCCAATTCTGGTGGGAGATCCCCGTTAACGAACTTGGATTGCAAGAGTTACAGCATTTGATGTTTTCGTTGGAGGAACTGAAAAACACTGTTGCAAAATATGCTACTCAAATAATGTCCATGGACCAAACTAGTATTGGGCCAACAGTTACTGGACCCGGGCCCATTGGATTTACCCTTGGGCCTTACGATGCCTTCGACACCAAACATGCTGATATTTACGCTAATGCCCCCGGTCTGAGCTTTCCATATTAA

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