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Integrated genomic strategy for accelerating domestication of
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Gene Details:

Gene ID Chr. No. Start Position End Position Function View on
Vu_28280 LG7 49653573 49656598 PREDICTED: cysteine-rich receptor-like protein kinase 10
Map

Annotations  
category   relationship type   keyword
SNP Position Effect Amino acid change
G/A 49653582 missense_variant p.Val4Ile
C/G 49653610 missense_variant p.Ala13Gly
A/T 49653800 upstream_gene_variant
C/T 49653829 upstream_gene_variant
T/C 49656510 missense_variant p.Phe509Ser
A/T 49656533 missense_variant p.Asn517Tyr
T/C 49656539 missense_variant p.Ser519Pro
C/T 49656540 missense_variant p.Ser519Leu

View accession wise SNPs


Sequence Details:

Protein Sequence:
>Vu_28280.1
MNTVAAGTVLSNAFGDHSVLVNYVLKPITNLFSSSHYVVFGDPPYNICSSSGSYVNGGSFENNLNNLLSSLSSNASDSKFYNTSYGIASDRVYGLYMCLDYISNDNCQKCIATVTEEIVKLCPQAKEAIVWEELCQLRYSNINFLGSLNVTGNIGLDNVQNLTEPKKFESAVNETLRNLTKVASFHVSANMYATGDVPFGDQTIFALVQCTRDLAANDCNSCLQSAIGDIPSCCYASIGARVLSRSCYLRYEFYAFYNGVTGPTDSSNGKKESKNKSSKTWMIAGIAVMVGLVIVFFIFGLYLFRNKRHRHDPMQRAQLDWSKRLNIINGIARGILYLHEDSRLKVIHRDLKASNVLLDHDMNAKISDFGMARIFSGNEGEANTATIVGTYGYMAPEYAMEGLYSIKSDVFGFGVLLLEIITGKRNAGFYHSKNTPSLLSYAWSLWNEGKGIELSDSLLCDSCPGDEFLRYMQIGLLCVQEDAYDRPTMSSVVMMLKNESATLGHPEKPPFSVGRFHANDSDSQECSVNFLTMSDILPQ*


CDS Sequence:
>Vu_28280.1
ATGAACACTGTAGCAGCTGGTACTGTTCTATCAAATGCATTCGGCGACCACTCTGTTCTGGTGAACTATGTTCTCAAACCAATTACCAATTTGTTTTCCTCATCTCACTATGTTGTATTTGGCGATCCTCCGTATAATATTTGTTCTTCAAGCGGCAGCTATGTAAATGGCGGTTCCTTTGAAAACAATTTAAACAACCTGCTTTCATCTTTATCCTCCAATGCTTCAGACTCCAAATTCTATAATACTTCTTATGGGATTGCCTCTGACAGAGTTTATGGCCTCTACATGTGCCTCGACTATATTTCAAATGATAATTGCCAGAAATGCATCGCCACAGTTACAGAGGAAATTGTCAAACTGTGTCCTCAAGCAAAAGAAGCAATTGTGTGGGAAGAGTTGTGTCAGTTGCGTTATTCCAACATTAATTTCCTGGGTAGTTTGAATGTCACGGGAAACATTGGCTTAGATAATGTACAGAATCTTACAGAGCCAAAGAAGTTTGAGTCTGCTGTGAATGAGACACTAAGGAATCTTACTAAGGTAGCATCTTTTCATGTTTCGGCTAACATGTATGCTACTGGAGATGTCCCCTTTGGAGATCAAACAATATTTGCCTTAGTGCAGTGCACCAGAGATTTAGCTGCAAATGATTGTAATAGCTGCCTACAAAGTGCCATTGGAGATATACCAAGTTGTTGCTATGCCTCCATCGGGGCCAGAGTTCTGAGCCGTAGCTGTTATTTAAGGTATGAATTTTATGCATTTTATAATGGTGTCACAGGACCAACAGATTCTTCAAATGGCAAGAAAGAAAGCAAAAATAAGTCAAGCAAAACATGGATGATTGCTGGAATTGCAGTTATGGTAGGCTTGGTCATAGTATTTTTCATTTTCGGACTGTACCTTTTCAGGAATAAAAGACATCGGCATGATCCAATGCAACGTGCACAACTGGATTGGAGCAAACGCCTCAATATCATAAATGGAATAGCAAGAGGGATACTTTATCTTCACGAAGATTCTCGACTGAAAGTGATTCATAGAGACCTAAAAGCAAGTAATGTATTGTTGGACCATGACATGAATGCAAAGATCTCAGACTTTGGAATGGCAAGGATATTTTCAGGAAATGAAGGTGAAGCTAACACTGCTACAATAGTTGGCACATATGGGTATATGGCTCCAGAGTATGCAATGGAGGGATTATATTCCATAAAATCTGATGTGTTTGGGTTTGGTGTACTATTGCTTGAGATCATTACAGGGAAACGTAACGCGGGTTTCTATCACTCTAAAAACACTCCTAGCCTTCTGTCATATGCATGGAGTCTATGGAATGAAGGAAAGGGTATAGAACTAAGTGATTCCTTGTTGTGTGATTCATGCCCTGGAGATGAGTTTTTGAGATACATGCAGATTGGACTACTGTGTGTTCAAGAGGATGCATATGATAGACCAACCATGTCTTCTGTTGTGATGATGCTGAAGAATGAATCAGCTACGCTTGGTCATCCAGAAAAACCACCTTTCTCTGTAGGGAGATTCCATGCTAATGACTCAGATTCACAAGAATGCTCAGTCAATTTCTTAACCATGTCAGATATATTACCCCAGTAA


Promoter Sequence:
>Vu_28280::LG7:49651573-49653573(+)
TAAAGCGAAAATGAAACGATTATCAAATAATGATACCGATGGAACAAAAGTTGCATAGGTCTGTGACACAGAGAAAGGAACGTGTACCCTATCTTAGTTGAATGAGCAATGGTAACAGAAGGTCCAACAATAGTTCCAGAACCTATACGAACATTTGGGCCAACAACAGATTCTGAATGAACTACAGCGCCAACCTCTACAAGTGCTGTGGAGTCGATGCAAGCTGACTCGTGGAAAGTGCCACCACCATTATGCCATTTAAGAAATTTATCACCAAAAGAATCATCCTCTAATCTTGAAACACAAGACAACTGTAAAATATATTGAAAAGATGAAACAGAAAATATATTAAGAAATATATGTGATGATCATTCACCTGGAGAAGCAGAAAAACCGAGGAAAGCAAAAATACGTTGGAAGTTTATATTTCGATTGAGATTGAGAAAAAGGGGTTGAAGCGGAACAAGCAAAGGCAAATAACCTCCTTCCAGCCATAGTCATCGCATGATTCATTTGGCTTCGCACCTAGACAGCAACCAGAACAAGGGTTCCTTACAAGGTGGATGGAGCTCCGACCAATTTGGAGACTCAAATATGCGGGTGATCCGATCCGATCCGATCTCATGTTTAATCCATATTTGTTTTTATTCCATCTCATCTAGGATAGAGTCCTGCGTACTTTCTTATTATTTTAAATGTTAACTAAAAGTATTTAGAAAAAAATAAAAACCATAATAAAAAATACATGATACTATCACATATTTAATATTAGAATGATACACGTATAAATTTAAATATCAGGAAAAAAACATTATGATTATATAAATTTTAAATTAAAATATCAAAGAACAACTAAATAAAAATTAAATATTTATAAAAAAATAATAAAAAGTGTTCCTTAAAATTAAGTTATAAAAAACTGAAAGTAAAAAATTATAATAAACTTTTTAATTTAAAGAATAAATTAAATATGTTTTAATAATTTAAAATAAAAACATGTACTAGTACTAAAATGAGTACAAAGACATCTTCATTCTTATACCCAACTCAAAATAAAATTTAAAATTGATAAATGGTTCATTAGTCAATAATTGAAAAGTTGAAAAATTTCTAAAATTTAAAATGGATGTAAGCTATACAAATTTAAATATTCTAAATATATAAGATACTTAATTATTTTACTCGTTTTAATAATTGTCACATGCAATGAACGCTAAAAGTTATTAGTTTTAGAATGAGTTGAATTTTGTATGTGATTATAATATTAATTCAAAATATTTGTTGACTTTAGTGGAGACTAACCTCTATTAAAGAAATTGATGAACCCGTAATTTTGAAATCTTGTTTTTCTTCAATAATGTTTGAATCTAAAACTCGAAAAGTACACATCTAATTCCATTCATACCAAAACCATGTTGGTTGATGAGTTCAGATTAAGTAAAAATTTTAAAACACAAAAAAATTATATTAGCATGAGTTGTTTTTAAAAATATATTATTTTGCATAAGTTAGAATTGGAAGGGATGATAACTTAATTATCTTGATTTTTTATTATGAAATTAAATTACTTATTTTTTAAAATTAAAAAAAAAAAAGTATGACTGGCCTTCTCCTTTAAAAATAAGTAAAAAAGGTTACAACTAACAATGTTAAAATTATAATAGAGTAAGTTAAAATTAAATAAGACATATTTTTATATTCATTTGATATAAAAATAAAATGATGAATTTTTATATTTTATTAAAAAAAAAAGCAAAAGAGTAACAAAAGACAATATCAAATAAATATAAAAAAGAAATATTTTTATTTACATAATTTTTTTTTACCTTCATTTAAATTATCCTTATTTATTTTCTATTTTTAAAAAGTACAAAATTTTATTTTTTAATAACTATTTTAATCTTGTATTGTGTTAAAAACTTATCCCCTTCCTATTACTTTTTTTTCTTTTAATCTATCTATATAATATGTTGGCAGGAAAGAAACAAAGGAAACAAGTA


Gene Sequence:
>Vu_28280(+)
ATGAACACTGTAGCAGCTGGTACTGTTCTATCAAATGCATTCGGCGACCACTCTGTTCTGGTGAACTATGTTCTCAAACCAATTACCAATTTGTTTTCCTCATCTCACTGTCAGTGCATCTTTTTCTGATCTATCATGTATGGAATCAAATGTTATTTAATTTAGTATAAGCGCGTCATTATCTGACAAATTGATTGAACCTTGTAAACCTAATTTTCAGGGTCAATAAAAAATAGTTCTTCAGCTTTCATTTAGTCAACTCTGAAATTTGGATATTACTTAACGTTTTAAACTCAGAATATCTTAATTTCCTCACTGACGTAGAACAAATAAACTCTGAAGTGTTTTCCTGTAATTGTAAATTATATTTTGGTTGAAGTCCAACCTTGTACCATTGCCGATAGTTATTATTTGGTTTGACCAATTTCAATGAATCACCTTCTTAGGAGCTTCTGAGAAATTGTAACCTCTGTTACTGCATAGGTAATACTGGAAGTGCAAGTATTGAAATAGTACTGCCAACTTCTAAATTATCATCGCCAATCGGAAGGGAAAAATTCATTTTTTCTCTAATGCATTCCAAACCCATTCAATTGCTGCTTCTTTGCACTTTTGCTTTGTTTTCAGATGTTGTATTTGGCGATCCTCCGTATAATATTTGTTCTTCAAGCGGCAGCTATGTAAATGGCGGTTCCTTTGAAAACAATTTAAACAACCTGCTTTCATCTTTATCCTCCAATGCTTCAGACTCCAAATTCTATAATACTTCTTATGGGATTGCCTCTGACAGAGTTTATGGCCTCTACATGTGCCTCGACTATATTTCAAATGATAATTGCCAGAAATGCATCGCCACAGTTACAGAGGAAATTGTCAAACTGTGTCCTCAAGCAAAAGAAGCAATTGTGTGGGAAGAGTTGTGTCAGTTGCGTTATTCCAACATTAATTTCCTGGGTAGTTTGAATGTCACGGGAAACATTGGCTTAGATAATGTACAGAATCTTACAGAGCCAAAGAAGTTTGAGTCTGCTGTGAATGAGACACTAAGGAATCTTACTAAGGTAGCATCTTTTCATGTTTCGGCTAACATGTATGCTACTGGAGATGTCCCCTTTGGAGATCAAACAATATTTGCCTTAGTGCAGTGCACCAGAGATTTAGCTGCAAATGATTGTAATAGCTGCCTACAAAGTGCCATTGGAGATATACCAAGTTGTTGCTATGCCTCCATCGGGGCCAGAGTTCTGAGCCGTAGCTGTTATTTAAGGTATGAATTTTATGCATTTTATAATGGTGTCACAGGACCAACAGATTCTTCAAATGGCAAGAAAGAAAGCAAAAGTAAGCAATTCAAGTCACTCTCTGGTTTTAACATGTGGTCTTAAGCATATTATAAACTGCAACAATTAAAATCAGCATTGGGTTGATTCTTTATGCAGATAAGTCAAGCAAAACATGGATGATTGCTGGAATTGCAGTTATGGTAGGCTTGGTCATAGTATTTTTCATTTTCGGACTGTACCTTTTCAGGAATAAAAGACATCGGCATGGTAAGTTGCAATATGAAAGTATGTTAAGCTTGTGAACTCTTTCCTTTTAGCAACTTATTTGATTCTTGTCTTTAGGTAAAAATGAAATAGAAAATCATAACATCAATCTTGGATCTCTTCGAGTGGCTACCAATAATTTTTCTGATTTGAATAAGCTTGGACAAGGTGGCTTTGGCCCTGTTTACAAGGTAAATAGAATTCAAGGTTATACAAAGTTCATTCCTTCCTGCTTGAATATTAATTTTATCATAGGAAAGTTCAGACAGATCTTATTATATTGTTTGTTAGGGGAAACTTGGTGATGGCCAAGAAGTAGCAATCAAGAGGTTGTCAGCTTGCTCTGAACAAGGCTCAGAGGAATTCATAAACGAGGTTCTTCTGATAATGAAACTTCAACACAAAAATCTTGTAAAACTTCTTGGATTTTGTGTAGATGGAGAGGAGAAGCTTCTTGTGTATGAATTTTTACCCAATGGTAGTCTTGATGTCGTACTCTTTGGTAAGTATATTTTTTCAAAGCGACCAATTACAGTAGAGTAAATTAAACAAACAGAAAATAGGTTGATTGTAGCATTCATCTTACTGCATATTTTCATTTTTATTGGATGGTTGGAATATGGATAGATCCAATGCAACGTGCACAACTGGATTGGAGCAAACGCCTCAATATCATAAATGGAATAGCAAGAGGGATACTTTATCTTCACGAAGATTCTCGACTGAAAGTGATTCATAGAGACCTAAAAGCAAGTAATGTATTGTTGGACCATGACATGAATGCAAAGATCTCAGACTTTGGAATGGCAAGGATATTTTCAGGAAATGAAGGTGAAGCTAACACTGCTACAATAGTTGGCACATAGTAAGAAACCTTTTTCAGCATCAACGTTTCTCCTTTATAGGTATATTGACATCCTTAACAGTAGCTGTATTTCCAAATTGCAGTGGGTATATGGCTCCAGAGTATGCAATGGAGGGATTATATTCCATAAAATCTGATGTGTTTGGGTTTGGTGTACTATTGCTTGAGATCATTACAGGGAAACGTAACGCGGGTTTCTATCACTCTAAAAACACTCCTAGCCTTCTGTCATATGTATGTGACTGTGTCAGATTCTGAACTTACTAAACGTGTTGTGACCATTATTCATTGAATTACTTGTGAACTTTGCATTGCAGGCATGGAGTCTATGGAATGAAGGAAAGGGTATAGAACTAAGTGATTCCTTGTTGTGTGATTCATGCCCTGGAGATGAGTTTTTGAGATACATGCAGATTGGACTACTGTGTGTTCAAGAGGATGCATATGATAGACCAACCATGTCTTCTGTTGTGATGATGCTGAAGAATGAATCAGCTACGCTTGGTCATCCAGAAAAACCACCTTTCTCTGTAGGGAGATTCCATGCTAATGACTCAGATTCACAAGAATGCTCAGTCAATTTCTTAACCATGTCAGATATATTACCCCAGTAA

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